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단세포 전사체 분석에 의한 이식 수용성의 정량적 동정

2017년 3월 21일 업데이트: Carlos Simon, Igenomix

인간 자궁내막 수용성의 새로운 진단 테스트로서 자궁내막액의 단일 세포 수준에서 비침습적 전사 서명

이 프로젝트는 자궁내막 고유 조직(생검)과 자궁내막액 모두에서 단일 세포 수준에서 자궁내막 전사체를 연구하는 것을 목표로 합니다. 기본적으로 목표는 다음과 같습니다. 1) 단일 세포 RNA-seq에서 제공하는 해상도를 사용하여 월경 주기 전체에 걸쳐 자궁내막 전사체의 실시간 역학을 알려진 인구 이질성에 의해 생성된 인공물에서 분리하고 2) 자궁내막 유체를 사용하여 자궁내막을 대체합니다. 고해상도 및 최소 침습적 자궁내막 수용 상태를 결정하기 위한 새로운 진단 플랫폼을 개발하기 위한 신호 소스로서의 생검. 이 연구는 월경 단계 전반에 걸쳐 전체 전사체 분석을 통해 자궁내막 세포 계층의 전례 없는 고해상도 특성을 제공할 것입니다. 이러한 결과는 단계 정의 유전자 발현 서명의 강력한 정의로 이어지고 대량 조직 연구에서 발생하는 오랜 불일치를 해결할 것입니다. 데이터 세트는 자궁내막의 역학에 대한 생물학적 통찰력을 제공하고 기능 연구를 위한 새로운 기준점을 시작하기 위해 정보학 도구를 통해 추가로 탐색될 것입니다.

연구 개요

상세 설명

시험관 수정을 위한 성공적인 배아 이식에는 건강한 배아와 수용성 자궁내막이 모두 필요합니다. 자궁내막이 수용 상태에 도달하는 이식 창(WOI)은 개인마다 다릅니다. WOI의 변위는 반복되는 이식 실패의 주요 원인으로 보고되었습니다. 그러나 자궁내막 수용 상태를 평가하기 위한 신뢰할 수 있는 진단 메트릭이 부족합니다. 이 연구의 제안은 단일 세포 RNA 서열 및 생물정보학 도구를 사용하여 자궁내막 활동을 특성화하고 비침습적 방식으로 자궁내막 수용 상태를 측정하기 위한 고해상도 플랫폼을 개발하는 것입니다.

첫 번째 목표는 다음 각 단계에서 월경 주기 전반에 걸쳐 건강한 환자의 자궁내막 생검 및 자궁내막액으로부터 고품질 단일 세포 RNA-seq 데이터를 생성하는 실험 파이프라인을 개발하는 것입니다: 조기 증식(EP; 0-8일), 후기 증식성(LP; 9-14일), 초기 분비(ES; 15-18일), 중간 분비 또는 수용성(MS; 19-23일) 및 후기 분비(LS; 24-30일). 이러한 조직은 기계적으로 및 효소적으로 해리되고 미세유체 분류, 단일 세포 전사체 증폭 및 분석을 받게 됩니다. 이러한 데이터는 인간 자궁내막의 다양한 세포 유형에 대한 최초의 전사체 전체 단일 세포 데이터를 제공할 것입니다.

둘째, 이 연구는 관심 있는 집단을 먼저 정제할 필요 없이 정보적으로 상피 및 간질 집단을 구별하기 위한 알고리즘 모델을 확립하는 방법을 살펴봅니다. 이렇게 하면 혼합된 세포 집단에서 전사체 분석이 가능해집니다.

마지막으로 다른 월경 단계에서 인간 환자로부터 수집된 자궁내막액에서 단일 세포의 전사체 프로파일을 분석하는 수용성 진단을 위한 대체 소스로서 자궁내막액의 사용을 평가합니다. 이러한 서명은 또한 생검에서 얻은 서명과 비교 및 ​​상관 관계가 있을 것이며, 이는 자궁내막액에서 이러한 세포의 발생으로 이어지는 생물학적 사건을 더 잘 이해하고 다른 자궁내막 조건의 진단을 위해 사용을 확장할 가능성을 평가하는 데 도움이 될 것입니다.

연구 유형

중재적

등록 (예상)

70

단계

  • 해당 없음

참여기준

연구원은 적격성 기준이라는 특정 설명에 맞는 사람을 찾습니다. 이러한 기준의 몇 가지 예는 개인의 일반적인 건강 상태 또는 이전 치료입니다.

자격 기준

공부할 수 있는 나이

18년 (성인)

건강한 자원 봉사자를 받아들입니다

예

연구 대상 성별

여성

설명

포함 기준:

  • 자연 주기의 건강한 여성;
  • 정상 핵형;
  • HIV, HBV, HCV, RPR에 대한 음성 혈청 검사;
  • BMI: 18 - 30 Kg/m2(둘 다 포함됨);
  • 규칙적인 월경 주기(3-4/28-30일)를 가진 여성.

제외 기준:

  • 지난 3개월 동안 자궁 내 장치를 휴대한 환자;
  • 최근 2개월 이내에 호르몬 피임약을 복용한 적이 있는 환자
  • 부속기 또는 자궁 병리;
  • 다낭성 난소;
  • 연구를 방해하거나 환자의 건강을 위험에 빠뜨릴 수 있는 불안정한 질병 또는 의학적 상태(연구 팀의 수석 연구원이 평가);
  • 모든 질병 또는 의학적 불안정 상태.

공부 계획

이 섹션에서는 연구 설계 방법과 연구가 측정하는 내용을 포함하여 연구 계획에 대한 세부 정보를 제공합니다.

연구는 어떻게 설계됩니까?

디자인 세부사항

  • 주 목적: 기초_과학
  • 할당: NON_RANDOMIZED
  • 중재 모델: 크로스오버
  • 마스킹: 없음

무기와 개입

참가자 그룹 / 팔
개입 / 치료
ACTIVE_COMPARATOR: 자연 순환

다음 각 단계에서 월경 주기 동안 건강한 여성에게서 채취한 자궁내막 생검 및 자궁내막액:

조기 증식(EP; 0-8일), 후기 증식(LP; 9-14일), 초기 분비(ES; 15-18일), 중간 분비 또는 수용(MS; 19-23일) 및 후기 분비 (LS; 24-30일)

ACTIVE_COMPARATOR: HRT 주기의 ERA
호르몬 대체 요법(HRT) 주기에서 자궁내막 수용성 분석(ERA)을 받는 여성에게서 얻은 자궁내막 생검 및 자궁내막액.

연구는 무엇을 측정합니까?

주요 결과 측정

결과 측정
기간
RNA 시퀀싱에 의한 자궁내막 샘플의 전사 프로파일 분석.
기간: 24개월
24개월

공동 작업자 및 조사자

여기에서 이 연구와 관련된 사람과 조직을 찾을 수 있습니다.

스폰서

연구 기록 날짜

이 날짜는 ClinicalTrials.gov에 대한 연구 기록 및 요약 결과 제출의 진행 상황을 추적합니다. 연구 기록 및 보고된 결과는 공개 웹사이트에 게시되기 전에 특정 품질 관리 기준을 충족하는지 확인하기 위해 국립 의학 도서관(NLM)에서 검토합니다.

연구 주요 날짜

연구 시작

2016년 3월 1일

기본 완료 (예상)

2017년 12월 1일

연구 완료 (예상)

2018년 12월 1일

연구 등록 날짜

최초 제출

2016년 8월 30일

QC 기준을 충족하는 최초 제출

2017년 3월 21일

처음 게시됨 (실제)

2017년 3월 27일

연구 기록 업데이트

마지막 업데이트 게시됨 (실제)

2017년 3월 27일

QC 기준을 충족하는 마지막 업데이트 제출

2017년 3월 21일

마지막으로 확인됨

2017년 3월 1일

추가 정보

이 연구와 관련된 용어

추가 관련 MeSH 약관

기타 연구 ID 번호

  • 1603-IGX-016-CS

개별 참가자 데이터(IPD) 계획

개별 참가자 데이터(IPD)를 공유할 계획입니까?

아니요

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