Identificación cuantitativa de la receptividad de implantación mediante análisis de transcriptoma de células individuales

La implantación exitosa de embriones para la fertilización in vitro requiere embriones sanos y un endometrio receptivo. La ventana de implantación (WOI), durante la cual el endometrio alcanza el estado receptivo, varía entre los individuos. Se ha informado que los desplazamientos de WOI son una causa importante de fallas repetidas de implantación. Sin embargo, falta una métrica de diagnóstico confiable para evaluar el estado receptivo del endometrio. La propuesta de este estudio es utilizar herramientas bioinformáticas y de secuenciación de ARN de una sola célula para desarrollar una plataforma de alta resolución para caracterizar las actividades del endometrio y medir el estado receptivo del endometrio de una manera no invasiva.

El primer objetivo es desarrollar una tubería experimental para generar datos de secuenciación de ARN de una sola célula de alta calidad a partir de biopsias endometriales y líquido endometrial de pacientes sanas a lo largo del ciclo menstrual en cada una de estas etapas: proliferativa temprana (EP; días 0-8), tardía proliferativa (LP; días 9-14), secretora temprana (ES; días 15-18), secretora media o receptiva (MS; días 19-23) y secretora tardía (LS; días 24-30). Estos tejidos se disociarán mecánica y enzimáticamente y se someterán a clasificación microfluídica, amplificación y análisis del transcriptoma de células individuales. Estos datos proporcionarán los primeros datos de células individuales de todo el transcriptoma sobre varios tipos de células del endometrio humano.

En segundo lugar, este estudio busca establecer modelos algorítmicos para distinguir informáticamente las poblaciones epiteliales y de estroma, sin necesidad de purificar primero las poblaciones de interés. Esto permitirá el análisis del transcriptoma a partir de poblaciones mixtas de células.

Finalmente, evalúe el uso del líquido endometrial como una fuente alternativa para el diagnóstico de receptividad analizando el perfil del transcriptoma de células individuales del líquido endometrial recolectado de pacientes humanas en diferentes etapas menstruales. Estas firmas también se compararán y correlacionarán con firmas obtenidas de biopsias, lo que nos ayudará a comprender mejor los eventos biológicos que conducen a la aparición de estas células en el líquido endometrial y evaluar el potencial de extender su uso para el diagnóstico de otras afecciones del endometrio.