Tämä sivu käännettiin automaattisesti, eikä käännösten tarkkuutta voida taata. Katso englanninkielinen versio lähdetekstiä varten.

Implantaation reseptiivisuuden kvantitatiivinen tunnistaminen yksisoluisen transkription analyysillä

tiistai 21. maaliskuuta 2017 päivittänyt: Carlos Simon, Igenomix

Ei-invasiivinen transkriptominen allekirjoitus yhden solun tasolla kohdun limakalvon nesteessä uudenlaisena diagnostisena testinä ihmisen kohdun limakalvon vastaanottokyvystä

Tämän projektin tavoitteena on tutkia kohdun limakalvon transkriptiota yksisolutasolla sekä kohdun limakalvon alkuperäiskudoksessa (biopsiat) että kohdun limakalvon nesteessä. Pohjimmiltaan tavoitteet ovat: 1) Yksisoluisen RNA-seq:n tarjoaman resoluution käyttäminen endometriumin transkription reaaliaikaisen dynamiikan purkamiseen koko kuukautiskierron ajan tunnetun populaation heterogeenisyyden aiheuttamista artefakteista ja 2) endometriumin nesteen käyttö endometriumin korvaamiseen. biopsiat signaalilähteenä uuden diagnostisen alustan kehittämiseksi endometriumin vastaanottavan tilan määrittämiseksi, joka on korkearesoluutioinen ja minimaalisesti invasiivinen. Tämä tutkimus tarjoaa ennennäkemättömän korkearesoluutioisen luonnehdinnan kohdun limakalvon soluhierarkialle koko transkriptianalyysin avulla koko kuukautisvaiheen aikana. Nämä tulokset johtavat vaiheen määrittelevien geenien ilmentymisen allekirjoitusten vankkaan määritelmään ja ratkaisevat pitkäaikaisista kudostutkimuksista johtuvat epäjohdonmukaisuudet. Aineistoa tutkitaan edelleen informatiikan työkalujen avulla, jotta saadaan biologisia näkemyksiä kohdun limakalvon dynamiikasta ja luodaan uusia ankkuripisteitä toiminnallisille tutkimuksille.

Tutkimuksen yleiskatsaus

Yksityiskohtainen kuvaus

Onnistuneet alkion implantaatiot koeputkihedelmöitystä varten edellyttävät sekä terveitä alkioita että vastaanottavaa endometriumia. Implantaatioikkuna (WOI), jonka aikana kohdun limakalvo saavuttaa vastaanottavan tilan, vaihtelee yksilöiden välillä. WOI:n siirtymien on raportoitu olevan suurin syy toistuviin implantaatiovirheisiin. Luotettava diagnostinen mittari endometriumin reseptiivisen tilan arvioimiseksi puuttuu kuitenkin. Tämän tutkimuksen ehdotuksena on käyttää yksisoluisen RNA-sekvenssin ja bioinformatiikan työkaluja korkearesoluutioisen alustan kehittämiseen kohdun limakalvon toiminnan karakterisoimiseksi ja kohdun limakalvon reseptiivisen tilan mittaamiseksi ei-invasiivisella tavalla.

Ensimmäinen tavoite on kehittää kokeellinen putkilinja korkealaatuisten yksisoluisten RNA-seq-tietojen tuottamiseksi terveiden potilaiden kohdun limakalvon biopsioista ja kohdun limakalvon nesteestä koko kuukautiskierron aikana kussakin näistä vaiheista: varhainen proliferatiivinen (EP; päivät 0-8), myöhäinen proliferatiivinen (LP; päivät 9-14), varhainen eritys (ES; päivät 15-18), puolivälissä eritys tai vastaanottava (MS; päivät 19-23) ja myöhäinen eritys (LS; päivät 24-30). Nämä kudokset dissosioidaan mekaanisesti ja entsymaattisesti ja alistetaan mikrofluidilajittelulle, yksisoluisen transkription amplifikaatiolle ja analyysille. Nämä tiedot tarjoavat ensimmäiset transkription laajuiset yksittäissolutiedot, jotka koskevat ihmisen endometriumin eri solutyyppejä.

Toiseksi tässä tutkimuksessa tarkastellaan algoritmisten mallien luomista epiteeli- ja stroomapopulaatioiden erottamiseksi informaattisesti ilman tarvetta puhdistaa ensin kiinnostavia populaatioita. Tämä mahdollistaa transkriptioanalyysin solujen sekapopulaatioista.

Lopuksi arvioidaan kohdun limakalvon nesteen käyttöä vaihtoehtoisena lähteenä vastaanottavuusdiagnoosissa analysoimalla yksittäisten solujen transkriptioprofiilia kohdun limakalvon nesteestä, joka on kerätty ihmispotilailta kuukautisten eri vaiheissa. Näitä allekirjoituksia myös verrataan ja korreloidaan biopsioista saatujen allekirjoitusten kanssa, mikä auttaa meitä ymmärtämään paremmin biologisia tapahtumia, jotka johtavat näiden solujen esiintymiseen kohdun limakalvon nesteessä, ja arvioimaan mahdollisuuksia laajentaa niiden käyttöä muiden kohdun limakalvon sairauksien diagnosoinnissa.

Opintotyyppi

Interventio

Ilmoittautuminen (Odotettu)

70

Vaihe

  • Ei sovellettavissa

Osallistumiskriteerit

Tutkijat etsivät ihmisiä, jotka sopivat tiettyyn kuvaukseen, jota kutsutaan kelpoisuuskriteereiksi. Joitakin esimerkkejä näistä kriteereistä ovat henkilön yleinen terveydentila tai aiemmat hoidot.

Kelpoisuusvaatimukset

Opintokelpoiset iät

18 vuotta - 35 vuotta (AIKUINEN)

Hyväksyy terveitä vapaaehtoisia

Joo

Sukupuolet, jotka voivat opiskella

Nainen

Kuvaus

Sisällyttämiskriteerit:

  • Terveet naiset luonnollisessa kierrossa;
  • Normaali karyotyyppi;
  • Negatiiviset serologiset testit HIV:lle, HBV:lle, HCV:lle, RPR:lle;
  • BMI: 18 - 30 kg/m2 (molemmat mukana);
  • Naiset, joilla on säännöllinen kuukautiskierto (3-4/28-30 päivää).

Poissulkemiskriteerit:

  • Potilaat, joilla oli ollut kohdunsisäinen laite viimeisten 3 kuukauden aikana;
  • Potilaat, jotka ovat käyttäneet hormonaalista ehkäisyä viimeisten 2 kuukauden aikana;
  • Adnexaaliset tai kohdun patologiat;
  • munasarjojen monirakkulat;
  • Mikä tahansa epävakaa sairaus tai lääketieteellinen tila, joka voi häiritä tutkimusta tai vaarantaa potilaan terveyden (tutkimusryhmän päätutkijan arvioima);
  • Mikä tahansa sairaus tai lääketieteellinen epävakaa tila.

Opintosuunnitelma

Tässä osiossa on tietoja tutkimussuunnitelmasta, mukaan lukien kuinka tutkimus on suunniteltu ja mitä tutkimuksella mitataan.

Miten tutkimus on suunniteltu?

Suunnittelun yksityiskohdat

  • Ensisijainen käyttötarkoitus: BASIC_SCIENCE
  • Jako: EI_SATUNNAISTUJA
  • Inventiomalli: RISTO
  • Naamiointi: EI MITÄÄN

Aseet ja interventiot

Osallistujaryhmä / Arm
Interventio / Hoito
ACTIVE_COMPARATOR: Luonnollinen kiertokulku

Endometriumin biopsiat ja kohdun limakalvon nesteet, jotka on saatu terveiltä naisilta kuukautiskierron aikana kussakin näistä vaiheista:

Varhainen proliferatiivinen (EP; päivät 0–8), myöhäinen proliferatiivinen (LP; päivät 9–14), varhainen eritys (ES; päivät 15–18), puolivälissä erittyvä tai vastaanottava (MS; päivät 19–23) ja myöhäinen eritys (LS; päivät 24-30)

ACTIVE_COMPARATOR: ERA hormonikorvaussyklissä
Endometriumin biopsia ja kohdun limakalvon neste, joka on otettu hormonaalisen korvaushoidon (HRT) syklissä endometriaalisen reseptiivisyysanalyysin (ERA) läpikäyvältä naiselta.

Mitä tutkimuksessa mitataan?

Ensisijaiset tulostoimenpiteet

Tulosmittaus
Aikaikkuna
Endometriumnäytteiden transkriptominen profiilianalyysi RNA-sekvensoinnilla.
Aikaikkuna: 24 kuukautta
24 kuukautta

Yhteistyökumppanit ja tutkijat

Täältä löydät tähän tutkimukseen osallistuvat ihmiset ja organisaatiot.

Sponsori

Yhteistyökumppanit

Opintojen ennätyspäivät

Nämä päivämäärät seuraavat ClinicalTrials.gov-sivustolle lähetettyjen tutkimustietueiden ja yhteenvetojen edistymistä. National Library of Medicine (NLM) tarkistaa tutkimustiedot ja raportoidut tulokset varmistaakseen, että ne täyttävät tietyt laadunvalvontastandardit, ennen kuin ne julkaistaan ​​julkisella verkkosivustolla.

Opi tärkeimmät päivämäärät

Opiskelun aloitus

Tiistai 1. maaliskuuta 2016

Ensisijainen valmistuminen (ODOTETTU)

Perjantai 1. joulukuuta 2017

Opintojen valmistuminen (ODOTETTU)

Lauantai 1. joulukuuta 2018

Opintoihin ilmoittautumispäivät

Ensimmäinen lähetetty

Tiistai 30. elokuuta 2016

Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit

Tiistai 21. maaliskuuta 2017

Ensimmäinen Lähetetty (TODELLINEN)

Maanantai 27. maaliskuuta 2017

Tutkimustietojen päivitykset

Viimeisin päivitys julkaistu (TODELLINEN)

Maanantai 27. maaliskuuta 2017

Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit

Tiistai 21. maaliskuuta 2017

Viimeksi vahvistettu

Keskiviikko 1. maaliskuuta 2017

Lisää tietoa

Tähän tutkimukseen liittyvät termit

Muita asiaankuuluvia MeSH-ehtoja

Muut tutkimustunnusnumerot

  • 1603-IGX-016-CS

Yksittäisten osallistujien tietojen suunnitelma (IPD)

Aiotko jakaa yksittäisten osallistujien tietoja (IPD)?

EI

Nämä tiedot haettiin suoraan verkkosivustolta clinicaltrials.gov ilman muutoksia. Jos sinulla on pyyntöjä muuttaa, poistaa tai päivittää tutkimustietojasi, ota yhteyttä register@clinicaltrials.gov. Heti kun muutos on otettu käyttöön osoitteessa clinicaltrials.gov, se päivitetään automaattisesti myös verkkosivustollemme .

Tilaa