Tato stránka byla automaticky přeložena a přesnost překladu není zaručena. Podívejte se prosím na anglická verze pro zdrojový text.

Kvantitativní identifikace vnímavosti implantace analýzou transkriptomu jedné buňky

21. března 2017 aktualizováno: Carlos Simon, Igenomix

Neinvazivní transkriptomický podpis na úrovni jedné buňky v endometriální tekutině jako nový diagnostický test lidské endometriální vnímavosti

Tento projekt si klade za cíl studovat endometriální transkriptom na úrovni jednotlivých buněk jak v endometriální nativní tkáni (biopsie), tak v endometriální tekutině. V zásadě jde o tyto cíle: 1) použít rozlišení poskytované jednobuněčnou RNA-seq k dekonvoluci dynamiky transkriptomu endometria v reálném čase během menstruačního cyklu z artefaktů produkovaných známou heterogenitou populace a 2) použít endometriální tekutinu k nahrazení endometria biopsie jako zdroj signálu pro vývoj nové diagnostické platformy pro stanovení receptivního stavu endometria, která je s vysokým rozlišením a minimálně invazivní. Tato studie poskytne bezprecedentní charakterizaci buněčné hierarchie endometria ve vysokém rozlišení prostřednictvím analýzy celého transkriptomu v průběhu menstruačních fází. Tyto výsledky povedou k robustní definici signatur genové exprese definujících stádium a vyřeší dlouhotrvající nesrovnalosti pocházející ze studií objemových tkání. Soubor dat bude dále prozkoumán pomocí nástrojů informatiky, aby poskytl biologický pohled na dynamiku endometria a inicioval nové kotevní body pro funkční studie.

Přehled studie

Postavení

Neznámý

Podmínky

Intervence / Léčba

Detailní popis

Úspěšné implantace embryí pro in vitro fertilizaci vyžadují jak zdravá embrya, tak receptivní endometrium. Okno implantace (WOI), během kterého endometrium dosáhne receptivního stavu, se u jednotlivců liší. Bylo hlášeno, že posuny WOI jsou hlavní příčinou opakovaných selhání implantace. Chybí však spolehlivá diagnostická metrika pro hodnocení receptivního stavu endometria. Cílem této studie je použít jednobuněčné RNA seq a bioinformatické nástroje k vývoji platformy s vysokým rozlišením pro charakterizaci aktivit endometria a měření receptivního stavu endometria neinvazivním způsobem.

Prvním cílem je vyvinout experimentální potrubí pro generování vysoce kvalitních jednobuněčných RNA-seq dat z endometriálních biopsií a endometriální tekutiny od zdravých pacientek v průběhu menstruačního cyklu v každé z těchto fází: časně proliferativní (EP; dny 0-8), pozdní proliferativní (LP; 9.-14. den), časně sekreční (ES; 15.-18. den), středně sekreční nebo receptivní (MS; 19.-23. den) a pozdní sekreční (LS; 24.-30. den). Tyto tkáně budou disociovány mechanicky a enzymaticky a podrobeny mikrofluidnímu třídění, amplifikaci a analýze jednobuněčného transkriptomu. Tato data poskytnou první jednobuněčná data pro celý transkriptom různých typů buněk lidského endometria.

Za druhé, tato studie se zabývá vytvořením algoritmických modelů pro informatické rozlišení epiteliálních a stromálních populací, aniž by bylo nutné nejprve purifikovat sledované populace. To umožní transkriptomovou analýzu ze smíšených populací buněk.

Nakonec zhodnoťte použití endometriální tekutiny jako alternativního zdroje pro diagnostiku receptivity analýzou transkriptomového profilu jednotlivých buněk z endometriální tekutiny odebrané lidským pacientkám v různých menstruačních fázích. Tyto signatury budou také porovnány a korelovány s signaturami získanými z biopsií, což nám pomůže lépe porozumět biologickým událostem, které vedou k výskytu těchto buněk v endometriální tekutině, a vyhodnotit potenciál rozšíření jejich použití pro diagnostiku dalších stavů endometria.

Typ studie

Intervenční

Zápis (Očekávaný)

70

Fáze

  • Nelze použít

Kritéria účasti

Výzkumníci hledají lidi, kteří odpovídají určitému popisu, kterému se říká kritéria způsobilosti. Některé příklady těchto kritérií jsou celkový zdravotní stav osoby nebo předchozí léčba.

Kritéria způsobilosti

Věk způsobilý ke studiu

18 let až 35 let (DOSPĚLÝ)

Přijímá zdravé dobrovolníky

Ano

Pohlaví způsobilá ke studiu

Ženský

Popis

Kritéria pro zařazení:

  • Zdravé ženy v přirozeném cyklu;
  • Normální karyotyp;
  • Negativní sérologické testy na HIV, HBV, HCV, RPR;
  • BMI: 18 - 30 Kg/m2 (oba včetně);
  • Ženy s pravidelným menstruačním cyklem (3-4/28-30 dní).

Kritéria vyloučení:

  • Pacientky, které měly v předchozích 3 měsících nitroděložní tělísko;
  • Pacienti, kteří v předchozích 2 měsících užívali hormonální antikoncepci;
  • Adnexální nebo děložní patologie;
  • Polycystický vaječník;
  • Jakékoli nestabilní onemocnění nebo zdravotní stav, který by mohl narušit studii nebo ohrozit zdraví pacienta (vyhodnoceno hlavním výzkumníkem výzkumného týmu);
  • Jakákoli nemoc nebo zdravotní nestabilní stav.

Studijní plán

Tato část poskytuje podrobnosti o studijním plánu, včetně toho, jak je studie navržena a co studie měří.

Jak je studie koncipována?

Detaily designu

  • Primární účel: ZÁKLADNÍ_VĚDA
  • Přidělení: NON_RANDOMIZED
  • Intervenční model: CROSSOVER
  • Maskování: ŽÁDNÝ

Zbraně a zásahy

Skupina účastníků / Arm
Intervence / Léčba
ACTIVE_COMPARATOR: Přírodní koloběh

Endometriální biopsie a endometriální tekutina získaná od zdravých žen během menstruačního cyklu v každé z těchto fází:

Časně proliferativní (EP; dny 0-8), pozdní proliferativní (LP; dny 9-14), časně sekreční (ES; dny 15-18), středně sekreční nebo receptivní (MS; dny 19-23) a pozdní sekrece (LS; dny 24-30)
Postup: Endometriální biopsie a odběr endometriální tekutiny
ACTIVE_COMPARATOR: ERA v cyklu HRT
Endometriální biopsie a endometriální tekutina získaná od ženy podstupující analýzu endometriální receptivity (ERA) v cyklu hormonální substituční terapie (HRT).
Postup: Endometriální biopsie a odběr endometriální tekutiny

Co je měření studie?

Primární výstupní opatření

Měření výsledku
Časové okno
Analýza transkriptomického profilu vzorků endometria sekvenováním RNA.
Časové okno: 24 měsíců
24 měsíců

Spolupracovníci a vyšetřovatelé

Zde najdete lidi a organizace zapojené do této studie.

Sponzor

Igenomix

Spolupracovníci

Stanford University

Termíny studijních záznamů

Tato data sledují průběh záznamů studie a předkládání souhrnných výsledků na ClinicalTrials.gov. Záznamy ze studií a hlášené výsledky jsou před zveřejněním na veřejné webové stránce přezkoumány Národní lékařskou knihovnou (NLM), aby se ujistily, že splňují specifické standardy kontroly kvality.

Hlavní termíny studia

Začátek studia

1. března 2016

Primární dokončení (OČEKÁVANÝ)

1. prosince 2017

Dokončení studie (OČEKÁVANÝ)

1. prosince 2018

Termíny zápisu do studia

První předloženo

30. srpna 2016

První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality

21. března 2017

První zveřejněno (AKTUÁLNÍ)

27. března 2017

Aktualizace studijních záznamů

Poslední zveřejněná aktualizace (AKTUÁLNÍ)

27. března 2017

Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality

21. března 2017

Naposledy ověřeno

1. března 2017

Více informací

Termíny související s touto studií

Klíčová slova

Další relevantní podmínky MeSH

Další identifikační čísla studie

  • 1603-IGX-016-CS

Plán pro data jednotlivých účastníků (IPD)

Plánujete sdílet data jednotlivých účastníků (IPD)?

NE

Tyto informace byly beze změn načteny přímo z webu clinicaltrials.gov. Máte-li jakékoli požadavky na změnu, odstranění nebo aktualizaci podrobností studie, kontaktujte prosím register@clinicaltrials.gov. Jakmile bude změna implementována na clinicaltrials.gov, bude automaticky aktualizována i na našem webu .

Předplatit