Ta strona została przetłumaczona automatycznie i dokładność tłumaczenia nie jest gwarantowana. Proszę odnieść się do angielska wersja za tekst źródłowy.

Ilościowa identyfikacja podatności implantacji za pomocą analizy transkryptomu pojedynczej komórki

21 marca 2017 zaktualizowane przez: Carlos Simon, Igenomix

Nieinwazyjna sygnatura transkryptomiczna na poziomie pojedynczej komórki w płynie endometrialnym jako nowy test diagnostyczny receptywności ludzkiego endometrium

Projekt ten ma na celu zbadanie transkryptomu endometrium na poziomie pojedynczej komórki zarówno w natywnej tkance endometrium (biopsje), jak iw płynie endometrialnym. Zasadniczo cele są następujące: 1) Wykorzystanie rozdzielczości zapewnianej przez sekwencję RNA pojedynczej komórki do dekonwolucji dynamiki w czasie rzeczywistym w transkryptomie endometrium w całym cyklu menstruacyjnym z artefaktów wytwarzanych przez znaną heterogeniczność populacji oraz 2) Wykorzystanie płynu endometrium do zastąpienia endometrium biopsje jako źródło sygnału w celu opracowania nowej platformy diagnostycznej do określania stanu receptywnego endometrium, która charakteryzuje się wysoką rozdzielczością i minimalnie inwazyjnością. Badanie to zapewni bezprecedensową charakterystykę hierarchii komórkowej endometrium w wysokiej rozdzielczości poprzez analizę całego transkryptomu na wszystkich etapach menstruacji. Wyniki te doprowadzą do solidnej definicji sygnatur ekspresji genów definiujących etapy i rozwiążą długotrwałe niespójności wynikające z badań tkanek masowych. Zbiór danych będzie dalej badany za pomocą narzędzi informatycznych, aby zapewnić biologiczny wgląd w dynamikę endometrium i zapoczątkować nowe punkty zaczepienia dla badań funkcjonalnych.

Przegląd badań

Szczegółowy opis

Pomyślne implantacje zarodków do zapłodnienia in vitro wymagają zarówno zdrowych zarodków, jak i receptywnego endometrium. Okno implantacji (WOI), podczas którego endometrium osiąga stan receptywny, jest różne u poszczególnych osób. Zgłaszano, że przemieszczenia WOI są główną przyczyną powtarzających się niepowodzeń implantacji. Brakuje jednak wiarygodnych wskaźników diagnostycznych do oceny stanu receptywności endometrium. Propozycja tego badania polega na wykorzystaniu jednokomórkowych narzędzi seq RNA i narzędzi bioinformatycznych do opracowania platformy o wysokiej rozdzielczości do charakteryzowania aktywności endometrium i do pomiaru stanu receptywnego endometrium w sposób nieinwazyjny.

Pierwszym celem jest opracowanie eksperymentalnego rurociągu do generowania wysokiej jakości danych seq pojedynczych komórek RNA z biopsji endometrium i płynu endometrium od zdrowych pacjentek w całym cyklu menstruacyjnym na każdym z tych etapów: wczesnej proliferacji (EP; dni 0-8), późnej proliferacyjne (LP; dni 9-14), wczesne wydzielanie (ES; dni 15-18), średnie wydzielanie lub receptywne (MS; dni 19-23) i późne wydzielanie (LS; dni 24-30). Tkanki te zostaną zdysocjowane mechanicznie i enzymatycznie oraz poddane sortowaniu mikroprzepływowemu, amplifikacji transkryptomu pojedynczej komórki i analizie. Dane te dostarczą pierwszych danych dotyczących pojedynczych komórek obejmujących cały transkryptom, różnych typów komórek ludzkiego endometrium.

Po drugie, badanie to ma na celu ustanowienie modeli algorytmicznych w celu informacyjnego rozróżnienia populacji nabłonka i zrębu, bez konieczności uprzedniego oczyszczania populacji będących przedmiotem zainteresowania. Umożliwi to analizę transkryptomu z mieszanych populacji komórek.

Na koniec oceń wykorzystanie płynu endometrialnego jako alternatywnego źródła do diagnozy receptywności, analizując profil transkryptomu pojedynczych komórek z płynu endometrialnego pobranego od pacjentek będących ludźmi na różnych etapach menstruacji. Sygnatury te zostaną również porównane i skorelowane z sygnaturami uzyskanymi z biopsji, co pozwoli nam lepiej zrozumieć zdarzenia biologiczne prowadzące do pojawienia się tych komórek w płynie endometrialnym i ocenić potencjał rozszerzenia ich zastosowania do diagnostyki innych chorób endometrium.

Typ studiów

Interwencyjne

Zapisy (Oczekiwany)

70

Faza

  • Nie dotyczy

Kryteria uczestnictwa

Badacze szukają osób, które pasują do określonego opisu, zwanego kryteriami kwalifikacyjnymi. Niektóre przykłady tych kryteriów to ogólny stan zdrowia danej osoby lub wcześniejsze leczenie.

Kryteria kwalifikacji

Wiek uprawniający do nauki

18 lat do 35 lat (DOROSŁY)

Akceptuje zdrowych ochotników

Tak

Płeć kwalifikująca się do nauki

Kobieta

Opis

Kryteria przyjęcia:

  • Zdrowe kobiety w naturalnym cyklu;
  • Normalny kariotyp;
  • Negatywne testy serologiczne w kierunku HIV, HBV, HCV, RPR;
  • BMI: 18 - 30 kg/m2 (oba uwzględnione);
  • Kobiety z regularnym cyklem miesiączkowym (3-4/28-30 dni).

Kryteria wyłączenia:

  • Pacjentki, które nosiły wkładkę wewnątrzmaciczną w ciągu ostatnich 3 miesięcy;
  • pacjentki, które stosowały hormonalne środki antykoncepcyjne w ciągu ostatnich 2 miesięcy;
  • Patologie przydatków lub macicy;
  • jajnik policystyczny;
  • Jakakolwiek niestabilna choroba lub stan chorobowy, który mógłby zakłócić badanie lub zagrozić zdrowiu pacjenta (oceniony przez głównego badacza zespołu badawczego);
  • Jakakolwiek choroba lub niestabilny stan zdrowia.

Plan studiów

Ta sekcja zawiera szczegółowe informacje na temat planu badania, w tym sposób zaprojektowania badania i jego pomiary.

Jak projektuje się badanie?

Szczegóły projektu

  • Główny cel: PODSTAWOWA NAUKA
  • Przydział: NIE_RANDOMIZOWANE
  • Model interwencyjny: KRZYŻOWANIE
  • Maskowanie: NIC

Broń i interwencje

Grupa uczestników / Arm
Interwencja / Leczenie
ACTIVE_COMPARATOR: Naturalny cykl

Biopsje endometrium i płyn endometrium pobrane od zdrowych kobiet w trakcie cyklu miesiączkowego na każdym z tych etapów:

Wczesna proliferacja (EP; dni 0-8), późna proliferacja (LP; dni 9-14), wczesna sekrecja (ES; dni 15-18), środkowa sekrecja lub receptywność (MS; dni 19-23) i późna sekrecja (LS; dni 24-30)

ACTIVE_COMPARATOR: ERA w cyklu HTZ
Biopsja endometrium i płyn endometrialny pobrany od kobiety poddawanej analizie receptywności endometrium (ERA) w cyklu hormonalnej terapii zastępczej (HTZ).

Co mierzy badanie?

Podstawowe miary wyniku

Miara wyniku
Ramy czasowe
Analiza profilu transkryptomicznego próbek endometrium metodą sekwencjonowania RNA.
Ramy czasowe: 24 miesiące
24 miesiące

Współpracownicy i badacze

Tutaj znajdziesz osoby i organizacje zaangażowane w to badanie.

Sponsor

Współpracownicy

Daty zapisu na studia

Daty te śledzą postęp w przesyłaniu rekordów badań i podsumowań wyników do ClinicalTrials.gov. Zapisy badań i zgłoszone wyniki są przeglądane przez National Library of Medicine (NLM), aby upewnić się, że spełniają określone standardy kontroli jakości, zanim zostaną opublikowane na publicznej stronie internetowej.

Główne daty studiów

Rozpoczęcie studiów

1 marca 2016

Zakończenie podstawowe (OCZEKIWANY)

1 grudnia 2017

Ukończenie studiów (OCZEKIWANY)

1 grudnia 2018

Daty rejestracji na studia

Pierwszy przesłany

30 sierpnia 2016

Pierwszy przesłany, który spełnia kryteria kontroli jakości

21 marca 2017

Pierwszy wysłany (RZECZYWISTY)

27 marca 2017

Aktualizacje rekordów badań

Ostatnia wysłana aktualizacja (RZECZYWISTY)

27 marca 2017

Ostatnia przesłana aktualizacja, która spełniała kryteria kontroli jakości

21 marca 2017

Ostatnia weryfikacja

1 marca 2017

Więcej informacji

Terminy związane z tym badaniem

Dodatkowe istotne warunki MeSH

Inne numery identyfikacyjne badania

  • 1603-IGX-016-CS

Plan dla danych uczestnika indywidualnego (IPD)

Planujesz udostępniać dane poszczególnych uczestników (IPD)?

NIE

Te informacje zostały pobrane bezpośrednio ze strony internetowej clinicaltrials.gov bez żadnych zmian. Jeśli chcesz zmienić, usunąć lub zaktualizować dane swojego badania, skontaktuj się z register@clinicaltrials.gov. Gdy tylko zmiana zostanie wprowadzona na stronie clinicaltrials.gov, zostanie ona automatycznie zaktualizowana również na naszej stronie internetowej .

Subskrybuj