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Identificazione quantitativa della ricettività all'impianto mediante analisi del trascrittoma a singola cellula

21 marzo 2017 aggiornato da: Carlos Simon, Igenomix

Firma trascrittomica non invasiva a livello di singola cellula nel fluido endometriale come nuovo test diagnostico della ricettività endometriale umana

Questo progetto mira a studiare il trascrittoma endometriale a livello di singola cellula sia nel tessuto endometriale nativo (biopsie) che nel fluido endometriale. Fondamentalmente, gli obiettivi sono: 1) Utilizzare la risoluzione fornita dall'RNA-seq a cellula singola per deconvolure le dinamiche in tempo reale nel trascrittoma dell'endometrio durante tutto il ciclo mestruale dagli artefatti prodotti dall'eterogeneità nota della popolazione e 2) Utilizzare il fluido dell'endometrio per sostituire l'endometrio biopsie come fonte di segnale per sviluppare una nuova piattaforma diagnostica per determinare lo stato ricettivo dell'endometrio che è ad alta risoluzione e minimamente invasiva. Questo studio fornirà una caratterizzazione ad alta risoluzione senza precedenti della gerarchia cellulare dell'endometrio attraverso l'analisi dell'intero trascrittoma durante le fasi mestruali. Questi risultati porteranno a una solida definizione delle firme di espressione genica che definiscono lo stadio e risolveranno le incoerenze di lunga data originate dagli studi sui tessuti sfusi. Il set di dati sarà ulteriormente esplorato tramite strumenti informatici per fornire approfondimenti biologici sulla dinamica dell'endometrio e avviare nuovi punti di ancoraggio per gli studi funzionali.

Panoramica dello studio

Descrizione dettagliata

Gli impianti embrionali di successo per la fecondazione in vitro richiedono sia embrioni sani che un endometrio ricettivo. La finestra di impianto (WOI), durante la quale l'endometrio raggiunge lo stato ricettivo, varia da individuo a individuo. È stato riportato che gli spostamenti di WOI sono una delle principali cause di ripetuti fallimenti di impianto. Tuttavia, manca una metrica diagnostica affidabile per valutare lo stato ricettivo dell'endometrio. La proposta di questo studio è di utilizzare strumenti di bioinformatica e RNA a singola cellula per sviluppare una piattaforma ad alta risoluzione per caratterizzare le attività dell'endometrio e misurare lo stato ricettivo dell'endometrio in modo non invasivo.

Il primo obiettivo è sviluppare una pipeline sperimentale per generare dati RNA-seq a singola cellula di alta qualità da biopsie endometriali e fluido endometriale da pazienti sane durante il ciclo mestruale in ciascuna di queste fasi: proliferazione precoce (EP; giorni 0-8), ritardo proliferativo (LP; giorni 9-14), secretorio precoce (ES; giorni 15-18), secretorio medio o ricettivo (SM; giorni 19-23) e secretorio tardivo (LS; giorni 24-30). Questi tessuti saranno dissociati meccanicamente ed enzimaticamente e sottoposti a sorting microfluidico, amplificazione e analisi del trascrittoma di singola cellula. Questi dati forniranno i primi dati di una singola cellula a livello di trascrittoma su vari tipi di cellule dell'endometrio umano.

In secondo luogo, questo studio cerca di stabilire modelli algoritmici per distinguere le popolazioni epiteliali e stromali in modo informatico, senza la necessità di purificare prima le popolazioni di interesse. Ciò consentirà l'analisi del trascrittoma da popolazioni miste di cellule.

Infine valutare l'uso del fluido endometriale come fonte alternativa per la diagnosi di ricettività analizzando il profilo del trascrittoma di singole cellule dal fluido endometriale raccolto da pazienti umani in diverse fasi mestruali. Queste firme saranno anche confrontate e correlate con le firme ottenute dalle biopsie, che ci aiuteranno a comprendere meglio gli eventi biologici che portano alla comparsa di queste cellule nel fluido endometriale e valutare il potenziale di estendere il loro uso per la diagnosi di altre condizioni dell'endometrio.

Tipo di studio

Interventistico

Iscrizione (Anticipato)

70

Fase

  • Non applicabile

Criteri di partecipazione

I ricercatori cercano persone che corrispondano a una certa descrizione, chiamata criteri di ammissibilità. Alcuni esempi di questi criteri sono le condizioni generali di salute di una persona o trattamenti precedenti.

Criteri di ammissibilità

Età idonea allo studio

Da 18 anni a 35 anni (ADULTO)

Accetta volontari sani

Sessi ammissibili allo studio

Femmina

Descrizione

Criterio di inclusione:

  • Donne sane nel ciclo naturale;
  • Cariotipo normale;
  • Test sierologici negativi per HIV, HBV, HCV, RPR;
  • BMI: 18 - 30 Kg/m2 (entrambi inclusi);
  • Donne con ciclo mestruale regolare (3-4/28-30 giorni).

Criteri di esclusione:

  • Pazienti che avevano portato un dispositivo intrauterino nei 3 mesi precedenti;
  • Pazienti che hanno assunto contraccettivi ormonali nei 2 mesi precedenti;
  • Patologie annessiali o uterine;
  • Ovaio policistico;
  • Qualsiasi malattia o condizione medica instabile che possa interferire con lo studio o mettere a rischio la salute del paziente (valutata dal ricercatore principale del gruppo di ricerca);
  • Qualsiasi malattia o condizione medica instabile.

Piano di studio

Questa sezione fornisce i dettagli del piano di studio, compreso il modo in cui lo studio è progettato e ciò che lo studio sta misurando.

Come è strutturato lo studio?

Dettagli di progettazione

  • Scopo principale: SCIENZA BASILARE
  • Assegnazione: NON_RANDOMIZZATO
  • Modello interventistico: INCROCIO
  • Mascheramento: NESSUNO

Armi e interventi

Gruppo di partecipanti / Arm
Intervento / Trattamento
ACTIVE_COMPARATORE: Ciclo naturale

Biopsie endometriali e fluido endometriale ottenuti da femmine sane durante tutto il ciclo mestruale in ciascuna di queste fasi:

Proliferante precoce (EP; giorni 0-8), proliferativo tardivo (LP; giorni 9-14), secretorio precoce (ES; giorni 15-18), secretorio medio o ricettivo (SM; giorni 19-23) e secretorio tardivo (LS; giorni 24-30)

ACTIVE_COMPARATORE: ERA nel ciclo HRT
Biopsia endometriale e liquido endometriale ottenuti da donna sottoposta ad analisi della ricettività endometriale (ERA) in un ciclo di terapia ormonale sostitutiva (HRT).

Cosa sta misurando lo studio?

Misure di risultato primarie

Misura del risultato
Lasso di tempo
Analisi del profilo trascrittomico dei campioni endometriali mediante sequenziamento dell'RNA.
Lasso di tempo: 24 mesi
24 mesi

Collaboratori e investigatori

Qui è dove troverai le persone e le organizzazioni coinvolte in questo studio.

Sponsor

Collaboratori

Studiare le date dei record

Queste date tengono traccia dell'avanzamento della registrazione dello studio e dell'invio dei risultati di sintesi a ClinicalTrials.gov. I record degli studi e i risultati riportati vengono esaminati dalla National Library of Medicine (NLM) per assicurarsi che soddisfino specifici standard di controllo della qualità prima di essere pubblicati sul sito Web pubblico.

Studia le date principali

Inizio studio

1 marzo 2016

Completamento primario (ANTICIPATO)

1 dicembre 2017

Completamento dello studio (ANTICIPATO)

1 dicembre 2018

Date di iscrizione allo studio

Primo inviato

30 agosto 2016

Primo inviato che soddisfa i criteri di controllo qualità

21 marzo 2017

Primo Inserito (EFFETTIVO)

27 marzo 2017

Aggiornamenti dei record di studio

Ultimo aggiornamento pubblicato (EFFETTIVO)

27 marzo 2017

Ultimo aggiornamento inviato che soddisfa i criteri QC

21 marzo 2017

Ultimo verificato

1 marzo 2017

Maggiori informazioni

Termini relativi a questo studio

Termini MeSH pertinenti aggiuntivi

Altri numeri di identificazione dello studio

  • 1603-IGX-016-CS

Piano per i dati dei singoli partecipanti (IPD)

Hai intenzione di condividere i dati dei singoli partecipanti (IPD)?

NO

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