Quantitative Identifizierung der Implantationsrezeptivität durch Einzelzell-Transkriptomanalyse

Erfolgreiche Embryoimplantationen für die In-vitro-Fertilisation erfordern sowohl gesunde Embryonen als auch ein aufnahmefähiges Endometrium. Das Implantationsfenster (WOI), während dessen das Endometrium den rezeptiven Zustand erreicht, variiert von Person zu Person. Es wurde berichtet, dass Verschiebungen von WOI eine Hauptursache für wiederholte Implantationsfehler sind. Es fehlt jedoch eine zuverlässige diagnostische Metrik zur Beurteilung des rezeptiven Status des Endometriums. Der Vorschlag dieser Studie ist es, Einzelzell-RNA-Seq- und Bioinformatik-Tools zu verwenden, um eine hochauflösende Plattform zu entwickeln, um Endometriumaktivitäten zu charakterisieren und den rezeptiven Zustand des Endometriums auf nicht-invasive Weise zu messen.

Das erste Ziel ist die Entwicklung einer experimentellen Pipeline zur Generierung hochwertiger Einzelzell-RNA-seq-Daten aus Endometriumbiopsien und Endometriumflüssigkeit von gesunden Patientinnen während des gesamten Menstruationszyklus in jedem dieser Stadien: früh proliferativ (EP; Tage 0-8), spät proliferativ (LP; Tage 9–14), früh sekretorisch (ES; Tage 15–18), mittelsekretorisch oder rezeptiv (MS; Tage 19–23) und spät sekretorisch (LS; Tage 24–30). Diese Gewebe werden mechanisch und enzymatisch dissoziiert und einer mikrofluidischen Sortierung, Einzelzell-Transkriptom-Amplifikation und Analyse unterzogen. Diese Daten werden die ersten transkriptomweiten Einzelzelldaten verschiedener Zelltypen des menschlichen Endometriums liefern.

Zweitens befasst sich diese Studie mit etablierten algorithmischen Modellen zur informellen Unterscheidung von Epithel- und Stromapopulationen, ohne dass zuerst interessierende Populationen gereinigt werden müssen. Dies wird eine Transkriptomanalyse aus gemischten Zellpopulationen ermöglichen.

Bewerten Sie abschließend die Verwendung von Endometriumflüssigkeit als alternative Quelle für die Diagnose der Empfänglichkeit, indem Sie das Transkriptomprofil einzelner Zellen aus Endometriumflüssigkeit analysieren, die von menschlichen Patienten in verschiedenen Menstruationsstadien gesammelt wurden. Diese Signaturen werden auch mit aus Biopsien gewonnenen Signaturen verglichen und korreliert, was uns helfen wird, die biologischen Ereignisse, die zum Auftreten dieser Zellen in der Endometriumflüssigkeit führen, besser zu verstehen und das Potenzial einer Ausweitung ihrer Verwendung für die Diagnose anderer Endometriumerkrankungen zu bewerten.