Количественная идентификация восприимчивости к имплантации с помощью анализа транскриптома отдельных клеток

Успешная имплантация эмбрионов для экстракорпорального оплодотворения требует как здоровых эмбрионов, так и рецептивного эндометрия. Окно имплантации (WOI), в течение которого эндометрий достигает рецептивного состояния, варьируется у разных людей. Сообщалось, что смещения WOI являются основной причиной повторяющихся неудач при имплантации. Тем не менее, отсутствует надежный диагностический показатель для оценки рецептивного статуса эндометрия. Предложение этого исследования состоит в том, чтобы использовать секвенирование одноклеточной РНК и инструменты биоинформатики для разработки платформы с высоким разрешением для характеристики активности эндометрия и измерения состояния рецептивности эндометрия неинвазивным способом.

Первая цель состоит в том, чтобы разработать экспериментальный конвейер для получения высококачественных данных секвенирования одноклеточной РНК из биоптатов эндометрия и эндометриальной жидкости здоровых пациенток в течение всего менструального цикла на каждой из следующих стадий: ранняя пролиферативная (ЭП; дни 0-8), поздняя пролиферативные (ПП; 9–14 дни), раннесекреторные (ПС; 15–18 дни), среднесекреторные или рецептивные (МС; 19–23 дни) и поздние секреторные (ПС; 24–30 дни). Эти ткани будут механически и ферментативно диссоциированы и подвергнуты микрожидкостной сортировке, амплификации и анализу транскриптома отдельных клеток. Эти данные обеспечат первые транскриптомные данные по отдельным клеткам различных типов клеток человеческого эндометрия.

Во-вторых, это исследование направлено на создание алгоритмических моделей для информативного различения популяций эпителия и стромы без необходимости предварительной очистки интересующих популяций. Это позволит проводить анализ транскриптома из смешанных популяций клеток.

Наконец, оцените использование жидкости эндометрия в качестве альтернативного источника для диагностики рецептивности, анализируя профиль транскриптома отдельных клеток из жидкости эндометрия, собранной у пациентов-людей на разных стадиях менструации. Эти сигнатуры также будут сравниваться и коррелироваться с сигнатурами, полученными при биопсии, что поможет нам лучше понять биологические события, которые приводят к появлению этих клеток в эндометриальной жидкости, и оценить потенциал расширения их использования для диагностики других состояний эндометрия.