Denne side blev automatisk oversat, og nøjagtigheden af ​​oversættelsen er ikke garanteret. Der henvises til engelsk version for en kildetekst.

Kvantitativ identifikation af implantationsreceptivitet ved enkeltcellet transkriptomanalyse

21. marts 2017 opdateret af: Carlos Simon, Igenomix

Ikke-invasiv transkriptomisk signatur på enkeltcelleniveau i endometrievæske som en ny diagnostisk test af human endometrie-receptivitet

Dette projekt har til formål at studere endometrietranskriptomet på enkeltcelleniveau i både endometrievæv (biopsier) og endometrievæske. Grundlæggende er målene: 1) At bruge opløsningen leveret af enkeltcellet RNA-seq til at deconvolute real-time dynamik i endometrium transkriptom gennem hele menstruationscyklussen fra artefakter produceret af kendt populationsheterogenitet, og 2) At bruge endometrium væske til at erstatte endometrium biopsier som signalkilde for at udvikle en ny diagnostisk platform til at bestemme endometriets modtagelige tilstand, som er høj opløsning og minimalt invasiv. Denne undersøgelse vil give en hidtil uset højopløsningskarakterisering af endometriums cellulære hierarki via hele transkriptomanalyse gennem menstruationsstadierne. Disse resultater vil føre til en robust definition af stadiedefinerende genekspressionssignaturer og løse de langvarige inkonsekvenser, der stammer fra bulkvævsundersøgelser. Datasættet vil blive yderligere udforsket via informatikværktøjer for at give biologisk indsigt i dynamikken i endometrium og initiere nye ankerpunkter for funktionelle undersøgelser.

Studieoversigt

Detaljeret beskrivelse

Vellykkede embryoimplantationer til in vitro fertilisering kræver både sunde embryoner og et receptivt endometrium. Vinduet for implantation (WOI), hvor endometrium når modtagelig tilstand, varierer mellem individer. Forskydninger af WOI er blevet rapporteret at være en væsentlig årsag til gentagne implantationsfejl. Der mangler imidlertid en pålidelig diagnostisk metrik til at evaluere endometrie-receptive status. Forslaget med denne undersøgelse er at bruge enkeltcellede RNA-seq og bioinformatiske værktøjer til at udvikle en højopløsningsplatform til at karakterisere endometriumaktiviteter og til at måle endometriets modtagelige tilstand på en ikke-invasiv måde.

Første mål er at udvikle en eksperimentel pipeline til at generere højkvalitets enkeltcellede RNA-seq-data fra endometriebiopsier og endometrievæske fra raske patienter gennem hele menstruationscyklussen på hvert af disse stadier: tidlig proliferativ (EP; dag 0-8), sent proliferativ (LP; dag 9-14), tidlig sekretorisk (ES; dag 15-18), mid-sekretorisk eller receptiv (MS; dag 19-23) og sen sekretorisk (LS; dag 24-30). Disse væv vil blive dissocieret mekanisk og enzymatisk og udsat for mikrofluidisk sortering, enkeltcellet transkriptom-amplifikation og analyse. Disse data vil give de første transkriptom-brede enkeltcelledata forskellige celletyper af det humane endometrium.

For det andet ser denne undersøgelse på etablering af algoritmiske modeller til at skelne epitel- og stroma-populationer informatisk uden behov for først at rense populationer af interesse. Dette vil muliggøre transkriptomanalyse fra blandede populationer af celler.

Evaluer endelig brugen af ​​endometrievæske som en alternativ kilde til receptivitetsdiagnose ved at analysere transkriptomprofilen af ​​enkeltceller fra endometrievæske indsamlet fra humane patienter i forskellige menstruationsstadier. Disse signaturer vil også blive sammenlignet og korreleret med signaturer opnået fra biopsier, hvilket vil hjælpe os med bedre at forstå de biologiske hændelser, der fører til forekomsten af ​​disse celler i endometrievæsken, og evaluere potentialet for at udvide deres anvendelse til diagnosticering af andre endometriumtilstande.

Undersøgelsestype

Interventionel

Tilmelding (Forventet)

70

Fase

  • Ikke anvendelig

Deltagelseskriterier

Forskere leder efter personer, der passer til en bestemt beskrivelse, kaldet berettigelseskriterier. Nogle eksempler på disse kriterier er en persons generelle helbredstilstand eller tidligere behandlinger.

Berettigelseskriterier

Aldre berettiget til at studere

18 år til 35 år (VOKSEN)

Tager imod sunde frivillige

Ja

Køn, der er berettiget til at studere

Kvinde

Beskrivelse

Inklusionskriterier:

  • Sunde kvinder i naturlig cyklus;
  • Normal karyotype;
  • Negative serologiske tests for HIV, HBV, HCV, RPR;
  • BMI: 18 - 30 Kg/m2 (begge inkluderet);
  • Kvinder med regelmæssig menstruationscyklus (3-4/28-30 dage).

Ekskluderingskriterier:

  • Patienter, der havde båret en intrauterin enhed i de foregående 3 måneder;
  • Patienter, der har taget hormonelle præventionsmidler inden for de foregående 2 måneder;
  • Adnexal eller livmoderpatologier;
  • polycystisk ovarie;
  • Enhver ustabil sygdom eller medicinsk tilstand, der kan interferere med undersøgelsen eller bringe patientens helbred i fare (vurderet af forskerholdets hovedforsker);
  • Enhver sygdom eller medicinsk ustabil tilstand.

Studieplan

Dette afsnit indeholder detaljer om studieplanen, herunder hvordan undersøgelsen er designet, og hvad undersøgelsen måler.

Hvordan er undersøgelsen tilrettelagt?

Design detaljer

  • Primært formål: BASIC_SCIENCE
  • Tildeling: NON_RANDOMIZED
  • Interventionel model: OVERKRYDS
  • Maskning: INGEN

Våben og indgreb

Deltagergruppe / Arm
Intervention / Behandling
ACTIVE_COMPARATOR: Naturlig kredsløb

Endometriebiopsier og endometrievæske opnået fra raske kvinder gennem hele menstruationscyklussen i hvert af disse stadier:

Tidlig proliferativ (EP; dag 0-8), sen proliferativ (LP; dag 9-14), tidlig sekretorisk (ES; dag 15-18), mid-sekretorisk eller receptiv (MS; dag 19-23) og sen sekretorisk (LS; dag 24-30)

ACTIVE_COMPARATOR: ERA i HRT-cyklus
Endometriebiopsi og endometrievæske opnået fra kvinde, der gennemgår en endometriereceptivitetsanalyse (ERA) i en hormonal substitutionsterapi (HRT) cyklus.

Hvad måler undersøgelsen?

Primære resultatmål

Resultatmål
Tidsramme
Transkriptomisk profilanalyse af endometrieprøverne ved RNA-sekventering.
Tidsramme: 24 måneder
24 måneder

Samarbejdspartnere og efterforskere

Det er her, du vil finde personer og organisationer, der er involveret i denne undersøgelse.

Sponsor

Samarbejdspartnere

Datoer for undersøgelser

Disse datoer sporer fremskridtene for indsendelser af undersøgelsesrekord og resumeresultater til ClinicalTrials.gov. Studieregistreringer og rapporterede resultater gennemgås af National Library of Medicine (NLM) for at sikre, at de opfylder specifikke kvalitetskontrolstandarder, før de offentliggøres på den offentlige hjemmeside.

Studer store datoer

Studiestart

1. marts 2016

Primær færdiggørelse (FORVENTET)

1. december 2017

Studieafslutning (FORVENTET)

1. december 2018

Datoer for studieregistrering

Først indsendt

30. august 2016

Først indsendt, der opfyldte QC-kriterier

21. marts 2017

Først opslået (FAKTISKE)

27. marts 2017

Opdateringer af undersøgelsesjournaler

Sidste opdatering sendt (FAKTISKE)

27. marts 2017

Sidste opdatering indsendt, der opfyldte kvalitetskontrolkriterier

21. marts 2017

Sidst verificeret

1. marts 2017

Mere information

Begreber relateret til denne undersøgelse

Yderligere relevante MeSH-vilkår

Andre undersøgelses-id-numre

  • 1603-IGX-016-CS

Plan for individuelle deltagerdata (IPD)

Planlægger du at dele individuelle deltagerdata (IPD)?

INGEN

Disse oplysninger blev hentet direkte fra webstedet clinicaltrials.gov uden ændringer. Hvis du har nogen anmodninger om at ændre, fjerne eller opdatere dine undersøgelsesoplysninger, bedes du kontakte register@clinicaltrials.gov. Så snart en ændring er implementeret på clinicaltrials.gov, vil denne også blive opdateret automatisk på vores hjemmeside .

Abonner