소장 장루 배출수 및 대장 대변의 미생물 다양성
2019년 2월 10일 업데이트: Xinhua Hospital, Shanghai Jiao Tong University School of Medicine
단장증후군 아동의 소장 장루 유출액과 대장 대변의 장내 미생물 다양성
여러 연구에 따르면 dysbacteriosis는 일반적으로 장 부전(IF) 환자에서 발생했습니다.
그러나 소장 기공 유출물과 결장 대변의 미생물 다양성 차이는 거의 연구되지 않았습니다.
따라서 본 연구는 소아 IF 환자를 대상으로 소장 장루와 대장의 미생물 구성과 배출의 차이를 조사하는 것을 목적으로 한다.
IF 환자의 대변 샘플.
각 환자는 우리 센터에서 누공 폐쇄를 받았고 소장 장루와 결장에서 대변 샘플을 수집했습니다.
분변 미생물 조성은 고처리량 시퀀싱에 의해 결정되었습니다.
연구 개요
상태
알려지지 않은
정황
연구 유형
관찰
등록 (예상)
60
연락처 및 위치
이 섹션에서는 연구를 수행하는 사람들의 연락처 정보와 이 연구가 수행되는 장소에 대한 정보를 제공합니다.
연구 장소
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Shanghai, 중국
- 모병
- Shanghai Xinhua Hospital, affiliated to Shanghai Jiao Tong University, School of Medicine
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연락하다:
- Wei Cai, MD, PhD
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참여기준
연구원은 적격성 기준이라는 특정 설명에 맞는 사람을 찾습니다. 이러한 기준의 몇 가지 예는 개인의 일반적인 건강 상태 또는 이전 치료입니다.
자격 기준
공부할 수 있는 나이
1개월 (어린이)
건강한 자원 봉사자를 받아들입니다
예
연구 대상 성별
모두
샘플링 방법
비확률 샘플
연구 인구
입원 환자
설명
포함 기준:
- 장 부전 환자. 환자들은 비경구 및 경장 영양 투여에 대해 우수한 내성을 보였다. 경장 영양의 비율은 80% 이상입니다.
대변 배출량은 50mL/kg/일 미만으로 유지됩니다. 최소 1주일 동안 합병증은 발생하지 않았습니다.
제외 기준:
- 환자는 주로 비경구 영양에 의존합니다. 발열, 복부 팽만, 설사와 같은 증상. 비경구 영양 관련 간 질환, 폐렴 및 카테터 관련 감염과 같은 합병증.
공부 계획
이 섹션에서는 연구 설계 방법과 연구가 측정하는 내용을 포함하여 연구 계획에 대한 세부 정보를 제공합니다.
연구는 어떻게 설계됩니까?
디자인 세부사항
코호트 및 개입
그룹/코호트 |
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장 구멍 출력
개입이 없습니다.
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결장 대변
개입이 없습니다.
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건강한 통제
개입이 없습니다.
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연구는 무엇을 측정합니까?
주요 결과 측정
결과 측정 |
측정값 설명 |
기간 |
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16s rRNA 시퀀싱으로 밝혀진 미생물 다양성 및 구성
기간: 1) 검체채취 : 환자가 퇴원하기 1일전; 2)DNA 추출: 검체 채취 후 1주일 이내; 3) sequencing 및 data 분석 : DNA추출 후 1개월 이내
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장내 미생물의 DNA를 추출합니다.
그런 다음 정제된 DNA 앰플리콘은 Illumina MiSeq 플랫폼에서 등몰 및 페어드 엔드 시퀀싱(2 × 250)으로 풀링됩니다.
원시 Fastq 파일은 QIIME(버전 1.17)를 사용하여 역다중화되고 품질 필터링됩니다.
운영 분류 단위(OTU)는 UPARSE 버전 7.1(http://drive5.com/
uparse/) 및 키메라 시퀀스는 UCHIME(http://drive5.com/index.htm)를 사용하여 식별 및 제거됩니다.
RDP Classifier(http://rdp.cme.msu.edu/)를 이용하여 각 16S rRNA 유전자 염기서열의 계통발생학적 소속을 분석하였다.
실바(SSU117/119)16S rRNA에 대해.
Sobs 지수와 Chao 지수는 미생물 다양성을 평가하는 데 사용됩니다.
Microbiota 구성은 문, 가족 및 속을 포함하여 다른 수준에서 확인됩니다.
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1) 검체채취 : 환자가 퇴원하기 1일전; 2)DNA 추출: 검체 채취 후 1주일 이내; 3) sequencing 및 data 분석 : DNA추출 후 1개월 이내
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공동 작업자 및 조사자
여기에서 이 연구와 관련된 사람과 조직을 찾을 수 있습니다.
간행물 및 유용한 링크
연구에 대한 정보 입력을 담당하는 사람이 자발적으로 이러한 간행물을 제공합니다. 이것은 연구와 관련된 모든 것에 관한 것일 수 있습니다.
일반 간행물
- Arrieta MC, Stiemsma LT, Amenyogbe N, Brown EM, Finlay B. The intestinal microbiome in early life: health and disease. Front Immunol. 2014 Sep 5;5:427. doi: 10.3389/fimmu.2014.00427. eCollection 2014.
- Booijink CC, El-Aidy S, Rajilic-Stojanovic M, Heilig HG, Troost FJ, Smidt H, Kleerebezem M, De Vos WM, Zoetendal EG. High temporal and inter-individual variation detected in the human ileal microbiota. Environ Microbiol. 2010 Dec;12(12):3213-27. doi: 10.1111/j.1462-2920.2010.02294.x.
- Barrett E, Guinane CM, Ryan CA, Dempsey EM, Murphy BP, O'Toole PW, Fitzgerald GF, Cotter PD, Ross RP, Stanton C. Microbiota diversity and stability of the preterm neonatal ileum and colon of two infants. Microbiologyopen. 2013 Apr;2(2):215-25. doi: 10.1002/mbo3.64. Epub 2013 Jan 24.
- Huang Y, Guo F, Li Y, Wang J, Li J. Fecal microbiota signatures of adult patients with different types of short bowel syndrome. J Gastroenterol Hepatol. 2017 Dec;32(12):1949-1957. doi: 10.1111/jgh.13806.
연구 기록 날짜
이 날짜는 ClinicalTrials.gov에 대한 연구 기록 및 요약 결과 제출의 진행 상황을 추적합니다. 연구 기록 및 보고된 결과는 공개 웹사이트에 게시되기 전에 특정 품질 관리 기준을 충족하는지 확인하기 위해 국립 의학 도서관(NLM)에서 검토합니다.
연구 주요 날짜
연구 시작 (실제)
2016년 11월 1일
기본 완료 (예상)
2019년 12월 15일
연구 완료 (예상)
2020년 6월 1일
연구 등록 날짜
최초 제출
2018년 6월 15일
QC 기준을 충족하는 최초 제출
2018년 7월 5일
처음 게시됨 (실제)
2018년 7월 18일
연구 기록 업데이트
마지막 업데이트 게시됨 (실제)
2019년 2월 15일
QC 기준을 충족하는 마지막 업데이트 제출
2019년 2월 10일
마지막으로 확인됨
2017년 11월 1일
추가 정보
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