- ICH GCP
- US Clinical Trials Registry
- Klinisk forsøg NCT03590418
Mikrobiel mangfoldighed af tyndtarmsstomiafløb og tyktarmsfæces
10. februar 2019 opdateret af: Xinhua Hospital, Shanghai Jiao Tong University School of Medicine
Intestinal mikrobiel mangfoldighed af tyndtarmsstomiafløb og colonafføring fra børn med korttarmssyndrom
Adskillige undersøgelser antydede, at dysbakteriose normalt opstod hos patienter med tarmsvigt (IF).
Forskelle i mikrobiotadiversitet i tyndtarmsstomiafløb og tyktarmsfæces var dog sjældent undersøgelser.
Denne undersøgelse har således til formål at undersøge mikrobiotasammensætninger og forskelle i output fra tyndtarmsstomi og colon hos pædiatriske IF-patienter.
Fækale prøver fra IF-patienter.
Hver patient modtog fistellukning i vores center, og fækale prøver fra både tyndtarmstomi og tyktarm blev indsamlet.
Fækale mikrobielle sammensætninger blev bestemt ved high-throughput sekventering.
Studieoversigt
Status
Ukendt
Betingelser
Undersøgelsestype
Observationel
Tilmelding (Forventet)
60
Kontakter og lokationer
Dette afsnit indeholder kontaktoplysninger for dem, der udfører undersøgelsen, og oplysninger om, hvor denne undersøgelse udføres.
Studiesteder
-
-
-
Shanghai, Kina
- Rekruttering
- Shanghai Xinhua Hospital, affiliated to Shanghai Jiao Tong University, School of Medicine
-
Kontakt:
- Wei Cai, MD, PhD
-
-
Deltagelseskriterier
Forskere leder efter personer, der passer til en bestemt beskrivelse, kaldet berettigelseskriterier. Nogle eksempler på disse kriterier er en persons generelle helbredstilstand eller tidligere behandlinger.
Berettigelseskriterier
Aldre berettiget til at studere
1 måned til 3 år (Barn)
Tager imod sunde frivillige
Ja
Køn, der er berettiget til at studere
Alle
Prøveudtagningsmetode
Ikke-sandsynlighedsprøve
Studiebefolkning
Indlagte patienter
Beskrivelse
Inklusionskriterier:
- Patienter med tarmsvigt. Patienterne viste god tolerance over for parenteral og enteral ernæringsadministration. Andelen af enteral ernæring er mere end 80%.
Afføringsoutput holdes på mindre end 50 ml/kg/dag. Der opstod ingen komplikationer i mindst 1 uge.
Ekskluderingskriterier:
- Patienter er hovedsageligt afhængige af parenteral ernæring. Symptomer som feber, udspilet mave og diarré. Komplikationer som parenteral ernæringsassocieret leversygdom, lungebetændelse og kateterrelateret infektion.
Studieplan
Dette afsnit indeholder detaljer om studieplanen, herunder hvordan undersøgelsen er designet, og hvad undersøgelsen måler.
Hvordan er undersøgelsen tilrettelagt?
Design detaljer
Kohorter og interventioner
Gruppe / kohorte |
---|
Intestinal stomi output
Ingen indgreb.
|
Colon afføring
Ingen indgreb.
|
Sund kontrol
Ingen indgreb.
|
Hvad måler undersøgelsen?
Primære resultatmål
Resultatmål |
Foranstaltningsbeskrivelse |
Tidsramme |
---|---|---|
Mikrobiota-diversitet og sammensætning afklaret ved 16s rRNA-sekventering
Tidsramme: 1) Prøveindsamling: en dag før patienter udskrives fra hospitalet; 2) DNA-ekstraktion: inden for en uge efter prøveindsamling; 3) Sekvensering og dataanalyse: inden for en måned efter DNA-ekstrakt
|
DNA fra tarmmikrobiota vil blive ekstraheret.
Derefter samles oprensede DNA-amplikoner i ækvimolære og parrede ende sekventeres (2 × 250) på en Illumina MiSeq-platform.
Rå Fastq-filer vil blive de-multiplekset, kvalitetsfiltreret ved hjælp af QIIME (version 1.17).
Operationelle taksonomiske enheder (OTU'er) vil næste gang blive grupperet med 97 % lighedsgrænse ved hjælp af UPARSE version 7.1 (http://drive5.com/
uparse/) og kimære sekvenser vil blive identificeret og fjernet ved hjælp af UCHIME (http://drive5.com/index.htm).
Den fylogenetiske tilknytning af hver 16S rRNA gensekvens analyseres af RDP Classifier (http://rdp.cme.msu.edu/)
mod silva (SSU117/119)16S rRNA.
Sobs-indeks og Chao-indeks vil blive brugt til at evaluere mikrobiota-diversiteten.
Mikrobiotasammensætning vil blive identificeret på forskellige niveauer, herunder phylum, familie og slægt.
|
1) Prøveindsamling: en dag før patienter udskrives fra hospitalet; 2) DNA-ekstraktion: inden for en uge efter prøveindsamling; 3) Sekvensering og dataanalyse: inden for en måned efter DNA-ekstrakt
|
Samarbejdspartnere og efterforskere
Det er her, du vil finde personer og organisationer, der er involveret i denne undersøgelse.
Publikationer og nyttige links
Den person, der er ansvarlig for at indtaste oplysninger om undersøgelsen, leverer frivilligt disse publikationer. Disse kan handle om alt relateret til undersøgelsen.
Generelle publikationer
- Arrieta MC, Stiemsma LT, Amenyogbe N, Brown EM, Finlay B. The intestinal microbiome in early life: health and disease. Front Immunol. 2014 Sep 5;5:427. doi: 10.3389/fimmu.2014.00427. eCollection 2014.
- Booijink CC, El-Aidy S, Rajilic-Stojanovic M, Heilig HG, Troost FJ, Smidt H, Kleerebezem M, De Vos WM, Zoetendal EG. High temporal and inter-individual variation detected in the human ileal microbiota. Environ Microbiol. 2010 Dec;12(12):3213-27. doi: 10.1111/j.1462-2920.2010.02294.x.
- Barrett E, Guinane CM, Ryan CA, Dempsey EM, Murphy BP, O'Toole PW, Fitzgerald GF, Cotter PD, Ross RP, Stanton C. Microbiota diversity and stability of the preterm neonatal ileum and colon of two infants. Microbiologyopen. 2013 Apr;2(2):215-25. doi: 10.1002/mbo3.64. Epub 2013 Jan 24.
- Huang Y, Guo F, Li Y, Wang J, Li J. Fecal microbiota signatures of adult patients with different types of short bowel syndrome. J Gastroenterol Hepatol. 2017 Dec;32(12):1949-1957. doi: 10.1111/jgh.13806.
Datoer for undersøgelser
Disse datoer sporer fremskridtene for indsendelser af undersøgelsesrekord og resumeresultater til ClinicalTrials.gov. Studieregistreringer og rapporterede resultater gennemgås af National Library of Medicine (NLM) for at sikre, at de opfylder specifikke kvalitetskontrolstandarder, før de offentliggøres på den offentlige hjemmeside.
Studer store datoer
Studiestart (Faktiske)
1. november 2016
Primær færdiggørelse (Forventet)
15. december 2019
Studieafslutning (Forventet)
1. juni 2020
Datoer for studieregistrering
Først indsendt
15. juni 2018
Først indsendt, der opfyldte QC-kriterier
5. juli 2018
Først opslået (Faktiske)
18. juli 2018
Opdateringer af undersøgelsesjournaler
Sidste opdatering sendt (Faktiske)
15. februar 2019
Sidste opdatering indsendt, der opfyldte kvalitetskontrolkriterier
10. februar 2019
Sidst verificeret
1. november 2017
Mere information
Begreber relateret til denne undersøgelse
Nøgleord
Andre undersøgelses-id-numre
- ShanghaiXinhua
Lægemiddel- og udstyrsoplysninger, undersøgelsesdokumenter
Studerer et amerikansk FDA-reguleret lægemiddelprodukt
Ingen
Studerer et amerikansk FDA-reguleret enhedsprodukt
Ingen
Disse oplysninger blev hentet direkte fra webstedet clinicaltrials.gov uden ændringer. Hvis du har nogen anmodninger om at ændre, fjerne eller opdatere dine undersøgelsesoplysninger, bedes du kontakte register@clinicaltrials.gov. Så snart en ændring er implementeret på clinicaltrials.gov, vil denne også blive opdateret automatisk på vores hjemmeside .
Kliniske forsøg med Tarmsvigt
-
Jinling Hospital, ChinaAfsluttetKronisk intestinal pseudoobstruktionKina
-
MovetisAfsluttetKronisk intestinal pseudo-obstruktionDet Forenede Kongerige
-
University of NottinghamNorthern Care Alliance NHS Foundation Trust; Cambridge University Hospitals... og andre samarbejdspartnereRekrutteringKronisk intestinal pseudo-obstruktionDet Forenede Kongerige
-
Alfasigma S.p.A.Aktiv, ikke rekrutterendeKronisk intestinal pseudo-obstruktionBelgien, Italien, Spanien
-
Maastricht University Medical CenterAfsluttet
-
a2 Milk Company Ltd.Afsluttet
-
Christian Medical College and Hospital, Ludhiana...Afsluttet
-
Shanghai 10th People's HospitalAfsluttetTransplantation af fækal mikrobiota | Intestinal Pseudo-obstruktionKina
-
BrightseedRekruttering
-
Chr HansenAtlantia Food Clinical Trials; Signifikans ApSAfsluttet