Różnorodność mikrobiologiczna ścieków ze stomii jelita cienkiego i kału okrężnicy
10 lutego 2019 zaktualizowane przez: Xinhua Hospital, Shanghai Jiao Tong University School of Medicine
Różnorodność drobnoustrojów jelitowych w wydzielinie ze stomii jelita cienkiego i kale okrężnicy u dzieci z zespołem krótkiego jelita
Kilka badań sugerowało, że dysbakterioza zwykle występuje u pacjentów z niewydolnością jelit (IF).
Rzadko jednak badano różnice w różnorodności mikrobiomu w wydzielinach ze stomii jelita cienkiego i kale okrężnicy.
Dlatego niniejsze badanie ma na celu zbadanie składu mikrobiomu i różnic w produkcji stomii jelita cienkiego i okrężnicy u dzieci z IF u dzieci.
Próbki kału od pacjentów z IF.
U każdego pacjenta zamknięto przetokę w naszym ośrodku i pobrano próbki kału zarówno ze stomii jelita cienkiego, jak i okrężnicy.
Skład drobnoustrojów kałowych określono za pomocą wysokowydajnego sekwencjonowania.
Przegląd badań
Status
Nieznany
Warunki
Typ studiów
Obserwacyjny
Zapisy (Oczekiwany)
60
Kontakty i lokalizacje
Ta sekcja zawiera dane kontaktowe osób prowadzących badanie oraz informacje o tym, gdzie badanie jest przeprowadzane.
Kontakt w sprawie studiów
- Nazwa: Wei Cai, MD, PhD
- E-mail: caiw204@sjtu.edu.cn
Lokalizacje studiów
-
-
-
Shanghai, Chiny
- Rekrutacyjny
- Shanghai Xinhua Hospital, affiliated to Shanghai Jiao Tong University, School of Medicine
-
Kontakt:
- Wei Cai, MD, PhD
-
-
Kryteria uczestnictwa
Badacze szukają osób, które pasują do określonego opisu, zwanego kryteriami kwalifikacyjnymi. Niektóre przykłady tych kryteriów to ogólny stan zdrowia danej osoby lub wcześniejsze leczenie.
Kryteria kwalifikacji
Wiek uprawniający do nauki
1 miesiąc do 3 lata (Dziecko)
Akceptuje zdrowych ochotników
Tak
Płeć kwalifikująca się do nauki
Wszystko
Metoda próbkowania
Próbka bez prawdopodobieństwa
Badana populacja
Pacjenci hospitalizowani
Opis
Kryteria przyjęcia:
- Pacjenci z niewydolnością jelit. Pacjenci wykazywali dobrą tolerancję na żywienie pozajelitowe i dojelitowe. Udział żywienia dojelitowego przekracza 80%.
Wydalanie stolca utrzymywane na poziomie poniżej 50 ml/kg/dzień. Przez co najmniej 1 tydzień nie wystąpiły żadne powikłania.
Kryteria wyłączenia:
- Pacjenci są zdani głównie na żywienie pozajelitowe. Objawy takie jak gorączka, wzdęcia brzucha i biegunka. Powikłania, takie jak choroba wątroby związana z żywieniem pozajelitowym, zapalenie płuc i infekcja związana z cewnikiem.
Plan studiów
Ta sekcja zawiera szczegółowe informacje na temat planu badania, w tym sposób zaprojektowania badania i jego pomiary.
Jak projektuje się badanie?
Szczegóły projektu
Kohorty i interwencje
Grupa / Kohorta |
|---|
|
Wyjście ze stomii jelitowej
Brak interwencji.
|
|
Kał okrężnicy
Brak interwencji.
|
|
Zdrowa kontrola
Brak interwencji.
|
Co mierzy badanie?
Podstawowe miary wyniku
Miara wyniku |
Opis środka |
Ramy czasowe |
|---|---|---|
|
Różnorodność i skład mikrobiomu wyjaśnione przez sekwencjonowanie 16s rRNA
Ramy czasowe: 1) Pobieranie próbek: jeden dzień przed wypisem pacjentów ze szpitala; 2) Ekstrakcja DNA: w ciągu jednego tygodnia po pobraniu próbek; 3) Sekwencjonowanie i analiza danych: w ciągu jednego miesiąca po ekstrakcji DNA
|
DNA mikroflory jelitowej zostanie wyekstrahowane.
Następnie oczyszczone amplikony DNA łączy się w równomolowe i sekwencjonuje sparowane końce (2 x 250) na platformie Illumina MiSeq.
Surowe pliki Fastq zostaną poddane demultipleksowaniu i filtrowaniu jakości przy użyciu QIIME (wersja 1.17).
Operacyjne jednostki taksonomiczne (OTU) będą następnie grupowane z 97% odcięciem podobieństwa przy użyciu UPARSE w wersji 7.1 (http://drive5.com/
uparse/), a sekwencje chimeryczne zostaną zidentyfikowane i usunięte przy użyciu UCHIME (http://drive5.com/index.htm).
Przynależność filogenetyczna każdej sekwencji genu 16S rRNA jest analizowana przez RDP Classifier (http://rdp.cme.msu.edu/)
przeciwko silva (SSU117/119)16S rRNA.
Do oceny różnorodności mikrobiomu zostaną wykorzystane indeksy Sobs i Chao.
Skład mikrobiomu zostanie zidentyfikowany na różnych poziomach, w tym typu, rodziny i rodzaju.
|
1) Pobieranie próbek: jeden dzień przed wypisem pacjentów ze szpitala; 2) Ekstrakcja DNA: w ciągu jednego tygodnia po pobraniu próbek; 3) Sekwencjonowanie i analiza danych: w ciągu jednego miesiąca po ekstrakcji DNA
|
Współpracownicy i badacze
Tutaj znajdziesz osoby i organizacje zaangażowane w to badanie.
Publikacje i pomocne linki
Osoba odpowiedzialna za wprowadzenie informacji o badaniu dobrowolnie udostępnia te publikacje. Mogą one dotyczyć wszystkiego, co jest związane z badaniem.
Publikacje ogólne
- Arrieta MC, Stiemsma LT, Amenyogbe N, Brown EM, Finlay B. The intestinal microbiome in early life: health and disease. Front Immunol. 2014 Sep 5;5:427. doi: 10.3389/fimmu.2014.00427. eCollection 2014.
- Booijink CC, El-Aidy S, Rajilic-Stojanovic M, Heilig HG, Troost FJ, Smidt H, Kleerebezem M, De Vos WM, Zoetendal EG. High temporal and inter-individual variation detected in the human ileal microbiota. Environ Microbiol. 2010 Dec;12(12):3213-27. doi: 10.1111/j.1462-2920.2010.02294.x.
- Barrett E, Guinane CM, Ryan CA, Dempsey EM, Murphy BP, O'Toole PW, Fitzgerald GF, Cotter PD, Ross RP, Stanton C. Microbiota diversity and stability of the preterm neonatal ileum and colon of two infants. Microbiologyopen. 2013 Apr;2(2):215-25. doi: 10.1002/mbo3.64. Epub 2013 Jan 24.
- Huang Y, Guo F, Li Y, Wang J, Li J. Fecal microbiota signatures of adult patients with different types of short bowel syndrome. J Gastroenterol Hepatol. 2017 Dec;32(12):1949-1957. doi: 10.1111/jgh.13806.
Daty zapisu na studia
Daty te śledzą postęp w przesyłaniu rekordów badań i podsumowań wyników do ClinicalTrials.gov. Zapisy badań i zgłoszone wyniki są przeglądane przez National Library of Medicine (NLM), aby upewnić się, że spełniają określone standardy kontroli jakości, zanim zostaną opublikowane na publicznej stronie internetowej.
Główne daty studiów
Rozpoczęcie studiów (Rzeczywisty)
1 listopada 2016
Zakończenie podstawowe (Oczekiwany)
15 grudnia 2019
Ukończenie studiów (Oczekiwany)
1 czerwca 2020
Daty rejestracji na studia
Pierwszy przesłany
15 czerwca 2018
Pierwszy przesłany, który spełnia kryteria kontroli jakości
5 lipca 2018
Pierwszy wysłany (Rzeczywisty)
18 lipca 2018
Aktualizacje rekordów badań
Ostatnia wysłana aktualizacja (Rzeczywisty)
15 lutego 2019
Ostatnia przesłana aktualizacja, która spełniała kryteria kontroli jakości
10 lutego 2019
Ostatnia weryfikacja
1 listopada 2017
Więcej informacji
Terminy związane z tym badaniem
Słowa kluczowe
Inne numery identyfikacyjne badania
- ShanghaiXinhua
Informacje o lekach i urządzeniach, dokumenty badawcze
Bada produkt leczniczy regulowany przez amerykańską FDA
Nie
Bada produkt urządzenia regulowany przez amerykańską FDA
Nie
Te informacje zostały pobrane bezpośrednio ze strony internetowej clinicaltrials.gov bez żadnych zmian. Jeśli chcesz zmienić, usunąć lub zaktualizować dane swojego badania, skontaktuj się z register@clinicaltrials.gov. Gdy tylko zmiana zostanie wprowadzona na stronie clinicaltrials.gov, zostanie ona automatycznie zaktualizowana również na naszej stronie internetowej .