Microbiële diversiteit van dunnedarmstoma-effluent en darmfaeces
10 februari 2019 bijgewerkt door: Xinhua Hospital, Shanghai Jiao Tong University School of Medicine
Intestinale microbiële diversiteit van dunnedarmstoma-effluent en darmfaeces van kinderen met kortedarmsyndroom
Verschillende onderzoeken suggereerden dat dysbacteriose meestal voorkwam bij patiënten met darmfalen (IF).
Verschillen in microbiota-diversiteit in stoma-effluenten van de dunne darm en feces in de dikke darm werden echter zelden onderzocht.
Deze studie is dus gericht op het onderzoeken van de samenstelling van de microbiota en de verschillen in output van stoma en colon in de dunne darm bij pediatrische IF-patiënten.
Fecale monsters van IF-patiënten.
Elke patiënt kreeg fistelsluiting in ons centrum en fecale monsters van zowel de dunne darm als de dikke darm werden verzameld.
Fecale microbiële samenstellingen werden bepaald door high-throughput sequencing.
Studie Overzicht
Toestand
Onbekend
Conditie
Studietype
Observationeel
Inschrijving (Verwacht)
60
Contacten en locaties
In dit gedeelte vindt u de contactgegevens van degenen die het onderzoek uitvoeren en informatie over waar dit onderzoek wordt uitgevoerd.
Studie Locaties
-
-
-
Shanghai, China
- Werving
- Shanghai Xinhua Hospital, affiliated to Shanghai Jiao Tong University, School of Medicine
-
Contact:
- Wei Cai, MD, PhD
-
-
Deelname Criteria
Onderzoekers zoeken naar mensen die aan een bepaalde beschrijving voldoen, de zogenaamde geschiktheidscriteria. Enkele voorbeelden van deze criteria zijn iemands algemene gezondheidstoestand of eerdere behandelingen.
Geschiktheidscriteria
Leeftijden die in aanmerking komen voor studie
1 maand tot 3 jaar (Kind)
Accepteert gezonde vrijwilligers
Ja
Geslachten die in aanmerking komen voor studie
Allemaal
Bemonsteringsmethode
Niet-waarschijnlijkheidssteekproef
Studie Bevolking
Gehospitaliseerde patiënten
Beschrijving
Inclusiecriteria:
- Patiënten met darmfalen. Patiënten vertoonden een goede tolerantie voor toediening van parenterale en enterale voeding. Aandeel enterale voeding is meer dan 80%.
De ontlastingsproductie wordt gehandhaafd op minder dan 50 ml/kg/dag. Gedurende ten minste 1 week deden zich geen complicaties voor.
Uitsluitingscriteria:
- Patiënten zijn voornamelijk afhankelijk van parenterale voeding. Symptomen zoals koorts, opgezette buik en diarree. Complicaties zoals parenterale voeding-geassocieerde leverziekte, longontsteking en katheter-gerelateerde infectie.
Studie plan
Dit gedeelte bevat details van het studieplan, inclusief hoe de studie is opgezet en wat de studie meet.
Hoe is de studie opgezet?
Ontwerpdetails
Cohorten en interventies
Groep / Cohort |
|---|
|
Uitvoer van een darmstoma
Geen tussenkomsten.
|
|
Dikke darmen
Geen tussenkomsten.
|
|
Gezonde Controle
Geen tussenkomsten.
|
Wat meet het onderzoek?
Primaire uitkomstmaten
Uitkomstmaat |
Maatregel Beschrijving |
Tijdsspanne |
|---|---|---|
|
Microbiota-diversiteit en -samenstelling verduidelijkt door 16s rRNA-sequencing
Tijdsspanne: 1) Monstername: één dag voordat patiënten uit het ziekenhuis worden ontslagen; 2) DNA-extractie: binnen een week na monstername; 3) Sequentiebepaling en gegevensanalyse: binnen een maand na DNA-extract
|
DNA van darmmicrobiota zal worden geëxtraheerd.
Vervolgens worden gezuiverde DNA-amplicons gepoold in equimolair en gepaarde uiteinden gesequenced (2 × 250) op een Illumina MiSeq-platform.
Onbewerkte Fastq-bestanden worden gedemultiplext en op kwaliteit gefilterd met behulp van QIIME (versie 1.17).
Operationele taxonomische eenheden (OTU's) worden vervolgens geclusterd met een afkapwaarde van 97% met behulp van UPARSE versie 7.1 (http://drive5.com/
uparse/) en chimere sequenties worden geïdentificeerd en verwijderd met behulp van UCHIME (http://drive5.com/index.htm).
De fylogenetische affiliatie van elke 16S rRNA-gensequentie wordt geanalyseerd door RDP Classifier (//rdp.cme.msu.edu/)
tegen het silva (SSU117/119)16S-rRNA.
Sobs-index en Chao-index zullen worden gebruikt om de diversiteit van de microbiota te evalueren.
De samenstelling van de microbiota zal op verschillende niveaus worden geïdentificeerd, waaronder phylum, familie en genus.
|
1) Monstername: één dag voordat patiënten uit het ziekenhuis worden ontslagen; 2) DNA-extractie: binnen een week na monstername; 3) Sequentiebepaling en gegevensanalyse: binnen een maand na DNA-extract
|
Medewerkers en onderzoekers
Hier vindt u mensen en organisaties die betrokken zijn bij dit onderzoek.
Publicaties en nuttige links
De persoon die verantwoordelijk is voor het invoeren van informatie over het onderzoek stelt deze publicaties vrijwillig ter beschikking. Dit kan gaan over alles wat met het onderzoek te maken heeft.
Algemene publicaties
- Arrieta MC, Stiemsma LT, Amenyogbe N, Brown EM, Finlay B. The intestinal microbiome in early life: health and disease. Front Immunol. 2014 Sep 5;5:427. doi: 10.3389/fimmu.2014.00427. eCollection 2014.
- Booijink CC, El-Aidy S, Rajilic-Stojanovic M, Heilig HG, Troost FJ, Smidt H, Kleerebezem M, De Vos WM, Zoetendal EG. High temporal and inter-individual variation detected in the human ileal microbiota. Environ Microbiol. 2010 Dec;12(12):3213-27. doi: 10.1111/j.1462-2920.2010.02294.x.
- Barrett E, Guinane CM, Ryan CA, Dempsey EM, Murphy BP, O'Toole PW, Fitzgerald GF, Cotter PD, Ross RP, Stanton C. Microbiota diversity and stability of the preterm neonatal ileum and colon of two infants. Microbiologyopen. 2013 Apr;2(2):215-25. doi: 10.1002/mbo3.64. Epub 2013 Jan 24.
- Huang Y, Guo F, Li Y, Wang J, Li J. Fecal microbiota signatures of adult patients with different types of short bowel syndrome. J Gastroenterol Hepatol. 2017 Dec;32(12):1949-1957. doi: 10.1111/jgh.13806.
Studie record data
Deze datums volgen de voortgang van het onderzoeksdossier en de samenvatting van de ingediende resultaten bij ClinicalTrials.gov. Studieverslagen en gerapporteerde resultaten worden beoordeeld door de National Library of Medicine (NLM) om er zeker van te zijn dat ze voldoen aan specifieke kwaliteitscontrolenormen voordat ze op de openbare website worden geplaatst.
Bestudeer belangrijke data
Studie start (Werkelijk)
1 november 2016
Primaire voltooiing (Verwacht)
15 december 2019
Studie voltooiing (Verwacht)
1 juni 2020
Studieregistratiedata
Eerst ingediend
15 juni 2018
Eerst ingediend dat voldeed aan de QC-criteria
5 juli 2018
Eerst geplaatst (Werkelijk)
18 juli 2018
Updates van studierecords
Laatste update geplaatst (Werkelijk)
15 februari 2019
Laatste update ingediend die voldeed aan QC-criteria
10 februari 2019
Laatst geverifieerd
1 november 2017
Meer informatie
Termen gerelateerd aan deze studie
Trefwoorden
Andere studie-ID-nummers
- ShanghaiXinhua
Informatie over medicijnen en apparaten, studiedocumenten
Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd geneesmiddel
Nee
Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd apparaatproduct
Nee
Deze informatie is zonder wijzigingen rechtstreeks van de website clinicaltrials.gov gehaald. Als u verzoeken heeft om uw onderzoeksgegevens te wijzigen, te verwijderen of bij te werken, neem dan contact op met register@clinicaltrials.gov. Zodra er een wijziging wordt doorgevoerd op clinicaltrials.gov, wordt deze ook automatisch bijgewerkt op onze website .