Mikrobiální diverzita výtoku stomie tenkého střeva a stolice tlustého střeva
10. února 2019 aktualizováno: Xinhua Hospital, Shanghai Jiao Tong University School of Medicine
Střevní mikrobiální diverzita výtoku stomie tenkého střeva a stolice tlustého střeva dětí se syndromem krátkého střeva
Několik studií naznačilo, že k dysbakterióze obvykle dochází u pacientů s intestinálním selháním (IF).
Rozdíly v diverzitě mikroflóry ve výtocích ze stomie tenkého střeva a stolici tlustého střeva však byly studovány jen zřídka.
Tato studie je tedy zaměřena na zkoumání složení mikrobioty a rozdílů ve výdeji stomie tenkého střeva a tlustého střeva u dětských pacientů s IF.
Vzorky stolice od pacientů s IF.
Každému pacientovi byla v našem centru uzavřena píštěl a byly odebrány vzorky stolice ze stomie tenkého střeva a tlustého střeva.
Fekální mikrobiální kompozice byly stanoveny vysoce výkonným sekvenováním.
Přehled studie
Postavení
Neznámý
Podmínky
Typ studie
Pozorovací
Zápis (Očekávaný)
60
Kontakty a umístění
Tato část poskytuje kontaktní údaje pro ty, kteří studii provádějí, a informace o tom, kde se tato studie provádí.
Studijní místa
-
-
-
Shanghai, Čína
- Nábor
- Shanghai Xinhua Hospital, affiliated to Shanghai Jiao Tong University, School of Medicine
-
Kontakt:
- Wei Cai, MD, PhD
-
-
Kritéria účasti
Výzkumníci hledají lidi, kteří odpovídají určitému popisu, kterému se říká kritéria způsobilosti. Některé příklady těchto kritérií jsou celkový zdravotní stav osoby nebo předchozí léčba.
Kritéria způsobilosti
Věk způsobilý ke studiu
1 měsíc až 3 roky (Dítě)
Přijímá zdravé dobrovolníky
Ano
Pohlaví způsobilá ke studiu
Všechno
Metoda odběru vzorků
Vzorek nepravděpodobnosti
Studijní populace
Hospitalizovaní pacienti
Popis
Kritéria pro zařazení:
- Pacienti se střevním selháním. Pacienti vykazovali dobrou toleranci k podávání parenterální a enterální výživy. Podíl enterální výživy je více než 80 %.
Výdej stolice se udržoval na méně než 50 ml/kg/den. Minimálně 1 týden se nevyskytly žádné komplikace.
Kritéria vyloučení:
- Pacienti jsou odkázáni především na parenterální výživu. Příznaky jako horečka, roztažení břicha a průjem. Komplikace jako onemocnění jater související s parenterální výživou, zápal plic a infekce související s katetrem.
Studijní plán
Tato část poskytuje podrobnosti o studijním plánu, včetně toho, jak je studie navržena a co studie měří.
Jak je studie koncipována?
Detaily designu
Kohorty a intervence
Skupina / kohorta |
|---|
|
Výstup ze střevní stomie
Žádné zásahy.
|
|
Koloniální výkaly
Žádné zásahy.
|
|
Zdravá kontrola
Žádné zásahy.
|
Co je měření studie?
Primární výstupní opatření
Měření výsledku |
Popis opatření |
Časové okno |
|---|---|---|
|
Diverzita a složení mikroflóry objasněno sekvenováním 16s rRNA
Časové okno: 1) Odběr vzorků: jeden den před propuštěním pacientů z nemocnice; 2) Extrakce DNA: do jednoho týdne po odběru vzorků; 3) Sekvenování a analýza dat: do jednoho měsíce po extrakci DNA
|
Bude extrahována DNA střevní mikroflóry.
Poté se purifikované amplikony DNA shromáždí v ekvimolárních a párových koncích se sekvenují (2 x 250) na platformě Illumina MiSeq.
Raw Fastq soubory budou demultiplexovány, kvalitativně filtrovány pomocí QIIME (verze 1.17).
Operační taxonomické jednotky (OTU) budou dále seskupeny s 97% hranicí podobnosti pomocí UPARSE verze 7.1 (http://drive5.com/
uparse/) a chimérické sekvence budou identifikovány a odstraněny pomocí UCHIME (http://drive5.com/index.htm).
Fylogenetická příslušnost každé genové sekvence 16S rRNA je analyzována pomocí klasifikátoru RDP (http://rdp.cme.msu.edu/)
proti silva (SSU117/119)16S rRNA.
K hodnocení diverzity mikrobioty bude použit index Sobs a Chao index.
Složení mikrobioty bude identifikováno na různých úrovních včetně kmene, čeledi a rodu.
|
1) Odběr vzorků: jeden den před propuštěním pacientů z nemocnice; 2) Extrakce DNA: do jednoho týdne po odběru vzorků; 3) Sekvenování a analýza dat: do jednoho měsíce po extrakci DNA
|
Spolupracovníci a vyšetřovatelé
Zde najdete lidi a organizace zapojené do této studie.
Publikace a užitečné odkazy
Osoba odpovědná za zadávání informací o studiu tyto publikace poskytuje dobrovolně. Mohou se týkat čehokoli, co souvisí se studiem.
Obecné publikace
- Arrieta MC, Stiemsma LT, Amenyogbe N, Brown EM, Finlay B. The intestinal microbiome in early life: health and disease. Front Immunol. 2014 Sep 5;5:427. doi: 10.3389/fimmu.2014.00427. eCollection 2014.
- Booijink CC, El-Aidy S, Rajilic-Stojanovic M, Heilig HG, Troost FJ, Smidt H, Kleerebezem M, De Vos WM, Zoetendal EG. High temporal and inter-individual variation detected in the human ileal microbiota. Environ Microbiol. 2010 Dec;12(12):3213-27. doi: 10.1111/j.1462-2920.2010.02294.x.
- Barrett E, Guinane CM, Ryan CA, Dempsey EM, Murphy BP, O'Toole PW, Fitzgerald GF, Cotter PD, Ross RP, Stanton C. Microbiota diversity and stability of the preterm neonatal ileum and colon of two infants. Microbiologyopen. 2013 Apr;2(2):215-25. doi: 10.1002/mbo3.64. Epub 2013 Jan 24.
- Huang Y, Guo F, Li Y, Wang J, Li J. Fecal microbiota signatures of adult patients with different types of short bowel syndrome. J Gastroenterol Hepatol. 2017 Dec;32(12):1949-1957. doi: 10.1111/jgh.13806.
Termíny studijních záznamů
Tato data sledují průběh záznamů studie a předkládání souhrnných výsledků na ClinicalTrials.gov. Záznamy ze studií a hlášené výsledky jsou před zveřejněním na veřejné webové stránce přezkoumány Národní lékařskou knihovnou (NLM), aby se ujistily, že splňují specifické standardy kontroly kvality.
Hlavní termíny studia
Začátek studia (Aktuální)
1. listopadu 2016
Primární dokončení (Očekávaný)
15. prosince 2019
Dokončení studie (Očekávaný)
1. června 2020
Termíny zápisu do studia
První předloženo
15. června 2018
První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality
5. července 2018
První zveřejněno (Aktuální)
18. července 2018
Aktualizace studijních záznamů
Poslední zveřejněná aktualizace (Aktuální)
15. února 2019
Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality
10. února 2019
Naposledy ověřeno
1. listopadu 2017
Více informací
Termíny související s touto studií
Klíčová slova
Další identifikační čísla studie
- ShanghaiXinhua
Informace o lécích a zařízeních, studijní dokumenty
Studuje lékový produkt regulovaný americkým FDA
Ne
Studuje produkt zařízení regulovaný americkým úřadem FDA
Ne
Tyto informace byly beze změn načteny přímo z webu clinicaltrials.gov. Máte-li jakékoli požadavky na změnu, odstranění nebo aktualizaci podrobností studie, kontaktujte prosím register@clinicaltrials.gov. Jakmile bude změna implementována na clinicaltrials.gov, bude automaticky aktualizována i na našem webu .