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Diversité microbienne des effluents de la stomie de l'intestin grêle et des fèces du côlon

10 février 2019 mis à jour par: Xinhua Hospital, Shanghai Jiao Tong University School of Medicine

Diversité microbienne intestinale des effluents de la stomie de l'intestin grêle et des selles coliques des enfants atteints du syndrome de l'intestin court

Plusieurs études ont suggéré que la dysbactériose survenait généralement chez les patients souffrant d'insuffisance intestinale (IF). Cependant, les différences de diversité du microbiote dans les effluents de stomies de l'intestin grêle et les fèces du côlon ont rarement été étudiées. Ainsi, cette étude vise à étudier les compositions du microbiote et les différences de sortie de la stomie de l'intestin grêle et du côlon chez les patients pédiatriques IF. Échantillons fécaux de patients IF. Chaque patient a reçu une fermeture de fistule dans notre centre et des échantillons fécaux de la petite stomie intestinale et du côlon ont été prélevés. Les compositions microbiennes fécales ont été déterminées par séquençage à haut débit.

Aperçu de l'étude

Statut

Inconnue

Les conditions

Type d'étude

Observationnel

Inscription (Anticipé)

60

Contacts et emplacements

Cette section fournit les coordonnées de ceux qui mènent l'étude et des informations sur le lieu où cette étude est menée.

Coordonnées de l'étude

Lieux d'étude

  • Chine
      • Shanghai, Chine
        • Recrutement
        • Shanghai Xinhua Hospital, affiliated to Shanghai Jiao Tong University, School of Medicine
        • Contact:
          • Wei Cai, MD, PhD

Critères de participation

Les chercheurs recherchent des personnes qui correspondent à une certaine description, appelée critères d'éligibilité. Certains exemples de ces critères sont l'état de santé général d'une personne ou des traitements antérieurs.

Critère d'éligibilité

Âges éligibles pour étudier

1 mois à 3 ans (Enfant)

Accepte les volontaires sains

Oui

Sexes éligibles pour l'étude

Tout

Méthode d'échantillonnage

Échantillon non probabiliste

Population étudiée

Patients hospitalisés

La description

Critère d'intégration:

  • Patients souffrant d'insuffisance intestinale. Les patients ont montré une bonne tolérance à l'administration de nutrition parentérale et entérale. La proportion de nutrition entérale est supérieure à 80 %.

Production de selles maintenue à moins de 50 ml/kg/jour. Aucune complication n'est survenue pendant au moins 1 semaine.

Critère d'exclusion:

  • Les patients dépendent principalement de la nutrition parentérale. Symptômes tels que fièvre, distension abdominale et diarrhée. Complications telles que maladie hépatique associée à la nutrition parentérale, pneumonie et infection liée au cathéter.

Plan d'étude

Cette section fournit des détails sur le plan d'étude, y compris la façon dont l'étude est conçue et ce que l'étude mesure.

Comment l'étude est-elle conçue ?

Détails de conception

Cohortes et interventions

Groupe / Cohorte
Sortie de stomie intestinale
Aucune intervention.
Fèces coliques
Aucune intervention.
Contrôle sain
Aucune intervention.

Que mesure l'étude ?

Principaux critères de jugement

Mesure des résultats
Description de la mesure
Délai
Diversité et composition du microbiote clarifiées par le séquençage de l'ARNr 16s
Délai: 1) Prélèvement d'échantillons : un jour avant la sortie des patients de l'hôpital ; 2) Extraction d'ADN : dans la semaine suivant le prélèvement des échantillons ; 3) Séquençage et analyse des données : dans un délai d'un mois après l'extraction de l'ADN
L'ADN du microbiote intestinal sera extrait. Ensuite, les amplicons d'ADN purifiés sont regroupés en séquences équimolaires et appariées (2 × 250) sur une plateforme Illumina MiSeq. Les fichiers Raw Fastq seront démultiplexés et filtrés par qualité à l'aide de QIIME (version 1.17). Les unités taxonomiques opérationnelles (OTU) seront ensuite regroupées avec un seuil de similarité de 97 % en utilisant UPARSE version 7.1 (http://drive5.com/ uparse/) et les séquences chimériques seront identifiées et supprimées à l'aide d'UCHIME (http://drive5.com/index.htm). L'affiliation phylogénétique de chaque séquence de gène d'ARNr 16S est analysée par RDP Classifier (http://rdp.cme.msu.edu/) contre l'ARNr Silva (SSU117/119)16S. L'indice Sobs et l'indice Chao seront utilisés pour évaluer la diversité du microbiote. La composition du microbiote sera identifiée à différents niveaux, notamment le phylum, la famille et le genre.
1) Prélèvement d'échantillons : un jour avant la sortie des patients de l'hôpital ; 2) Extraction d'ADN : dans la semaine suivant le prélèvement des échantillons ; 3) Séquençage et analyse des données : dans un délai d'un mois après l'extraction de l'ADN

Collaborateurs et enquêteurs

C'est ici que vous trouverez les personnes et les organisations impliquées dans cette étude.

Parrainer

Xinhua Hospital, Shanghai Jiao Tong University School of Medicine

Collaborateurs

National Natural Science Foundation of China
Shanghai Municipal Science and Technology Commission

Publications et liens utiles

La personne responsable de la saisie des informations sur l'étude fournit volontairement ces publications. Il peut s'agir de tout ce qui concerne l'étude.

Publications générales

Dates d'enregistrement des études

Ces dates suivent la progression des dossiers d'étude et des soumissions de résultats sommaires à ClinicalTrials.gov. Les dossiers d'étude et les résultats rapportés sont examinés par la Bibliothèque nationale de médecine (NLM) pour s'assurer qu'ils répondent à des normes de contrôle de qualité spécifiques avant d'être publiés sur le site Web public.

Dates principales de l'étude

Début de l'étude (Réel)

1 novembre 2016

Achèvement primaire (Anticipé)

15 décembre 2019

Achèvement de l'étude (Anticipé)

1 juin 2020

Dates d'inscription aux études

Première soumission

15 juin 2018

Première soumission répondant aux critères de contrôle qualité

5 juillet 2018

Première publication (Réel)

18 juillet 2018

Mises à jour des dossiers d'étude

Dernière mise à jour publiée (Réel)

15 février 2019

Dernière mise à jour soumise répondant aux critères de contrôle qualité

10 février 2019

Dernière vérification

1 novembre 2017

Plus d'information

Termes liés à cette étude

Mots clés

Autres numéros d'identification d'étude

  • ShanghaiXinhua

Informations sur les médicaments et les dispositifs, documents d'étude

Étudie un produit pharmaceutique réglementé par la FDA américaine

Non

Étudie un produit d'appareil réglementé par la FDA américaine

Non

Ces informations ont été extraites directement du site Web clinicaltrials.gov sans aucune modification. Si vous avez des demandes de modification, de suppression ou de mise à jour des détails de votre étude, veuillez contacter register@clinicaltrials.gov. Dès qu'un changement est mis en œuvre sur clinicaltrials.gov, il sera également mis à jour automatiquement sur notre site Web .

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