小肠造口流出物和结肠粪便的微生物多样性
短肠综合征患儿小肠造口流出物和结肠粪便的肠道微生物多样性
几项研究表明，菌群失调通常发生在肠衰竭 (IF) 患者中。
然而，很少研究小肠造口流出物和结肠粪便中微生物群多样性的差异。
因此，本研究旨在调查小儿 IF 患者小肠造口和结肠的微生物群组成和输出差异。
来自 IF 患者的粪便样本。
每位患者都在我们中心接受了瘘管闭合术，并收集了小肠造口和结肠的粪便样本。
通过高通量测序确定粪便微生物组成。
研究概览
地位
未知
条件
研究类型
观察性的
注册 (预期的)
60
联系人和位置
本节提供了进行研究的人员的详细联系信息，以及有关进行该研究的地点的信息。
学习地点
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Shanghai、中国
- 招聘中
- Shanghai Xinhua Hospital, affiliated to Shanghai Jiao Tong University, School of Medicine
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接触：
- Wei Cai, MD, PhD
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参与标准
研究人员寻找符合特定描述的人，称为资格标准。这些标准的一些例子是一个人的一般健康状况或先前的治疗。
资格标准
适合学习的年龄
1个月 至 3年 (孩子)
接受健康志愿者
是的
有资格学习的性别
全部
取样方法
非概率样本
研究人群
住院病人
描述
纳入标准：
- 肠衰竭患者。 患者对肠外和肠内营养给药表现出良好的耐受性。 肠内营养比例达80%以上。
大便量维持在低于 50mL/kg/天。 至少 1 周内无并发症发生。
排除标准：
- 患者主要依赖肠外营养。 出现发热、腹胀、腹泻等症状。 肠外营养相关肝病、肺炎和导管相关感染等并发症。
学习计划
本节提供研究计划的详细信息，包括研究的设计方式和研究的衡量标准。
研究是如何设计的？
设计细节
队列和干预
团体/队列 |
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肠造口输出
没有干预。
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结肠粪便
没有干预。
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健康控制
没有干预。
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研究衡量的是什么？
主要结果指标
结果测量 |
措施说明 |
大体时间 |
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通过 16s rRNA 测序阐明微生物群多样性和组成
大体时间：1）样本采集：患者出院前一天； 2）DNA提取：样本采集后一周内； 3）测序及数据分析：DNA提取后1个月内
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将提取肠道微生物群的 DNA。
然后纯化的 DNA 扩增子在 Illumina MiSeq 平台上等摩尔混合并进行双端测序 (2 × 250)。
原始 Fastq 文件将使用 QIIME（版本 1.17）进行多路复用和质量过滤。
接下来将使用 UPARSE 7.1 版 (http://drive5.com/
uparse/) 和嵌合序列将使用 UCHIME (http://drive5.com/index.htm) 进行识别和删除。
通过 RDP 分类器 (http://rdp.cme.msu.edu/) 分析每个 16S rRNA 基因序列的系统发育隶属关系
针对 silva (SSU117/119)16S rRNA。
Sobs指数和Chao指数将用于评估微生物群多样性。
微生物群的组成将在不同的层次上进行鉴定，包括门、科和属。
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1）样本采集：患者出院前一天； 2）DNA提取：样本采集后一周内； 3）测序及数据分析：DNA提取后1个月内
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合作者和调查者
在这里您可以找到参与这项研究的人员和组织。
出版物和有用的链接
负责输入研究信息的人员自愿提供这些出版物。这些可能与研究有关。
一般刊物
- Arrieta MC, Stiemsma LT, Amenyogbe N, Brown EM, Finlay B. The intestinal microbiome in early life: health and disease. Front Immunol. 2014 Sep 5;5:427. doi: 10.3389/fimmu.2014.00427. eCollection 2014.
- Booijink CC, El-Aidy S, Rajilic-Stojanovic M, Heilig HG, Troost FJ, Smidt H, Kleerebezem M, De Vos WM, Zoetendal EG. High temporal and inter-individual variation detected in the human ileal microbiota. Environ Microbiol. 2010 Dec;12(12):3213-27. doi: 10.1111/j.1462-2920.2010.02294.x.
- Barrett E, Guinane CM, Ryan CA, Dempsey EM, Murphy BP, O'Toole PW, Fitzgerald GF, Cotter PD, Ross RP, Stanton C. Microbiota diversity and stability of the preterm neonatal ileum and colon of two infants. Microbiologyopen. 2013 Apr;2(2):215-25. doi: 10.1002/mbo3.64. Epub 2013 Jan 24.
- Huang Y, Guo F, Li Y, Wang J, Li J. Fecal microbiota signatures of adult patients with different types of short bowel syndrome. J Gastroenterol Hepatol. 2017 Dec;32(12):1949-1957. doi: 10.1111/jgh.13806.
研究记录日期
这些日期跟踪向 ClinicalTrials.gov 提交研究记录和摘要结果的进度。研究记录和报告的结果由国家医学图书馆 (NLM) 审查，以确保它们在发布到公共网站之前符合特定的质量控制标准。
研究主要日期
学习开始 (实际的)
2016年11月1日
初级完成 (预期的)
2019年12月15日
研究完成 (预期的)
2020年6月1日
研究注册日期
首次提交
2018年6月15日
首先提交符合 QC 标准的
2018年7月5日
首次发布 (实际的)
2018年7月18日
研究记录更新
最后更新发布 (实际的)
2019年2月15日
上次提交的符合 QC 标准的更新
2019年2月10日
最后验证
2017年11月1日
更多信息
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