게놈 시퀀싱에 의한 산전 유전 진단 (PrenatalSEQ)
게놈 시퀀싱에 의한 산전 유전 진단: 전향적 평가
연구 개요
상세 설명
전체 엑솜 및 전체 게놈 시퀀싱(WGS)은 이전에 진단되지 않은 장애의 유전적 병인을 결정하는 능력을 확장했습니다. 이 연구는 구조적 이상이 있는 태아 관리를 위한 시퀀싱의 새로운 기술을 평가하기 위한 다기관 전향적 코호트 연구입니다. 가설은 태아 구조적 기형의 상당한 하위 집합이 시퀀싱으로 식별할 수 있는 유전적 병인을 가지고 있으며 이 정보에 대한 태아기 지식이 주산기 관리를 개선하고 불필요한 진단 검사를 줄이며 치료 비용을 줄이고 두 아이 모두의 삶의 질을 향상시킬 것이라는 것입니다. 그리고 가족. 이 연구의 목적은 혁신적인 통합 전향적 설계를 통해 단일 연구에서 태아 시퀀싱의 이러한 여러 측면을 조사하는 것입니다. 이를 통해 태아 환경에서 진단 및 예후 유전자 검사 결과를 제공할 때의 이점과 위험을 강력하게 평가할 수 있습니다.
이 연구는 선별된 태아의 구조적 이상과 음성 또는 비인과적 염색체 마이크로어레이(CMA)가 있는 임신의 순차적 모집단에서 시퀀싱으로 식별할 수 있는 병원성, 병원성 가능성이 있는 불확실한 게놈 변이의 빈도를 결정할 것입니다. 이 정보가 임상 치료에 미치는 영향을 확인하기 위해 유사한 구조적 이상을 가진 연속되지 않은 임신의 통제 집단을 전향적으로 모집하고 두 코호트의 영아를 최대 1세까지 추적합니다. 이 연구 구성 요소는 출산 후 병원 퇴원을 통한 의료 관리 및 비용의 차이와 1년 동안의 주산기 및 영아 결과를 평가합니다. 출생 전 기간, 보육원 및 생후 1년 동안 시퀀싱 결과의 교육, 상담 및 심리사회적 영향도 평가됩니다. 시퀀싱을 치료로 완전히 번역하는 데 필요한 분석 및 임상 도구가 여전히 개발 중이므로, 확립된 질병 유전자의 출생 전 표현형과 관련된 병원성 및 가능성 있는 병원성 돌연변이의 식별을 개선하기 위한 생물정보 도구의 최적화와 새로운 식별을 조사할 것입니다. 현재 진단되지 않은 태아/신생아 표현형과 관련된 유전자. 이 연구는 실전에 책임감 있게 도입하기 전에 시퀀싱의 산전 진단적 가치에 대한 심층 평가를 제공하고 번역을 안내하는 독립적인 데이터를 제공할 것입니다.
연구 유형
등록 (실제)
연락처 및 위치
연구 장소
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New York
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New York, New York, 미국, 10032
- Columbia University Medical Center
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North Carolina
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Chapel Hill, North Carolina, 미국, 27514
- University of North Carolina Chapel Hill
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Ohio
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Cincinnati, Ohio, 미국, 45229
- Children's Hospital, Cincinnati Medical Center
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Texas
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Houston, Texas, 미국, 77030
- Baylor College of Medicine
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Houston, Texas, 미국, 77030
- UT Health Houston
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참여기준
자격 기준
공부할 수 있는 나이
건강한 자원 봉사자를 받아들입니다
샘플링 방법
연구 인구
태아의 구조적 이상이 있고 자격 기준을 충족하는 총 1,100건의 임신이 연구에 등록됩니다. 이 중 750개는 태아기 게놈 염기서열 분석(산전 염기서열 분석 그룹)을 거치게 되며 나머지 350개 임신은 태아기 게놈 염기서열 분석을 수행하지 않습니다(순차가 없는 태아기 그룹).
격리된 목덜미 투명대 측정값이 ≥ 3.5mm인 임신의 등록은 각 그룹(순차 및 비순차) 내에서 5%로 제한되고 분리 추정 태아 체중 <5th %ile도 각 그룹(순차 및 비순차)에 대해 5%로 제한됩니다. .
설명
포함 기준:
산전 시퀀싱 그룹
초음파 및/또는 MRI로 식별된 태아가 다음 중 하나 이상:
- 하나 이상의 주요 구조적 이상(부록 A)
- ≥ 3.5mm의 목덜미 투명도 측정
- 임신 24주 0일 미만의 태아는 정상적인 해부학적 구조를 갖고 있으며 산모의 고혈압, 제1형 당뇨병 또는 태아 성장을 변화시키는 것으로 알려진 기타 산모의 장애 없이 초음파로 추정된 태아 체중이 5%ile 미만입니다.
- 음성 산전 CMA(또는 초음파 소견과 관련 없는 CMA 소견이 있는 경우)
- 싱글톤 또는 쌍둥이 임신
- 임신 36주 미만, 분만 전 시퀀싱 결과의 가용성을 허용하는 0일
순서가 지정되지 않은 그룹
초음파 및/또는 MRI로 식별된 태아가 다음 중 하나 이상:
- 하나 이상의 주요 구조적 이상(부록 A)
- ≥ 3.5mm의 목덜미 투명도 측정
- 임신 24주 0일 미만의 태아로 정상적인 해부학적 구조와 초음파로 추정된 태아 체중이 5%ile 미만이고 산모 고혈압, 제1형 당뇨병 또는 태아 성장을 변화시키는 것으로 알려진 기타 산모 질환이 없습니다.
- 음성 산전 또는 산후 CMA(또는 초음파 소견과 관련되지 않은 CMA 소견이 있는 경우)
- 산전 시퀀싱 거부
- 싱글톤 임신
제외 기준:
산전 시퀀싱 그룹
- 유전자 패널을 포함하여 연구 외부에서 수행된 산전 시퀀싱 또는 계획된 산전 시퀀싱
- 18세 미만의 어머니 또는 아버지의 연령
- 태아 기형의 입증된 감염성 또는 최기형성 원인
- 계획된 임신 중절
- 시퀀싱 전에 두 생물학적 부모로부터 사용할 수 없는 혈액 또는 타액 샘플
- 부모가 출생 후 1년 추적 조사에 참여하지 않으려 함
- 언어 장벽(비영어 또는 스페인어 사용)
- 순차가 없는 산전 그룹에 대한 사전 동의 또는 이전 임신 등록
순서가 지정되지 않은 그룹
- 18세 미만의 어머니 또는 아버지의 연령
- 태아 기형의 입증된 감염성 또는 최기형성 원인
- 삼염색체성 21, 18 또는 13에 대한 양성 산전 NIPT 선별검사. 포지티브 22q11.2 일관된 초음파 결과가 있는 산전 NIPT 검사도 제외됩니다.
- 계획된 임신 중절
- 부모가 출생 후 1년 추적 조사에 참여하지 않으려 함
- 언어 장벽(비영어 또는 스페인어 사용)
공부 계획
연구는 어떻게 설계됩니까?
디자인 세부사항
코호트 및 개입
그룹/코호트 |
개입 / 치료 |
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산전 서열 그룹
연구에서 산전 시퀀싱을 받은 태아 구조적 이상이 있는 750명의 트리오
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전체 게놈 시퀀싱(처음에는 엑솜으로만 가려지고 보고됨)
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산전 시퀀싱 없음(시퀀싱되지 않음) 그룹
산전 시퀀싱이 없는 태아 구조적 이상이 있는 트리오 350개
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연구는 무엇을 측정합니까?
주요 결과 측정
결과 측정 |
측정값 설명 |
기간 |
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보고 가능한 변종을 보유한 참가자 수
기간: 학업이 끝나면 약 4년
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보고 가능한 변종: 병원성/병원성 가능성이 있는 변종(P/LP) 또는 시퀀싱을 통해 식별되고 변이 판정 위원회에서 보고 가능한 것으로 간주되는 불확실한 의미의 변종(VUS)으로 정의됩니다.
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학업이 끝나면 약 4년
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의료 비용
기간: 이상 진단부터 영유아 퇴원까지
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순차화된 그룹과 비순차화된 그룹 간의 이상 진단 시점부터 영아 퇴원까지의 의료 비용입니다.
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이상 진단부터 영유아 퇴원까지
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2차 결과 측정
결과 측정 |
측정값 설명 |
기간 |
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분만 시 재태 연령
기간: 배송시
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분만 시 신생아의 재태 연령(주 단위)
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배송시
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신생아 결과
기간: 생후 28일까지
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신생아 결과를 비교하고 결과는 인공호흡기 지원 필요, 패혈증, 승압 지원 필요, 체외막 산소화(ECMO) 필요, 대사 이상(예: 산증, 요산 상승, 저혈당증/고혈당증), 뇌실내 출혈, 뇌실주위를 경험한 신생아의 수에 따라 측정됩니다. 백혈병, 뇌병증, 발작.
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생후 28일까지
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사망자 수
기간: 퇴원부터 산후 12개월까지
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퇴원 시점 및 12개월 시점의 신생아/영아 사망.
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퇴원부터 산후 12개월까지
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NICU 체류 기간
기간: 퇴원부터 산후 12개월까지
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최초 NICU 체류 기간 및 최초 퇴원부터 12개월까지 병원에서 보낸 일수.
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퇴원부터 산후 12개월까지
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길이(센티미터)
기간: 산후 12개월
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12개월 유아의 키.
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산후 12개월
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킬로그램 단위의 무게
기간: 산후 12개월
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12개월 아기의 체중.
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산후 12개월
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연령 및 단계별 발달 점수 설문지(ASQ-3)
기간: 산후 12개월
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ASQ-3을 사용하여 12개월의 의사소통, 대근육 운동, 미세 운동, 문제 해결 및 개인-사회적 매개변수로 정의된 발달 결과. 점수가 낮을수록 발달 지연과 관련이 있습니다. 각 발달 영역에 대해 부모는 각 항목 응답에 대한 풍선을 채워 YES=10, SOMETIMES=5 또는 NOT YET=0으로 답할 수 있습니다. 각 영역의 전체 점수 범위는 0~60입니다. 각 도메인의 컷오프는 다음과 같습니다. 통신 15.64, 총운동 21.49, 미세운동 34.5, 문제해결 27.32, 개인-사회 21.73 |
산후 12개월
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자가 보고 설문지를 통한 불안
기간: 연구 순서화 결과 공개 후 2주 또는 순서화되지 않은 그룹의 경우 등록 후 4주; 태아 사망 또는 임신 중절이 있었던 경우 퇴원 또는 임신 종료 후 1개월; 산후 12~15개월
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결과 공개(또는 순서가 지정되지 않은 그룹의 경우 등록 후 8주), 신생아 퇴원 및 산후 12개월 후 불안.
전체 점수 범위는 0~21점이며, 숫자가 낮을수록 불안감이 낮습니다(더 나은 결과).
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연구 순서화 결과 공개 후 2주 또는 순서화되지 않은 그룹의 경우 등록 후 4주; 태아 사망 또는 임신 중절이 있었던 경우 퇴원 또는 임신 종료 후 1개월; 산후 12~15개월
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자가 보고 설문지를 통한 우울증
기간: 연구 순서화 결과 공개 후 2주 또는 순서화되지 않은 그룹의 경우 등록 후 4주; 태아 사망 또는 임신 중절이 있었던 경우 퇴원 또는 임신 종료 후 1개월; 산후 12~15개월
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결과 공개(또는 비순차적 그룹의 경우 등록 후 8주), 신생아 퇴원 및 산후 12개월 후 우울증.
전체 점수 범위는 0~24점이며, 점수가 낮을수록 우울증이 낮다(더 나은 결과).
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연구 순서화 결과 공개 후 2주 또는 순서화되지 않은 그룹의 경우 등록 후 4주; 태아 사망 또는 임신 중절이 있었던 경우 퇴원 또는 임신 종료 후 1개월; 산후 12~15개월
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자가 보고 설문지를 통한 삶의 질
기간: 약 4.5년
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산후 12개월의 환자와 가족의 삶의 질.
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약 4.5년
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QALY, 연간 비용으로 측정
기간: 약 4.5년
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품질 조정 수명 연도(QALY)당 증분 비용.
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약 4.5년
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질병 서열 그룹과만 연관되어 확인된 표현형의 총 수
기간: 산후 12개월
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표현형 확장: 현재 정의된 소아 표현형에서 명백한 출생 전 표현형 확장입니다.
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산후 12개월
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VUS 참가자 수 - 순차 그룹만 해당
기간: 산후 12개월
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이 질병 표현형과 아직 연관되지 않은 불확실한 의미의 변종(VUS). 이 결과는 연구 프로토콜에 설명된 대로 순차 분석 부문의 참가자에서만 측정되도록 의도되었습니다. 이 결과에 대한 데이터는 Unsequenced 부문의 참가자로부터 수집되지 않았습니다. |
산후 12개월
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GUS로 분류된 변형이 있는 참가자 수 - 순차 그룹만 해당
기간: 산후 12개월
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VUS는 아직 질병과 관련되지 않은 새로운 유전자(불확실한 임상적 중요성의 유전자, GUS)의 강력한 변이체로 하위 분류됩니다. 이 결과는 연구 프로토콜에 설명된 대로 순차 분석 부문의 참가자에서만 측정되도록 의도되었습니다. 이 결과에 대한 데이터는 Unsequenced 부문의 참가자로부터 수집되지 않았습니다. |
산후 12개월
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디지털 WES - 코딩 및 비코딩 결과 비교 - 순차 그룹만 해당
기간: 약 4.5년
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코딩 영역만(디지털 WES)과 비교하여 시퀀싱(코딩 및 비코딩 영역)을 통해 식별된 병원성, 병원성 가능성이 있는 VUS 변종.
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약 4.5년
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프로밴드만 대 트리오 - 트리오와 프로밴드만 간의 결과 비교 - 순차 그룹만
기간: 약 4.5년
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발의자-부모 트리오와 비교하여 발의자 단독 분석을 통해 확인된 병원성, 병원성 가능성이 있는 VUS 변종.
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약 4.5년
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NICU 의사 및 기록 검토에 의해 결정된 관리(의료) 변경 - 순차 그룹에만 해당
기간: 출산부터 퇴원 또는 사망까지(신생아)
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환자의 치료 계획 변경 또는 즉각적 또는 장기적인 의학적 관리에 관한 환자/가족 상담의 변경으로 정의되는 게놈 결과로 인해 관리 결정이 변경된 참가자 수. 이 결과는 연구 프로토콜에 설명된 대로 순차 분석 부문의 참가자에서만 측정되도록 의도되었습니다. 이 결과에 대한 데이터는 Unsequenced 부문의 참가자로부터 수집되지 않았습니다. |
출산부터 퇴원 또는 사망까지(신생아)
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자가 보고 설문지를 통한 부모의 지원 요구 - 순차 그룹에만 해당
기간: 시퀀싱 완료 시 약 4.5년
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어머니와 아버지의 교육/상담 및 사회적 지원 요구를 평가합니다.
전체 점수 범위는 12~60점이며, 점수가 높을수록 경험에 대한 만족도(더 나은 결과)가 높다는 것을 의미합니다.
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시퀀싱 완료 시 약 4.5년
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자가 보고 설문지를 통한 부모의 이해 - 순차 그룹에만 해당
기간: 시퀀싱 완료 시 약 4.5년
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유전자 검사 결과에 대한 부모의 이해의 정확성.
'태아유전검사 결과를 얼마나 잘 이해하고 계십니까?'라는 질문에 대한 부모의 반응은 다음과 같습니다. 수집됩니다.
가능한 모든 응답은 다음과 같습니다: "전혀 없음", "약간 있음", "보통", "약간 있음", "매우 있음"
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시퀀싱 완료 시 약 4.5년
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시퀀싱 결과에 변경이 발생한 참가자 수 - 시퀀스된 그룹에만 해당
기간: 시퀀싱 완료부터 데이터 분석 기간까지 최대 4.5년
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시퀀싱 변이체 분류의 변경으로 이어지는 시퀀싱 결과의 재해석. 이 결과는 연구 프로토콜에 설명된 대로 순차 분석 부문의 참가자에서만 측정되도록 의도되었습니다. 이 결과에 대한 데이터는 Unsequenced 부문의 참가자로부터 수집되지 않았습니다. |
시퀀싱 완료부터 데이터 분석 기간까지 최대 4.5년
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처리 시간 - 순차 그룹에만 해당
기간: 시퀀싱 시작부터 연구 현장 결과까지의 시간, 최대 38일
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시퀀싱 구성 요소의 처리 시간과 시간에 따른 변화 방식.
이 결과는 연구 프로토콜에 설명된 대로 순차 분석 부문의 참가자에서만 측정되도록 의도되었습니다.
이 결과에 대한 데이터는 Unsequenced 부문의 참가자로부터 수집되지 않았습니다.
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시퀀싱 시작부터 연구 현장 결과까지의 시간, 최대 38일
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공동 작업자 및 조사자
협력자
수사관
- 수석 연구원: Ronald Wapner, MD, Columbia University
연구 기록 날짜
연구 주요 날짜
연구 시작 (실제)
기본 완료 (실제)
연구 완료 (실제)
연구 등록 날짜
최초 제출
QC 기준을 충족하는 최초 제출
처음 게시됨 (실제)
연구 기록 업데이트
마지막 업데이트 게시됨 (추정된)
QC 기준을 충족하는 마지막 업데이트 제출
마지막으로 확인됨
추가 정보
이 연구와 관련된 용어
기타 연구 ID 번호
- AAAS2118
- R01HD055651 (미국 NIH 보조금/계약)
개별 참가자 데이터(IPD) 계획
개별 참가자 데이터(IPD)를 공유할 계획입니까?
IPD 계획 설명
IPD 공유 기간
IPD 공유 액세스 기준
IPD 공유 지원 정보 유형
- 연구_프로토콜
- 수액
- ICF
- CSR
약물 및 장치 정보, 연구 문서
미국 FDA 규제 의약품 연구
미국 FDA 규제 기기 제품 연구
미국에서 제조되어 미국에서 수출되는 제품
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