Diagnóstico Genético Pré-Natal por Sequenciamento Genômico (PrenatalSEQ)
Diagnóstico genético pré-natal por sequenciamento genômico: uma avaliação prospectiva
Visão geral do estudo
Status
Condições
Intervenção / Tratamento
Descrição detalhada
O exoma total e o sequenciamento completo do genoma (WGS) expandiram a capacidade de determinar a etiologia genética de distúrbios não diagnosticados anteriormente. Este estudo é um estudo de coorte prospectivo multicêntrico para avaliar a tecnologia emergente de sequenciamento para o manejo de fetos com anomalias estruturais. A hipótese é que um subconjunto significativo de anomalias estruturais fetais tem uma etiologia genética identificável por sequenciamento e que o conhecimento pré-natal dessas informações melhorará o cuidado perinatal, reduzirá os testes diagnósticos desnecessários, reduzirá o custo do atendimento e melhorará a qualidade de vida da criança e a família. Os objetivos deste estudo são investigar esses múltiplos aspectos do sequenciamento pré-natal em um único estudo com um design prospectivo integrado inovador, que permitirá uma avaliação robusta dos benefícios e riscos da entrega de resultados de testes genéticos diagnósticos e prognósticos em um ambiente pré-natal.
O estudo determinará, em uma população sequencial de gestações com anomalias estruturais fetais selecionadas e um microarray cromossômico (CMA) negativo ou não causal, a frequência de variantes genômicas patogênicas, provavelmente patogênicas e incertas identificáveis por sequenciamento. Para determinar o impacto dessas informações no atendimento clínico, uma população controle de gestações não sequenciadas com anomalias estruturais semelhantes será recrutada prospectivamente e os bebês de ambas as coortes serão acompanhados até 1 ano de idade. Este componente do estudo avaliará as diferenças na gestão de cuidados de saúde e custos até a alta hospitalar pós-parto e resultados perinatais e infantis até 1 ano de vida. O impacto educacional, de aconselhamento e psicossocial dos resultados do sequenciamento durante o período pré-natal, no berçário e até 1 ano de vida também será avaliado. Uma vez que as ferramentas analíticas e clínicas necessárias para a tradução completa do sequenciamento em cuidados ainda estão em desenvolvimento, será investigada a otimização de ferramentas bioinformáticas para melhorar a identificação de mutações patogênicas e prováveis associadas a fenótipos pré-natais de genes de doenças estabelecidas, bem como a identificação de novos genes associados com fenótipos fetais/neonatais atualmente não diagnosticados. Este estudo fornecerá uma avaliação aprofundada do valor diagnóstico pré-natal do sequenciamento antes de sua introdução responsável na prática e fornecerá dados independentes para orientar sua tradução.
Tipo de estudo
Inscrição (Real)
Contactos e Locais
Locais de estudo
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New York
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New York, New York, Estados Unidos, 10032
- Columbia University Medical Center
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North Carolina
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Chapel Hill, North Carolina, Estados Unidos, 27514
- University of North Carolina Chapel Hill
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Ohio
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Cincinnati, Ohio, Estados Unidos, 45229
- Children's Hospital, Cincinnati Medical Center
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Texas
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Houston, Texas, Estados Unidos, 77030
- Baylor College of Medicine
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Houston, Texas, Estados Unidos, 77030
- UT Health Houston
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Critérios de participação
Critérios de elegibilidade
Idades elegíveis para estudo
Aceita Voluntários Saudáveis
Método de amostragem
População do estudo
Um total de 1.100 gestações com anomalias estruturais fetais e critérios de elegibilidade serão incluídos no estudo. Destas, 750 passarão por sequenciamento genômico pré-natal (grupo de sequenciamento pré-natal) e as 350 gestações restantes não terão sequenciamento genômico pré-natal (grupo pré-natal não sequenciado).
A inscrição de gestações com medidas isoladas de translucência nucal ≥ 3,5 mm será restrita a 5% dentro de cada grupo (sequenciado e não sequenciado) e o peso fetal estimado isolado <5% também será restrito a 5% para cada grupo (sequenciado e não sequenciado) .
Descrição
Critério de inclusão:
Grupo de sequenciamento pré-natal
Feto identificado por ultrassom e/ou ressonância magnética com pelo menos um dos seguintes:
- Uma ou mais anomalias estruturais importantes (Apêndice A)
- Uma medida de translucência nucal de ≥ 3,5 mm
- Um feto com menos de 24 semanas e 0 dias de gestação com anatomia normal e peso fetal ultrassonograficamente estimado < 5% sem hipertensão materna, diabetes tipo I ou outros distúrbios maternos conhecidos por alterar o crescimento fetal.
- CMA pré-natal negativo (ou aqueles com achados de CMA não relacionados ao achado ultrassonográfico)
- Gestação única ou gemelar
- Idade gestacional inferior a 36 semanas, 0 dias para permitir a disponibilidade de resultados de sequenciamento antes do parto
Grupo não sequenciado
Feto identificado por ultrassom e/ou ressonância magnética com pelo menos um dos seguintes:
- Uma ou mais anomalias estruturais importantes (Apêndice A)
- Uma medida de translucência nucal de ≥ 3,5 mm
- Um feto com menos de 24 semanas e 0 dias de gestação com anatomia normal e peso fetal ultrassonograficamente estimado <5% sem hipertensão materna, diabetes tipo I ou outros distúrbios maternos conhecidos por alterar o crescimento fetal
- CMA pré-natal ou pós-natal negativo (ou aqueles com achados de CMA não relacionados ao achado ultrassonográfico)
- Sequenciamento pré-natal recusado
- gestação única
Critério de exclusão:
Grupo de Sequenciamento Pré-Natal
- Sequenciamento pré-natal ou sequenciamento pré-natal planejado realizado fora do estudo, incluindo painéis de genes
- Idade materna ou paterna inferior a 18 anos
- Causa infecciosa ou teratogênica comprovada de anomalia fetal
- Interrupção planejada da gravidez
- Amostras indisponíveis de sangue ou saliva de ambos os pais biológicos antes do sequenciamento
- Relutância dos pais em participar do acompanhamento pós-natal de 1 ano
- Barreira de idioma (não fala inglês ou espanhol)
- Consentimento prévio ao grupo de pré-natal não sequenciado ou inscrição em gravidez anterior
Grupo não sequenciado
- Idade materna ou paterna inferior a 18 anos
- Causa infecciosa ou teratogênica comprovada de anomalia fetal
- Triagem NIPT pré-natal positiva para trissomia 21,18 ou 13. Positivo 22q11.2 O teste NIPT pré-natal com achados ultrassonográficos consistentes também é uma exclusão.
- Interrupção planejada da gravidez
- Relutância dos pais em participar do acompanhamento pós-natal de 1 ano
- Barreira de idioma (não fala inglês ou espanhol)
Plano de estudo
Como o estudo é projetado?
Detalhes do projeto
Coortes e Intervenções
Grupo / Coorte |
Intervenção / Tratamento |
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Grupo sequenciado pré-natal
750 trios com anomalias estruturais fetais que recebem sequenciamento pré-natal do estudo
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Sequenciamento completo do genoma (que inicialmente será mascarado e relatado apenas como exoma)
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Grupo Sem Sequenciamento Pré-Natal (Não Sequenciado)
350 trios com anomalias estruturais fetais que não possuem sequenciamento pré-natal
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O que o estudo está medindo?
Medidas de resultados primários
Medida de resultado |
Descrição da medida |
Prazo |
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Número de participantes que tinham variantes reportáveis
Prazo: No final do estudo, aproximadamente 4 anos
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Variantes reportáveis: definidas como patogênicas/provavelmente patogênicas (P/LP) ou variante de significado incerto (VUS) identificadas por sequenciamento e consideradas reportáveis pelo Comitê de Adjudicação de Variantes.
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No final do estudo, aproximadamente 4 anos
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Custos de saúde
Prazo: Do momento do diagnóstico da anomalia até a alta do bebê
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Custos de saúde desde o diagnóstico da anomalia até a alta do bebê entre grupos sequenciados e não sequenciados.
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Do momento do diagnóstico da anomalia até a alta do bebê
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Medidas de resultados secundários
Medida de resultado |
Descrição da medida |
Prazo |
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Idade gestacional no parto
Prazo: Na hora da entrega
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Idade gestacional do recém-nascido no parto (em semanas)
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Na hora da entrega
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Resultados neonatais
Prazo: Até 28 dias após o nascimento
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Os resultados neonatais serão comparados e medidos pelo número de recém-nascidos que apresentam: necessidade de suporte ventilatório, sepse, necessidade de suporte pressórico, necessidade de oxigenação por membrana extracorpórea (ECMO), anormalidades metabólicas (por exemplo, acidose, ácido úrico elevado, hipo/hiperglicemia), hemorragia intraventricular, periventricular leucomalácia, encefalopatia e convulsão.
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Até 28 dias após o nascimento
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Número de mortes
Prazo: Da alta até 12 meses pós-parto
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Morte neonatal/infantil no momento da alta e aos 12 meses de idade.
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Da alta até 12 meses pós-parto
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Duração da permanência na UTIN
Prazo: Da alta até 12 meses pós-parto
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Tempo de permanência inicial na UTIN e número de dias passados no hospital entre a alta inicial e os 12 meses de idade.
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Da alta até 12 meses pós-parto
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Comprimento em centímetros
Prazo: 12 meses pós-parto
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Comprimento do bebê aos 12 meses de idade.
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12 meses pós-parto
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Peso em quilogramas
Prazo: 12 meses pós-parto
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Peso do bebê aos 12 meses de idade.
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12 meses pós-parto
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Questionário de pontuação no desenvolvimento por idades e estágios (ASQ-3)
Prazo: 12 meses pós-parto
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Desfechos de desenvolvimento definidos pelos seguintes parâmetros: comunicação, motricidade grossa, motricidade fina, resolução de problemas e pessoal-social, aos 12 meses de idade por meio do ASQ-3. Pontuações mais baixas estão associadas ao atraso no desenvolvimento. Para cada área de desenvolvimento, os pais podem responder SIM = 10, ÀS VEZES = 5 ou AINDA NÃO = 0, preenchendo um balão para cada item de resposta. A faixa completa de pontuação para cada domínio é de 0 a 60. Os pontos de corte para cada domínio são: Comunicação 15.64, Motor Bruto 21,49, Motor Fino 34,5, Resolução de Problemas 27,32, Pessoal-Social 21,73 |
12 meses pós-parto
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Ansiedade por questionário de autorrelato
Prazo: 2 semanas após a divulgação dos resultados do sequenciamento do estudo ou 4 semanas após a inscrição para o grupo não sequenciado; 1 mês após a alta hospitalar ou término da gravidez se houve morte fetal ou interrupção da gravidez; 12-15 meses pós-parto
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Ansiedade após divulgação dos resultados (ou 8 semanas após a inscrição para o grupo não sequenciado), alta neonatal e 12 meses pós-parto.
A faixa de pontuação completa é de 0 a 21, onde números mais baixos representam menor ansiedade (melhor resultado).
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2 semanas após a divulgação dos resultados do sequenciamento do estudo ou 4 semanas após a inscrição para o grupo não sequenciado; 1 mês após a alta hospitalar ou término da gravidez se houve morte fetal ou interrupção da gravidez; 12-15 meses pós-parto
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Depressão por questionário de autorrelato
Prazo: 2 semanas após a divulgação dos resultados do sequenciamento do estudo ou 4 semanas após a inscrição para o grupo não sequenciado; 1 mês após a alta hospitalar ou término da gravidez se houve morte fetal ou interrupção da gravidez; 12-15 meses pós-parto
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Depressão após divulgação dos resultados (ou 8 semanas após a inscrição para o grupo não sequenciado), alta neonatal e 12 meses pós-parto.
A faixa de pontuação completa é de 0 a 24, onde uma pontuação mais baixa representa menor depressão (melhor resultado).
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2 semanas após a divulgação dos resultados do sequenciamento do estudo ou 4 semanas após a inscrição para o grupo não sequenciado; 1 mês após a alta hospitalar ou término da gravidez se houve morte fetal ou interrupção da gravidez; 12-15 meses pós-parto
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Qualidade de vida por questionário de autorrelato
Prazo: Aproximadamente 4,5 anos
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Qualidade de vida da paciente e família aos 12 meses pós-parto.
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Aproximadamente 4,5 anos
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QALY, medido em custo por ano
Prazo: Aproximadamente 4,5 anos
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Custo incremental por Ano de Vida Ajustado pela Qualidade (QALY).
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Aproximadamente 4,5 anos
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Número total de fenótipos identificados associados SOMENTE ao grupo sequenciado por doenças
Prazo: 12 meses pós-parto
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Expansão Fenotípica: Expansão fenotípica pré-natal aparente dos fenótipos pediátricos atualmente definidos.
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12 meses pós-parto
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Número de participantes com VUS - SOMENTE grupo sequenciado
Prazo: 12 meses pós-parto
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Variantes de significado incerto (VUS) que ainda não foram associadas ao fenótipo desta doença. Este resultado deveria ser medido apenas em participantes do braço Sequenciado, conforme descrito no protocolo do estudo. Os dados para este resultado não foram coletados de nenhum participante do braço Não Sequenciado. |
12 meses pós-parto
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Número de participantes com variantes classificadas como GUS - SOMENTE grupo sequenciado
Prazo: 12 meses pós-parto
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VUS subclassificado como variantes convincentes em novos genes que ainda não estão associados a doenças (genes de significado clínico incerto; GUS). Este resultado deveria ser medido apenas em participantes do braço Sequenciado, conforme descrito no protocolo do estudo. Os dados para este resultado não foram coletados de nenhum participante do braço Não Sequenciado. |
12 meses pós-parto
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WES digital - Comparação de resultados de codificação e não codificação - SOMENTE grupo sequenciado
Prazo: Aproximadamente 4,5 anos
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Variantes patogênicas, provavelmente patogênicas e VUS identificadas por sequenciamento (regiões codificantes e não codificantes) em comparação apenas com regiões codificantes (WES digital).
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Aproximadamente 4,5 anos
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Proband Only Versus Trio - Comparação de resultados entre Trio e Proband Only - SOMENTE Grupo Sequenciado
Prazo: Aproximadamente 4,5 anos
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Variantes patogênicas, provavelmente patogênicas e VUS identificadas pela análise de um probando sozinho em comparação com um trio probando-pai.
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Aproximadamente 4,5 anos
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Mudança na gestão (cuidados de saúde) conforme determinado pelo médico da UTIN e revisão de registros - SOMENTE grupo sequenciado
Prazo: Do parto até a alta ou óbito (neonatal)
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Número de participantes que tiveram uma mudança nas decisões de manejo atribuíveis aos resultados genômicos, definidos como mudanças no plano de tratamento do paciente ou mudanças no aconselhamento do paciente/família em relação ao manejo médico imediato ou de longo prazo. Este resultado deveria ser medido apenas em participantes do braço Sequenciado, conforme descrito no protocolo do estudo. Os dados para este resultado não foram coletados de nenhum participante do braço Não Sequenciado. |
Do parto até a alta ou óbito (neonatal)
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Necessidades de apoio parental por questionário de autorrelato - SOMENTE grupo sequenciado
Prazo: Na conclusão do sequenciamento, aproximadamente 4,5 anos
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Avaliação das necessidades educacionais/aconselhamento e de apoio social da mãe e do pai.
A faixa de pontuação completa é de 12 a 60, onde uma pontuação mais alta representa maior satisfação com a experiência (melhor resultado).
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Na conclusão do sequenciamento, aproximadamente 4,5 anos
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Compreensão dos pais por questionário de autorrelato - SOMENTE grupo sequenciado
Prazo: Na conclusão do sequenciamento, aproximadamente 4,5 anos
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Precisão da compreensão dos pais sobre os resultados dos testes genéticos.
As respostas dos pais à pergunta "Até que ponto você entende os resultados dos seus testes genéticos pré-natais?" serão recolhidos.
Todas as respostas possíveis são: “Nada”, “Um pouco”, “Moderadamente”, “Bastante” e “Extremamente”
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Na conclusão do sequenciamento, aproximadamente 4,5 anos
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Número de participantes que tiveram alteração no resultado do sequenciamento - SOMENTE grupo sequenciado
Prazo: Desde a conclusão do sequenciamento até o período de análise de dados, até 4,5 anos
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Reinterpretações dos resultados do sequenciamento que levam a uma mudança na classificação das variantes do sequenciamento. Este resultado deveria ser medido apenas em participantes do braço Sequenciado, conforme descrito no protocolo do estudo. Os dados para este resultado não foram coletados de nenhum participante do braço Não Sequenciado. |
Desde a conclusão do sequenciamento até o período de análise de dados, até 4,5 anos
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Tempo de resposta - SOMENTE grupo sequenciado
Prazo: Tempo desde o início do sequenciamento até o resultado do local do estudo, até 38 dias
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Tempo de resposta dos componentes de sequenciamento e como ele muda ao longo do tempo.
Este resultado deveria ser medido apenas em participantes do braço Sequenciado, conforme descrito no protocolo do estudo.
Os dados para este resultado não foram coletados de nenhum participante do braço Não Sequenciado.
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Tempo desde o início do sequenciamento até o resultado do local do estudo, até 38 dias
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Colaboradores e Investigadores
Patrocinador
Colaboradores
Investigadores
- Investigador principal: Ronald Wapner, MD, Columbia University
Datas de registro do estudo
Datas Principais do Estudo
Início do estudo (Real)
Conclusão Primária (Real)
Conclusão do estudo (Real)
Datas de inscrição no estudo
Enviado pela primeira vez
Enviado pela primeira vez que atendeu aos critérios de CQ
Primeira postagem (Real)
Atualizações de registro de estudo
Última Atualização Postada (Estimado)
Última atualização enviada que atendeu aos critérios de controle de qualidade
Última verificação
Mais Informações
Termos relacionados a este estudo
Outros números de identificação do estudo
- AAAS2118
- R01HD055651 (Concessão/Contrato do NIH dos EUA)
Plano para dados de participantes individuais (IPD)
Planeja compartilhar dados de participantes individuais (IPD)?
Descrição do plano IPD
Prazo de Compartilhamento de IPD
Critérios de acesso de compartilhamento IPD
Tipo de informação de suporte de compartilhamento de IPD
- PROTOCOLO DE ESTUDO
- SEIVA
- CIF
- CSR
Informações sobre medicamentos e dispositivos, documentos de estudo
Estuda um medicamento regulamentado pela FDA dos EUA
Estuda um produto de dispositivo regulamentado pela FDA dos EUA
produto fabricado e exportado dos EUA
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