Denne side blev automatisk oversat, og nøjagtigheden af ​​oversættelsen er ikke garanteret. Der henvises til engelsk version for en kildetekst.

Prænatal genetisk diagnose ved genomisk sekventering (PrenatalSEQ)

14. oktober 2025 opdateret af: Ronald J Wapner, MD, Columbia University

Prænatal genetisk diagnose ved genomisk sekventering: en prospektiv evaluering

Denne undersøgelse evaluerer virkningen af ​​prænatal sekventering på håndteringen af ​​fostre med ultralydsabnormiteter. Hypotesen er, at en betydelig delmængde af fosterabnormaliteter har en genetisk årsag, der kan identificeres ved sekventering, og at prænatal viden om denne information vil forbedre prænatal pleje, reducere unødvendige diagnostiske tests, reducere omkostningerne til pleje og forbedre livskvaliteten for både barnet og familien.

Studieoversigt

Status

Afsluttet

Detaljeret beskrivelse

Hele exome og hele genom sekventering (WGS) har udvidet evnen til at bestemme den genetiske ætiologi af tidligere udiagnosticerede lidelser. Denne undersøgelse er en multicenter prospektiv kohorteundersøgelse for at evaluere den nye teknologi til sekventering til håndtering af fostre med strukturelle anomalier. Hypotesen er, at en betydelig delmængde af føtale strukturelle anomalier har en genetisk ætiologi, der kan identificeres ved sekventering, og at prænatal viden om denne information vil forbedre den perinatale pleje, reducere unødvendige diagnostiske tests, reducere omkostningerne ved pleje og forbedre livskvaliteten for både barnet. og familien. Formålet med denne undersøgelse er at undersøge disse mange aspekter af prænatal sekventering i en enkelt undersøgelse med et innovativt integreret prospektivt design, som vil tillade en robust evaluering af fordele og risici ved at levere diagnostiske og prognostiske genetiske testresultater i en prænatal setting.

Undersøgelsen vil bestemme, i en sekventiel population af graviditeter med udvalgte føtale strukturelle anomalier og en negativ eller ikke-kausal kromosomal mikroarray (CMA), hyppigheden af ​​patogene, sandsynligt patogene og usikre genomiske varianter, der kan identificeres ved sekventering. For at bestemme virkningen af ​​denne information på den kliniske pleje, vil en kontrolpopulation af usekventerede graviditeter med lignende strukturelle anomalier blive rekrutteret prospektivt, og spædbørnene fra begge kohorter vil blive fulgt op til 1 års alderen. Denne undersøgelseskomponent vil evaluere forskelle i sundhedspleje og omkostninger ved udskrivelse fra hospital efter fødslen og perinatale og spædbørns resultater gennem 1 år af livet. Den pædagogiske, rådgivningsmæssige og psykosociale effekt af sekventeringsresultater i den prænatale periode, i vuggestuen og gennem 1 leveår vil også blive evalueret. Da de analytiske og kliniske værktøjer, der er nødvendige for den fulde oversættelse af sekventering til pleje, stadig er under udvikling, vil optimering af bioinformatiske værktøjer til at forbedre identifikation af patogene og sandsynlige patogene mutationer forbundet med prænatale fænotyper af etablerede sygdomsgener blive undersøgt, samt identifikation af nye gener forbundet med i øjeblikket udiagnosticerede føtale/neonatale fænotyper. Denne undersøgelse vil give en dybdegående evaluering af den prænatale diagnostiske værdi af sekventering forud for dens ansvarlige introduktion i praksis og vil give uafhængige data til at vejlede dens oversættelse.

Undersøgelsestype

Observationel

Tilmelding (Faktiske)

1097

Kontakter og lokationer

Dette afsnit indeholder kontaktoplysninger for dem, der udfører undersøgelsen, og oplysninger om, hvor denne undersøgelse udføres.

Studiesteder

    • New York
      • New York, New York, Forenede Stater, 10032
        • Columbia University Medical Center
    • North Carolina
      • Chapel Hill, North Carolina, Forenede Stater, 27514
        • University of North Carolina Chapel Hill
    • Ohio
      • Cincinnati, Ohio, Forenede Stater, 45229
        • Children's Hospital, Cincinnati Medical Center
    • Texas
      • Houston, Texas, Forenede Stater, 77030
        • Baylor College of Medicine
      • Houston, Texas, Forenede Stater, 77030
        • UT Health Houston

Deltagelseskriterier

Forskere leder efter personer, der passer til en bestemt beskrivelse, kaldet berettigelseskriterier. Nogle eksempler på disse kriterier er en persons generelle helbredstilstand eller tidligere behandlinger.

Berettigelseskriterier

Aldre berettiget til at studere

18 år og ældre (Voksen, Ældre voksen)

Tager imod sunde frivillige

Ja

Prøveudtagningsmetode

Ikke-sandsynlighedsprøve

Studiebefolkning

I alt 1.100 graviditeter med føtale strukturelle anomalier og opfyldelse af berettigelseskriterier vil blive tilmeldt undersøgelsen. Af disse vil 750 gennemgå prænatal genomisk sekventering (prænatal sekventeringsgruppe), og de resterende 350 graviditeter vil ikke have nogen prænatal genomisk sekventering (ikke-sekventeret prænatal gruppe).

Tilmelding af graviditeter med en isoleret nuchal translucensmålinger ≥ 3,5 mm vil være begrænset til 5 % inden for hver gruppe (sekventeret og usekventeret), og isoleret estimeret fostervægt <5. %ile vil også være begrænset til 5 % for hver gruppe (sekventeret og usekventeret) .

Beskrivelse

Inklusionskriterier:

Prænatal sekventeringsgruppe

  1. Foster identificeret ved ultralyd og/eller MR med mindst én af følgende:

    1. En eller flere større strukturelle anomalier (bilag A)
    2. En nuchal translucensmåling på ≥ 3,5 mm
    3. Et foster under 24 uger 0 dages svangerskab med normal anatomi og sonografisk estimeret fostervægt <5. %ile uden maternel hypertension, type I diabetes eller andre maternelle lidelser, der vides at ændre fostervæksten.
  2. Negativ prænatal CMA (eller dem med CMA-fund, der ikke er relateret til ultralydsfundet)
  3. Singleton eller tvilling graviditet
  4. Svangerskabsalder mindre end 36 uger, 0 dage for at give mulighed for tilgængelighed af sekventeringsresultater før levering

Ikke-sekventeret gruppe

  1. Foster identificeret ved ultralyd og/eller MR med mindst én af følgende:

    1. En eller flere større strukturelle anomalier (bilag A)
    2. En nuchal translucensmåling på ≥ 3,5 mm
    3. Et foster under 24 uger 0 dages svangerskab med normal anatomi og sonografisk estimeret fostervægt <5. %ile uden maternel hypertension, type I diabetes eller andre maternelle lidelser, der vides at ændre fostervæksten
  2. Negativ prænatal eller postnatal CMA (eller dem med CMA-fund, der ikke er relateret til ultralydsfundet)
  3. Afvist prænatal sekventering
  4. Singleton drægtighed

Ekskluderingskriterier:

Prænatal sekventeringsgruppe

  1. Prænatal sekventering eller planlagt prænatal sekventering udført uden for undersøgelsen, inklusive genpaneler
  2. Moderens eller faderens alder under 18 år
  3. Påvist infektiøs eller teratogene årsag til føtal anomali
  4. Planlagt afbrydelse af graviditeten
  5. Utilgængelige blod- eller spytprøver fra begge biologiske forældre før sekventering
  6. Forældres manglende vilje til at deltage i 1 års postnatal opfølgning
  7. Sprogbarriere (ikke-engelsk eller spansktalende)
  8. Tidligere samtykke til den usekventerede prænatale gruppe eller tilmelding til en tidligere graviditet

Ikke-sekventeret gruppe

  1. Moderens eller faderens alder under 18 år
  2. Påvist infektiøs eller teratogene årsag til føtal anomali
  3. Positiv prænatal NIPT-screening for trisomi 21, 18 eller 13. Positiv 22q11.2 prænatal NIPT-testning med konsistente ultralydsfund er også en udelukkelse.
  4. Planlagt afbrydelse af graviditeten
  5. Forældres manglende vilje til at deltage i 1 års postnatal opfølgning
  6. Sprogbarriere (ikke-engelsk eller spansktalende)

Studieplan

Dette afsnit indeholder detaljer om studieplanen, herunder hvordan undersøgelsen er designet, og hvad undersøgelsen måler.

Hvordan er undersøgelsen tilrettelagt?

Design detaljer

Kohorter og interventioner

Gruppe / kohorte
Intervention / Behandling
Prænatalt sekventeret gruppe
750 trioer med føtale strukturelle anomalier, der modtager prænatal sekventering fra undersøgelsen
Helgenomsekventering (som i første omgang vil blive maskeret og kun rapporteret som exome)
Ingen prænatal sekventeringsgruppe (ikke-sekventeret).
350 trioer med føtale strukturelle anomalier, der ikke har prænatal sekventering

Hvad måler undersøgelsen?

Primære resultatmål

Resultatmål
Foranstaltningsbeskrivelse
Tidsramme
Antal deltagere, der havde rapporterbare varianter
Tidsramme: Efter endt studie ca. 4 år
Rapporterbare varianter: defineret som enten patogene/sandsynlige patogene (P/LP) eller varianter af usikker betydning (VUS) identificeret ved sekventering og vurderet som rapporterbare af Variant Adjudication Committee.
Efter endt studie ca. 4 år
Udgifter til sundhedspleje
Tidsramme: Fra tidspunktet for diagnose af anomali til spædbarnsudledning
Sundhedsomkostninger fra tidspunktet for diagnosticering af anomali til spædbarnsudskrivning mellem sekventerede og ikke-sekventerede grupper.
Fra tidspunktet for diagnose af anomali til spædbarnsudledning

Sekundære resultatmål

Resultatmål
Foranstaltningsbeskrivelse
Tidsramme
Gestationsalder ved levering
Tidsramme: På leveringstidspunktet
Gestationsalder for nyfødt ved fødslen (i uger)
På leveringstidspunktet
Neonatale resultater
Tidsramme: Op til 28 dage efter fødslen
Neonatale resultater vil blive sammenlignet, og resultaterne vil blive målt ved antallet af nyfødte, der oplever: behov for ventilatorstøtte, sepsis, behov for pressorstøtte, behov for ekstrakorporal membraniltning (ECMO), metaboliske abnormiteter (f.eks. acidose, forhøjet urinsyre, hypo-/hyperglykæmi), intraventrikulær periventrikulær blødning, leukomalaci, encefalopati og anfald.
Op til 28 dage efter fødslen
Antal dødsfald
Tidsramme: Fra udskrivelse til 12 måneder efter fødslen
Neonatal/spædbarnsdød ved udskrivelse og ved 12 måneders alderen.
Fra udskrivelse til 12 måneder efter fødslen
Varighed af NICU-ophold
Tidsramme: Fra udskrivelse til 12 måneder efter fødslen
Længden af ​​indledende NICU-ophold og antal dage brugt på hospitalet mellem den første udskrivelse og 12 måneders alderen.
Fra udskrivelse til 12 måneder efter fødslen
Længde i centimeter
Tidsramme: 12 måneder efter fødslen
Spædbarnslængde ved 12 måneders alderen.
12 måneder efter fødslen
Vægt i kilogram
Tidsramme: 12 måneder efter fødslen
Spædbarnsvægt ved 12 måneders alderen.
12 måneder efter fødslen
Score på udvikling efter aldre og stadier Spørgeskema (ASQ-3)
Tidsramme: 12 måneder efter fødslen

Udviklingsresultater defineret af følgende parametre: kommunikation, grovmotorik, finmotorik, problemløsning og personlig-social, ved 12 måneders alderen ved brug af ASQ-3. Lavere score er forbundet med udviklingsforsinkelse. For hvert udviklingsområde kan forældre svare JA=10, NOGLE GANGE=5 eller IKKE ENDNU=0 ved at udfylde en boble for hvert emnesvar. Det fulde scoreinterval for hvert domæne er 0 til 60.

Afskæringer for hvert domæne er: Kommunikation 15.64, Bruttomotorisk 21,49, finmotorisk 34,5, problemløsning 27,32, personlig-social 21,73

12 måneder efter fødslen
Angst ved selvrapport spørgeskema
Tidsramme: 2 uger efter offentliggørelse af undersøgelsessekventeringsresultater eller 4 uger efter tilmelding til den ikke-sekventerede gruppe; 1 måned efter udskrivelse fra hospitalet eller afslutning af graviditeten, hvis der var fosterdød eller svangerskabsafbrydelse; 12-15 måneder efter fødslen
Angst efter afsløring af resultatet (eller 8 uger efter tilmelding for den ikke-sekventerede gruppe), neonatal udskrivning og 12 måneder efter fødslen. Det fulde scoreinterval er 0 til 21, hvor lavere tal repræsenterer lavere angst (bedre resultat).
2 uger efter offentliggørelse af undersøgelsessekventeringsresultater eller 4 uger efter tilmelding til den ikke-sekventerede gruppe; 1 måned efter udskrivelse fra hospitalet eller afslutning af graviditeten, hvis der var fosterdød eller svangerskabsafbrydelse; 12-15 måneder efter fødslen
Depression ved selvrapport spørgeskema
Tidsramme: 2 uger efter offentliggørelse af undersøgelsessekventeringsresultater eller 4 uger efter tilmelding til den ikke-sekventerede gruppe; 1 måned efter udskrivelse fra hospitalet eller afslutning af graviditeten, hvis der var fosterdød eller svangerskabsafbrydelse; 12-15 måneder efter fødslen
Depression efter afsløring af resultatet (eller 8 uger efter indskrivning for den ikke-sekventerede gruppe), neonatal udledning og 12 måneder postpartum. Det fulde scoreområde er 0 til 24, hvor en lavere score repræsenterer lavere depression (bedre resultat).
2 uger efter offentliggørelse af undersøgelsessekventeringsresultater eller 4 uger efter tilmelding til den ikke-sekventerede gruppe; 1 måned efter udskrivelse fra hospitalet eller afslutning af graviditeten, hvis der var fosterdød eller svangerskabsafbrydelse; 12-15 måneder efter fødslen
Livskvalitet ved selvrapport spørgeskema
Tidsramme: Cirka 4,5 år
Livskvalitet for patient og familie 12 måneder efter fødslen.
Cirka 4,5 år
QALY, målt i omkostninger pr. år
Tidsramme: Cirka 4,5 år
Inkrementelle omkostninger pr. kvalitetsjusteret levetid (QALY).
Cirka 4,5 år
Samlet antal identificerede fænotyper KUN associeret med sygdomssekventeret gruppe
Tidsramme: 12 måneder efter fødslen
Fænotypisk udvidelse: Tilsyneladende prænatal fænotypisk udvidelse fra aktuelt definerede pædiatriske fænotyper.
12 måneder efter fødslen
Antal deltagere med VUS - KUN sekventeret gruppe
Tidsramme: 12 måneder efter fødslen

Varianter af usikker betydning (VUS), som endnu ikke er blevet forbundet med denne sygdomsfænotype.

Dette resultat var kun beregnet til at blive målt hos deltagere i den sekventerede arm, som beskrevet i undersøgelsesprotokollen. Data for dette resultat blev ikke indsamlet fra nogen deltager i Unsequenced-armen.

12 måneder efter fødslen
Antal deltagere med varianter klassificeret som GUS - KUN sekventeret gruppe
Tidsramme: 12 måneder efter fødslen

VUS underklassificeret som overbevisende varianter i nye gener, der endnu ikke er sygdomsassocierede (gener af usikker klinisk betydning; GUS).

Dette resultat var kun beregnet til at blive målt hos deltagere i den sekventerede arm, som beskrevet i undersøgelsesprotokollen. Data for dette resultat blev ikke indsamlet fra nogen deltager i Unsequenced-armen.

12 måneder efter fødslen
Digital WES - Sammenligning af kodnings- og ikke-kodningsresultater - KUN sekventeret gruppe
Tidsramme: Cirka 4,5 år
Patogene, sandsynligvis patogene og VUS-varianter identificeret ved sekventering (kodende og ikke-kodende regioner) sammenlignet med kun kodende regioner (digital WES).
Cirka 4,5 år
Kun proband versus trio - sammenligning af resultater mellem trio og kun proband - KUN sekvensgruppe
Tidsramme: Cirka 4,5 år
Patogene, sandsynligvis patogene og VUS-varianter identificeret ved analyse af et proband alene sammenlignet med en proband-forælder-trio.
Cirka 4,5 år
Ændring i ledelse (sundhedspleje) som bestemt af NICU-læge og journalgennemgang - KUN sekventeret gruppe
Tidsramme: Fra levering til udskrivelse eller død (neonatal)

Antal deltagere, der havde ændret ledelsesbeslutninger, der kan henføres til genomiske resultater, defineret som ændringer i patientens behandlingsplan eller ændringer i rådgivningen af ​​patienten/familien vedrørende den umiddelbare eller langsigtede medicinske behandling.

Dette resultat var kun beregnet til at blive målt hos deltagere i den sekventerede arm, som beskrevet i undersøgelsesprotokollen. Data for dette resultat blev ikke indsamlet fra nogen deltager i Unsequenced-armen.

Fra levering til udskrivelse eller død (neonatal)
Forældrestøttebehov ved selvrapportering - KUN sekvensgruppe
Tidsramme: Ved sekvensafslutning, cirka 4,5 år
Vurdering af mors og fars behov for pædagogisk/rådgivning og social støtte. Det fulde scoreinterval er 12 til 60, hvor en højere score repræsenterer en højere tilfredshed med oplevelsen (bedre resultat).
Ved sekvensafslutning, cirka 4,5 år
Forældreforståelse ved selvrapporteringsspørgeskema - KUN sekvensgruppe
Tidsramme: Ved sekvensafslutning, cirka 4,5 år
Nøjagtighed af forældrenes forståelse af genetiske testresultater. Forældrenes svar på spørgsmålet "Hvor godt forstår du dine prænatale genetiske testresultater?" vil blive indsamlet. Alle mulige svar er: "Slet ikke", "En lille smule", "Moderat", "Ganske lidt" og "Ekstremt"
Ved sekvensafslutning, cirka 4,5 år
Antal deltagere, der havde en ændring i sekventeringsresultatet - KUN sekvensgruppe
Tidsramme: Fra færdiggørelse af sekvensering til dataanalyseperiode, op til 4,5 år

Genfortolkninger af sekventeringsresultater, der fører til en ændring i klassificering af sekventeringsvarianter.

Dette resultat var kun beregnet til at blive målt hos deltagere i den sekventerede arm, som beskrevet i undersøgelsesprotokollen. Data for dette resultat blev ikke indsamlet fra nogen deltager i Unsequenced-armen.

Fra færdiggørelse af sekvensering til dataanalyseperiode, op til 4,5 år
Ekspeditionstid - KUN sekvensgruppe
Tidsramme: Tid fra påbegyndelse af sekvensering til resultat af undersøgelsessted, op til 38 dage
Omløbstid for sekventeringskomponenter og hvordan den ændrer sig over tid. Dette resultat var kun beregnet til at blive målt hos deltagere i den sekventerede arm, som beskrevet i undersøgelsesprotokollen. Data for dette resultat blev ikke indsamlet fra nogen deltager i Unsequenced-armen.
Tid fra påbegyndelse af sekvensering til resultat af undersøgelsessted, op til 38 dage

Samarbejdspartnere og efterforskere

Det er her, du vil finde personer og organisationer, der er involveret i denne undersøgelse.

Datoer for undersøgelser

Disse datoer sporer fremskridtene for indsendelser af undersøgelsesrekord og resumeresultater til ClinicalTrials.gov. Studieregistreringer og rapporterede resultater gennemgås af National Library of Medicine (NLM) for at sikre, at de opfylder specifikke kvalitetskontrolstandarder, før de offentliggøres på den offentlige hjemmeside.

Studer store datoer

Studiestart (Faktiske)

28. juni 2019

Primær færdiggørelse (Faktiske)

25. marts 2024

Studieafslutning (Faktiske)

25. marts 2024

Datoer for studieregistrering

Først indsendt

25. marts 2019

Først indsendt, der opfyldte QC-kriterier

30. april 2019

Først opslået (Faktiske)

3. maj 2019

Opdateringer af undersøgelsesjournaler

Sidste opdatering sendt (Anslået)

27. oktober 2025

Sidste opdatering indsendt, der opfyldte kvalitetskontrolkriterier

14. oktober 2025

Sidst verificeret

1. oktober 2025

Mere information

Begreber relateret til denne undersøgelse

Andre undersøgelses-id-numre

  • AAAS2118
  • R01HD055651 (U.S. NIH-bevilling/kontrakt)

Plan for individuelle deltagerdata (IPD)

Planlægger du at dele individuelle deltagerdata (IPD)?

JA

IPD-planbeskrivelse

I overensstemmelse med NIHs genomiske datadelingspolitik vil sekventeringsdata (inklusive VCF-filer) og kliniske data blive delt med andre videnskabelige efterforskere og gennem dbGAP-depotet med kontrolleret adgang eller sammenlignelige genomics commons, Sequence Read Archive og eventuelle NIH Birth Defects Commons der er etableret. Et endeligt datasæt indeholdende kliniske og fænotypiske data vil blive indsendt til NICHD data repository (DASH). Derudover vil nye algoritmer og allelfrekvensdata blive delt med den nyudviklede Precision FDA-platform efter behov.

IPD-delingstidsramme

Efter endt studie.

IPD-delingsadgangskriterier

Gennem dbGaP eller andre kontrollerede adgangsdatabaser.

IPD-deling Understøttende informationstype

  • STUDY_PROTOCOL
  • SAP
  • ICF
  • CSR

Lægemiddel- og udstyrsoplysninger, undersøgelsesdokumenter

Studerer et amerikansk FDA-reguleret lægemiddelprodukt

Ingen

Studerer et amerikansk FDA-reguleret enhedsprodukt

Ingen

produkt fremstillet i og eksporteret fra U.S.A.

Ingen

Disse oplysninger blev hentet direkte fra webstedet clinicaltrials.gov uden ændringer. Hvis du har nogen anmodninger om at ændre, fjerne eller opdatere dine undersøgelsesoplysninger, bedes du kontakte register@clinicaltrials.gov. Så snart en ændring er implementeret på clinicaltrials.gov, vil denne også blive opdateret automatisk på vores hjemmeside .

Abonner