- ICH GCP
- US Clinical Trials Registry
- Klinisk forsøg NCT03936101
Prænatal genetisk diagnose ved genomisk sekventering (PrenatalSEQ)
Prænatal genetisk diagnose ved genomisk sekventering: en prospektiv evaluering
Studieoversigt
Status
Betingelser
Intervention / Behandling
Detaljeret beskrivelse
Hele exome og hele genom sekventering (WGS) har udvidet evnen til at bestemme den genetiske ætiologi af tidligere udiagnosticerede lidelser. Denne undersøgelse er en multicenter prospektiv kohorteundersøgelse for at evaluere den nye teknologi til sekventering til håndtering af fostre med strukturelle anomalier. Hypotesen er, at en betydelig delmængde af føtale strukturelle anomalier har en genetisk ætiologi, der kan identificeres ved sekventering, og at prænatal viden om denne information vil forbedre den perinatale pleje, reducere unødvendige diagnostiske tests, reducere omkostningerne ved pleje og forbedre livskvaliteten for både barnet. og familien. Formålet med denne undersøgelse er at undersøge disse mange aspekter af prænatal sekventering i en enkelt undersøgelse med et innovativt integreret prospektivt design, som vil tillade en robust evaluering af fordele og risici ved at levere diagnostiske og prognostiske genetiske testresultater i en prænatal setting.
Undersøgelsen vil bestemme, i en sekventiel population af graviditeter med udvalgte føtale strukturelle anomalier og en negativ eller ikke-kausal kromosomal mikroarray (CMA), hyppigheden af patogene, sandsynligt patogene og usikre genomiske varianter, der kan identificeres ved sekventering. For at bestemme virkningen af denne information på den kliniske pleje, vil en kontrolpopulation af usekventerede graviditeter med lignende strukturelle anomalier blive rekrutteret prospektivt, og spædbørnene fra begge kohorter vil blive fulgt op til 1 års alderen. Denne undersøgelseskomponent vil evaluere forskelle i sundhedspleje og omkostninger ved udskrivelse fra hospital efter fødslen og perinatale og spædbørns resultater gennem 1 år af livet. Den pædagogiske, rådgivningsmæssige og psykosociale effekt af sekventeringsresultater i den prænatale periode, i vuggestuen og gennem 1 leveår vil også blive evalueret. Da de analytiske og kliniske værktøjer, der er nødvendige for den fulde oversættelse af sekventering til pleje, stadig er under udvikling, vil optimering af bioinformatiske værktøjer til at forbedre identifikation af patogene og sandsynlige patogene mutationer forbundet med prænatale fænotyper af etablerede sygdomsgener blive undersøgt, samt identifikation af nye gener forbundet med i øjeblikket udiagnosticerede føtale/neonatale fænotyper. Denne undersøgelse vil give en dybdegående evaluering af den prænatale diagnostiske værdi af sekventering forud for dens ansvarlige introduktion i praksis og vil give uafhængige data til at vejlede dens oversættelse.
Undersøgelsestype
Tilmelding (Faktiske)
Kontakter og lokationer
Studiesteder
-
-
New York
-
New York, New York, Forenede Stater, 10032
- Columbia University Medical Center
-
-
North Carolina
-
Chapel Hill, North Carolina, Forenede Stater, 27514
- University of North Carolina Chapel Hill
-
-
Ohio
-
Cincinnati, Ohio, Forenede Stater, 45229
- Children's Hospital, Cincinnati Medical Center
-
-
Texas
-
Houston, Texas, Forenede Stater, 77030
- Baylor College of Medicine
-
Houston, Texas, Forenede Stater, 77030
- UT Health Houston
-
-
Deltagelseskriterier
Berettigelseskriterier
Aldre berettiget til at studere
Tager imod sunde frivillige
Prøveudtagningsmetode
Studiebefolkning
I alt 1.100 graviditeter med føtale strukturelle anomalier og opfyldelse af berettigelseskriterier vil blive tilmeldt undersøgelsen. Af disse vil 750 gennemgå prænatal genomisk sekventering (prænatal sekventeringsgruppe), og de resterende 350 graviditeter vil ikke have nogen prænatal genomisk sekventering (ikke-sekventeret prænatal gruppe).
Tilmelding af graviditeter med en isoleret nuchal translucensmålinger ≥ 3,5 mm vil være begrænset til 5 % inden for hver gruppe (sekventeret og usekventeret), og isoleret estimeret fostervægt <5. %ile vil også være begrænset til 5 % for hver gruppe (sekventeret og usekventeret) .
Beskrivelse
Inklusionskriterier:
Prænatal sekventeringsgruppe
Foster identificeret ved ultralyd og/eller MR med mindst én af følgende:
- En eller flere større strukturelle anomalier (bilag A)
- En nuchal translucensmåling på ≥ 3,5 mm
- Et foster under 24 uger 0 dages svangerskab med normal anatomi og sonografisk estimeret fostervægt <5. %ile uden maternel hypertension, type I diabetes eller andre maternelle lidelser, der vides at ændre fostervæksten.
- Negativ prænatal CMA (eller dem med CMA-fund, der ikke er relateret til ultralydsfundet)
- Singleton eller tvilling graviditet
- Svangerskabsalder mindre end 36 uger, 0 dage for at give mulighed for tilgængelighed af sekventeringsresultater før levering
Ikke-sekventeret gruppe
Foster identificeret ved ultralyd og/eller MR med mindst én af følgende:
- En eller flere større strukturelle anomalier (bilag A)
- En nuchal translucensmåling på ≥ 3,5 mm
- Et foster under 24 uger 0 dages svangerskab med normal anatomi og sonografisk estimeret fostervægt <5. %ile uden maternel hypertension, type I diabetes eller andre maternelle lidelser, der vides at ændre fostervæksten
- Negativ prænatal eller postnatal CMA (eller dem med CMA-fund, der ikke er relateret til ultralydsfundet)
- Afvist prænatal sekventering
- Singleton drægtighed
Ekskluderingskriterier:
Prænatal sekventeringsgruppe
- Prænatal sekventering eller planlagt prænatal sekventering udført uden for undersøgelsen, inklusive genpaneler
- Moderens eller faderens alder under 18 år
- Påvist infektiøs eller teratogene årsag til føtal anomali
- Planlagt afbrydelse af graviditeten
- Utilgængelige blod- eller spytprøver fra begge biologiske forældre før sekventering
- Forældres manglende vilje til at deltage i 1 års postnatal opfølgning
- Sprogbarriere (ikke-engelsk eller spansktalende)
- Tidligere samtykke til den usekventerede prænatale gruppe eller tilmelding til en tidligere graviditet
Ikke-sekventeret gruppe
- Moderens eller faderens alder under 18 år
- Påvist infektiøs eller teratogene årsag til føtal anomali
- Positiv prænatal NIPT-screening for trisomi 21, 18 eller 13. Positiv 22q11.2 prænatal NIPT-testning med konsistente ultralydsfund er også en udelukkelse.
- Planlagt afbrydelse af graviditeten
- Forældres manglende vilje til at deltage i 1 års postnatal opfølgning
- Sprogbarriere (ikke-engelsk eller spansktalende)
Studieplan
Hvordan er undersøgelsen tilrettelagt?
Design detaljer
Kohorter og interventioner
Gruppe / kohorte |
Intervention / Behandling |
|---|---|
|
Prænatalt sekventeret gruppe
750 trioer med føtale strukturelle anomalier, der modtager prænatal sekventering fra undersøgelsen
|
Helgenomsekventering (som i første omgang vil blive maskeret og kun rapporteret som exome)
|
|
Ingen prænatal sekventeringsgruppe (ikke-sekventeret).
350 trioer med føtale strukturelle anomalier, der ikke har prænatal sekventering
|
Hvad måler undersøgelsen?
Primære resultatmål
Resultatmål |
Foranstaltningsbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
Antal deltagere, der havde rapporterbare varianter
Tidsramme: Efter endt studie ca. 4 år
|
Rapporterbare varianter: defineret som enten patogene/sandsynlige patogene (P/LP) eller varianter af usikker betydning (VUS) identificeret ved sekventering og vurderet som rapporterbare af Variant Adjudication Committee.
|
Efter endt studie ca. 4 år
|
|
Udgifter til sundhedspleje
Tidsramme: Fra tidspunktet for diagnose af anomali til spædbarnsudledning
|
Sundhedsomkostninger fra tidspunktet for diagnosticering af anomali til spædbarnsudskrivning mellem sekventerede og ikke-sekventerede grupper.
|
Fra tidspunktet for diagnose af anomali til spædbarnsudledning
|
Sekundære resultatmål
Resultatmål |
Foranstaltningsbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
Gestationsalder ved levering
Tidsramme: På leveringstidspunktet
|
Gestationsalder for nyfødt ved fødslen (i uger)
|
På leveringstidspunktet
|
|
Neonatale resultater
Tidsramme: Op til 28 dage efter fødslen
|
Neonatale resultater vil blive sammenlignet, og resultaterne vil blive målt ved antallet af nyfødte, der oplever: behov for ventilatorstøtte, sepsis, behov for pressorstøtte, behov for ekstrakorporal membraniltning (ECMO), metaboliske abnormiteter (f.eks. acidose, forhøjet urinsyre, hypo-/hyperglykæmi), intraventrikulær periventrikulær blødning, leukomalaci, encefalopati og anfald.
|
Op til 28 dage efter fødslen
|
|
Antal dødsfald
Tidsramme: Fra udskrivelse til 12 måneder efter fødslen
|
Neonatal/spædbarnsdød ved udskrivelse og ved 12 måneders alderen.
|
Fra udskrivelse til 12 måneder efter fødslen
|
|
Varighed af NICU-ophold
Tidsramme: Fra udskrivelse til 12 måneder efter fødslen
|
Længden af indledende NICU-ophold og antal dage brugt på hospitalet mellem den første udskrivelse og 12 måneders alderen.
|
Fra udskrivelse til 12 måneder efter fødslen
|
|
Længde i centimeter
Tidsramme: 12 måneder efter fødslen
|
Spædbarnslængde ved 12 måneders alderen.
|
12 måneder efter fødslen
|
|
Vægt i kilogram
Tidsramme: 12 måneder efter fødslen
|
Spædbarnsvægt ved 12 måneders alderen.
|
12 måneder efter fødslen
|
|
Score på udvikling efter aldre og stadier Spørgeskema (ASQ-3)
Tidsramme: 12 måneder efter fødslen
|
Udviklingsresultater defineret af følgende parametre: kommunikation, grovmotorik, finmotorik, problemløsning og personlig-social, ved 12 måneders alderen ved brug af ASQ-3. Lavere score er forbundet med udviklingsforsinkelse. For hvert udviklingsområde kan forældre svare JA=10, NOGLE GANGE=5 eller IKKE ENDNU=0 ved at udfylde en boble for hvert emnesvar. Det fulde scoreinterval for hvert domæne er 0 til 60. Afskæringer for hvert domæne er: Kommunikation 15.64, Bruttomotorisk 21,49, finmotorisk 34,5, problemløsning 27,32, personlig-social 21,73 |
12 måneder efter fødslen
|
|
Angst ved selvrapport spørgeskema
Tidsramme: 2 uger efter offentliggørelse af undersøgelsessekventeringsresultater eller 4 uger efter tilmelding til den ikke-sekventerede gruppe; 1 måned efter udskrivelse fra hospitalet eller afslutning af graviditeten, hvis der var fosterdød eller svangerskabsafbrydelse; 12-15 måneder efter fødslen
|
Angst efter afsløring af resultatet (eller 8 uger efter tilmelding for den ikke-sekventerede gruppe), neonatal udskrivning og 12 måneder efter fødslen.
Det fulde scoreinterval er 0 til 21, hvor lavere tal repræsenterer lavere angst (bedre resultat).
|
2 uger efter offentliggørelse af undersøgelsessekventeringsresultater eller 4 uger efter tilmelding til den ikke-sekventerede gruppe; 1 måned efter udskrivelse fra hospitalet eller afslutning af graviditeten, hvis der var fosterdød eller svangerskabsafbrydelse; 12-15 måneder efter fødslen
|
|
Depression ved selvrapport spørgeskema
Tidsramme: 2 uger efter offentliggørelse af undersøgelsessekventeringsresultater eller 4 uger efter tilmelding til den ikke-sekventerede gruppe; 1 måned efter udskrivelse fra hospitalet eller afslutning af graviditeten, hvis der var fosterdød eller svangerskabsafbrydelse; 12-15 måneder efter fødslen
|
Depression efter afsløring af resultatet (eller 8 uger efter indskrivning for den ikke-sekventerede gruppe), neonatal udledning og 12 måneder postpartum.
Det fulde scoreområde er 0 til 24, hvor en lavere score repræsenterer lavere depression (bedre resultat).
|
2 uger efter offentliggørelse af undersøgelsessekventeringsresultater eller 4 uger efter tilmelding til den ikke-sekventerede gruppe; 1 måned efter udskrivelse fra hospitalet eller afslutning af graviditeten, hvis der var fosterdød eller svangerskabsafbrydelse; 12-15 måneder efter fødslen
|
|
Livskvalitet ved selvrapport spørgeskema
Tidsramme: Cirka 4,5 år
|
Livskvalitet for patient og familie 12 måneder efter fødslen.
|
Cirka 4,5 år
|
|
QALY, målt i omkostninger pr. år
Tidsramme: Cirka 4,5 år
|
Inkrementelle omkostninger pr. kvalitetsjusteret levetid (QALY).
|
Cirka 4,5 år
|
|
Samlet antal identificerede fænotyper KUN associeret med sygdomssekventeret gruppe
Tidsramme: 12 måneder efter fødslen
|
Fænotypisk udvidelse: Tilsyneladende prænatal fænotypisk udvidelse fra aktuelt definerede pædiatriske fænotyper.
|
12 måneder efter fødslen
|
|
Antal deltagere med VUS - KUN sekventeret gruppe
Tidsramme: 12 måneder efter fødslen
|
Varianter af usikker betydning (VUS), som endnu ikke er blevet forbundet med denne sygdomsfænotype. Dette resultat var kun beregnet til at blive målt hos deltagere i den sekventerede arm, som beskrevet i undersøgelsesprotokollen. Data for dette resultat blev ikke indsamlet fra nogen deltager i Unsequenced-armen. |
12 måneder efter fødslen
|
|
Antal deltagere med varianter klassificeret som GUS - KUN sekventeret gruppe
Tidsramme: 12 måneder efter fødslen
|
VUS underklassificeret som overbevisende varianter i nye gener, der endnu ikke er sygdomsassocierede (gener af usikker klinisk betydning; GUS). Dette resultat var kun beregnet til at blive målt hos deltagere i den sekventerede arm, som beskrevet i undersøgelsesprotokollen. Data for dette resultat blev ikke indsamlet fra nogen deltager i Unsequenced-armen. |
12 måneder efter fødslen
|
|
Digital WES - Sammenligning af kodnings- og ikke-kodningsresultater - KUN sekventeret gruppe
Tidsramme: Cirka 4,5 år
|
Patogene, sandsynligvis patogene og VUS-varianter identificeret ved sekventering (kodende og ikke-kodende regioner) sammenlignet med kun kodende regioner (digital WES).
|
Cirka 4,5 år
|
|
Kun proband versus trio - sammenligning af resultater mellem trio og kun proband - KUN sekvensgruppe
Tidsramme: Cirka 4,5 år
|
Patogene, sandsynligvis patogene og VUS-varianter identificeret ved analyse af et proband alene sammenlignet med en proband-forælder-trio.
|
Cirka 4,5 år
|
|
Ændring i ledelse (sundhedspleje) som bestemt af NICU-læge og journalgennemgang - KUN sekventeret gruppe
Tidsramme: Fra levering til udskrivelse eller død (neonatal)
|
Antal deltagere, der havde ændret ledelsesbeslutninger, der kan henføres til genomiske resultater, defineret som ændringer i patientens behandlingsplan eller ændringer i rådgivningen af patienten/familien vedrørende den umiddelbare eller langsigtede medicinske behandling. Dette resultat var kun beregnet til at blive målt hos deltagere i den sekventerede arm, som beskrevet i undersøgelsesprotokollen. Data for dette resultat blev ikke indsamlet fra nogen deltager i Unsequenced-armen. |
Fra levering til udskrivelse eller død (neonatal)
|
|
Forældrestøttebehov ved selvrapportering - KUN sekvensgruppe
Tidsramme: Ved sekvensafslutning, cirka 4,5 år
|
Vurdering af mors og fars behov for pædagogisk/rådgivning og social støtte.
Det fulde scoreinterval er 12 til 60, hvor en højere score repræsenterer en højere tilfredshed med oplevelsen (bedre resultat).
|
Ved sekvensafslutning, cirka 4,5 år
|
|
Forældreforståelse ved selvrapporteringsspørgeskema - KUN sekvensgruppe
Tidsramme: Ved sekvensafslutning, cirka 4,5 år
|
Nøjagtighed af forældrenes forståelse af genetiske testresultater.
Forældrenes svar på spørgsmålet "Hvor godt forstår du dine prænatale genetiske testresultater?" vil blive indsamlet.
Alle mulige svar er: "Slet ikke", "En lille smule", "Moderat", "Ganske lidt" og "Ekstremt"
|
Ved sekvensafslutning, cirka 4,5 år
|
|
Antal deltagere, der havde en ændring i sekventeringsresultatet - KUN sekvensgruppe
Tidsramme: Fra færdiggørelse af sekvensering til dataanalyseperiode, op til 4,5 år
|
Genfortolkninger af sekventeringsresultater, der fører til en ændring i klassificering af sekventeringsvarianter. Dette resultat var kun beregnet til at blive målt hos deltagere i den sekventerede arm, som beskrevet i undersøgelsesprotokollen. Data for dette resultat blev ikke indsamlet fra nogen deltager i Unsequenced-armen. |
Fra færdiggørelse af sekvensering til dataanalyseperiode, op til 4,5 år
|
|
Ekspeditionstid - KUN sekvensgruppe
Tidsramme: Tid fra påbegyndelse af sekvensering til resultat af undersøgelsessted, op til 38 dage
|
Omløbstid for sekventeringskomponenter og hvordan den ændrer sig over tid.
Dette resultat var kun beregnet til at blive målt hos deltagere i den sekventerede arm, som beskrevet i undersøgelsesprotokollen.
Data for dette resultat blev ikke indsamlet fra nogen deltager i Unsequenced-armen.
|
Tid fra påbegyndelse af sekvensering til resultat af undersøgelsessted, op til 38 dage
|
Samarbejdspartnere og efterforskere
Sponsor
Samarbejdspartnere
Efterforskere
- Ledende efterforsker: Ronald Wapner, MD, Columbia University
Datoer for undersøgelser
Studer store datoer
Studiestart (Faktiske)
Primær færdiggørelse (Faktiske)
Studieafslutning (Faktiske)
Datoer for studieregistrering
Først indsendt
Først indsendt, der opfyldte QC-kriterier
Først opslået (Faktiske)
Opdateringer af undersøgelsesjournaler
Sidste opdatering sendt (Anslået)
Sidste opdatering indsendt, der opfyldte kvalitetskontrolkriterier
Sidst verificeret
Mere information
Begreber relateret til denne undersøgelse
Andre undersøgelses-id-numre
- AAAS2118
- R01HD055651 (U.S. NIH-bevilling/kontrakt)
Plan for individuelle deltagerdata (IPD)
Planlægger du at dele individuelle deltagerdata (IPD)?
IPD-planbeskrivelse
IPD-delingstidsramme
IPD-delingsadgangskriterier
IPD-deling Understøttende informationstype
- STUDY_PROTOCOL
- SAP
- ICF
- CSR
Lægemiddel- og udstyrsoplysninger, undersøgelsesdokumenter
Studerer et amerikansk FDA-reguleret lægemiddelprodukt
Studerer et amerikansk FDA-reguleret enhedsprodukt
produkt fremstillet i og eksporteret fra U.S.A.
Disse oplysninger blev hentet direkte fra webstedet clinicaltrials.gov uden ændringer. Hvis du har nogen anmodninger om at ændre, fjerne eller opdatere dine undersøgelsesoplysninger, bedes du kontakte register@clinicaltrials.gov. Så snart en ændring er implementeret på clinicaltrials.gov, vil denne også blive opdateret automatisk på vores hjemmeside .