Ezt az oldalt automatikusan lefordították, és a fordítás pontossága nem garantált. Kérjük, olvassa el a angol verzió forrásszöveghez.

Prenatális genetikai diagnosztika genomi szekvenálás segítségével (PrenatalSEQ)

2022. október 20. frissítette: Ronald J Wapner, MD, Columbia University

Prenatális genetikai diagnosztika genomi szekvenálás segítségével: jövőbeli értékelés

Ez a tanulmány a prenatális szekvenálás hatását értékeli az ultrahang-rendellenességgel rendelkező magzatok kezelésében. A hipotézis az, hogy a magzati rendellenességek jelentős részhalmazának genetikai oka van, amely szekvenálással azonosítható, és ezen információk prenatális ismerete javítja a terhesgondozást, csökkenti a szükségtelen diagnosztikai vizsgálatokat, csökkenti az ellátás költségeit és javítja az életminőséget. a gyereket és a családot egyaránt.

A tanulmány áttekintése

Részletes leírás

A teljes exome és a teljes genom szekvenálás (WGS) kiterjesztette a korábban nem diagnosztizált rendellenességek genetikai etiológiájának meghatározásának lehetőségét. Ez a tanulmány egy többközpontú prospektív kohorsz-tanulmány, amely a szerkezeti anomáliákkal küzdő magzatok kezelésére szolgáló szekvenálás feltörekvő technológiájának értékelésére szolgál. A hipotézis az, hogy a magzati szerkezeti anomáliák jelentős részhalmazának genetikai etiológiája szekvenálással azonosítható, és ezen információk prenatális ismerete javítja a perinatális ellátást, csökkenti a szükségtelen diagnosztikai vizsgálatokat, csökkenti az ellátás költségeit és javítja mindkét gyermek életminőségét. és a család. Ennek a tanulmánynak a célja a prenatális szekvenálás e több aspektusának vizsgálata egyetlen tanulmányban, egy innovatív, integrált prospektív tervezéssel, amely lehetővé teszi a diagnosztikus és prognosztikai genetikai tesztek prenatális környezetben történő szállításának előnyeinek és kockázatainak átfogó értékelését.

A tanulmány meghatározza a kiválasztott magzati szerkezeti anomáliákkal és negatív vagy nem okozati kromoszóma microarray-vel (CMA) járó terhességek sorozatos populációjában a szekvenálással azonosítható patogén, valószínű patogén és bizonytalan genomi variánsok gyakoriságát. Ennek az információnak a klinikai ellátásra gyakorolt ​​hatásának meghatározására a hasonló szerkezeti anomáliákkal rendelkező, szekvencia nélküli terhességek kontrollpopulációját prospektívan toborozzák, és mindkét kohorsz csecsemőit 1 éves korukig követik. Ez a vizsgálati komponens értékelni fogja az egészségügyi ellátás kezelésében és a szülés utáni kórházi elbocsátás költségeiben mutatkozó különbségeket, valamint a perinatális és csecsemőkori eredményeket egy életév során. A szekvenálási eredmények nevelési, tanácsadási és pszichoszociális hatásait a prenatális időszakban, a bölcsődében és az 1 életév során is értékelni fogják. Mivel a szekvenálás teljes átültetéséhez szükséges analitikai és klinikai eszközök még fejlesztés alatt állnak, a bioinformatikai eszközök optimalizálása a kialakult betegséggének prenatális fenotípusaihoz kapcsolódó patogén és valószínű patogén mutációk azonosításának javítása érdekében, valamint újak azonosítása is megtörténik. jelenleg nem diagnosztizált magzati/újszülöttkori fenotípusokhoz kapcsolódó gének. Ez a tanulmány mélyreható értékelést nyújt a szekvenálás prenatális diagnosztikai értékéről a felelősségteljes gyakorlatba történő bevezetés előtt, és független adatokat szolgáltat a fordításhoz.

Tanulmány típusa

Megfigyelő

Beiratkozás (Várható)

1100

Kapcsolatok és helyek

Ez a rész a vizsgálatot végzők elérhetőségeit, valamint a vizsgálat lefolytatásának helyére vonatkozó információkat tartalmazza.

Tanulmányi kapcsolat

Tanulmányozza a kapcsolattartók biztonsági mentését

Tanulmányi helyek

    • New York
      • New York, New York, Egyesült Államok, 10032
        • Toborzás
        • Columbia University Medical Center
        • Kapcsolatba lépni:
          • Ronald Wapner, MD
          • Telefonszám: 212-305-1521
    • North Carolina
      • Chapel Hill, North Carolina, Egyesült Államok, 27514
        • Toborzás
        • University of North Carolina Chapel Hill
        • Kapcsolatba lépni:
        • Kutatásvezető:
          • Neeta Vora, MD
    • Ohio
      • Cincinnati, Ohio, Egyesült Államok, 45229
        • Toborzás
        • Children's Hospital, Cincinnati Medical Center
        • Kapcsolatba lépni:
    • Texas
      • Houston, Texas, Egyesült Államok, 77030
        • Toborzás
        • Baylor College of Medicine
      • Houston, Texas, Egyesült Államok, 77030

Részvételi kritériumok

A kutatók olyan embereket keresnek, akik megfelelnek egy bizonyos leírásnak, az úgynevezett jogosultsági kritériumoknak. Néhány példa ezekre a kritériumokra a személy általános egészségi állapota vagy a korábbi kezelések.

Jogosultsági kritériumok

Tanulmányozható életkorok

18 év és régebbi (FELNŐTT, OLDER_ADULT)

Egészséges önkénteseket fogad

Igen

Tanulmányozható nemek

Összes

Mintavételi módszer

Nem valószínűségi minta

Tanulmányi populáció

A vizsgálatba összesen 1100 magzati szerkezeti anomáliával rendelkező, alkalmassági kritériumoknak megfelelő terhességet vonnak be. Ezek közül 750-en prenatális genomi szekvenálást végeznek (prenatális szekvenálási csoport), a fennmaradó 350 terhességnél pedig nem lesz prenatális genomi szekvenálás (szekvenálatlan prenatális csoport).

A 3,5 mm-nél nagyobb izolált nyaki áttetszőségi mérésekkel rendelkező terhességek felvétele 5%-ra korlátozódik minden csoporton belül (szekvenciális és nem szekvenált), és az izolált becsült magzati súly <5%ile szintén 5%-ra lesz korlátozva minden csoportban (szekvenciális és nem szekvenált) .

Leírás

Bevételi kritériumok:

Prenatális szekvenáló csoport

  1. Ultrahanggal és/vagy MRI-vel azonosított magzat a következők legalább egyikével:

    1. Egy vagy több jelentős szerkezeti anomália (A. függelék)
    2. A nyaki áttetszőség mérése ≥ 3,5 mm
    3. 24 hétnél 0 napnál rövidebb terhességi magzat, normális anatómiával és ultrahangos becsült magzati tömeggel <5 %ile anyai hipertónia, I-es típusú cukorbetegség vagy egyéb olyan anyai rendellenességek nélkül, amelyekről ismert, hogy megváltoztatják a magzat növekedését.
  2. Negatív prenatális CMA (vagy azok, amelyeknél a CMA-lelet nem kapcsolódik az ultrahangos lelethez)
  3. Egy- vagy ikerterhesség
  4. Terhességi kor 36 hétnél kevesebb, 0 nap, hogy a szülés előtt rendelkezésre álljanak a szekvenálási eredmények

Sorozat nélküli csoport

  1. Ultrahanggal és/vagy MRI-vel azonosított magzat a következők legalább egyikével:

    1. Egy vagy több jelentős szerkezeti anomália (A. függelék)
    2. A nyaki áttetszőség mérése ≥ 3,5 mm
    3. 24 hétnél 0 napnál fiatalabb magzat normál anatómiával és ultrahangosan becsült magzati súly <5 %ile anyai hipertónia, I-es típusú cukorbetegség vagy más olyan anyai rendellenesség nélkül, amelyekről ismert, hogy megváltoztatják a magzat növekedését
  2. Negatív prenatális vagy posztnatális CMA (vagy azok, amelyeknél a CMA-lelet nem kapcsolódik az ultrahangos lelethez)
  3. Csökkent prenatális szekvenálás
  4. Singleton terhesség

Kizárási kritériumok:

Prenatális szekvenáló csoport

  1. A vizsgálaton kívül végzett prenatális vagy tervezett prenatális szekvenálás, beleértve a génpaneleket is
  2. Anyai vagy apai életkor 18 évnél fiatalabb
  3. A magzati anomália bizonyítottan fertőző vagy teratogén oka
  4. A terhesség tervezett megszakítása
  5. Nem elérhető vér- vagy nyálminták mindkét biológiai szülőtől a szekvenálás előtt
  6. A szülők nem hajlandók részt venni egy éves szülés utáni nyomon követésben
  7. Nyelvi akadály (nem angolul vagy spanyolul beszélő)
  8. Korábbi beleegyezés a szekvencia nélküli prenatális csoportba vagy egy korábbi terhességbe való beiratkozás

Sorozat nélküli csoport

  1. Anyai vagy apai életkor 18 évnél fiatalabb
  2. A magzati anomália bizonyítottan fertőző vagy teratogén oka
  3. Pozitív prenatális NIPT-szűrés a 21-es, 18-as vagy 13-as triszómiára. Pozitív 22q11.2 A prenatális NIPT vizsgálat következetes ultrahangos leletekkel szintén kizárás.
  4. A terhesség tervezett megszakítása
  5. A szülők nem hajlandók részt venni egy éves szülés utáni nyomon követésben
  6. Nyelvi akadály (nem angolul vagy spanyolul beszélő)

Tanulási terv

Ez a rész a vizsgálati terv részleteit tartalmazza, beleértve a vizsgálat megtervezését és a vizsgálat mérését.

Hogyan készül a tanulmány?

Tervezési részletek

Kohorszok és beavatkozások

Csoport / Kohorsz
Beavatkozás / kezelés
Prenatálisan szekvenált csoport
750 magzati szerkezeti anomáliával rendelkező trió, akik prenatális szekvenálást kapnak a vizsgálatból
A teljes genom szekvenálása (amelyet kezdetben elfednek és csak exomeként jelentenek)
Nincs prenatális szekvenálás (unszekvencia nélküli) csoport
350 magzati szerkezeti rendellenességekkel rendelkező trió, akiknél nincs prenatális szekvenálás

Mit mér a tanulmány?

Elsődleges eredményintézkedések

Eredménymérő
Intézkedés leírása
Időkeret
Jelenthető változatok
Időkeret: Körülbelül 4,5 év
Jelentendő variánsok (meghatározása szerint patogén, valószínű patogén vagy VUS), amelyeket szekvenálás útján azonosítanak, és a Változatok Elbíráló Bizottsága jelentéskötelesnek tekint.
Körülbelül 4,5 év
Egészségügyi költségek
Időkeret: Körülbelül 4,5 év
Egészségügyi költségek az anomália diagnosztizálásától a csecsemő elbocsátásáig a szekvenált és a szekvencia nélküli csoportok között.
Körülbelül 4,5 év

Másodlagos eredményintézkedések

Eredménymérő
Intézkedés leírása
Időkeret
Perinatális eredmények orvosi feljegyzések áttekintése alapján
Időkeret: Körülbelül 4,5 év
A perinatális kimeneteleket összehasonlítják, és az eredményeket a következő szempontok szerint mérik: terhességi kor a szüléskor, főbb megbetegedések, beleértve a lélegeztetőgép-támogatás időtartamát, szepszis, nyomás alatti támogatás szükségessége, ECMO szükségessége, anyagcsere-rendellenességek (pl. acidózis, emelkedett húgysav, hypo-/ hiperglikémia), intravénás vérzés/periventricularis leukomalacia, encephalopathia és görcsrohamok.
Körülbelül 4,5 év
Halál
Időkeret: Körülbelül 4,5 év
Újszülött/csecsemő halála a hazabocsátáskor és 12 hónapos korban.
Körülbelül 4,5 év
NICU tartózkodási idő
Időkeret: Körülbelül 4,5 év
A kezdeti NICU tartózkodás időtartama és a kórházban töltött napok száma a kezdeti elbocsátás és a 12 hónapos kor között.
Körülbelül 4,5 év
Hosszúság centiméterben
Időkeret: Körülbelül 4,5 év
Csecsemőhossz 12 hónapos korban.
Körülbelül 4,5 év
Súly kilogrammban
Időkeret: Körülbelül 4,5 év
Csecsemő súlya 12 hónapos korban.
Körülbelül 4,5 év
Fejlesztés korok és szakaszok szerint kérdőív
Időkeret: Körülbelül 4,5 év
A következő paraméterekkel meghatározott fejlődési eredmények: kommunikáció, nagymotorika, finommotorika, problémamegoldás és személyes-szociális, 12 hónapos korban ASQ-3 használatával. Az alacsonyabb pontszámok fejlődési késleltetéssel járnak. A 12 hónapos vizsga határértékei: Kommunikáció 15.64, Bruttó motor 21,49, finom motor 34,5, problémamegoldás 27,32, személyes-közösségi 21,73
Körülbelül 4,5 év
Szorongás önbevallásos kérdőív alapján
Időkeret: Körülbelül 4,5 év
Szorongás az eredmények nyilvánosságra hozatala után (vagy a nem szekvencia nélküli csoport esetében a felvétel után 8 héttel), az újszülöttkori elbocsátás és a szülés utáni 12 hónap.
Körülbelül 4,5 év
Depresszió/szorongás önbevallásos kérdőív alapján
Időkeret: Körülbelül 4,5 év
Depresszió az eredmény nyilvánosságra hozatalát követően (vagy 8 héttel a beiratkozás után a szekvencia nélküli csoportban), újszülöttkori elbocsátás és 12 hónappal a szülés után.
Körülbelül 4,5 év
Életminőség önbevallásos kérdőív alapján
Időkeret: Körülbelül 4,5 év
Életminőség a beteg és családja számára a szülés után 12 hónappal.
Körülbelül 4,5 év
QALY, éves költségben mérve
Időkeret: Körülbelül 4,5 év
Növekményes költség egy minőségileg korrigált életévre (QALY).
Körülbelül 4,5 év
Fenotípusos expanzió – betegséggel kapcsolatos új fenotípusok azonosítása – CSAK szekvenált csoport
Időkeret: Körülbelül 4,5 év
Látható prenatális fenotípusos expanzió a jelenleg meghatározott gyermekgyógyászati ​​fenotípusokhoz képest.
Körülbelül 4,5 év
VUS gyakoriság és eredmény – CSAK szekvenciális csoport
Időkeret: Körülbelül 4,5 év
Bizonytalan jelentőségű változatok (VUS), amelyeket még nem hoznak összefüggésbe ezzel a betegség fenotípussal.
Körülbelül 4,5 év
GUS frekvencia és eredmény – CSAK szekvenált csoport
Időkeret: Körülbelül 4,5 év
A VUS-t a betegséggel még nem összefüggő új gének kényszerítő variánsai közé sorolták (bizonytalan klinikai jelentőségű gének; GUS).
Körülbelül 4,5 év
Digitális WES - kódolási és nem kódolási eredmények összehasonlítása - CSAK szekvenciális csoport
Időkeret: Körülbelül 4,5 év
A szekvenálással azonosított patogén, valószínű patogén és VUS variánsok (kódoló és nem kódoló régiók), összehasonlítva a csak kódoló régiókkal (digitális WES).
Körülbelül 4,5 év
Csak Proband Versus Trio – a trió és csak a proband eredmények összehasonlítása – CSAK szekvenált csoport
Időkeret: Körülbelül 4,5 év
Patogén, valószínű patogén és VUS variánsok, amelyeket egy proband elemzésével azonosítottak, összehasonlítva a proband-szülő trióval.
Körülbelül 4,5 év
Változás a menedzsmentben (egészségügy) a NICU orvosa és a nyilvántartás felülvizsgálata szerint – CSAK szekvenciális csoport
Időkeret: Körülbelül 4,5 év
A genomikai eredményekre visszavezethető vezetési döntésekben bekövetkezett változás a beteg kezelési tervében bekövetkezett változás vagy a beteg/család tanácsának változása az azonnali vagy hosszú távú orvosi kezelésre vonatkozóan.
Körülbelül 4,5 év
Szülői megértés önbevallásos kérdőív alapján – CSAK szekvenciális csoport
Időkeret: Körülbelül 4,5 év
A genetikai tesztek eredményeinek szülői megértésének pontossága.
Körülbelül 4,5 év
Szülői támogatási igények - önbevallásos kérdőív alapján - CSAK szekvenciális csoport
Időkeret: Körülbelül 4,5 év
Az anya és az apa nevelési/tanácsadási és szociális támogatási szükségletei.
Körülbelül 4,5 év
Időbeli besorolás (a szekvenálás eredményének időbeli változása) – CSAK szekvenált csoport
Időkeret: Körülbelül 4,5 év
A szekvenálási változatok osztályozásának változásai az idő múlásával.
Körülbelül 4,5 év
Átfutási idő – CSAK szekvenciális csoport
Időkeret: Körülbelül 4,5 év
A szekvenálási összetevők átfutási ideje és annak időbeli változása.
Körülbelül 4,5 év

Együttműködők és nyomozók

Itt találhatja meg a tanulmányban érintett személyeket és szervezeteket.

Tanulmányi rekorddátumok

Ezek a dátumok nyomon követik a ClinicalTrials.gov webhelyre benyújtott vizsgálati rekordok és összefoglaló eredmények benyújtásának folyamatát. A vizsgálati feljegyzéseket és a jelentett eredményeket a Nemzeti Orvostudományi Könyvtár (NLM) felülvizsgálja, hogy megbizonyosodjon arról, hogy megfelelnek-e az adott minőség-ellenőrzési szabványoknak, mielőtt közzéteszik őket a nyilvános weboldalon.

Tanulmány főbb dátumok

Tanulmány kezdete (TÉNYLEGES)

2019. június 28.

Elsődleges befejezés (VÁRHATÓ)

2023. augusztus 1.

A tanulmány befejezése (VÁRHATÓ)

2023. november 1.

Tanulmányi regisztráció dátumai

Először benyújtva

2019. március 25.

Először nyújtották be, amely megfelel a minőségbiztosítási kritériumoknak

2019. április 30.

Első közzététel (TÉNYLEGES)

2019. május 3.

Tanulmányi rekordok frissítései

Utolsó frissítés közzétéve (TÉNYLEGES)

2022. október 24.

Az utolsó frissítés elküldve, amely megfelel a minőségbiztosítási kritériumoknak

2022. október 20.

Utolsó ellenőrzés

2022. október 1.

Több információ

A tanulmányhoz kapcsolódó kifejezések

Egyéb vizsgálati azonosító számok

  • AAAS2118
  • R01HD055651 (NIH, Nemzeti Egészségügyi Intézet)

Terv az egyéni résztvevői adatokhoz (IPD)

Tervezi megosztani az egyéni résztvevői adatokat (IPD)?

IGEN

IPD terv leírása

Az NIH genomiális adatmegosztási szabályzatának megfelelően a szekvenálási adatokat (beleértve a VCF-fájlokat) és a klinikai adatokat megosztják más tudományos kutatókkal, valamint a szabályozott hozzáférésű dbGAP adattáron vagy hasonló genomics commons-on, a Sequence Read Archive-on és bármely NIH Birth Defects Commons-on keresztül. hogy létrejött. A klinikai és fenotípusos adatokat tartalmazó végleges adatkészletet elküldik a NICHD adattárába (DASH). Ezen túlmenően az új algoritmusok és az allélgyakorisági adatok adott esetben meg lesznek osztva az újonnan kifejlesztett Precision FDA platformmal.

IPD megosztási időkeret

A tanulmányok befejezése után.

IPD-megosztási hozzáférési feltételek

DbGaP vagy más ellenőrzött hozzáférésű adatbázisokon keresztül.

Az IPD megosztását támogató információ típusa

  • STUDY_PROTOCOL
  • NEDV
  • ICF
  • CSR

Gyógyszer- és eszközinformációk, tanulmányi dokumentumok

Egy amerikai FDA által szabályozott gyógyszerkészítményt tanulmányoz

Nem

Egy amerikai FDA által szabályozott eszközterméket tanulmányoz

Nem

Ezt az információt közvetlenül a clinicaltrials.gov webhelyről szereztük be, változtatás nélkül. Ha bármilyen kérése van vizsgálati adatainak módosítására, eltávolítására vagy frissítésére, kérjük, írjon a következő címre: register@clinicaltrials.gov. Amint a változás bevezetésre kerül a clinicaltrials.gov oldalon, ez a webhelyünkön is automatikusan frissül. .

Klinikai vizsgálatok a Magzati szerkezeti anomáliák

Klinikai vizsgálatok a Prenatális genomi szekvenálás

3
Iratkozz fel