- ICH GCP
- Rejestr badań klinicznych w USA
- Badanie kliniczne NCT03936101
Prenatalna diagnostyka genetyczna za pomocą sekwencjonowania genomu (PrenatalSEQ)
Prenatalna diagnostyka genetyczna za pomocą sekwencjonowania genomu: ocena prospektywna
Przegląd badań
Status
Warunki
Interwencja / Leczenie
Szczegółowy opis
Sekwencjonowanie całego egzomu i całego genomu (WGS) rozszerzyło możliwości określania genetycznej etiologii wcześniej niezdiagnozowanych zaburzeń. Niniejsze badanie jest wieloośrodkowym prospektywnym badaniem kohortowym mającym na celu ocenę pojawiającej się technologii sekwencjonowania w leczeniu płodów z anomaliami strukturalnymi. Hipoteza jest taka, że znaczny podzbiór anomalii strukturalnych płodu ma genetyczną etiologię możliwą do zidentyfikowania za pomocą sekwencjonowania i że prenatalna znajomość tych informacji poprawi opiekę okołoporodową, ograniczy niepotrzebne badania diagnostyczne, zmniejszy koszty opieki i poprawi jakość życia zarówno dziecka i rodzina. Celem tego badania jest zbadanie tych wielu aspektów sekwencjonowania prenatalnego w jednym badaniu z innowacyjnym zintegrowanym prospektywnym projektem, który pozwoli na solidną ocenę korzyści i ryzyka dostarczania diagnostycznych i prognostycznych wyników badań genetycznych w warunkach prenatalnych.
Badanie określi, w sekwencyjnej populacji ciąż z wybranymi anomaliami strukturalnymi płodu i ujemną lub nieprzyczynową mikromacierzą chromosomalną (CMA), częstość patogennych, prawdopodobnie patogennych i niepewnych wariantów genomowych, które można zidentyfikować za pomocą sekwencjonowania. Aby określić wpływ tych informacji na opiekę kliniczną, zostanie prospektywnie zrekrutowana populacja kontrolna niesekwencjonowanych ciąż z podobnymi anomaliami strukturalnymi, a niemowlęta z obu kohort będą obserwowane do 1 roku życia. Ten komponent badania oceni różnice w zarządzaniu opieką zdrowotną i kosztach poprzez wypis ze szpitala po porodzie oraz wyniki okołoporodowe i niemowlęce w ciągu 1 roku życia. Oceniony zostanie również edukacyjny, poradniczy i psychospołeczny wpływ wyników sekwencjonowania w okresie prenatalnym, w żłobku i do 1 roku życia. Ponieważ narzędzia analityczne i kliniczne potrzebne do pełnego przełożenia sekwencjonowania na opiekę wciąż się rozwijają, zbadana zostanie optymalizacja narzędzi bioinformatycznych w celu poprawy identyfikacji patogennych i prawdopodobnych mutacji patogennych związanych z prenatalnymi fenotypami ustalonych genów chorobowych, a także identyfikacja nowych geny związane z obecnie niezdiagnozowanymi fenotypami płodu/noworodka. Badanie to zapewni dogłębną ocenę prenatalnej wartości diagnostycznej sekwencjonowania przed jego odpowiedzialnym wprowadzeniem do praktyki i dostarczy niezależnych danych, które pomogą w jego tłumaczeniu.
Typ studiów
Zapisy (Rzeczywisty)
Kontakty i lokalizacje
Lokalizacje studiów
-
-
New York
-
New York, New York, Stany Zjednoczone, 10032
- Columbia University Medical Center
-
-
North Carolina
-
Chapel Hill, North Carolina, Stany Zjednoczone, 27514
- University of North Carolina Chapel Hill
-
-
Ohio
-
Cincinnati, Ohio, Stany Zjednoczone, 45229
- Children's Hospital, Cincinnati Medical Center
-
-
Texas
-
Houston, Texas, Stany Zjednoczone, 77030
- Baylor College of Medicine
-
Houston, Texas, Stany Zjednoczone, 77030
- UT Health Houston
-
-
Kryteria uczestnictwa
Kryteria kwalifikacji
Wiek uprawniający do nauki
Akceptuje zdrowych ochotników
Metoda próbkowania
Badana populacja
Do badania zostanie włączonych łącznie 1100 ciąż z wadami strukturalnymi płodu i spełniających kryteria kwalifikacji. Spośród nich 750 zostanie poddanych prenatalnemu sekwencjonowaniu genomowemu (grupa sekwencjonowania prenatalnego), a pozostałe 350 ciąż nie będzie miało żadnego prenatalnego sekwencjonowania genomowego (niesekwencjonowana grupa prenatalna).
Rejestracja ciąż z izolowanymi pomiarami przezierności karkowej ≥ 3,5 mm będzie ograniczona do 5% w każdej grupie (sekwencjonowana i niesekwencjonowana), a izolowana szacowana masa płodu <5% ile będzie również ograniczona do 5% dla każdej grupy (sekwencjonowana i niesekwencjonowana). .
Opis
Kryteria przyjęcia:
Grupa sekwencjonowania prenatalnego
Płód zidentyfikowany za pomocą USG i/lub MRI z co najmniej jednym z poniższych:
- Jedna lub więcej poważnych anomalii strukturalnych (Załącznik A)
- Pomiar przezierności karkowej ≥ 3,5 mm
- Płód w wieku poniżej 24 tygodni i 0 dni ciąży z prawidłową anatomią i oszacowaną ultrasonograficznie masą płodu <5 %ile, bez nadciśnienia u matki, cukrzycy typu I lub innych chorób matki, o których wiadomo, że wpływają na wzrost płodu.
- Negatywny prenatalny CMA (lub te z wynikami CMA niezwiązanymi z wynikiem USG)
- Ciąża pojedyncza lub bliźniacza
- Wiek ciążowy krótszy niż 36 tygodni, 0 dni, aby umożliwić dostępność wyników sekwencjonowania przed porodem
Grupa niesekwencjonowana
Płód zidentyfikowany za pomocą USG i/lub MRI z co najmniej jednym z poniższych:
- Jedna lub więcej poważnych anomalii strukturalnych (Załącznik A)
- Pomiar przezierności karkowej ≥ 3,5 mm
- Płód w wieku poniżej 24 tygodni i 0 dni ciąży z prawidłową anatomią i oszacowaną ultrasonograficznie masą płodu <5 %ile bez nadciśnienia u matki, cukrzycy typu I lub innych zaburzeń u matki, o których wiadomo, że wpływają na wzrost płodu
- Negatywny prenatalny lub postnatalny CMA (lub te z wynikami CMA niezwiązanymi z wynikiem badania ultrasonograficznego)
- Odrzucone sekwencjonowanie prenatalne
- Ciąża pojedyncza
Kryteria wyłączenia:
Grupa sekwencjonowania prenatalnego
- Sekwencjonowanie prenatalne lub planowane sekwencjonowanie prenatalne wykonywane poza badaniem, w tym panele genów
- Wiek matki lub ojca poniżej 18 lat
- Udowodniona zakaźna lub teratogenna przyczyna wad płodu
- Planowane przerwanie ciąży
- Niedostępne próbki krwi lub śliny od obojga biologicznych rodziców przed sekwencjonowaniem
- Niechęć rodziców do udziału w rocznej obserwacji poporodowej
- Bariera językowa (nieanglojęzyczna lub hiszpańskojęzyczna)
- Wcześniejsza zgoda na niesekwencjonowaną grupę prenatalną lub włączenie w poprzedniej ciąży
Grupa niesekwencjonowana
- Wiek matki lub ojca poniżej 18 lat
- Udowodniona zakaźna lub teratogenna przyczyna wad płodu
- Pozytywne prenatalne badanie przesiewowe NIPT w kierunku trisomii 21,18 lub 13. Pozytywny 22q11.2 wykluczeniem jest również prenatalne badanie NIPT ze spójnymi wynikami badania ultrasonograficznego.
- Planowane przerwanie ciąży
- Niechęć rodziców do udziału w rocznej obserwacji poporodowej
- Bariera językowa (nieanglojęzyczna lub hiszpańskojęzyczna)
Plan studiów
Jak projektuje się badanie?
Szczegóły projektu
Kohorty i interwencje
Grupa / Kohorta |
Interwencja / Leczenie |
|---|---|
|
Grupa z sekwencjonowaniem prenatalnym
750 trio z anomaliami strukturalnymi płodu, które otrzymały sekwencjonowanie prenatalne z badania
|
Sekwencjonowanie całego genomu (które początkowo będzie zamaskowane i zgłaszane tylko jako egzom)
|
|
Brak grupy sekwencjonowania prenatalnego (niesekwencjonowanego).
350 trio z anomaliami strukturalnymi płodu, które nie mają sekwencjonowania prenatalnego
|
Co mierzy badanie?
Podstawowe miary wyniku
Miara wyniku |
Opis środka |
Ramy czasowe |
|---|---|---|
|
Liczba uczestników, którzy mieli raportowane warianty
Ramy czasowe: Pod koniec studiów, około 4 lata
|
Warianty podlegające zgłoszeniu: zdefiniowane jako patogenne/prawdopodobnie patogenne (P/LP) lub warianty o niepewnym znaczeniu (VUS) zidentyfikowane w drodze sekwencjonowania i uznane za podlegające zgłoszeniu przez Komisję ds. oceny wariantów.
|
Pod koniec studiów, około 4 lata
|
|
Koszty opieki zdrowotnej
Ramy czasowe: Od momentu rozpoznania nieprawidłowości do wypisu dziecka
|
Koszty opieki zdrowotnej od momentu rozpoznania anomalii do wypisu dziecka pomiędzy grupami sekwencjonowanymi i niesekwencjonowanymi.
|
Od momentu rozpoznania nieprawidłowości do wypisu dziecka
|
Miary wyników drugorzędnych
Miara wyniku |
Opis środka |
Ramy czasowe |
|---|---|---|
|
Wiek ciążowy w momencie porodu
Ramy czasowe: W momencie dostawy
|
Wiek ciążowy noworodka w chwili porodu (w tygodniach)
|
W momencie dostawy
|
|
Wyniki noworodków
Ramy czasowe: Do 28 dni po urodzeniu
|
Wyniki noworodków zostaną porównane, a wyniki będą mierzone na podstawie liczby noworodków, u których wystąpiły: potrzeba wspomagania respiratora, posocznica, potrzeba wspomagania ciśnieniowego, potrzeba pozaustrojowego natleniania błony (ECMO), nieprawidłowości metaboliczne (np. kwasica, podwyższony poziom kwasu moczowego, hipo-/hiperglikemia), krwotok śródkomorowy, zaburzenia okołokomorowe leukomalacja, encefalopatia i drgawki.
|
Do 28 dni po urodzeniu
|
|
Liczba zgonów
Ramy czasowe: Od wypisu do 12 miesięcy po porodzie
|
Śmierć noworodka/niemowlęcia w chwili wypisu i w wieku 12 miesięcy.
|
Od wypisu do 12 miesięcy po porodzie
|
|
Czas pobytu na OIOM-ie
Ramy czasowe: Od wypisu do 12 miesięcy po porodzie
|
Długość początkowego pobytu na OITN i liczba dni spędzonych w szpitalu od pierwszego wypisu do 12 miesiąca życia.
|
Od wypisu do 12 miesięcy po porodzie
|
|
Długość w centymetrach
Ramy czasowe: 12 miesięcy po porodzie
|
Długość niemowlęca w wieku 12 miesięcy.
|
12 miesięcy po porodzie
|
|
Waga w kilogramach
Ramy czasowe: 12 miesięcy po porodzie
|
Masa ciała niemowlęcia w wieku 12 miesięcy.
|
12 miesięcy po porodzie
|
|
Kwestionariusz Wyników Rozwoju według Wieku i Etapów (ASQ-3)
Ramy czasowe: 12 miesięcy po porodzie
|
Wyniki rozwojowe określone przez następujące parametry: komunikacja, motoryka duża, motoryka mała, rozwiązywanie problemów i rozwój personalno-społeczny, w wieku 12 miesięcy za pomocą ASQ-3. Niższe wyniki są związane z opóźnieniem rozwoju. W przypadku każdego obszaru rozwojowego rodzice mogą odpowiedzieć TAK=10, CZASAMI=5 lub JESZCZE NIE=0, wypełniając dymek przy każdej odpowiedzi. Pełny zakres wyników dla każdej domeny wynosi od 0 do 60. Wartości graniczne dla każdej domeny to: Komunikacja 15,64, Silnik brutto 21,49, Silnik dobry 34,5, Rozwiązywanie problemów 27,32, Personal-Social 21,73 |
12 miesięcy po porodzie
|
|
Lęk według kwestionariusza samoopisowego
Ramy czasowe: 2 tygodnie po ujawnieniu wyników sekwencjonowania badania lub 4 tygodnie po włączeniu do grupy niesekwencjonowanej; 1 miesiąc po wypisaniu ze szpitala lub zakończeniu ciąży, jeśli doszło do obumarcia płodu lub przerwania ciąży; 12-15 miesięcy po porodzie
|
Niepokój po ujawnieniu wyniku (lub 8 tygodni po włączeniu do grupy niesekwencjonowanej), wypisie noworodka i 12 miesięcy po porodzie.
Pełny zakres wyników wynosi od 0 do 21, gdzie niższe liczby oznaczają niższy poziom lęku (lepszy wynik).
|
2 tygodnie po ujawnieniu wyników sekwencjonowania badania lub 4 tygodnie po włączeniu do grupy niesekwencjonowanej; 1 miesiąc po wypisaniu ze szpitala lub zakończeniu ciąży, jeśli doszło do obumarcia płodu lub przerwania ciąży; 12-15 miesięcy po porodzie
|
|
Depresja według kwestionariusza samoopisowego
Ramy czasowe: 2 tygodnie po ujawnieniu wyników sekwencjonowania badania lub 4 tygodnie po włączeniu do grupy niesekwencjonowanej; 1 miesiąc po wypisaniu ze szpitala lub zakończeniu ciąży, jeśli doszło do obumarcia płodu lub przerwania ciąży; 12-15 miesięcy po porodzie
|
Depresja po ujawnieniu wyników (lub 8 tygodni po włączeniu do grupy niesekwencjonowanej), wypisie noworodka i 12 miesięcy po porodzie.
Pełny zakres wyników wynosi od 0 do 24, gdzie niższy wynik oznacza mniejszą depresję (lepszy wynik).
|
2 tygodnie po ujawnieniu wyników sekwencjonowania badania lub 4 tygodnie po włączeniu do grupy niesekwencjonowanej; 1 miesiąc po wypisaniu ze szpitala lub zakończeniu ciąży, jeśli doszło do obumarcia płodu lub przerwania ciąży; 12-15 miesięcy po porodzie
|
|
Jakość życia według kwestionariusza samoopisowego
Ramy czasowe: Około 4,5 roku
|
Jakość życia pacjentki i rodziny 12 miesięcy po porodzie.
|
Około 4,5 roku
|
|
QALY, mierzona kosztem rocznym
Ramy czasowe: Około 4,5 roku
|
Koszt przyrostowy na rok życia skorygowany o jakość (QALY).
|
Około 4,5 roku
|
|
TYLKO całkowita liczba zidentyfikowanych fenotypów powiązanych z grupą sekwencjonowaną przez chorobę
Ramy czasowe: 12 miesięcy po porodzie
|
Ekspansja fenotypowa: Pozorna prenatalna ekspansja fenotypowa z aktualnie zdefiniowanych fenotypów pediatrycznych.
|
12 miesięcy po porodzie
|
|
Liczba uczestników z VUS – TYLKO grupa sekwencyjna
Ramy czasowe: 12 miesięcy po porodzie
|
Warianty o niepewnym znaczeniu (VUS), które nie zostały jeszcze powiązane z tym fenotypem choroby. Wynik ten miał być mierzony wyłącznie u uczestników grupy poddanej sekwencjonowaniu, zgodnie z protokołem badania. Nie zebrano danych dotyczących tego wyniku od żadnego uczestnika badania niesekwencjonowanego. |
12 miesięcy po porodzie
|
|
Liczba uczestników z wariantami sklasyfikowanymi jako GUS – TYLKO grupa sekwencyjna
Ramy czasowe: 12 miesięcy po porodzie
|
VUS sklasyfikowano jako atrakcyjne warianty nowych genów, które nie są jeszcze powiązane z chorobą (geny o niepewnym znaczeniu klinicznym; GUS). Wynik ten miał być mierzony wyłącznie u uczestników grupy poddanej sekwencjonowaniu, zgodnie z protokołem badania. Nie zebrano danych dotyczących tego wyniku od żadnego uczestnika badania niesekwencjonowanego. |
12 miesięcy po porodzie
|
|
Cyfrowy WES – porównanie wyników kodowania i niekodowania – TYLKO grupa sekwencjonowana
Ramy czasowe: Około 4,5 roku
|
Patogenne, prawdopodobnie patogenne i warianty VUS zidentyfikowane poprzez sekwencjonowanie (regiony kodujące i niekodujące) w porównaniu z samymi regionami kodującymi (cyfrowy WES).
|
Około 4,5 roku
|
|
Tylko Proband kontra Trio — porównanie wyników pomiędzy Trio i Tylko Proband — TYLKO grupa sekwencjonowana
Ramy czasowe: Około 4,5 roku
|
Patogenne, prawdopodobnie patogenne i warianty VUS zidentyfikowane poprzez analizę samego probanda w porównaniu z trio probant-rodzic.
|
Około 4,5 roku
|
|
Zmiana w zarządzaniu (opieka zdrowotna) ustalona przez lekarza OIOM-u i przegląd dokumentacji – TYLKO grupa sekwencyjna
Ramy czasowe: Od porodu do wypisu lub śmierci (noworodek)
|
Liczba uczestników, u których nastąpiła zmiana decyzji dotyczących postępowania wynikająca z wyników badań genomu, zdefiniowana jako zmiany w planie leczenia pacjenta lub zmiany w poradnictwie dla pacjenta/rodziny dotyczącym natychmiastowego lub długoterminowego postępowania medycznego. Wynik ten miał być mierzony wyłącznie u uczestników grupy poddanej sekwencjonowaniu, zgodnie z protokołem badania. Nie zebrano danych dotyczących tego wyniku od żadnego uczestnika badania niesekwencjonowanego. |
Od porodu do wypisu lub śmierci (noworodek)
|
|
Potrzeby wsparcia rodziców na podstawie kwestionariusza samoopisowego – TYLKO grupa sekwencyjna
Ramy czasowe: Po zakończeniu sekwencjonowania około 4,5 roku
|
Ocena potrzeb edukacyjnych/doradczych i wsparcia społecznego matki i ojca.
Pełny zakres wyników wynosi od 12 do 60, gdzie wyższy wynik oznacza wyższą satysfakcję z doświadczenia (lepszy wynik).
|
Po zakończeniu sekwencjonowania około 4,5 roku
|
|
Porozumienie rodziców na podstawie kwestionariusza samoopisowego – TYLKO grupa sekwencyjna
Ramy czasowe: Po zakończeniu sekwencjonowania około 4,5 roku
|
Dokładność zrozumienia przez rodziców wyników badań genetycznych.
Odpowiedzi rodziców na pytanie: „Jak dobrze rozumiesz wyniki swoich prenatalnych badań genetycznych?” zostaną zebrane.
Wszystkie możliwe odpowiedzi to: „Wcale nie”, „Trochę”, „Umiarkowanie”, „Całkiem trochę” i „Bardzo”
|
Po zakończeniu sekwencjonowania około 4,5 roku
|
|
Liczba uczestników, u których nastąpiła zmiana w wyniku sekwencjonowania – TYLKO grupa sekwencjonowana
Ramy czasowe: Od zakończenia sekwencjonowania do okresu analizy danych – do 4,5 roku
|
Reinterpretacje wyników sekwencjonowania prowadzące do zmiany klasyfikacji wariantów sekwencjonowania. Wynik ten miał być mierzony wyłącznie u uczestników grupy poddanej sekwencjonowaniu, zgodnie z protokołem badania. Nie zebrano danych dotyczących tego wyniku od żadnego uczestnika badania niesekwencjonowanego. |
Od zakończenia sekwencjonowania do okresu analizy danych – do 4,5 roku
|
|
Czas realizacji — TYLKO grupa sekwencyjna
Ramy czasowe: Czas od rozpoczęcia sekwencjonowania do uzyskania wyniku w ośrodku badawczym, do 38 dni
|
Czas realizacji elementów sekwencjonowania i jego zmiany w czasie.
Wynik ten miał być mierzony wyłącznie u uczestników grupy poddanej sekwencjonowaniu, zgodnie z protokołem badania.
Nie zebrano danych dotyczących tego wyniku od żadnego uczestnika badania niesekwencjonowanego.
|
Czas od rozpoczęcia sekwencjonowania do uzyskania wyniku w ośrodku badawczym, do 38 dni
|
Współpracownicy i badacze
Sponsor
Współpracownicy
Śledczy
- Główny śledczy: Ronald Wapner, MD, Columbia University
Daty zapisu na studia
Główne daty studiów
Rozpoczęcie studiów (Rzeczywisty)
Zakończenie podstawowe (Rzeczywisty)
Ukończenie studiów (Rzeczywisty)
Daty rejestracji na studia
Pierwszy przesłany
Pierwszy przesłany, który spełnia kryteria kontroli jakości
Pierwszy wysłany (Rzeczywisty)
Aktualizacje rekordów badań
Ostatnia wysłana aktualizacja (Szacowany)
Ostatnia przesłana aktualizacja, która spełniała kryteria kontroli jakości
Ostatnia weryfikacja
Więcej informacji
Terminy związane z tym badaniem
Inne numery identyfikacyjne badania
- AAAS2118
- R01HD055651 (Grant/umowa NIH USA)
Plan dla danych uczestnika indywidualnego (IPD)
Planujesz udostępniać dane poszczególnych uczestników (IPD)?
Opis planu IPD
Ramy czasowe udostępniania IPD
Kryteria dostępu do udostępniania IPD
Typ informacji pomocniczych dotyczących udostępniania IPD
- PROTOKÓŁ BADANIA
- SOK ROŚLINNY
- ICF
- CSR
Informacje o lekach i urządzeniach, dokumenty badawcze
Bada produkt leczniczy regulowany przez amerykańską FDA
Bada produkt urządzenia regulowany przez amerykańską FDA
produkt wyprodukowany i wyeksportowany z USA
Te informacje zostały pobrane bezpośrednio ze strony internetowej clinicaltrials.gov bez żadnych zmian. Jeśli chcesz zmienić, usunąć lub zaktualizować dane swojego badania, skontaktuj się z register@clinicaltrials.gov. Gdy tylko zmiana zostanie wprowadzona na stronie clinicaltrials.gov, zostanie ona automatycznie zaktualizowana również na naszej stronie internetowej .