Эта страница была переведена автоматически, точность перевода не гарантируется. Пожалуйста, обратитесь к английской версии для исходного текста.

Пренатальная генетическая диагностика с помощью геномного секвенирования (PrenatalSEQ)

20 октября 2022 г. обновлено: Ronald J Wapner, MD, Columbia University

Пренатальная генетическая диагностика с помощью геномного секвенирования: перспективная оценка

В этом исследовании оценивается влияние пренатального секвенирования на ведение плода с ультразвуковыми аномалиями. Гипотеза состоит в том, что значительное подмножество аномалий плода имеет генетическую причину, которая может быть идентифицирована путем секвенирования, и что пренатальное знание этой информации улучшит пренатальную помощь, уменьшит количество ненужных диагностических тестов, снизит стоимость лечения и улучшит качество жизни для беременных. и ребенку, и семье.

Обзор исследования

Статус

Рекрутинг

Условия

Вмешательство/лечение

Подробное описание

Секвенирование полного экзома и всего генома (WGS) расширило возможности определения генетической этиологии ранее недиагностированных заболеваний. Это исследование представляет собой многоцентровое проспективное когортное исследование для оценки новой технологии секвенирования для лечения плодов со структурными аномалиями. Гипотеза состоит в том, что значительное подмножество структурных аномалий плода имеет генетическую этиологию, которую можно определить с помощью секвенирования, и что пренатальное знание этой информации улучшит перинатальную помощь, уменьшит количество ненужных диагностических тестов, снизит стоимость ухода и улучшит качество жизни как для ребенка, так и для ребенка. и семья. Целью данного исследования является изучение этих многочисленных аспектов пренатального секвенирования в одном исследовании с инновационным интегрированным проспективным дизайном, который позволит провести надежную оценку преимуществ и рисков получения результатов диагностического и прогностического генетического тестирования в пренатальных условиях.

Исследование определит в последовательной популяции беременных с выбранными структурными аномалиями плода и отрицательным или не причинным хромосомным микрочипом (CMA) частоту патогенных, вероятно патогенных и неопределенных геномных вариантов, идентифицируемых с помощью секвенирования. Чтобы определить влияние этой информации на клиническую помощь, будет проспективно набрана контрольная популяция несеквенированных беременностей с аналогичными структурными аномалиями, и младенцы из обеих групп будут наблюдаться до 1 года. Этот компонент исследования будет оценивать различия в управлении здравоохранением и стоимости при выписке из больницы после родов, а также перинатальные и младенческие исходы в течение 1 года жизни. Также будет оцениваться образовательное, консультационное и психосоциальное влияние результатов секвенирования в пренатальный период, в дошкольном возрасте и в течение 1 года жизни. Поскольку аналитические и клинические инструменты, необходимые для полного преобразования секвенирования в лечение, все еще развиваются, будет исследована оптимизация биоинформационных инструментов для улучшения идентификации патогенных и вероятно патогенных мутаций, связанных с пренатальными фенотипами установленных генов болезней, а также выявление новых гены, связанные с недиагностированными в настоящее время фетальными/неонатальными фенотипами. Это исследование предоставит глубокую оценку пренатальной диагностической ценности секвенирования до его ответственного внедрения в практику и предоставит независимые данные для руководства его переводом.

Тип исследования

Наблюдательный

Регистрация (Ожидаемый)

1100

Контакты и местонахождение

В этом разделе приведены контактные данные лиц, проводящих исследование, и информация о том, где проводится это исследование.

Контакты исследования

  • Имя: Jessica L Giordano, CGC
  • Номер телефона: 516-521-5604
  • Электронная почта: jlg2197@cumc.columbia.edu

Учебное резервное копирование контактов

  • Имя: Ronnie J Loosen
  • Номер телефона: 415-652-1177
  • Электронная почта: rla2156@cumc.columbia.edu

Места учебы

  • Соединенные Штаты
    • New York
      • New York, New York, Соединенные Штаты, 10032
        • Рекрутинг
        • Columbia University Medical Center
        • Контакт:
          • Ronald Wapner, MD
          • Номер телефона: 212-305-1521
    • North Carolina
      • Chapel Hill, North Carolina, Соединенные Штаты, 27514
        • Рекрутинг
        • University of North Carolina Chapel Hill
        • Контакт:
        • Главный следователь:
          • Neeta Vora, MD
    • Ohio
      • Cincinnati, Ohio, Соединенные Штаты, 45229
        • Рекрутинг
        • Children's Hospital, Cincinnati Medical Center
        • Контакт:
          • Beatrix Wong, CGC
          • Номер телефона: 513-636-4200
          • Электронная почта: beatrix.wong@cchmc.org
    • Texas
      • Houston, Texas, Соединенные Штаты, 77030
        • Рекрутинг
        • Baylor College of Medicine
      • Houston, Texas, Соединенные Штаты, 77030
        • Рекрутинг
        • UT Health Houston
        • Контакт:

Критерии участия

Исследователи ищут людей, которые соответствуют определенному описанию, называемому критериям приемлемости. Некоторыми примерами этих критериев являются общее состояние здоровья человека или предшествующее лечение.

Критерии приемлемости

Возраст, подходящий для обучения

18 лет и старше (ВЗРОСЛЫЙ, OLDER_ADULT)

Принимает здоровых добровольцев

Да

Полы, имеющие право на обучение

Все

Метод выборки

Невероятностная выборка

Исследуемая популяция

Всего в исследование будет включено 1100 беременностей с аномалиями строения плода, отвечающими критериям приемлемости. Из них 750 будут подвергнуты пренатальному секвенированию генома (группа пренатального секвенирования), а оставшиеся 350 беременностей не будут подвергаться пренатальному секвенированию генома (группа пренатального секвенирования).

Регистрация беременностей с изолированными измерениями воротникового пространства ≥ 3,5 мм будет ограничена 5% в каждой группе (секвенированные и несеквенированные), а изолированная расчетная масса плода <5-го процента также будет ограничена 5% для каждой группы (секвенированные и несеквенированные) .

Описание

Критерии включения:

Группа пренатального секвенирования

  1. У плода, идентифицированного с помощью УЗИ и / или МРТ, по крайней мере, один из следующих признаков:

    1. Одна или несколько крупных структурных аномалий (Приложение A)
    2. Измерение воротниковой прозрачности ≥ 3,5 мм
    3. Плод со сроком гестации менее 24 недель 0 дней с нормальной анатомией и сонографически оцененной массой плода <5-го процента без материнской гипертонии, диабета I типа или других материнских заболеваний, которые, как известно, влияют на рост плода.
  2. Отрицательный пренатальный CMA (или те, у кого результаты CMA не связаны с данными УЗИ)
  3. Одноплодная или двойная беременность
  4. Гестационный возраст менее 36 недель, 0 дней, чтобы можно было получить результаты секвенирования до родов.

Неупорядоченная группа

  1. У плода, идентифицированного с помощью УЗИ и / или МРТ, по крайней мере, один из следующих признаков:

    1. Одна или несколько крупных структурных аномалий (Приложение A)
    2. Измерение воротниковой прозрачности ≥ 3,5 мм
    3. Плод со сроком гестации менее 24 недель 0 дней с нормальной анатомией и сонографически оцененной массой плода <5% без артериальной гипертензии у матери, диабета I типа или других заболеваний у матери, о которых известно, что они влияют на рост плода
  2. Отрицательный пренатальный или постнатальный CMA (или результаты CMA, не связанные с результатами УЗИ)
  3. Отказ от пренатального секвенирования
  4. Одноплодная беременность

Критерий исключения:

Группа пренатального секвенирования

  1. Пренатальное секвенирование или запланированное пренатальное секвенирование, проводимое вне исследования, включая генные панели
  2. Возраст матери или отца менее 18 лет
  3. Доказанная инфекционная или тератогенная причина аномалии плода
  4. Планируемое прерывание беременности
  5. Недоступные образцы крови или слюны от обоих биологических родителей перед секвенированием
  6. Нежелание родителей участвовать в послеродовом наблюдении в течение 1 года
  7. Языковой барьер (не говорящий по-английски или по-испански)
  8. Предыдущее согласие на несеквенированную пренатальную группу или зачисление в предыдущую беременность

Неупорядоченная группа

  1. Возраст матери или отца менее 18 лет
  2. Доказанная инфекционная или тератогенная причина аномалии плода
  3. Положительный пренатальный скрининг НИПТ на трисомию 21, 18 или 13. Положительный 22q11.2 Исключением также является пренатальное НИПТ-тестирование с последовательными данными УЗИ.
  4. Планируемое прерывание беременности
  5. Нежелание родителей участвовать в послеродовом наблюдении в течение 1 года
  6. Языковой барьер (не говорящий по-английски или по-испански)

Учебный план

В этом разделе представлена ​​подробная информация о плане исследования, в том числе о том, как планируется исследование и что оно измеряет.

Как устроено исследование?

Детали дизайна

Когорты и вмешательства

Группа / когорта
Вмешательство/лечение
Группа пренатального секвенирования
750 троек со структурными аномалиями плода, которые получили пренатальное секвенирование в рамках исследования
Диагностический тест: Пренатальное геномное секвенирование
Секвенирование всего генома (которое изначально будет замаскировано и указано только как экзом)
Группа без пренатального секвенирования (несеквенированная)
350 троек с аномалиями строения плода, которым не проводили пренатальное секвенирование

Что измеряет исследование?

Первичные показатели результатов

Мера результата
Мера Описание
Временное ограничение
Отчетные варианты
Временное ограничение: Примерно 4,5 года
Подлежащие регистрации варианты (определяемые как патогенные, вероятно патогенные или VUS), идентифицированные путем секвенирования и признанные подлежащими регистрации Комитетом по рассмотрению вариантов.
Примерно 4,5 года
Расходы на здравоохранение
Временное ограничение: Примерно 4,5 года
Затраты на здравоохранение с момента постановки диагноза аномалии до выписки младенца между секвенированными и несеквенированными группами.
Примерно 4,5 года

Вторичные показатели результатов

Мера результата
Мера Описание
Временное ограничение
Перинатальные исходы по данным обзора медицинских карт
Временное ограничение: Примерно 4,5 года
Перинатальные исходы будут сравниваться, и исходы будут оцениваться по: гестационному возрасту на момент родов, основным заболеваниям, включая длительность искусственной вентиляции легких, сепсис, потребность в прессорной поддержке, потребность в ЭКМО, метаболические нарушения (например, ацидоз, повышенный уровень мочевой кислоты, гипо-/ гипергликемия), внутрижелудочковое кровоизлияние/перивентрикулярная лейкомаляция, энцефалопатия и судороги.
Примерно 4,5 года
Смерть
Временное ограничение: Примерно 4,5 года
Неонатальная/младенческая смертность при выписке и в возрасте 12 месяцев.
Примерно 4,5 года
Продолжительность пребывания в отделении интенсивной терапии
Временное ограничение: Примерно 4,5 года
Продолжительность первоначального пребывания в отделении интенсивной терапии и количество дней, проведенных в больнице между первоначальной выпиской и 12-месячным возрастом.
Примерно 4,5 года
Длина в сантиметрах
Временное ограничение: Примерно 4,5 года
Длина тела младенца в возрасте 12 месяцев.
Примерно 4,5 года
Вес в килограммах
Временное ограничение: Примерно 4,5 года
Вес ребенка в 12 месяцев.
Примерно 4,5 года
Анкета развития по возрастам и стадиям
Временное ограничение: Примерно 4,5 года
Результаты развития, определяемые следующими параметрами: общение, крупная моторика, мелкая моторика, решение проблем и личностно-социальные, в возрасте 12 месяцев с использованием ASQ-3. Более низкие баллы связаны с задержкой развития. Предельные значения для 12-месячного экзамена: Общение 15.64, Общая моторика 21,49, Мелкая моторика 34,5, Решение проблем 27,32, Лично-социальные 21,73
Примерно 4,5 года
Тревога по анкете самоотчета
Временное ограничение: Примерно 4,5 года
Беспокойство после раскрытия результатов (или через 8 недель после зачисления в группу без секвенирования), после выписки новорожденного и через 12 месяцев после родов.
Примерно 4,5 года
Депрессия/тревога по анкете самоотчета
Временное ограничение: Примерно 4,5 года
Депрессия после раскрытия результатов (или через 8 недель после зачисления в группу без секвенирования), после выписки новорожденного и через 12 месяцев после родов.
Примерно 4,5 года
Качество жизни по анкете самоотчета
Временное ограничение: Примерно 4,5 года
Качество жизни пациентки и ее семьи через 12 месяцев после родов.
Примерно 4,5 года
QALY, измеряемый в стоимостном выражении в год
Временное ограничение: Примерно 4,5 года
Дополнительные затраты на год жизни с поправкой на качество (QALY).
Примерно 4,5 года
Расширение фенотипа — идентификация новых фенотипов, связанных с заболеванием — ТОЛЬКО секвенированная группа
Временное ограничение: Примерно 4,5 года
Очевидное пренатальное фенотипическое расширение от определенных в настоящее время педиатрических фенотипов.
Примерно 4,5 года
Частота VUS и результат - ТОЛЬКО секвенированная группа
Временное ограничение: Примерно 4,5 года
Варианты неопределенной значимости (ВУС), которые еще не были связаны с фенотипом этого заболевания.
Примерно 4,5 года
Частота GUS и результат - ТОЛЬКО секвенированная группа
Временное ограничение: Примерно 4,5 года
VUS подклассифицируется как убедительные варианты в новых генах, которые еще не связаны с заболеванием (гены с неопределенной клинической значимостью; GUS).
Примерно 4,5 года
Цифровой WES — сравнение результатов кодирования и некодирования — ТОЛЬКО секвенированная группа
Временное ограничение: Примерно 4,5 года
Патогенные, вероятно патогенные и варианты VUS, идентифицированные путем секвенирования (кодирующие и некодирующие области), сравниваются только с кодирующими областями (цифровой WES).
Примерно 4,5 года
Только пробанд против трио — сравнение результатов между трио и только пробандом — ТОЛЬКО секвенированная группа
Временное ограничение: Примерно 4,5 года
Патогенные, вероятно патогенные и варианты VUS, выявленные путем анализа одного пробанда по сравнению с трио пробанд-родитель.
Примерно 4,5 года
Изменение в управлении (медицинское обслуживание) по решению врача отделения интенсивной терапии и проверка документации — ТОЛЬКО для секвенированной группы
Временное ограничение: Примерно 4,5 года
Изменения в управленческих решениях, связанные с геномными результатами, определяемыми как изменения в плане лечения пациента или изменения в консультировании пациента/семьи относительно немедленного или долгосрочного медицинского лечения.
Примерно 4,5 года
Родительское понимание с помощью анкеты для самоотчета - ТОЛЬКО для последовательной группы
Временное ограничение: Примерно 4,5 года
Точность понимания родителями результатов генетического теста.
Примерно 4,5 года
Потребности в родительской поддержке - по анкете для самоотчетов - ТОЛЬКО в группе последовательностей
Временное ограничение: Примерно 4,5 года
Образовательная/консультационная и социальная поддержка матери и отца.
Примерно 4,5 года
Классификация с течением времени (изменение результатов секвенирования с течением времени) — ТОЛЬКО секвенированная группа
Временное ограничение: Примерно 4,5 года
Изменения в классификации вариантов секвенирования с течением времени.
Примерно 4,5 года
Время оборота - ТОЛЬКО последовательная группа
Временное ограничение: Примерно 4,5 года
Время оборота компонентов секвенирования и его изменение с течением времени.
Примерно 4,5 года

Соавторы и исследователи

Здесь вы найдете людей и организации, участвующие в этом исследовании.

Спонсор

Columbia University

Соавторы

Eunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human Development (NICHD)
The University of Texas Health Science Center, Houston
Baylor College of Medicine
Oregon Health and Science University
Children's Hospital Medical Center, Cincinnati
University of North Carolina
The George Washington University Biostatistics Center
Broad Institute
The Jackson Laboratory

Даты записи исследования

Эти даты отслеживают ход отправки отчетов об исследованиях и сводных результатов на сайт ClinicalTrials.gov. Записи исследований и сообщаемые результаты проверяются Национальной медицинской библиотекой (NLM), чтобы убедиться, что они соответствуют определенным стандартам контроля качества, прежде чем публиковать их на общедоступном веб-сайте.

Изучение основных дат

Начало исследования (ДЕЙСТВИТЕЛЬНЫЙ)

28 июня 2019 г.

Первичное завершение (ОЖИДАЕТСЯ)

1 августа 2023 г.

Завершение исследования (ОЖИДАЕТСЯ)

1 ноября 2023 г.

Даты регистрации исследования

Первый отправленный

25 марта 2019 г.

Впервые представлено, что соответствует критериям контроля качества

30 апреля 2019 г.

Первый опубликованный (ДЕЙСТВИТЕЛЬНЫЙ)

3 мая 2019 г.

Обновления учебных записей

Последнее опубликованное обновление (ДЕЙСТВИТЕЛЬНЫЙ)

24 октября 2022 г.

Последнее отправленное обновление, отвечающее критериям контроля качества

20 октября 2022 г.

Последняя проверка

1 октября 2022 г.

Дополнительная информация

Термины, связанные с этим исследованием

Другие идентификационные номера исследования

  • AAAS2118
  • R01HD055651 (Национальные институты здравоохранения США)

Планирование данных отдельных участников (IPD)

Планируете делиться данными об отдельных участниках (IPD)?

ДА

Описание плана IPD

В соответствии с политикой совместного использования геномных данных NIH, данные секвенирования (включая файлы VCF) и клинические данные будут передаваться другим научным исследователям, а также через репозиторий dbGAP с контролируемым доступом или сопоставимые общие ресурсы геномики, архив чтения последовательностей и любые общие ресурсы NIH Birth Defects Commons. что установлено. Окончательный набор данных, содержащий клинические и фенотипические данные, будет отправлен в хранилище данных NICHD (DASH). Кроме того, новые алгоритмы и данные о частоте аллелей будут совместно использоваться с недавно разработанной платформой Precision FDA, если это применимо.

Сроки обмена IPD

После окончания учебы.

Критерии совместного доступа к IPD

Через dbGaP или другие базы данных с контролируемым доступом.

Совместное использование IPD Поддерживающий тип информации

  • STUDY_PROTOCOL
  • САП
  • МКФ
  • КСО

Информация о лекарствах и устройствах, исследовательские документы

Изучает лекарственный продукт, регулируемый FDA США.

Нет

Изучает продукт устройства, регулируемый Управлением по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов США.

Нет

Эта информация была получена непосредственно с веб-сайта clinicaltrials.gov без каких-либо изменений. Если у вас есть запросы на изменение, удаление или обновление сведений об исследовании, обращайтесь по адресу register@clinicaltrials.gov. Как только изменение будет реализовано на clinicaltrials.gov, оно будет автоматически обновлено и на нашем веб-сайте. .

Клинические исследования Пренатальное геномное секвенирование

Искать похожие исследования

Спонсоры и соавторы

Заболевания

Медикаментозные вмешательства

CROs by country

CROs in Macedonia

Заболевания

Редкие заболевания

Медикаментозные вмешательства

Пищевые добавки

Спонсор / Соавторы

Места

Подписаться