Deze pagina is automatisch vertaald en de nauwkeurigheid van de vertaling kan niet worden gegarandeerd. Raadpleeg de Engelse versie voor een brontekst.

Prenatale genetische diagnose door genomische sequencing (PrenatalSEQ)

14 oktober 2025 bijgewerkt door: Ronald J Wapner, MD, Columbia University

Prenatale genetische diagnose door genomische sequencing: een prospectieve evaluatie

Deze studie evalueert de impact van prenatale sequencing op de behandeling van foetussen met echografische afwijkingen. De hypothese is dat een significante subset van foetale afwijkingen een genetische oorzaak heeft die kan worden geïdentificeerd door middel van sequentiëring en dat prenatale kennis van deze informatie de prenatale zorg zal verbeteren, onnodig diagnostisch onderzoek zal verminderen, de zorgkosten zal verlagen en de kwaliteit van leven zal verbeteren. zowel het kind als het gezin.

Studie Overzicht

Toestand

Voltooid

Conditie

Interventie / Behandeling

Gedetailleerde beschrijving

Whole exome en whole genome sequencing (WGS) hebben het vermogen uitgebreid om de genetische etiologie van voorheen niet-gediagnosticeerde aandoeningen te bepalen. Deze studie is een multicenter prospectieve cohortstudie om de opkomende technologie van sequencing voor de behandeling van foetussen met structurele afwijkingen te evalueren. De hypothese is dat een significante subset van foetale structurele anomalieën een genetische etiologie heeft die kan worden geïdentificeerd door sequentiëring en dat prenatale kennis van deze informatie de perinatale zorg zal verbeteren, onnodig diagnostisch testen zal verminderen, de kosten van zorg zal verminderen en de kwaliteit van leven voor zowel het kind als het kind zal verbeteren. en de familie. Het doel van deze studie is om deze meerdere aspecten van prenatale sequencing te onderzoeken in een enkele studie met een innovatief geïntegreerd prospectief ontwerp, dat een robuuste evaluatie mogelijk zal maken van de voordelen en risico's van het leveren van diagnostische en prognostische genetische testresultaten in een prenatale setting.

De studie zal, in een sequentiële populatie van zwangerschappen met geselecteerde foetale structurele anomalieën en een negatieve of niet-causale chromosomale microarray (CMA), de frequentie bepalen van pathogene, waarschijnlijk pathogene en onzekere genomische varianten die kunnen worden geïdentificeerd door sequencing. Om de impact van deze informatie op de klinische zorg te bepalen, zal prospectief een controlepopulatie van niet-gesequenteerde zwangerschappen met vergelijkbare structurele afwijkingen worden gerekruteerd en zullen de baby's uit beide cohorten worden gevolgd tot een leeftijd van 1 jaar. Deze studiecomponent evalueert de verschillen in zorgmanagement en kosten door ontslag uit het ziekenhuis na de bevalling, en perinatale en baby-uitkomsten gedurende 1 levensjaar. De educatieve, counseling en psychosociale impact van sequentieresultaten tijdens de prenatale periode, in de kinderkamer en gedurende 1 levensjaar zal ook worden geëvalueerd. Aangezien de analytische en klinische hulpmiddelen die nodig zijn voor de volledige vertaling van sequencing naar zorg nog in ontwikkeling zijn, zal optimalisatie van bio-informatica-instrumenten worden onderzocht om de identificatie van pathogene en waarschijnlijke pathogene mutaties geassocieerd met prenatale fenotypes van gevestigde ziektegenen te verbeteren, evenals de identificatie van nieuwe genen geassocieerd met momenteel niet-gediagnosticeerde foetale/neonatale fenotypes. Deze studie zal een grondige evaluatie geven van de prenatale diagnostische waarde van sequencing voordat deze op een verantwoorde manier in de praktijk wordt geïntroduceerd en zal onafhankelijke gegevens opleveren om de vertaling ervan te begeleiden.

Studietype

Observationeel

Inschrijving (Werkelijk)

1097

Contacten en locaties

In dit gedeelte vindt u de contactgegevens van degenen die het onderzoek uitvoeren en informatie over waar dit onderzoek wordt uitgevoerd.

Studie Locaties

  • Verenigde Staten
    • New York
      • New York, New York, Verenigde Staten, 10032
        • Columbia University Medical Center
    • North Carolina
      • Chapel Hill, North Carolina, Verenigde Staten, 27514
        • University of North Carolina Chapel Hill
    • Ohio
      • Cincinnati, Ohio, Verenigde Staten, 45229
        • Children's Hospital, Cincinnati Medical Center
    • Texas
      • Houston, Texas, Verenigde Staten, 77030
        • Baylor College of Medicine
      • Houston, Texas, Verenigde Staten, 77030
        • UT Health Houston

Deelname Criteria

Onderzoekers zoeken naar mensen die aan een bepaalde beschrijving voldoen, de zogenaamde geschiktheidscriteria. Enkele voorbeelden van deze criteria zijn iemands algemene gezondheidstoestand of eerdere behandelingen.

Geschiktheidscriteria

Leeftijden die in aanmerking komen voor studie

18 jaar en ouder (Volwassen, Oudere volwassene)

Accepteert gezonde vrijwilligers

Ja

Bemonsteringsmethode

Niet-waarschijnlijkheidssteekproef

Studie Bevolking

In totaal zullen 1.100 zwangerschappen met foetale structurele anomalieën die voldoen aan de criteria om in aanmerking te komen voor het onderzoek worden ingeschreven. Hiervan zullen er 750 prenatale genomische sequencing ondergaan (prenatale sequencing-groep) en de overige 350 zwangerschappen zullen geen prenatale genomische sequencing ondergaan (prenatale groep zonder sequentie).

Registratie van zwangerschappen met een geïsoleerde nekplooimeting ≥ 3,5 mm wordt beperkt tot 5% binnen elke groep (met en zonder sequentie) en geïsoleerd geschat foetaal gewicht <5%ile wordt ook beperkt tot 5% voor elke groep (met en zonder sequentie) .

Beschrijving

Inclusiecriteria:

Prenatale sequencing-groep

  1. Foetus geïdentificeerd door middel van echografie en/of MRI met ten minste een van de volgende:

    1. Een of meer grote structurele afwijkingen (bijlage A)
    2. Een nekplooimeting van ≥ 3,5 mm
    3. Een foetus met een zwangerschapsduur van minder dan 24 weken 0 dagen met een normale anatomie en een echografisch geschat foetaal gewicht <5%ile zonder maternale hypertensie, diabetes type I of andere maternale stoornissen waarvan bekend is dat ze de groei van de foetus verstoren.
  2. Negatieve prenatale CMA (of die met CMA-bevindingen die geen verband houden met de echo-bevinding)
  3. Eenling- of tweelingzwangerschap
  4. Zwangerschapsduur minder dan 36 weken, 0 dagen om beschikbaarheid van sequentieresultaten mogelijk te maken vóór de bevalling

Ongenummerde groep

  1. Foetus geïdentificeerd door middel van echografie en/of MRI met ten minste een van de volgende:

    1. Een of meer grote structurele afwijkingen (bijlage A)
    2. Een nekplooimeting van ≥ 3,5 mm
    3. Een foetus minder dan 24 weken 0 dagen zwangerschap met normale anatomie en echografisch geschat foetaal gewicht <5%ile zonder maternale hypertensie, type I diabetes of andere maternale stoornissen waarvan bekend is dat ze de groei van de foetus beïnvloeden
  2. Negatieve prenatale of postnatale CMA (of die met CMA-bevindingen die geen verband houden met de echo-bevinding)
  3. Geweigerde prenatale sequencing
  4. Singleton draagtijd

Uitsluitingscriteria:

Prenatale Sequencing-groep

  1. Prenatale sequencing of geplande prenatale sequencing uitgevoerd buiten het onderzoek, inclusief genenpanels
  2. Leeftijd van moeder of vader jonger dan 18 jaar
  3. Bewezen infectieuze of teratogene oorzaak van foetale anomalie
  4. Geplande zwangerschapsafbreking
  5. Onbeschikbare bloed- of speekselmonsters van beide biologische ouders voorafgaand aan sequencing
  6. Ouderlijke onwil om deel te nemen aan 1 jaar postnatale follow-up
  7. Taalbarrière (niet-Engels of Spaans sprekend)
  8. Eerdere toestemming voor de prenatale groep zonder sequentie of deelname aan een eerdere zwangerschap

Ongenummerde groep

  1. Leeftijd van moeder of vader jonger dan 18 jaar
  2. Bewezen infectieuze of teratogene oorzaak van foetale anomalie
  3. Positieve prenatale NIPT-screening op trisomie 21,18 of 13. Positief 22q11.2 prenatale NIPT-testen met consistente echo-bevindingen zijn ook een uitsluiting.
  4. Geplande zwangerschapsafbreking
  5. Ouderlijke onwil om deel te nemen aan 1 jaar postnatale follow-up
  6. Taalbarrière (niet-Engels of Spaans sprekend)

Studie plan

Dit gedeelte bevat details van het studieplan, inclusief hoe de studie is opgezet en wat de studie meet.

Hoe is de studie opgezet?

Ontwerpdetails

Cohorten en interventies

Groep / Cohort
Interventie / Behandeling
Prenataal gesequentiseerde groep
750 trio's met foetale structurele afwijkingen die prenatale sequencing van de studie ontvangen
Diagnostische toets: Prenatale genomische sequentiebepaling
Gehele genoomsequencing (die in eerste instantie wordt gemaskeerd en alleen als exoom wordt gerapporteerd)
Geen prenatale sequencing (niet-gesequenced) groep
350 trio's met foetale structurele afwijkingen die geen prenatale sequencing hebben

Wat meet het onderzoek?

Primaire uitkomstmaten

Uitkomstmaat
Maatregel Beschrijving
Tijdsspanne
Aantal deelnemers met te rapporteren varianten
Tijdsspanne: Aan het einde van de studie, ongeveer 4 jaar
Rapporteerbare varianten: gedefinieerd als pathogeen/waarschijnlijk pathogeen (P/LP) of variant van onzekere significantie (VUS), geïdentificeerd door sequencing en rapporteerbaar geacht door de variantbeoordelingscommissie.
Aan het einde van de studie, ongeveer 4 jaar
Gezondheidszorgkosten
Tijdsspanne: Vanaf het moment van de diagnose van een afwijking tot het ontslag van het kind
Gezondheidszorgkosten vanaf het moment van de diagnose van de afwijking tot het ontslag van het kind tussen groepen met en zonder sequentie.
Vanaf het moment van de diagnose van een afwijking tot het ontslag van het kind

Secundaire uitkomstmaten

Uitkomstmaat
Maatregel Beschrijving
Tijdsspanne
Zwangerschapsduur bij bevalling
Tijdsspanne: Op het moment van levering
Zwangerschapsduur van de pasgeborene bij de bevalling (in weken)
Op het moment van levering
Neonatale resultaten
Tijdsspanne: Tot 28 dagen na de geboorte
Neonatale uitkomsten zullen worden vergeleken en de uitkomsten zullen worden gemeten aan de hand van het aantal pasgeborenen die last hebben van: behoefte aan beademingsondersteuning, sepsis, behoefte aan pressorondersteuning, behoefte aan extracorporale membraanoxygenatie (ECMO), metabolische afwijkingen (bijv. acidose, verhoogd urinezuur, hypo-/hyperglykemie), intraventriculaire bloeding, periventriculaire leukomalacie, encefalopathie en toevallen.
Tot 28 dagen na de geboorte
Aantal sterfgevallen
Tijdsspanne: Vanaf ontslag tot 12 maanden postpartum
Sterfte bij pasgeborenen/zuigelingen bij ontslag en op de leeftijd van 12 maanden.
Vanaf ontslag tot 12 maanden postpartum
Duur van het verblijf op de NICU
Tijdsspanne: Vanaf ontslag tot 12 maanden postpartum
De duur van het initiële verblijf op de NICU en het aantal dagen dat u in het ziekenhuis heeft doorgebracht tussen het eerste ontslag en de leeftijd van 12 maanden.
Vanaf ontslag tot 12 maanden postpartum
Lengte in centimeters
Tijdsspanne: 12 maanden postpartum
Lengte van baby op de leeftijd van 12 maanden.
12 maanden postpartum
Gewicht in kilogram
Tijdsspanne: 12 maanden postpartum
Gewicht van het kind op de leeftijd van 12 maanden.
12 maanden postpartum
Vragenlijst over ontwikkeling per leeftijd en fase (ASQ-3)
Tijdsspanne: 12 maanden postpartum

Ontwikkelingsresultaten gedefinieerd door de volgende parameters: communicatie, grove motoriek, fijne motoriek, probleemoplossing en persoonlijk-sociaal, op de leeftijd van 12 maanden met behulp van ASQ-3. Lagere scores houden verband met ontwikkelingsachterstand. Voor elk ontwikkelingsgebied kunnen ouders JA=10, SOMS=5, of NOG NIET=0 antwoorden door voor elk itemantwoord een ballon in te vullen. Het volledige scorebereik voor elk domein is 0 tot 60.

Cutoffs voor elk domein zijn: Communicatie 15.64, Grove motoriek 21,49, fijne motoriek 34,5, probleemoplossing 27,32, persoonlijk-sociaal 21,73
12 maanden postpartum
Angst door zelfrapportagevragenlijst
Tijdsspanne: 2 weken na openbaarmaking van de resultaten van de studiesequentie of 4 weken na inschrijving voor de groep zonder sequentie; 1 maand na ontslag uit het ziekenhuis of einde van de zwangerschap als er sprake is van foetaal overlijden of zwangerschapsafbreking; 12-15 maanden postpartum
Angst na openbaarmaking van de resultaten (of 8 weken na inschrijving voor de groep zonder sequentie), ontslag bij pasgeborenen en 12 maanden postpartum. Het volledige scorebereik loopt van 0 tot 21, waarbij lagere cijfers een lagere angst vertegenwoordigen (beter resultaat).
2 weken na openbaarmaking van de resultaten van de studiesequentie of 4 weken na inschrijving voor de groep zonder sequentie; 1 maand na ontslag uit het ziekenhuis of einde van de zwangerschap als er sprake is van foetaal overlijden of zwangerschapsafbreking; 12-15 maanden postpartum
Depressie volgens zelfrapportagevragenlijst
Tijdsspanne: 2 weken na openbaarmaking van de resultaten van de studiesequentie of 4 weken na inschrijving voor de groep zonder sequentie; 1 maand na ontslag uit het ziekenhuis of einde van de zwangerschap als er sprake is van foetaal overlijden of zwangerschapsafbreking; 12-15 maanden postpartum
Depressie na openbaarmaking van de resultaten (of 8 weken na inschrijving voor de groep zonder sequentie), ontslag bij pasgeborenen en 12 maanden postpartum. Het volledige scorebereik loopt van 0 tot 24, waarbij een lagere score een lagere depressie vertegenwoordigt (beter resultaat).
2 weken na openbaarmaking van de resultaten van de studiesequentie of 4 weken na inschrijving voor de groep zonder sequentie; 1 maand na ontslag uit het ziekenhuis of einde van de zwangerschap als er sprake is van foetaal overlijden of zwangerschapsafbreking; 12-15 maanden postpartum
Kwaliteit van leven volgens zelfrapportagevragenlijst
Tijdsspanne: Ongeveer 4,5 jaar
Kwaliteit van leven voor de patiënt en het gezin 12 maanden postpartum.
Ongeveer 4,5 jaar
QALY, gemeten in kosten per jaar
Tijdsspanne: Ongeveer 4,5 jaar
Incrementele kosten per voor kwaliteit gecorrigeerd levensjaar (QALY).
Ongeveer 4,5 jaar
Totaal aantal geïdentificeerde fenotypen die ALLEEN geassocieerd zijn met de ziektegesequenteerde groep
Tijdsspanne: 12 maanden postpartum
Fenotypische expansie: Schijnbare prenatale fenotypische expansie van momenteel gedefinieerde pediatrische fenotypes.
12 maanden postpartum
Aantal deelnemers met VUS - ALLEEN op volgorde geplaatste groep
Tijdsspanne: 12 maanden postpartum

Varianten van onzekere significantie (VUS) die nog niet in verband zijn gebracht met dit ziektefenotype.

Deze uitkomst was alleen bedoeld om te worden gemeten bij deelnemers aan de Sequenced-arm, zoals beschreven in het onderzoeksprotocol. Gegevens voor deze uitkomst zijn van geen enkele deelnemer in de Unsequenced-arm verzameld.
12 maanden postpartum
Aantal deelnemers met varianten geclassificeerd als GUS - ALLEEN op volgorde gezette groep
Tijdsspanne: 12 maanden postpartum

VUS is onderverdeeld als overtuigende varianten in nieuwe genen die nog niet met de ziekte zijn geassocieerd (genen van onzekere klinische betekenis; GUS).

Deze uitkomst was alleen bedoeld om te worden gemeten bij deelnemers aan de Sequenced-arm, zoals beschreven in het onderzoeksprotocol. Gegevens voor deze uitkomst zijn van geen enkele deelnemer in de Unsequenced-arm verzameld.
12 maanden postpartum
Digitale WES - Vergelijking van coderings- en niet-coderingsresultaten - ALLEEN geordende groep
Tijdsspanne: Ongeveer 4,5 jaar
Pathogene, waarschijnlijk pathogene en VUS-varianten geïdentificeerd door sequencing (coderende en niet-coderende regio's) vergeleken met alleen coderende regio's (digitale WES).
Ongeveer 4,5 jaar
Alleen Proband versus Trio - Vergelijking van resultaten tussen Trio en Alleen Proband - ALLEEN gesequenceerde groep
Tijdsspanne: Ongeveer 4,5 jaar
Pathogene, waarschijnlijk pathogene en VUS-varianten geïdentificeerd door analyse van alleen een proband vergeleken met een proband-oudertrio.
Ongeveer 4,5 jaar
Verandering in management (gezondheidszorg) zoals bepaald door NICU-arts en dossierbeoordeling - ALLEEN in volgorde van groep
Tijdsspanne: Vanaf de bevalling tot ontslag of overlijden (neonataal)

Aantal deelnemers bij wie een wijziging in de managementbeslissingen heeft plaatsgevonden die toe te schrijven is aan genomische resultaten, gedefinieerd als wijzigingen in het behandelplan van de patiënt of wijzigingen in de begeleiding van de patiënt/familie met betrekking tot de medische behandeling op de onmiddellijke of lange termijn.

Deze uitkomst was alleen bedoeld om te worden gemeten bij deelnemers aan de Sequenced-arm, zoals beschreven in het onderzoeksprotocol. Gegevens voor deze uitkomst zijn van geen enkele deelnemer in de Unsequenced-arm verzameld.
Vanaf de bevalling tot ontslag of overlijden (neonataal)
Behoeften aan ouderlijke ondersteuning op basis van zelfrapportagevragenlijst - ALLEEN op volgorde van de groep
Tijdsspanne: Bij voltooiing van de sequencing ongeveer 4,5 jaar
Beoordeling van de behoeften op het gebied van onderwijs/advies en sociale ondersteuning van moeder en vader. Het volledige scorebereik loopt van 12 tot 60, waarbij een hogere score een hogere tevredenheid over de ervaring vertegenwoordigt (beter resultaat).
Bij voltooiing van de sequencing ongeveer 4,5 jaar
Begrip van ouders via zelfrapportagevragenlijst - ALLEEN op volgorde van de groep
Tijdsspanne: Bij voltooiing van de sequencing ongeveer 4,5 jaar
Nauwkeurigheid van het begrip door ouders van genetische testresultaten. De antwoorden van ouders op de vraag "Hoe goed begrijpt u de resultaten van uw prenatale genetische test?" zal worden verzameld. Alle mogelijke antwoorden zijn: ‘helemaal niet’, ‘een beetje’, ‘redelijk’, ‘redelijk’ en ‘extreem’
Bij voltooiing van de sequencing ongeveer 4,5 jaar
Aantal deelnemers met een verandering in het sequentieresultaat - ALLEEN sequentiële groep
Tijdsspanne: Vanaf de voltooiing van de sequencing tot de data-analyseperiode, tot 4,5 jaar

Herinterpretaties van sequentieresultaten die leiden tot een verandering in de classificatie van sequentievarianten.

Deze uitkomst was alleen bedoeld om te worden gemeten bij deelnemers aan de Sequenced-arm, zoals beschreven in het onderzoeksprotocol. Gegevens voor deze uitkomst zijn van geen enkele deelnemer in de Unsequenced-arm verzameld.
Vanaf de voltooiing van de sequencing tot de data-analyseperiode, tot 4,5 jaar
Doorlooptijd - ALLEEN op volgorde geplaatste groep
Tijdsspanne: Tijd vanaf het starten van de sequentiebepaling tot het resultaat van de onderzoekslocatie, maximaal 38 dagen
Doorlooptijd van sequencing-componenten en hoe deze in de loop van de tijd verandert. Deze uitkomst was alleen bedoeld om te worden gemeten bij deelnemers aan de Sequenced-arm, zoals beschreven in het onderzoeksprotocol. Gegevens voor deze uitkomst zijn van geen enkele deelnemer in de Unsequenced-arm verzameld.
Tijd vanaf het starten van de sequentiebepaling tot het resultaat van de onderzoekslocatie, maximaal 38 dagen

Medewerkers en onderzoekers

Hier vindt u mensen en organisaties die betrokken zijn bij dit onderzoek.

Sponsor

Columbia University

Medewerkers

Eunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human Development (NICHD)
The University of Texas Health Science Center, Houston
Baylor College of Medicine
Oregon Health and Science University
Children's Hospital Medical Center, Cincinnati
University of North Carolina
The George Washington University Biostatistics Center
The Jackson Laboratory
Broad Institute of MIT and Harvard

Onderzoekers

  • Hoofdonderzoeker: Ronald Wapner, MD, Columbia University

Studie record data

Deze datums volgen de voortgang van het onderzoeksdossier en de samenvatting van de ingediende resultaten bij ClinicalTrials.gov. Studieverslagen en gerapporteerde resultaten worden beoordeeld door de National Library of Medicine (NLM) om er zeker van te zijn dat ze voldoen aan specifieke kwaliteitscontrolenormen voordat ze op de openbare website worden geplaatst.

Bestudeer belangrijke data

Studie start (Werkelijk)

28 juni 2019

Primaire voltooiing (Werkelijk)

25 maart 2024

Studie voltooiing (Werkelijk)

25 maart 2024

Studieregistratiedata

Eerst ingediend

25 maart 2019

Eerst ingediend dat voldeed aan de QC-criteria

30 april 2019

Eerst geplaatst (Werkelijk)

3 mei 2019

Updates van studierecords

Laatste update geplaatst (Geschat)

27 oktober 2025

Laatste update ingediend die voldeed aan QC-criteria

14 oktober 2025

Laatst geverifieerd

1 oktober 2025

Meer informatie

Termen gerelateerd aan deze studie

Andere studie-ID-nummers

  • AAAS2118
  • R01HD055651 (Subsidie/contract van de Amerikaanse NIH)

Plan Individuele Deelnemersgegevens (IPD)

Bent u van plan om gegevens van individuele deelnemers (IPD) te delen?

JA

Beschrijving IPD-plan

In overeenstemming met het NIH Genomic Data Sharing-beleid, zullen sequentiegegevens (inclusief VCF-bestanden) en klinische gegevens worden gedeeld met andere wetenschappelijke onderzoekers en via de dbGAP-repository met gecontroleerde toegang of vergelijkbare genomics commons, het Sequence Read Archive en alle NIH Birth Defects Commons dat is vastgesteld. Een definitieve dataset met klinische en fenotypische gegevens zal worden ingediend bij de NICHD data repository (DASH). Bovendien zullen nieuwe algoritmen en allelfrequentiegegevens worden gedeeld met het nieuw ontwikkelde Precision FDA-platform, indien van toepassing.

IPD-tijdsbestek voor delen

Na afronding van de studie.

IPD-toegangscriteria voor delen

Via dbGaP of andere databases met gecontroleerde toegang.

IPD delen Ondersteunend informatietype

  • LEERPROTOCOOL
  • SAP
  • ICF
  • MVO

Informatie over medicijnen en apparaten, studiedocumenten

Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd geneesmiddel

Nee

Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd apparaatproduct

Nee

product vervaardigd in en geëxporteerd uit de V.S.

Nee

Deze informatie is zonder wijzigingen rechtstreeks van de website clinicaltrials.gov gehaald. Als u verzoeken heeft om uw onderzoeksgegevens te wijzigen, te verwijderen of bij te werken, neem dan contact op met register@clinicaltrials.gov. Zodra er een wijziging wordt doorgevoerd op clinicaltrials.gov, wordt deze ook automatisch bijgewerkt op onze website .

Abonneren