Deze pagina is automatisch vertaald en de nauwkeurigheid van de vertaling kan niet worden gegarandeerd. Raadpleeg de Engelse versie voor een brontekst.

Prenatale genetische diagnose door genomische sequencing (PrenatalSEQ)

20 oktober 2022 bijgewerkt door: Ronald J Wapner, MD, Columbia University

Prenatale genetische diagnose door genomische sequencing: een prospectieve evaluatie

Deze studie evalueert de impact van prenatale sequencing op de behandeling van foetussen met echografische afwijkingen. De hypothese is dat een significante subset van foetale afwijkingen een genetische oorzaak heeft die kan worden geïdentificeerd door middel van sequentiëring en dat prenatale kennis van deze informatie de prenatale zorg zal verbeteren, onnodig diagnostisch onderzoek zal verminderen, de zorgkosten zal verlagen en de kwaliteit van leven zal verbeteren. zowel het kind als het gezin.

Studie Overzicht

Toestand

Werving

Conditie

Interventie / Behandeling

Gedetailleerde beschrijving

Whole exome en whole genome sequencing (WGS) hebben het vermogen uitgebreid om de genetische etiologie van voorheen niet-gediagnosticeerde aandoeningen te bepalen. Deze studie is een multicenter prospectieve cohortstudie om de opkomende technologie van sequencing voor de behandeling van foetussen met structurele afwijkingen te evalueren. De hypothese is dat een significante subset van foetale structurele anomalieën een genetische etiologie heeft die kan worden geïdentificeerd door sequentiëring en dat prenatale kennis van deze informatie de perinatale zorg zal verbeteren, onnodig diagnostisch testen zal verminderen, de kosten van zorg zal verminderen en de kwaliteit van leven voor zowel het kind als het kind zal verbeteren. en de familie. Het doel van deze studie is om deze meerdere aspecten van prenatale sequencing te onderzoeken in een enkele studie met een innovatief geïntegreerd prospectief ontwerp, dat een robuuste evaluatie mogelijk zal maken van de voordelen en risico's van het leveren van diagnostische en prognostische genetische testresultaten in een prenatale setting.

De studie zal, in een sequentiële populatie van zwangerschappen met geselecteerde foetale structurele anomalieën en een negatieve of niet-causale chromosomale microarray (CMA), de frequentie bepalen van pathogene, waarschijnlijk pathogene en onzekere genomische varianten die kunnen worden geïdentificeerd door sequencing. Om de impact van deze informatie op de klinische zorg te bepalen, zal prospectief een controlepopulatie van niet-gesequenteerde zwangerschappen met vergelijkbare structurele afwijkingen worden gerekruteerd en zullen de baby's uit beide cohorten worden gevolgd tot een leeftijd van 1 jaar. Deze studiecomponent evalueert de verschillen in zorgmanagement en kosten door ontslag uit het ziekenhuis na de bevalling, en perinatale en baby-uitkomsten gedurende 1 levensjaar. De educatieve, counseling en psychosociale impact van sequentieresultaten tijdens de prenatale periode, in de kinderkamer en gedurende 1 levensjaar zal ook worden geëvalueerd. Aangezien de analytische en klinische hulpmiddelen die nodig zijn voor de volledige vertaling van sequencing naar zorg nog in ontwikkeling zijn, zal optimalisatie van bio-informatica-instrumenten worden onderzocht om de identificatie van pathogene en waarschijnlijke pathogene mutaties geassocieerd met prenatale fenotypes van gevestigde ziektegenen te verbeteren, evenals de identificatie van nieuwe genen geassocieerd met momenteel niet-gediagnosticeerde foetale/neonatale fenotypes. Deze studie zal een grondige evaluatie geven van de prenatale diagnostische waarde van sequencing voordat deze op een verantwoorde manier in de praktijk wordt geïntroduceerd en zal onafhankelijke gegevens opleveren om de vertaling ervan te begeleiden.

Studietype

Observationeel

Inschrijving (Verwacht)

1100

Contacten en locaties

In dit gedeelte vindt u de contactgegevens van degenen die het onderzoek uitvoeren en informatie over waar dit onderzoek wordt uitgevoerd.

Studiecontact

Studie Contact Back-up

Studie Locaties

  • Verenigde Staten
    • New York
      • New York, New York, Verenigde Staten, 10032
        • Werving
        • Columbia University Medical Center
        • Contact:
          • Ronald Wapner, MD
          • Telefoonnummer: 212-305-1521
    • North Carolina
      • Chapel Hill, North Carolina, Verenigde Staten, 27514
        • Werving
        • University of North Carolina Chapel Hill
        • Contact:
        • Hoofdonderzoeker:
          • Neeta Vora, MD
    • Ohio
      • Cincinnati, Ohio, Verenigde Staten, 45229
        • Werving
        • Children's Hospital, Cincinnati Medical Center
        • Contact:
    • Texas
      • Houston, Texas, Verenigde Staten, 77030
        • Werving
        • Baylor College of Medicine
      • Houston, Texas, Verenigde Staten, 77030

Deelname Criteria

Onderzoekers zoeken naar mensen die aan een bepaalde beschrijving voldoen, de zogenaamde geschiktheidscriteria. Enkele voorbeelden van deze criteria zijn iemands algemene gezondheidstoestand of eerdere behandelingen.

Geschiktheidscriteria

Leeftijden die in aanmerking komen voor studie

18 jaar en ouder (VOLWASSEN, OUDER_ADULT)

Accepteert gezonde vrijwilligers

Ja

Geslachten die in aanmerking komen voor studie

Allemaal

Bemonsteringsmethode

Niet-waarschijnlijkheidssteekproef

Studie Bevolking

In totaal zullen 1.100 zwangerschappen met foetale structurele anomalieën die voldoen aan de criteria om in aanmerking te komen voor het onderzoek worden ingeschreven. Hiervan zullen er 750 prenatale genomische sequencing ondergaan (prenatale sequencing-groep) en de overige 350 zwangerschappen zullen geen prenatale genomische sequencing ondergaan (prenatale groep zonder sequentie).

Registratie van zwangerschappen met een geïsoleerde nekplooimeting ≥ 3,5 mm wordt beperkt tot 5% binnen elke groep (met en zonder sequentie) en geïsoleerd geschat foetaal gewicht <5%ile wordt ook beperkt tot 5% voor elke groep (met en zonder sequentie) .

Beschrijving

Inclusiecriteria:

Prenatale sequencing-groep

  1. Foetus geïdentificeerd door middel van echografie en/of MRI met ten minste een van de volgende:

    1. Een of meer grote structurele afwijkingen (bijlage A)
    2. Een nekplooimeting van ≥ 3,5 mm
    3. Een foetus met een zwangerschapsduur van minder dan 24 weken 0 dagen met een normale anatomie en een echografisch geschat foetaal gewicht <5%ile zonder maternale hypertensie, diabetes type I of andere maternale stoornissen waarvan bekend is dat ze de groei van de foetus verstoren.
  2. Negatieve prenatale CMA (of die met CMA-bevindingen die geen verband houden met de echo-bevinding)
  3. Eenling- of tweelingzwangerschap
  4. Zwangerschapsduur minder dan 36 weken, 0 dagen om beschikbaarheid van sequentieresultaten mogelijk te maken vóór de bevalling

Ongenummerde groep

  1. Foetus geïdentificeerd door middel van echografie en/of MRI met ten minste een van de volgende:

    1. Een of meer grote structurele afwijkingen (bijlage A)
    2. Een nekplooimeting van ≥ 3,5 mm
    3. Een foetus minder dan 24 weken 0 dagen zwangerschap met normale anatomie en echografisch geschat foetaal gewicht <5%ile zonder maternale hypertensie, type I diabetes of andere maternale stoornissen waarvan bekend is dat ze de groei van de foetus beïnvloeden
  2. Negatieve prenatale of postnatale CMA (of die met CMA-bevindingen die geen verband houden met de echo-bevinding)
  3. Geweigerde prenatale sequencing
  4. Singleton draagtijd

Uitsluitingscriteria:

Prenatale Sequencing-groep

  1. Prenatale sequencing of geplande prenatale sequencing uitgevoerd buiten het onderzoek, inclusief genenpanels
  2. Leeftijd van moeder of vader jonger dan 18 jaar
  3. Bewezen infectieuze of teratogene oorzaak van foetale anomalie
  4. Geplande zwangerschapsafbreking
  5. Onbeschikbare bloed- of speekselmonsters van beide biologische ouders voorafgaand aan sequencing
  6. Ouderlijke onwil om deel te nemen aan 1 jaar postnatale follow-up
  7. Taalbarrière (niet-Engels of Spaans sprekend)
  8. Eerdere toestemming voor de prenatale groep zonder sequentie of deelname aan een eerdere zwangerschap

Ongenummerde groep

  1. Leeftijd van moeder of vader jonger dan 18 jaar
  2. Bewezen infectieuze of teratogene oorzaak van foetale anomalie
  3. Positieve prenatale NIPT-screening op trisomie 21,18 of 13. Positief 22q11.2 prenatale NIPT-testen met consistente echo-bevindingen zijn ook een uitsluiting.
  4. Geplande zwangerschapsafbreking
  5. Ouderlijke onwil om deel te nemen aan 1 jaar postnatale follow-up
  6. Taalbarrière (niet-Engels of Spaans sprekend)

Studie plan

Dit gedeelte bevat details van het studieplan, inclusief hoe de studie is opgezet en wat de studie meet.

Hoe is de studie opgezet?

Ontwerpdetails

Cohorten en interventies

Groep / Cohort
Interventie / Behandeling
Prenataal gesequentiseerde groep
750 trio's met foetale structurele afwijkingen die prenatale sequencing van de studie ontvangen
Diagnostische toets: Prenatale genomische sequentiebepaling
Gehele genoomsequencing (die in eerste instantie wordt gemaskeerd en alleen als exoom wordt gerapporteerd)
Geen prenatale sequencing (niet-gesequenced) groep
350 trio's met foetale structurele afwijkingen die geen prenatale sequencing hebben

Wat meet het onderzoek?

Primaire uitkomstmaten

Uitkomstmaat
Maatregel Beschrijving
Tijdsspanne
Rapporteerbare varianten
Tijdsspanne: Ongeveer 4,5 jaar
Rapporteerbare varianten (gedefinieerd als pathogeen, waarschijnlijk pathogeen of VUS) geïdentificeerd door sequentiëring en rapporteerbaar geacht door de Variant Adjudication Committee.
Ongeveer 4,5 jaar
Kosten van de gezondheidszorg
Tijdsspanne: Ongeveer 4,5 jaar
Gezondheidszorgkosten vanaf het moment van diagnose van een afwijking tot het ontslag van de baby tussen groepen met en zonder sequentie.
Ongeveer 4,5 jaar

Secundaire uitkomstmaten

Uitkomstmaat
Maatregel Beschrijving
Tijdsspanne
Perinatale resultaten door beoordeling van medische dossiers
Tijdsspanne: Ongeveer 4,5 jaar
Perinatale uitkomsten zullen worden vergeleken en de uitkomsten zullen worden gemeten aan de hand van: zwangerschapsduur bij bevalling, belangrijke morbiditeiten waaronder de duur van de beademingsondersteuning, sepsis, behoefte aan pressorondersteuning, behoefte aan ECMO, metabole afwijkingen (bijv. acidose, verhoogd urinezuur, hypo-/ hyperglycemie), intraventriculaire bloeding/periventriculaire leukomalacie, encefalopathie en convulsies.
Ongeveer 4,5 jaar
Dood
Tijdsspanne: Ongeveer 4,5 jaar
Neonatale/kindersterfte op het moment van ontslag en op de leeftijd van 12 maanden.
Ongeveer 4,5 jaar
NICU-verblijfsduur
Tijdsspanne: Ongeveer 4,5 jaar
Duur van het eerste verblijf op de NICU en het aantal dagen doorgebracht in het ziekenhuis tussen het eerste ontslag en de leeftijd van 12 maanden.
Ongeveer 4,5 jaar
Lengte in centimeters
Tijdsspanne: Ongeveer 4,5 jaar
Babylengte op de leeftijd van 12 maanden.
Ongeveer 4,5 jaar
Gewicht in kilogram
Tijdsspanne: Ongeveer 4,5 jaar
Gewicht van de baby op de leeftijd van 12 maanden.
Ongeveer 4,5 jaar
Vragenlijst ontwikkeling per leeftijd en stadia
Tijdsspanne: Ongeveer 4,5 jaar
Ontwikkelingsresultaten gedefinieerd door de volgende parameters: communicatie, grove motoriek, fijne motoriek, probleemoplossing en persoonlijk-sociaal, op de leeftijd van 12 maanden met behulp van ASQ-3. Lagere scores worden in verband gebracht met ontwikkelingsachterstand. Cutoffs voor examen van 12 maanden zijn: Communicatie 15.64, Grove motoriek 21,49, fijne motoriek 34,5, probleemoplossing 27,32, persoonlijk-sociaal 21,73
Ongeveer 4,5 jaar
Angst door zelfrapportagevragenlijst
Tijdsspanne: Ongeveer 4,5 jaar
Angst na bekendmaking van het resultaat (of 8 weken na inschrijving voor de groep zonder sequentie), neonatale ontslag en 12 maanden postpartum.
Ongeveer 4,5 jaar
Depressie / angst door zelfrapportagevragenlijst
Tijdsspanne: Ongeveer 4,5 jaar
Depressie na bekendmaking van het resultaat (of 8 weken na inschrijving voor de groep zonder sequentie), neonatale ontslag en 12 maanden postpartum.
Ongeveer 4,5 jaar
Kwaliteit van leven door zelfrapportagevragenlijst
Tijdsspanne: Ongeveer 4,5 jaar
Kwaliteit van leven voor patiënt en familie 12 maanden postpartum.
Ongeveer 4,5 jaar
QALY, gemeten in kosten per jaar
Tijdsspanne: Ongeveer 4,5 jaar
Incrementele kosten per Quality Adjusted Life Year (QALY).
Ongeveer 4,5 jaar
Fenotypische uitbreiding - identificatie van nieuwe fenotypes geassocieerd met ziekte- ALLEEN groep met sequentiebepaling
Tijdsspanne: Ongeveer 4,5 jaar
Schijnbare prenatale fenotypische expansie van momenteel gedefinieerde pediatrische fenotypes.
Ongeveer 4,5 jaar
VUS-frequentie en resultaat - ALLEEN sequentiegroep
Tijdsspanne: Ongeveer 4,5 jaar
Varianten van onzekere significantie (VUS) die nog niet in verband zijn gebracht met dit ziektefenotype.
Ongeveer 4,5 jaar
GUS-frequentie en resultaat - ALLEEN sequentiegroep
Tijdsspanne: Ongeveer 4,5 jaar
VUS subgeclassificeerd als overtuigende varianten in nieuwe genen die nog niet geassocieerd zijn met ziekte (genen van onzekere klinische significantie; GUS).
Ongeveer 4,5 jaar
Digitale WES - vergelijking van coderings- en niet-coderingsresultaten - ALLEEN sequentiegroep
Tijdsspanne: Ongeveer 4,5 jaar
Pathogene, waarschijnlijk pathogene en VUS-varianten geïdentificeerd door sequencing (coderende en niet-coderende regio's) vergeleken met alleen coderende regio's (digitale WES).
Ongeveer 4,5 jaar
Proband Only Versus Trio - vergelijking van resultaten tussen trio en alleen proband - ALLEEN Sequenced Group
Tijdsspanne: Ongeveer 4,5 jaar
Pathogene, waarschijnlijk pathogene en VUS-varianten geïdentificeerd door analyse van een proband alleen in vergelijking met een proband-oudertrio.
Ongeveer 4,5 jaar
Verandering in management (gezondheidszorg) zoals bepaald door NICU-arts en dossierbeoordeling - ALLEEN sequentiegroep
Tijdsspanne: Ongeveer 4,5 jaar
Veranderingen in managementbeslissingen die toe te schrijven zijn aan genomische resultaten, gedefinieerd als veranderingen in het behandelplan van de patiënt of veranderingen in de advisering van de patiënt/familie met betrekking tot de onmiddellijke of langdurige medische behandeling.
Ongeveer 4,5 jaar
Ouderlijk begrip door zelfrapportagevragenlijst - ALLEEN gesequenteerde groep
Tijdsspanne: Ongeveer 4,5 jaar
Nauwkeurigheid van ouderlijk begrip van genetische testresultaten.
Ongeveer 4,5 jaar
Behoeften aan ouderlijke ondersteuning - door zelfrapportagevragenlijst - ALLEEN gesequenteerde groep
Tijdsspanne: Ongeveer 4,5 jaar
Educatieve/counseling en sociale ondersteuningsbehoeften van de moeder en vader.
Ongeveer 4,5 jaar
Classificatie in de loop van de tijd (verandering in het sequentieresultaat in de loop van de tijd) - ALLEEN sequentiegroep
Tijdsspanne: Ongeveer 4,5 jaar
Veranderingen in classificatie van sequentievarianten in de loop van de tijd.
Ongeveer 4,5 jaar
Doorlooptijd - ALLEEN groep op volgorde
Tijdsspanne: Ongeveer 4,5 jaar
Doorlooptijd van volgordecomponenten en hoe deze in de loop van de tijd verandert.
Ongeveer 4,5 jaar

Medewerkers en onderzoekers

Hier vindt u mensen en organisaties die betrokken zijn bij dit onderzoek.

Sponsor

Columbia University

Medewerkers

Eunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human Development (NICHD)
The University of Texas Health Science Center, Houston
Baylor College of Medicine
Oregon Health and Science University
Children's Hospital Medical Center, Cincinnati
University of North Carolina
The George Washington University Biostatistics Center
Broad Institute
The Jackson Laboratory

Studie record data

Deze datums volgen de voortgang van het onderzoeksdossier en de samenvatting van de ingediende resultaten bij ClinicalTrials.gov. Studieverslagen en gerapporteerde resultaten worden beoordeeld door de National Library of Medicine (NLM) om er zeker van te zijn dat ze voldoen aan specifieke kwaliteitscontrolenormen voordat ze op de openbare website worden geplaatst.

Bestudeer belangrijke data

Studie start (WERKELIJK)

28 juni 2019

Primaire voltooiing (VERWACHT)

1 augustus 2023

Studie voltooiing (VERWACHT)

1 november 2023

Studieregistratiedata

Eerst ingediend

25 maart 2019

Eerst ingediend dat voldeed aan de QC-criteria

30 april 2019

Eerst geplaatst (WERKELIJK)

3 mei 2019

Updates van studierecords

Laatste update geplaatst (WERKELIJK)

24 oktober 2022

Laatste update ingediend die voldeed aan QC-criteria

20 oktober 2022

Laatst geverifieerd

1 oktober 2022

Meer informatie

Termen gerelateerd aan deze studie

Andere studie-ID-nummers

  • AAAS2118
  • R01HD055651 (NIH)

Plan Individuele Deelnemersgegevens (IPD)

Bent u van plan om gegevens van individuele deelnemers (IPD) te delen?

JA

Beschrijving IPD-plan

In overeenstemming met het NIH Genomic Data Sharing-beleid, zullen sequentiegegevens (inclusief VCF-bestanden) en klinische gegevens worden gedeeld met andere wetenschappelijke onderzoekers en via de dbGAP-repository met gecontroleerde toegang of vergelijkbare genomics commons, het Sequence Read Archive en alle NIH Birth Defects Commons dat is vastgesteld. Een definitieve dataset met klinische en fenotypische gegevens zal worden ingediend bij de NICHD data repository (DASH). Bovendien zullen nieuwe algoritmen en allelfrequentiegegevens worden gedeeld met het nieuw ontwikkelde Precision FDA-platform, indien van toepassing.

IPD-tijdsbestek voor delen

Na afronding van de studie.

IPD-toegangscriteria voor delen

Via dbGaP of andere databases met gecontroleerde toegang.

IPD delen Ondersteunend informatietype

  • LEERPROTOCOOL
  • SAP
  • ICF
  • MVO

Informatie over medicijnen en apparaten, studiedocumenten

Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd geneesmiddel

Nee

Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd apparaatproduct

Nee

Deze informatie is zonder wijzigingen rechtstreeks van de website clinicaltrials.gov gehaald. Als u verzoeken heeft om uw onderzoeksgegevens te wijzigen, te verwijderen of bij te werken, neem dan contact op met register@clinicaltrials.gov. Zodra er een wijziging wordt doorgevoerd op clinicaltrials.gov, wordt deze ook automatisch bijgewerkt op onze website .

Klinische onderzoeken op Prenatale genomische sequentiebepaling

Zoek naar vergelijkbare onderzoeken

Sponsors en medewerkers

Medische omstandigheden

Geneesmiddelinterventies

CROs by country

CROs in Bahrain

Voorwaarden

Zeldzame ziekten

Geneesmiddelinterventies

Voedingssupplementen

Sponsor / medewerkers

Locaties

3
Abonneren