Denne siden ble automatisk oversatt og nøyaktigheten av oversettelsen er ikke garantert. Vennligst referer til engelsk versjon for en kildetekst.

Prenatal genetisk diagnose ved genomisk sekvensering (PrenatalSEQ)

14. oktober 2025 oppdatert av: Ronald J Wapner, MD, Columbia University

Prenatal genetisk diagnose ved genomisk sekvensering: en prospektiv evaluering

Denne studien evaluerer virkningen av prenatal sekvensering på håndteringen av fostre med ultralydavvik. Hypotesen er at en betydelig undergruppe av fosteravvik har en genetisk årsak som kan identifiseres ved sekvensering og at prenatal kunnskap om denne informasjonen vil forbedre svangerskapsomsorgen, redusere unødvendig diagnostisk testing, redusere omsorgskostnadene og forbedre livskvaliteten for både barnet og familien.

Studieoversikt

Status

Fullført

Forhold

Intervensjon / Behandling

Detaljert beskrivelse

Hele eksom- og helgenomsekvensering (WGS) har utvidet muligheten til å bestemme den genetiske etiologien til tidligere udiagnostiserte lidelser. Denne studien er en multisenter prospektiv kohortstudie for å evaluere den nye teknologien for sekvensering for håndtering av fostre med strukturelle anomalier. Hypotesen er at en betydelig undergruppe av føtale strukturelle anomalier har en genetisk etiologi som kan identifiseres ved sekvensering, og at prenatal kunnskap om denne informasjonen vil forbedre perinatal omsorg, redusere unødvendig diagnostisk testing, redusere omsorgskostnadene og forbedre livskvaliteten for både barnet. og familien. Målet med denne studien er å undersøke disse flere aspektene ved prenatal sekvensering i en enkelt studie med et innovativt integrert prospektivt design, som vil tillate en robust evaluering av fordelene og risikoene ved å levere diagnostiske og prognostiske genetiske testresultater i en prenatal setting.

Studien vil bestemme, i en sekvensiell populasjon av svangerskap med utvalgte føtale strukturelle anomalier og en negativ eller ikke-årsaklig kromosomal mikroarray (CMA), frekvensen av patogene, sannsynlig patogene og usikre genomiske varianter som kan identifiseres ved sekvensering. For å bestemme effekten av denne informasjonen på klinisk behandling, vil en kontrollpopulasjon av usekvenserte graviditeter med lignende strukturelle anomalier bli rekruttert prospektivt og spedbarn fra begge kohorter vil bli fulgt opp til 1 års alder. Denne studiekomponenten vil evaluere forskjeller i helsebehandling og kostnader gjennom utskrivning fra sykehus etter fødsel, og perinatale og spedbarnsutfall gjennom 1 år av livet. Den pedagogiske, rådgivningsmessige og psykososiale effekten av sekvenseringsresultater i prenatale perioden, i barnehagen og gjennom 1 leveår vil også bli evaluert. Siden de analytiske og kliniske verktøyene som trengs for full oversettelse av sekvensering til omsorg fortsatt er under utvikling, vil optimalisering av bioinformatiske verktøy for å forbedre identifisering av patogene og sannsynlige patogene mutasjoner assosiert med prenatale fenotyper av etablerte sykdomsgener bli undersøkt, samt identifisering av nye gener assosiert med for tiden udiagnostiserte føtale/neonatale fenotyper. Denne studien vil gi en dyptgående evaluering av den prenatale diagnostiske verdien av sekvensering før den ansvarlige introduksjonen i praksis og vil gi uavhengige data for å veilede oversettelsen.

Studietype

Observasjonsmessig

Registrering (Faktiske)

1097

Kontakter og plasseringer

Denne delen inneholder kontaktinformasjon for de som utfører studien, og informasjon om hvor denne studien blir utført.

Studiesteder

  • Forente stater
    • New York
      • New York, New York, Forente stater, 10032
        • Columbia University Medical Center
    • North Carolina
      • Chapel Hill, North Carolina, Forente stater, 27514
        • University of North Carolina Chapel Hill
    • Ohio
      • Cincinnati, Ohio, Forente stater, 45229
        • Children's Hospital, Cincinnati Medical Center
    • Texas
      • Houston, Texas, Forente stater, 77030
        • Baylor College of Medicine
      • Houston, Texas, Forente stater, 77030
        • UT Health Houston

Deltakelseskriterier

Forskere ser etter personer som passer til en bestemt beskrivelse, kalt kvalifikasjonskriterier. Noen eksempler på disse kriteriene er en persons generelle helsetilstand eller tidligere behandlinger.

Kvalifikasjonskriterier

Alder som er kvalifisert for studier

18 år og eldre (Voksen, Eldre voksen)

Tar imot friske frivillige

Ja

Prøvetakingsmetode

Ikke-sannsynlighetsprøve

Studiepopulasjon

Totalt 1100 graviditeter med føtale strukturelle anomalier og oppfyller kvalifikasjonskriterier vil bli registrert i studien. Av disse vil 750 gjennomgå prenatal genomisk sekvensering (prenatal sekvenseringsgruppe) og de resterende 350 svangerskapene vil ikke ha noen prenatal genomisk sekvensering (usekvensert prenatal gruppe).

Registrering av svangerskap med en isolert nakkegjennomskinnelig målinger ≥ 3,5 mm vil være begrenset til 5 % innenfor hver gruppe (sekvensert og usekvensert) og isolert estimert fostervekt <5 %ile vil også være begrenset til 5 % for hver gruppe (sekvensert og usekvensert) .

Beskrivelse

Inklusjonskriterier:

Prenatal sekvenseringsgruppe

  1. Foster identifisert ved ultralyd og/eller MR med minst ett av følgende:

    1. En eller flere store strukturelle anomalier (vedlegg A)
    2. En nakkegjennomskinnelighetsmåling på ≥ 3,5 mm
    3. Et foster mindre enn 24 uker 0 dager svangerskap med normal anatomi og sonografisk estimert fostervekt <5. %ile uten maternell hypertensjon, type I diabetes eller andre maternel lidelser som er kjent for å endre fosterveksten.
  2. Negativ prenatal CMA (eller de med CMA-funn som ikke er relatert til ultralydfunnet)
  3. Enkelt- eller tvillingsdrektighet
  4. Gestasjonsalder mindre enn 36 uker, 0 dager for å tillate tilgjengelighet av sekvenseringsresultater før levering

Usekvensert gruppe

  1. Foster identifisert ved ultralyd og/eller MR med minst ett av følgende:

    1. En eller flere store strukturelle anomalier (vedlegg A)
    2. En nakkegjennomskinnelighetsmåling på ≥ 3,5 mm
    3. Et foster mindre enn 24 uker 0 dager svangerskap med normal anatomi og sonografisk estimert fostervekt <5. %ile uten maternell hypertensjon, type I diabetes eller andre maternel lidelser som er kjent for å endre fosterveksten
  2. Negativ prenatal eller postnatal CMA (eller de med CMA-funn som ikke er relatert til ultralydfunnet)
  3. Avvist prenatal sekvensering
  4. Singleton svangerskap

Ekskluderingskriterier:

Prenatal sekvenseringsgruppe

  1. Prenatal sekvensering eller planlagt prenatal sekvensering utført utenfor studien, inkludert genpaneler
  2. Mors eller fars alder under 18 år
  3. Påvist smittsom eller teratogene årsak til fosteranomali
  4. Planlagt avbrytelse av svangerskapet
  5. Utilgjengelige blod- eller spyttprøver fra begge biologiske foreldre før sekvensering
  6. Foreldres manglende vilje til å delta i 1 års fødselsoppfølging
  7. Språkbarriere (ikke-engelsk eller spansktalende)
  8. Tidligere samtykke til den usekvenserte prenatale gruppen eller registrering i et tidligere svangerskap

Usekvensert gruppe

  1. Mors eller fars alder under 18 år
  2. Påvist smittsom eller teratogene årsak til fosteranomali
  3. Positiv prenatal NIPT-screening for trisomi 21, 18 eller 13. Positiv 22q11.2 prenatal NIPT-testing med konsistente ultralydfunn er også en eksklusjon.
  4. Planlagt avbrytelse av svangerskapet
  5. Foreldres manglende vilje til å delta i 1 års fødselsoppfølging
  6. Språkbarriere (ikke-engelsk eller spansktalende)

Studieplan

Denne delen gir detaljer om studieplanen, inkludert hvordan studien er utformet og hva studien måler.

Hvordan er studiet utformet?

Designdetaljer

Kohorter og intervensjoner

Gruppe / Kohort
Intervensjon / Behandling
Prenatalt sekvensert gruppe
750 trioer med føtale strukturelle anomalier som mottar prenatal sekvensering fra studien
Diagnostisk test: Prenatal genomisk sekvensering
Helgenomsekvensering (som i utgangspunktet vil bli maskert og rapportert som kun eksom)
Ingen prenatal sekvenseringsgruppe (ikke-sekvensert).
350 trioer med føtale strukturelle anomalier som ikke har prenatal sekvensering

Hva måler studien?

Primære resultatmål

Resultatmål
Tiltaksbeskrivelse
Tidsramme
Antall deltakere som hadde rapporterbare varianter
Tidsramme: Ved studieslutt, ca 4 år
Rapporterbare varianter: definert som enten Patogen / Sannsynlig patogen (P/LP) eller variant av usikker betydning (VUS) identifisert ved sekvensering og ansett som rapporterbare av Variant Adjudication Committee.
Ved studieslutt, ca 4 år
Helsekostnader
Tidsramme: Fra tidspunkt for diagnose av anomali til spedbarnsutslipp
Helsekostnader fra tidspunkt for diagnose av anomali til spedbarnsutskrivning mellom sekvenserte og usekvenserte grupper.
Fra tidspunkt for diagnose av anomali til spedbarnsutslipp

Sekundære resultatmål

Resultatmål
Tiltaksbeskrivelse
Tidsramme
Svangerskapsalder ved levering
Tidsramme: På leveringstidspunktet
Svangerskapsalder til nyfødt ved fødsel (i uker)
På leveringstidspunktet
Neonatale utfall
Tidsramme: Inntil 28 dager etter fødselen
Neonatale utfall vil bli sammenlignet og utfall vil bli målt ved antall nyfødte som opplever: behov for ventilatorstøtte, sepsis, behov for pressorstøtte, behov for ekstrakorporal membranoksygenering (ECMO), metabolske abnormiteter (f.eks. acidose, forhøyet urinsyre, hypo-/hyperglykemi), intraventrikulær blødning, periventrikulær blødning, leukomalacia, encefalopati og anfall.
Inntil 28 dager etter fødselen
Antall dødsfall
Tidsramme: Fra utskrivning til 12 måneder etter fødsel
Neonatal/spedbarnsdød ved utskrivningstidspunkt og ved 12 måneders alder.
Fra utskrivning til 12 måneder etter fødsel
Varighet for NICU-opphold
Tidsramme: Fra utskrivning til 12 måneder etter fødsel
Lengde på initial NICU-opphold og antall dager brukt på sykehuset mellom første utskrivning og 12 måneders alder.
Fra utskrivning til 12 måneder etter fødsel
Lengde i centimeter
Tidsramme: 12 måneder etter fødselen
Spedbarnslengde ved 12 måneders alder.
12 måneder etter fødselen
Vekt i kilogram
Tidsramme: 12 måneder etter fødselen
Spedbarnsvekt ved 12 måneders alder.
12 måneder etter fødselen
Score på utvikling etter alder og stadier spørreskjema (ASQ-3)
Tidsramme: 12 måneder etter fødselen

Utviklingsresultater definert av følgende parametere: kommunikasjon, grovmotorikk, finmotorikk, problemløsning og personlig-sosial, ved 12 måneders alder ved bruk av ASQ-3. Lavere skår er assosiert med utviklingsforsinkelse. For hvert utviklingsområde kan foreldre svare JA=10, NOEN GANGER=5 eller IKKE ENNÅ=0 ved å fylle ut en boble for hvert elementsvar. Full poengsum for hvert domene er 0 til 60.

Avskjæringsgrenser for hvert domene er: Kommunikasjon 15.64, Bruttomotorisk 21.49, finmotorisk 34.5, problemløsning 27.32, personlig-sosial 21.73
12 måneder etter fødselen
Spørreskjema for angst ved selvrapportering
Tidsramme: 2 uker etter offentliggjøring av studiesekvenseringsresultater eller 4 uker etter registrering for den ikke-sekvenserte gruppen; 1 måned etter utskrivning fra sykehuset eller slutten av svangerskapet dersom det var fosterdød eller svangerskapsavbrudd; 12-15 måneder etter fødsel
Angst etter avsløring av resultat (eller 8 uker etter innmelding for den ikke-sekvenserte gruppen), neonatal utskrivning og 12 måneder postpartum. Hele poengområdet er 0 til 21, der lavere tall representerer lavere angst (bedre utfall).
2 uker etter offentliggjøring av studiesekvenseringsresultater eller 4 uker etter registrering for den ikke-sekvenserte gruppen; 1 måned etter utskrivning fra sykehuset eller slutten av svangerskapet dersom det var fosterdød eller svangerskapsavbrudd; 12-15 måneder etter fødsel
Depresjon ved selvrapportering spørreskjema
Tidsramme: 2 uker etter offentliggjøring av studiesekvenseringsresultater eller 4 uker etter registrering for den ikke-sekvenserte gruppen; 1 måned etter utskrivning fra sykehuset eller slutten av svangerskapet dersom det var fosterdød eller svangerskapsavbrudd; 12-15 måneder etter fødsel
Depresjon etter avsløring av resultat (eller 8 uker etter registrering for den ikke-sekvenserte gruppen), neonatal utskrivning og 12 måneder postpartum. Full poengsum er 0 til 24, der en lavere poengsum representerer lavere depresjon (bedre resultat).
2 uker etter offentliggjøring av studiesekvenseringsresultater eller 4 uker etter registrering for den ikke-sekvenserte gruppen; 1 måned etter utskrivning fra sykehuset eller slutten av svangerskapet dersom det var fosterdød eller svangerskapsavbrudd; 12-15 måneder etter fødsel
Livskvalitet ved selvrapporteringsspørreskjema
Tidsramme: Ca 4,5 år
Livskvalitet for pasient og familie 12 måneder etter fødsel.
Ca 4,5 år
QALY, målt i kostnad per år
Tidsramme: Ca 4,5 år
Inkrementell kostnad per kvalitetsjustert leveår (QALY).
Ca 4,5 år
Totalt antall identifiserte fenotyper KUN assosiert med sykdomssekvensert gruppe
Tidsramme: 12 måneder etter fødselen
Fenotypisk utvidelse: Tilsynelatende prenatal fenotypisk ekspansjon fra for tiden definerte pediatriske fenotyper.
12 måneder etter fødselen
Antall deltakere med VUS - KUN sekvensert gruppe
Tidsramme: 12 måneder etter fødselen

Varianter av usikker betydning (VUS) som ennå ikke er assosiert med denne sykdomsfenotypen.

Dette utfallet var kun ment å måles hos deltakere i Sequenced-armen, som skissert i studieprotokollen. Data for dette utfallet ble ikke samlet inn fra noen deltaker i Unsequenced-armen.
12 måneder etter fødselen
Antall deltakere med varianter klassifisert som GUS - KUN sekvensert gruppe
Tidsramme: 12 måneder etter fødselen

VUS underklassifisert som overbevisende varianter i nye gener som ennå ikke er sykdomsassosiert (gener med usikker klinisk betydning; GUS).

Dette utfallet var kun ment å måles hos deltakere i Sequenced-armen, som skissert i studieprotokollen. Data for dette utfallet ble ikke samlet inn fra noen deltaker i Unsequenced-armen.
12 måneder etter fødselen
Digital WES - Sammenligning av kodende og ikke-kodede resultater - KUN sekvensert gruppe
Tidsramme: Ca 4,5 år
Patogene, sannsynlig patogene og VUS-varianter identifisert ved sekvensering (kodende og ikke-kodende regioner) sammenlignet med kun kodende regioner (digital WES).
Ca 4,5 år
Kun proband versus trio - sammenligning av resultater mellom trio og kun proband - KUN sekvensert gruppe
Tidsramme: Ca 4,5 år
Patogene, sannsynlige patogene og VUS-varianter identifisert ved analyse av et proband alene sammenlignet med en proband-foreldre-trio.
Ca 4,5 år
Endring i ledelse (helsevesen) som bestemt av NICU-lege og journalgjennomgang - KUN sekvensert gruppe
Tidsramme: Fra levering til utskrivning eller død (neonatal)

Antall deltakere som hadde en endring i ledelsesbeslutninger som kan tilskrives genomiske resultater, definert som endringer i pasientens behandlingsplan eller endringer i rådgivningen til pasienten/familien om umiddelbar eller langsiktig medisinsk behandling.

Dette utfallet var kun ment å måles hos deltakere i Sequenced-armen, som skissert i studieprotokollen. Data for dette utfallet ble ikke samlet inn fra noen deltaker i Unsequenced-armen.
Fra levering til utskrivning eller død (neonatal)
Foreldrestøttebehov ved selvrapporteringsspørreskjema - KUN sekvensert gruppe
Tidsramme: Ved fullføring av sekvensering, ca. 4,5 år
Vurdering av pedagogiske/rådgivnings- og sosialstøttebehov hos mor og far. Full poengsum er 12 til 60, der en høyere poengsum representerer en høyere tilfredshet med opplevelsen (bedre resultat).
Ved fullføring av sekvensering, ca. 4,5 år
Spørreskjema for foreldreforståelse ved selvrapportering - KUN sekvensert gruppe
Tidsramme: Ved fullføring av sekvensering, ca. 4,5 år
Nøyaktighet av foreldrenes forståelse av genetiske testresultater. Foreldrenes svar på spørsmålet "Hvor godt forstår du resultatene fra prenatale genetiske tester?" vil bli samlet inn. Alle mulige svar er: "Ikke i det hele tatt", "Litt", "Moderat", "Ganske mye" og "Ekstremt"
Ved fullføring av sekvensering, ca. 4,5 år
Antall deltakere som hadde en endring i sekvenseringsresultatet - KUN sekvensert gruppe
Tidsramme: Fra fullføring av sekvensering til dataanalyseperiode, opptil 4,5 år

Nytolkninger av sekvenseringsresultater som fører til en endring i klassifisering av sekvenseringsvarianter.

Dette utfallet var kun ment å måles hos deltakere i Sequenced-armen, som skissert i studieprotokollen. Data for dette utfallet ble ikke samlet inn fra noen deltaker i Unsequenced-armen.
Fra fullføring av sekvensering til dataanalyseperiode, opptil 4,5 år
Omløpstid – KUN sekvensert gruppe
Tidsramme: Tid fra sekvenseringsstart til resultat av studiestedet, opptil 38 dager
Omløpstid for sekvenseringskomponenter og hvordan den endres over tid. Dette utfallet var kun ment å måles hos deltakere i Sequenced-armen, som skissert i studieprotokollen. Data for dette utfallet ble ikke samlet inn fra noen deltaker i Unsequenced-armen.
Tid fra sekvenseringsstart til resultat av studiestedet, opptil 38 dager

Samarbeidspartnere og etterforskere

Det er her du vil finne personer og organisasjoner som er involvert i denne studien.

Sponsor

Columbia University

Samarbeidspartnere

Eunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human Development (NICHD)
The University of Texas Health Science Center, Houston
Baylor College of Medicine
Oregon Health and Science University
Children's Hospital Medical Center, Cincinnati
University of North Carolina
The George Washington University Biostatistics Center
The Jackson Laboratory
Broad Institute of MIT and Harvard

Etterforskere

  • Hovedetterforsker: Ronald Wapner, MD, Columbia University

Studierekorddatoer

Disse datoene sporer fremdriften for innsending av studieposter og sammendragsresultater til ClinicalTrials.gov. Studieposter og rapporterte resultater gjennomgås av National Library of Medicine (NLM) for å sikre at de oppfyller spesifikke kvalitetskontrollstandarder før de legges ut på det offentlige nettstedet.

Studer hoveddatoer

Studiestart (Faktiske)

28. juni 2019

Primær fullføring (Faktiske)

25. mars 2024

Studiet fullført (Faktiske)

25. mars 2024

Datoer for studieregistrering

Først innsendt

25. mars 2019

Først innsendt som oppfylte QC-kriteriene

30. april 2019

Først lagt ut (Faktiske)

3. mai 2019

Oppdateringer av studieposter

Sist oppdatering lagt ut (Antatt)

27. oktober 2025

Siste oppdatering sendt inn som oppfylte QC-kriteriene

14. oktober 2025

Sist bekreftet

1. oktober 2025

Mer informasjon

Begreper knyttet til denne studien

Andre studie-ID-numre

  • AAAS2118
  • R01HD055651 (U.S. NIH-stipend/kontrakt)

Plan for individuelle deltakerdata (IPD)

Planlegger du å dele individuelle deltakerdata (IPD)?

JA

IPD-planbeskrivelse

I samsvar med NIHs policy for deling av genomiske data, vil sekvenseringsdata (inkludert VCF-filer) og kliniske data bli delt med andre vitenskapelige etterforskere og gjennom dbGAP-depotet med kontrollert tilgang eller sammenlignbare genomics commons, Sequence Read Archive og eventuelle NIH Birth Defects Commons som er etablert. Et endelig datasett som inneholder kliniske og fenotypiske data vil bli sendt til NICHD-datalageret (DASH). I tillegg vil nye algoritmer og allelfrekvensdata bli delt med den nyutviklede Precision FDA-plattformen etter behov.

IPD-delingstidsramme

Etter endt studie.

Tilgangskriterier for IPD-deling

Gjennom dbGaP eller andre kontrollerte tilgangsdatabaser.

IPD-deling Støtteinformasjonstype

  • STUDY_PROTOCOL
  • SEVJE
  • ICF
  • CSR

Legemiddel- og utstyrsinformasjon, studiedokumenter

Studerer et amerikansk FDA-regulert medikamentprodukt

Nei

Studerer et amerikansk FDA-regulert enhetsprodukt

Nei

produkt produsert i og eksportert fra USA

Nei

Denne informasjonen ble hentet direkte fra nettstedet clinicaltrials.gov uten noen endringer. Hvis du har noen forespørsler om å endre, fjerne eller oppdatere studiedetaljene dine, vennligst kontakt register@clinicaltrials.gov. Så snart en endring er implementert på clinicaltrials.gov, vil denne også bli oppdatert automatisk på nettstedet vårt. .

Abonnere