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RNU4ATAC 및 RTTN 관련 증후군의 병태생리학 연구 (ATAC)

2024년 10월 8일 업데이트: Hospices Civils de Lyon

관련 증후군의 병태생리학을 결정하기 위한 전사체, 생화학적 및 세포 접근법을 통한 RNU4ATAC 및 RTTN 유전자의 돌연변이 결과에 대한 연구: 소두증 골이형성 원시 왜소증 유형 I/III, 로이프만 증후군 및 로리-우드 증후군

인간 게놈에는 약 750개의 유전자가 작은 스플라이스솜에 의해 절단된 하나의 인트론을 포함합니다. 이들 유전자는 U12 유전자로 명명되고, 이러한 인트론은 마이너 또는 U12 인트론으로 명명됩니다. 작은 스플라이오솜(minor spliceosome)은 자체 snRNA 세트로 구성되며 그 중 U4atac이 포함됩니다. 비코딩 유전자인 RNU4ATAC는 Taybi-Linder(TALS), Roifman(RFMN) 및 Lowry-Wood 증후군(LWS)에서 돌연변이가 있는 것으로 밝혀졌습니다. 이러한 희귀 발달 장애는 출생 전후 성장 지연, 소두증, 골격 이형성증, 지적 장애, 망막 이영양증 및 면역 결핍과 관련이 있습니다. 이들의 생리병리학적 메커니즘은 아직 해결되지 않은 상태로 남아 있습니다. 관련된 U12 유전자의 수, 이들의 정체와 기능, 스플라이싱 결함에 의해 영향을 받는 세포 메커니즘은 아직 알려지지 않았습니다.

연구의 가설은 일차 섬모 구성 요소를 암호화하는 U12 유전자가 RNU4ATAC 돌연변이로 인한 사소한 접합 결함에 특히 민감하다는 것입니다. 실제로, TALS의 징후를 보이지만 RNU4ATAC에는 음성인 어린이는 RTTN 유전자에 동형접합성 변이체를 갖고 있는 것으로 밝혀졌습니다. 이 변이체는 중심체와 일차 섬모의 기저부에 위치한 로타틴 단백질을 코딩하고 이러한 구조를 유지하는 역할을 합니다. 또한 잘 알려진 섬모병증인 주베르 증후군(JBTS)을 암시하는 특성을 나타내는 5명의 환자에게서 이중 대립유전자 RNU4ATAC 돌연변이가 확인되었습니다. 이 환자들은 또한 TALS/RFMN/LWS의 전형적인 특성을 나타냅니다.

이러한 병리의 원인을 더 잘 이해하기 위해 RNU4ATAC 또는 RTTN 유전자의 이중 대립 유전자 돌연변이와 관련된 증후군을 가진 환자 집단을 모아 이들 환자의 세포에 대한 연구를 수행할 것입니다. 가능하다면 혈액 샘플을 채취하고 피부 생검도 실시합니다. 이 샘플은 유도 만능 줄기 세포주를 만드는 데 사용됩니다. 전사체 분석에서 유전적 배경의 차이로 인한 발현 변화를 제거하기 위해 RNU4ATAC 환자의 부모로부터 혈액 샘플도 수집됩니다. 부모가 유산했거나 의료적 낙태를 선택한 경우, 두 대립유전자 RNU4ATAC 또는 RTTN 돌연변이를 보유한 태아에서 피부, 근육 및 뇌 조직의 생검을 수집합니다. 수집된 생물학적 샘플은 U12 유전자의 전사 수준, 전대사 RNA의 접합, 주요 세포 기능, 조직과 세포의 구조적 특성을 연구하는 데 사용됩니다.

연구 개요

연구 유형

중재적

등록 (추정된)

45

단계

  • 해당 없음

연락처 및 위치

이 섹션에서는 연구를 수행하는 사람들의 연락처 정보와 이 연구가 수행되는 장소에 대한 정보를 제공합니다.

연구 연락처

연구 연락처 백업

연구 장소

      • Bordeaux, 프랑스, 33000
        • 아직 모집하지 않음
        • Centre de référence des anomalies du développement et syndromes malformatifs du Sud-Ouest Occitanie Réunion, CHU de Bordeaux-GH Pellegrin
        • 연락하다:
      • Bron, 프랑스, 69500
        • 모병
        • Centre de référence anomalies du développement de Lyon, Hôpital Femme Mère Enfant
        • 연락하다:
      • Dijon, 프랑스, 9000
        • 아직 모집하지 않음
        • Centre de référence des anomalies du développement et syndromes malformatifs de l'Est, CHU de DIJON
        • 연락하다:
      • Lille, 프랑스, 59000
        • 아직 모집하지 않음
        • Centre de référence des anomalies du développement et syndromes malformatifs de l'inter région Nord-Ouest, Hôpital J de Flandre
        • 연락하다:
      • Paris, 프랑스, 75743
        • 아직 모집하지 않음
        • Unité Fonctionelle d'embryo-fœtopathologie, Hôpital Necker-Enfants Malades
        • 연락하다:
      • Rennes, 프랑스, 35000
        • 아직 모집하지 않음
        • Centre de référence des anomalies du développement et syndromes malformatifs de l'Ouest, Hôpital Sud
        • 연락하다:

참여기준

연구원은 적격성 기준이라는 특정 설명에 맞는 사람을 찾습니다. 이러한 기준의 몇 가지 예는 개인의 일반적인 건강 상태 또는 이전 치료입니다.

자격 기준

공부할 수 있는 나이

  • 어린이
  • 성인
  • 고령자

건강한 자원 봉사자를 받아들입니다

설명

포함 기준:

TALS, RFMN, LWS 또는 기타 병리학 환자

  • 여자든 남자든
  • 모든 연령층
  • RNU4ATAC 또는 RTTN의 이중 대립 유전자 돌연변이의 존재
  • 부모 또는 법적 보호자의 서면 동의
  • 사회 보장 제도 가입

건강한 참가자(환자의 부모)

  • 여자든 남자든
  • 주요한
  • RNU4ATAC의 단일 대립 유전자 돌연변이의 존재
  • 참가자의 서면 동의
  • 사회 보장 제도 가입

의학적 임신 종료 또는 자연 유산을 경험한 부모(태아 샘플의 경우)

  • 여자든 남자든
  • 주요한
  • 태아에 RNU4ATAC 또는 RTTN의 이중 대립유전자 돌연변이 존재
  • 서면 부모 동의
  • 사회 보장 제도 가입

제외 기준:

제외 기간을 포함하여 다른 연구에 참여하는 피험자는 아직 진행 중입니다.

공부 계획

이 섹션에서는 연구 설계 방법과 연구가 측정하는 내용을 포함하여 연구 계획에 대한 세부 정보를 제공합니다.

연구는 어떻게 설계됩니까?

디자인 세부사항

  • 주 목적: 다른
  • 할당: 무작위화되지 않음
  • 중재 모델: 단일 그룹 할당
  • 마스킹: 없음(오픈 라벨)

무기와 개입

참가자 그룹 / 팔
개입 / 치료
다른: RNU4ATAC 환자
RNU4ATAC 유전자의 이중 대립유전자 돌연변이 환자
체중에 따라 5ml ~ 15ml의 혈액 샘플
길이 2~3mm, 너비 1mm, 깊이 1mm의 피부 조각에 대한 생검은 엄격한 무균 조건에서 팔 안쪽, 위쪽 1/3, 팔꿈치 굴곡부와 겨드랑이 구멍 사이에서 채취하는 것이 바람직합니다. .
다른: RNU4ATAC 태아
RNU4ATAC 유전자의 이중 대립 유전자 돌연변이가 있는 태아
임신 또는 유산이 의료적으로 종료된 후 부검실에서 태아로부터 피부, 근육, 뇌 및 뼈 생검을 채취합니다.
다른: RNU4ATAC 상위
RNU4ATAC 유전자의 이중 대립유전자 돌연변이가 있고 스스로 RNU4ATAC 유전자의 단일 대립유전자 돌연변이를 나타내는 환자 또는 태아의 부모
체중에 따라 5ml ~ 15ml의 혈액 샘플
다른: RTTN 환자
RTTN 유전자의 이중 대립유전자 돌연변이 환자
체중에 따라 5ml ~ 15ml의 혈액 샘플
길이 2~3mm, 너비 1mm, 깊이 1mm의 피부 조각에 대한 생검은 엄격한 무균 조건에서 팔 안쪽, 위쪽 1/3, 팔꿈치 굴곡부와 겨드랑이 구멍 사이에서 채취하는 것이 바람직합니다. .
다른: RTTN 태아
RTTN 유전자의 이중 대립유전자 돌연변이가 있는 태아
임신 또는 유산이 의료적으로 종료된 후 부검실에서 태아로부터 피부, 근육, 뇌 및 뼈 생검을 채취합니다.

연구는 무엇을 측정합니까?

주요 결과 측정

결과 측정
측정값 설명
기간
세포 수준에서 RNU4ATAC 돌연변이 결과 확인
기간: 5 년

RNU4ATAC 환자로부터 얻은 다양한 세포 유형에 존재하는 기능 장애를 대조군과 비교하여 식별하고 RTTN 환자에 존재하는 기능과 비교할 것입니다.

형광 현미경으로 측정한 일차 섬모의 길이와 구조 및 글리세롤 구배 침강 분석으로 측정한 작은 핵 리보핵산단백질(snRNP) 입자의 형성에 대한 RNU4ATAC 돌연변이 환자 세포의 결과

5 년

2차 결과 측정

결과 측정
측정값 설명
기간
사소한 접합 이상
기간: 5 년

대조군 세포에 비해 환자 세포에서 스플라이싱 변경이 확인될 U12 유전자의 수와 목록은 다양한 표현형(TALS, RFMN, LWS 및 확인될 수 있는 기타 병리)을 고려하여 비교됩니다.

RNA 시퀀싱 실험 후 IRFinder 및 KisSplice 생물정보학 소프트웨어를 사용한 인트론 보유 분석으로 측정한 작은 인트론 스플라이싱에 대한 RNU4ATAC 돌연변이 환자의 세포에서의 결과

5 년
신경 분화 이상에 대한 이해
기간: 5 년

뉴런 전구세포로 분화된 세포의 행동 이상은 대조군과의 비교를 통해 확인하고, 확인될 수 있는 다양한 표현형(TALS, RFMN, LWS 및 기타 병리학(들))을 고려하여 비교할 것입니다.

면역세포화학으로 측정한 바와 같이, 유도 만능 줄기 세포가 신경 계통으로 분화하는 능력에 대한 RNU4ATAC 돌연변이의 결과

5 년

공동 작업자 및 조사자

여기에서 이 연구와 관련된 사람과 조직을 찾을 수 있습니다.

연구 기록 날짜

이 날짜는 ClinicalTrials.gov에 대한 연구 기록 및 요약 결과 제출의 진행 상황을 추적합니다. 연구 기록 및 보고된 결과는 공개 웹사이트에 게시되기 전에 특정 품질 관리 기준을 충족하는지 확인하기 위해 국립 의학 도서관(NLM)에서 검토합니다.

연구 주요 날짜

연구 시작 (실제)

2024년 8월 27일

기본 완료 (추정된)

2029년 8월 27일

연구 완료 (추정된)

2029년 8월 27일

연구 등록 날짜

최초 제출

2023년 3월 31일

QC 기준을 충족하는 최초 제출

2023년 10월 26일

처음 게시됨 (실제)

2023년 11월 1일

연구 기록 업데이트

마지막 업데이트 게시됨 (추정된)

2024년 10월 9일

QC 기준을 충족하는 마지막 업데이트 제출

2024년 10월 8일

마지막으로 확인됨

2024년 10월 1일

추가 정보

이 연구와 관련된 용어

개별 참가자 데이터(IPD) 계획

개별 참가자 데이터(IPD)를 공유할 계획입니까?

아니요

약물 및 장치 정보, 연구 문서

미국 FDA 규제 의약품 연구

아니

미국 FDA 규제 기기 제품 연구

아니

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