Tämä sivu käännettiin automaattisesti, eikä käännösten tarkkuutta voida taata. Katso englanninkielinen versio lähdetekstiä varten.

RNU4ATAC- ja RTTN-assosioituneiden oireyhtymien patofysiologian tutkimus (ATAC)

torstai 26. lokakuuta 2023 päivittänyt: Hospices Civils de Lyon

Tutkimus RNU4ATAC- ja RTTN-geenien mutaatioiden seurauksista transkriptomisilla, biokemiallisilla ja solullisilla lähestymistavoilla niihin liittyvien oireyhtymien patofysiologian määrittämiseksi: mikrokefaalinen osteodysplastinen primordiaalinen kääpiötyyppi I/III, Roifmanin oireyhtymä ja Lowry-Wood-oireyhtymä

Ihmisen genomissa noin 750 geeniä sisältää yhden intronin, jonka pieni silmukointi on leikannut pois. Näitä geenejä kutsutaan U12-geeneiksi, ja nämä intronit, pienet tai U12-intronit. Vähäinen silmukointi sisältää oman snRNA-sarjansa, joiden joukossa on U4atac. Sen ei-koodaava geeni, RNU4ATAC, on löydetty mutatoituneena Taybi-Linderin (TALS), Roifmanin (RFMN) ja Lowry-Woodin oireyhtymissä (LWS). Näihin harvinaisiin kehityshäiriöihin liittyy synnytystä edeltävä ja postnataalinen kasvun hidastuminen, mikrokefalia, luuston dysplasia, älyllinen vamma, verkkokalvon dystrofia ja immuunipuutos. Niiden fysiopatologiset mekanismit ovat edelleen ratkaisematta: mukana olevien U12-geenien lukumäärä, niiden identiteetti ja toiminta tai solumekanismit, joihin silmukointivirhe vaikuttaa, ovat edelleen tuntemattomia.

Tutkimuksen hypoteesi on, että U12-geenit, jotka koodaavat primaarisia värekarvokomponentteja, ovat erityisen herkkiä RNU4ATAC-mutaatioiden aiheuttamille pienille silmukointivirheille. Todellakin, lapsella, jolla oli merkkejä TALS:sta, mutta negatiivinen RNU4ATAC:n suhteen, havaittiin kantavan homotsygoottista varianttia RTTN-geenissä, joka koodaa rotatiiniproteiinia, joka sijaitsee sentrosomissa ja primaarisen värekäreen pohjassa ja jolla on rooli näiden rakenteiden ylläpitämisessä. Lisäksi kaksialleeliset RNU4ATAC-mutaatiot tunnistettiin viidellä potilaalla, joilla oli piirteitä, jotka viittaavat Joubertin oireyhtymään (JBTS), joka on hyvin karakterisoitu siliopatia. Näillä potilailla on myös TALS/RFMN/LWS:lle tyypillisiä piirteitä.

Näiden patologioiden syiden ymmärtämiseksi paremmin kerätään potilaiden kohortti, joilla on RNU4ATAC- tai RTTN-geenin bi-alleelimutaatioihin liittyviä oireyhtymiä, jotta voidaan suorittaa tutkimuksia näiden potilaiden soluilla. Otetaan verinäytteitä sekä mahdollisuuksien mukaan ihobiopsiat. Näitä näytteitä käytetään indusoitujen pluripotenttien kantasolulinjojen luomiseen. Verinäytteitä kerätään myös RNU4ATAC-potilaiden vanhemmilta geneettisen taustan eroista johtuvien ekspressiovaihteluiden eliminoimiseksi transkriptomisissa analyyseissä. Iho-, lihas- ja aivokudoksen biopsiat otetaan sikiöistä, joilla on kaksialleelinen RNU4ATAC- tai RTTN-mutaatio ja joiden vanhemmat ovat saaneet keskenmenon tai ovat päättäneet tehdä lääketieteellisen abortin. Kerätyillä biologisilla näytteillä tutkitaan U12-geenien transkriptiotasoa, niiden pre-messenger-RNA:n silmukointia, tärkeimpiä solutoimintoja sekä kudosten ja solujen rakenteellisia ominaisuuksia.

Tutkimuksen yleiskatsaus

Opintotyyppi

Interventio

Ilmoittautuminen (Arvioitu)

45

Vaihe

  • Ei sovellettavissa

Yhteystiedot ja paikat

Tässä osiossa on tutkimuksen suorittajien yhteystiedot ja tiedot siitä, missä tämä tutkimus suoritetaan.

Opiskeluyhteys

Tutki yhteystietojen varmuuskopiointi

Opiskelupaikat

      • Bordeaux, Ranska, 33000
        • Centre de référence des anomalies du développement et syndromes malformatifs du Sud-Ouest Occitanie Réunion, CHU de Bordeaux-GH Pellegrin
        • Ottaa yhteyttä:
      • Bron, Ranska, 69500
        • Centre de référence anomalies du développement de Lyon, Hôpital Femme Mère Enfant
        • Ottaa yhteyttä:
      • Dijon, Ranska, 9000
        • Centre de référence des anomalies du développement et syndromes malformatifs de l'Est, CHU de DIJON
        • Ottaa yhteyttä:
      • Lille, Ranska, 59000
        • Centre de référence des anomalies du développement et syndromes malformatifs de l'inter région Nord-Ouest, Hôpital J de Flandre
        • Ottaa yhteyttä:
      • Paris, Ranska, 75743
        • Unité Fonctionelle d'embryo-fœtopathologie, Hôpital Necker-Enfants Malades
        • Ottaa yhteyttä:
      • Rennes, Ranska, 35000
        • Centre de référence des anomalies du développement et syndromes malformatifs de l'Ouest, Hôpital Sud
        • Ottaa yhteyttä:

Osallistumiskriteerit

Tutkijat etsivät ihmisiä, jotka sopivat tiettyyn kuvaukseen, jota kutsutaan kelpoisuuskriteereiksi. Joitakin esimerkkejä näistä kriteereistä ovat henkilön yleinen terveydentila tai aiemmat hoidot.

Kelpoisuusvaatimukset

Opintokelpoiset iät

  • Lapsi
  • Aikuinen
  • Vanhempi Aikuinen

Hyväksyy terveitä vapaaehtoisia

Joo

Kuvaus

Sisällyttämiskriteerit:

TALS, RFMN, LWS tai muut patologiset potilaat

  • Nainen tai mies
  • Kaikki iät
  • RNU4ATAC:n tai RTTN:n kaksialleelisten mutaatioiden esiintyminen
  • Vanhempien tai laillisten huoltajien kirjallinen suostumus
  • Sosiaaliturvajärjestelmään kuuluminen

Terveet osallistujat (potilaan vanhempi)

  • Nainen tai mies
  • Suuri
  • RNU4ATAC:n monoalleelisten mutaatioiden esiintyminen
  • Osallistujan kirjallinen suostumus
  • Sosiaaliturvajärjestelmään kuuluminen

Vanhemmat, jotka turvautuvat lääketieteelliseen raskauden keskeytykseen tai joilla on ollut spontaani keskenmeno (sikiönäytteitä varten)

  • Nainen tai mies
  • Suuri
  • RNU4ATAC:n tai RTTN:n bi-alleelisten mutaatioiden esiintyminen sikiössä
  • Vanhemman kirjallinen suostumus
  • Sosiaaliturvajärjestelmään kuuluminen

Poissulkemiskriteerit:

Kohde osallistuu toiseen tutkimukseen, mukaan lukien poissulkemisjakso vielä kesken.

Opintosuunnitelma

Tässä osiossa on tietoja tutkimussuunnitelmasta, mukaan lukien kuinka tutkimus on suunniteltu ja mitä tutkimuksella mitataan.

Miten tutkimus on suunniteltu?

Suunnittelun yksityiskohdat

  • Ensisijainen käyttötarkoitus: Muut
  • Jako: Ei satunnaistettu
  • Inventiomalli: Yksittäinen ryhmätehtävä
  • Naamiointi: Ei mitään (avoin tarra)

Aseet ja interventiot

Osallistujaryhmä / Arm
Interventio / Hoito
Muut: RNU4ATAC-potilas
Potilas, jolla on RNU4ATAC-geenin kaksialleelinen mutaatio
Verinäytteitä 5–15 ml painosta riippuen
Biopsiat 2–3 mm pitkästä, 1 mm leveästä ja 1 mm syvästä ihofragmentista otetaan mieluiten käsivarren sisäpuolelta, ylemmältä kolmannekselta, kyynärpään mutkan ja kainaloontelon väliltä tiukoissa steriiliysolosuhteissa. .
Muut: RNU4ATAC sikiö
Sikiö, jolla on RNU4ATAC-geenin kaksialleelinen mutaatio
Ruumiinavaushuoneessa olevilta sikiöiltä otetaan iho-, lihas-, aivo- ja luubiopsiat raskauden lääketieteellisen keskeytyksen tai keskenmenon jälkeen
Muut: RNU4ATAC-emo
Potilaan tai sikiön vanhempi, jolla on RNU4ATAC-geenin kaksialleelinen mutaatio ja jolla on itsellään RNU4ATAC-geenin monoalleelinen mutaatio
Verinäytteitä 5–15 ml painosta riippuen
Muut: RTTN-potilas
Potilas, jolla on RTTN-geenin kaksialleelinen mutaatio
Verinäytteitä 5–15 ml painosta riippuen
Biopsiat 2–3 mm pitkästä, 1 mm leveästä ja 1 mm syvästä ihofragmentista otetaan mieluiten käsivarren sisäpuolelta, ylemmältä kolmannekselta, kyynärpään mutkan ja kainaloontelon väliltä tiukoissa steriiliysolosuhteissa. .
Muut: RTTN sikiö
Sikiö, jolla on RTTN-geenin kaksialleelinen mutaatio
Ruumiinavaushuoneessa olevilta sikiöiltä otetaan iho-, lihas-, aivo- ja luubiopsiat raskauden lääketieteellisen keskeytyksen tai keskenmenon jälkeen

Mitä tutkimuksessa mitataan?

Ensisijaiset tulostoimenpiteet

Tulosmittaus
Toimenpiteen kuvaus
Aikaikkuna
RNU4ATAC-mutaatioiden seurausten tunnistaminen solutasolla
Aikaikkuna: 5 vuotta

RNU4ATAC-potilailta saaduissa eri solutyypeissä esiintyvät toimintahäiriöt tunnistetaan vertailemalla verrokkeja, ja niitä verrataan RTTN-potilailla esiintyviin.

Seuraukset RNU4ATAC-mutaatioiden potilaiden soluissa primaarisilmun pituuteen ja rakenteeseen, mitattuna fluoresenssimikroskoopilla, sekä pienten ydinribonukleoproteiinihiukkasten (snRNP:t) muodostumiseen glyseroligradienttisedimentaatioanalyysillä mitattuna

5 vuotta

Toissijaiset tulostoimenpiteet

Tulosmittaus
Toimenpiteen kuvaus
Aikaikkuna
Pieniä liitosvirheitä
Aikaikkuna: 5 vuotta

Niiden U12-geenien lukumäärää ja luetteloa, joiden silmukoinnin muutos tunnistetaan potilassoluissa verrattuna kontrollisoluihin, verrataan ottaen huomioon erilaiset fenotyypit (TALS, RFMN, LWS ja muut mahdollisesti tunnistetut patologiat).

Seuraukset RNU4ATAC-mutaatioiden potilaiden soluissa vähäisemmässä intronin silmukoitumisessa mitattuna introniretentioanalyysillä IRFinder- ja KisSplice-bioinformatiikkaohjelmistoilla RNA-sekvensointikokeiden jälkeen

5 vuotta
Hermosolujen erilaistumishäiriöiden ymmärtäminen
Aikaikkuna: 5 vuotta

Poikkeavuudet hermosolujen kantasoluiksi erilaistuneiden solujen käyttäytymisessä tunnistetaan vertailemalla kontrolleihin, ja niitä verrataan ottaen huomioon mahdollisesti tunnistetut erilaiset fenotyypit (TALS, RFMN, LWS ja muut patologiat).

RNU4ATAC-mutaatioiden seuraukset indusoitujen pluripotenttien kantasolujen kykyyn erilaistua hermosoluja kohti immunosytokemialla mitattuna

5 vuotta

Yhteistyökumppanit ja tutkijat

Täältä löydät tähän tutkimukseen osallistuvat ihmiset ja organisaatiot.

Opintojen ennätyspäivät

Nämä päivämäärät seuraavat ClinicalTrials.gov-sivustolle lähetettyjen tutkimustietueiden ja yhteenvetojen edistymistä. National Library of Medicine (NLM) tarkistaa tutkimustiedot ja raportoidut tulokset varmistaakseen, että ne täyttävät tietyt laadunvalvontastandardit, ennen kuin ne julkaistaan ​​julkisella verkkosivustolla.

Opi tärkeimmät päivämäärät

Opiskelun aloitus (Arvioitu)

Perjantai 1. joulukuuta 2023

Ensisijainen valmistuminen (Arvioitu)

Perjantai 1. joulukuuta 2028

Opintojen valmistuminen (Arvioitu)

Perjantai 1. joulukuuta 2028

Opintoihin ilmoittautumispäivät

Ensimmäinen lähetetty

Perjantai 31. maaliskuuta 2023

Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit

Torstai 26. lokakuuta 2023

Ensimmäinen Lähetetty (Todellinen)

Keskiviikko 1. marraskuuta 2023

Tutkimustietojen päivitykset

Viimeisin päivitys julkaistu (Todellinen)

Keskiviikko 1. marraskuuta 2023

Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit

Torstai 26. lokakuuta 2023

Viimeksi vahvistettu

Sunnuntai 1. lokakuuta 2023

Lisää tietoa

Tähän tutkimukseen liittyvät termit

Yksittäisten osallistujien tietojen suunnitelma (IPD)

Aiotko jakaa yksittäisten osallistujien tietoja (IPD)?

EI

Lääke- ja laitetiedot, tutkimusasiakirjat

Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää lääkevalmistetta

Ei

Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää laitetuotetta

Ei

Nämä tiedot haettiin suoraan verkkosivustolta clinicaltrials.gov ilman muutoksia. Jos sinulla on pyyntöjä muuttaa, poistaa tai päivittää tutkimustietojasi, ota yhteyttä register@clinicaltrials.gov. Heti kun muutos on otettu käyttöön osoitteessa clinicaltrials.gov, se päivitetään automaattisesti myös verkkosivustollemme .

Kliiniset tutkimukset Lowry Woodin oireyhtymä

  • Nemours Children's Clinic
    Potentials Foundation; Walking with Giants Foundation
    Rekrytointi
    MOPDII | RNU4atac-opatia (esim. MOPDI/III, Lowry-Woodin oireyhtymä, Roifmanin oireyhtymä) | Meier-Gorlinin oireyhtymä | Saul-Wilsonin oireyhtymä | Ligaasi 4 -syndrooma | Mikrokefaalinen primordiaalinen kääpiö
    Yhdysvallat

Kliiniset tutkimukset Verinäytteitä

3
Tilaa