- ICH GCP
- Yhdysvaltain kliinisten tutkimusten rekisteri
- Kliininen tutkimus NCT06111950
RNU4ATAC- ja RTTN-assosioituneiden oireyhtymien patofysiologian tutkimus (ATAC)
Tutkimus RNU4ATAC- ja RTTN-geenien mutaatioiden seurauksista transkriptomisilla, biokemiallisilla ja solullisilla lähestymistavoilla niihin liittyvien oireyhtymien patofysiologian määrittämiseksi: mikrokefaalinen osteodysplastinen primordiaalinen kääpiötyyppi I/III, Roifmanin oireyhtymä ja Lowry-Wood-oireyhtymä
Ihmisen genomissa noin 750 geeniä sisältää yhden intronin, jonka pieni silmukointi on leikannut pois. Näitä geenejä kutsutaan U12-geeneiksi, ja nämä intronit, pienet tai U12-intronit. Vähäinen silmukointi sisältää oman snRNA-sarjansa, joiden joukossa on U4atac. Sen ei-koodaava geeni, RNU4ATAC, on löydetty mutatoituneena Taybi-Linderin (TALS), Roifmanin (RFMN) ja Lowry-Woodin oireyhtymissä (LWS). Näihin harvinaisiin kehityshäiriöihin liittyy synnytystä edeltävä ja postnataalinen kasvun hidastuminen, mikrokefalia, luuston dysplasia, älyllinen vamma, verkkokalvon dystrofia ja immuunipuutos. Niiden fysiopatologiset mekanismit ovat edelleen ratkaisematta: mukana olevien U12-geenien lukumäärä, niiden identiteetti ja toiminta tai solumekanismit, joihin silmukointivirhe vaikuttaa, ovat edelleen tuntemattomia.
Tutkimuksen hypoteesi on, että U12-geenit, jotka koodaavat primaarisia värekarvokomponentteja, ovat erityisen herkkiä RNU4ATAC-mutaatioiden aiheuttamille pienille silmukointivirheille. Todellakin, lapsella, jolla oli merkkejä TALS:sta, mutta negatiivinen RNU4ATAC:n suhteen, havaittiin kantavan homotsygoottista varianttia RTTN-geenissä, joka koodaa rotatiiniproteiinia, joka sijaitsee sentrosomissa ja primaarisen värekäreen pohjassa ja jolla on rooli näiden rakenteiden ylläpitämisessä. Lisäksi kaksialleeliset RNU4ATAC-mutaatiot tunnistettiin viidellä potilaalla, joilla oli piirteitä, jotka viittaavat Joubertin oireyhtymään (JBTS), joka on hyvin karakterisoitu siliopatia. Näillä potilailla on myös TALS/RFMN/LWS:lle tyypillisiä piirteitä.
Näiden patologioiden syiden ymmärtämiseksi paremmin kerätään potilaiden kohortti, joilla on RNU4ATAC- tai RTTN-geenin bi-alleelimutaatioihin liittyviä oireyhtymiä, jotta voidaan suorittaa tutkimuksia näiden potilaiden soluilla. Otetaan verinäytteitä sekä mahdollisuuksien mukaan ihobiopsiat. Näitä näytteitä käytetään indusoitujen pluripotenttien kantasolulinjojen luomiseen. Verinäytteitä kerätään myös RNU4ATAC-potilaiden vanhemmilta geneettisen taustan eroista johtuvien ekspressiovaihteluiden eliminoimiseksi transkriptomisissa analyyseissä. Iho-, lihas- ja aivokudoksen biopsiat otetaan sikiöistä, joilla on kaksialleelinen RNU4ATAC- tai RTTN-mutaatio ja joiden vanhemmat ovat saaneet keskenmenon tai ovat päättäneet tehdä lääketieteellisen abortin. Kerätyillä biologisilla näytteillä tutkitaan U12-geenien transkriptiotasoa, niiden pre-messenger-RNA:n silmukointia, tärkeimpiä solutoimintoja sekä kudosten ja solujen rakenteellisia ominaisuuksia.
Tutkimuksen yleiskatsaus
Tila
Ehdot
Interventio / Hoito
Opintotyyppi
Ilmoittautuminen (Arvioitu)
Vaihe
- Ei sovellettavissa
Yhteystiedot ja paikat
Opiskeluyhteys
- Nimi: Sylvie MAZOYER, Dr
- Puhelinnumero: +33 04 81 10 65 33
- Sähköposti: sylvie.mazoyer@inserm.fr
Tutki yhteystietojen varmuuskopiointi
- Nimi: Patrick EDERY, Pr
- Puhelinnumero: +33 04 72 12 96 98
- Sähköposti: charles-patrick.edery@chu-lyon.fr
Opiskelupaikat
-
-
-
Bordeaux, Ranska, 33000
- Centre de référence des anomalies du développement et syndromes malformatifs du Sud-Ouest Occitanie Réunion, CHU de Bordeaux-GH Pellegrin
-
Ottaa yhteyttä:
- Didier LACOMBE, MD, PhD
- Puhelinnumero: +33 05 56 79 56 48
- Sähköposti: didier.lacombe@chu-bordeaux.fr
-
Bron, Ranska, 69500
- Centre de référence anomalies du développement de Lyon, Hôpital Femme Mère Enfant
-
Ottaa yhteyttä:
- Patrick EDERY, MD, PhD
- Puhelinnumero: 04 72 12 96 98
- Sähköposti: charles-patrick.edery@chu-lyon.fr
-
Dijon, Ranska, 9000
- Centre de référence des anomalies du développement et syndromes malformatifs de l'Est, CHU de DIJON
-
Ottaa yhteyttä:
- Laurence OLIVIER-FAIVRE, MD, PhD
- Puhelinnumero: +33 03 80 29 53 13
- Sähköposti: laurence.faivre@chu-dijon.fr
-
Lille, Ranska, 59000
- Centre de référence des anomalies du développement et syndromes malformatifs de l'inter région Nord-Ouest, Hôpital J de Flandre
-
Ottaa yhteyttä:
- Sylvie MANOUVRIER-HANU, MD, PhD
- Puhelinnumero: +33 03 20 44 49 11
- Sähköposti: sylvie.manouvrier@chru-lille.fr
-
Paris, Ranska, 75743
- Unité Fonctionelle d'embryo-fœtopathologie, Hôpital Necker-Enfants Malades
-
Ottaa yhteyttä:
- Tania ATTIE-BITTACH, MD, PhD
- Puhelinnumero: +33 01 44 49 51 44
- Sähköposti: tania.attie@inserm.fr
-
Rennes, Ranska, 35000
- Centre de référence des anomalies du développement et syndromes malformatifs de l'Ouest, Hôpital Sud
-
Ottaa yhteyttä:
- Sylvie ODENT, MD, PhD
- Puhelinnumero: +33 02 99 26 67 44
- Sähköposti: sylvie.odent@chru-rennes.fr
-
-
Osallistumiskriteerit
Kelpoisuusvaatimukset
Opintokelpoiset iät
- Lapsi
- Aikuinen
- Vanhempi Aikuinen
Hyväksyy terveitä vapaaehtoisia
Kuvaus
Sisällyttämiskriteerit:
TALS, RFMN, LWS tai muut patologiset potilaat
- Nainen tai mies
- Kaikki iät
- RNU4ATAC:n tai RTTN:n kaksialleelisten mutaatioiden esiintyminen
- Vanhempien tai laillisten huoltajien kirjallinen suostumus
- Sosiaaliturvajärjestelmään kuuluminen
Terveet osallistujat (potilaan vanhempi)
- Nainen tai mies
- Suuri
- RNU4ATAC:n monoalleelisten mutaatioiden esiintyminen
- Osallistujan kirjallinen suostumus
- Sosiaaliturvajärjestelmään kuuluminen
Vanhemmat, jotka turvautuvat lääketieteelliseen raskauden keskeytykseen tai joilla on ollut spontaani keskenmeno (sikiönäytteitä varten)
- Nainen tai mies
- Suuri
- RNU4ATAC:n tai RTTN:n bi-alleelisten mutaatioiden esiintyminen sikiössä
- Vanhemman kirjallinen suostumus
- Sosiaaliturvajärjestelmään kuuluminen
Poissulkemiskriteerit:
Kohde osallistuu toiseen tutkimukseen, mukaan lukien poissulkemisjakso vielä kesken.
Opintosuunnitelma
Miten tutkimus on suunniteltu?
Suunnittelun yksityiskohdat
- Ensisijainen käyttötarkoitus: Muut
- Jako: Ei satunnaistettu
- Inventiomalli: Yksittäinen ryhmätehtävä
- Naamiointi: Ei mitään (avoin tarra)
Aseet ja interventiot
Osallistujaryhmä / Arm |
Interventio / Hoito |
---|---|
Muut: RNU4ATAC-potilas
Potilas, jolla on RNU4ATAC-geenin kaksialleelinen mutaatio
|
Verinäytteitä 5–15 ml painosta riippuen
Biopsiat 2–3 mm pitkästä, 1 mm leveästä ja 1 mm syvästä ihofragmentista otetaan mieluiten käsivarren sisäpuolelta, ylemmältä kolmannekselta, kyynärpään mutkan ja kainaloontelon väliltä tiukoissa steriiliysolosuhteissa. .
|
Muut: RNU4ATAC sikiö
Sikiö, jolla on RNU4ATAC-geenin kaksialleelinen mutaatio
|
Ruumiinavaushuoneessa olevilta sikiöiltä otetaan iho-, lihas-, aivo- ja luubiopsiat raskauden lääketieteellisen keskeytyksen tai keskenmenon jälkeen
|
Muut: RNU4ATAC-emo
Potilaan tai sikiön vanhempi, jolla on RNU4ATAC-geenin kaksialleelinen mutaatio ja jolla on itsellään RNU4ATAC-geenin monoalleelinen mutaatio
|
Verinäytteitä 5–15 ml painosta riippuen
|
Muut: RTTN-potilas
Potilas, jolla on RTTN-geenin kaksialleelinen mutaatio
|
Verinäytteitä 5–15 ml painosta riippuen
Biopsiat 2–3 mm pitkästä, 1 mm leveästä ja 1 mm syvästä ihofragmentista otetaan mieluiten käsivarren sisäpuolelta, ylemmältä kolmannekselta, kyynärpään mutkan ja kainaloontelon väliltä tiukoissa steriiliysolosuhteissa. .
|
Muut: RTTN sikiö
Sikiö, jolla on RTTN-geenin kaksialleelinen mutaatio
|
Ruumiinavaushuoneessa olevilta sikiöiltä otetaan iho-, lihas-, aivo- ja luubiopsiat raskauden lääketieteellisen keskeytyksen tai keskenmenon jälkeen
|
Mitä tutkimuksessa mitataan?
Ensisijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
---|---|---|
RNU4ATAC-mutaatioiden seurausten tunnistaminen solutasolla
Aikaikkuna: 5 vuotta
|
RNU4ATAC-potilailta saaduissa eri solutyypeissä esiintyvät toimintahäiriöt tunnistetaan vertailemalla verrokkeja, ja niitä verrataan RTTN-potilailla esiintyviin. Seuraukset RNU4ATAC-mutaatioiden potilaiden soluissa primaarisilmun pituuteen ja rakenteeseen, mitattuna fluoresenssimikroskoopilla, sekä pienten ydinribonukleoproteiinihiukkasten (snRNP:t) muodostumiseen glyseroligradienttisedimentaatioanalyysillä mitattuna |
5 vuotta
|
Toissijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
---|---|---|
Pieniä liitosvirheitä
Aikaikkuna: 5 vuotta
|
Niiden U12-geenien lukumäärää ja luetteloa, joiden silmukoinnin muutos tunnistetaan potilassoluissa verrattuna kontrollisoluihin, verrataan ottaen huomioon erilaiset fenotyypit (TALS, RFMN, LWS ja muut mahdollisesti tunnistetut patologiat). Seuraukset RNU4ATAC-mutaatioiden potilaiden soluissa vähäisemmässä intronin silmukoitumisessa mitattuna introniretentioanalyysillä IRFinder- ja KisSplice-bioinformatiikkaohjelmistoilla RNA-sekvensointikokeiden jälkeen |
5 vuotta
|
Hermosolujen erilaistumishäiriöiden ymmärtäminen
Aikaikkuna: 5 vuotta
|
Poikkeavuudet hermosolujen kantasoluiksi erilaistuneiden solujen käyttäytymisessä tunnistetaan vertailemalla kontrolleihin, ja niitä verrataan ottaen huomioon mahdollisesti tunnistetut erilaiset fenotyypit (TALS, RFMN, LWS ja muut patologiat). RNU4ATAC-mutaatioiden seuraukset indusoitujen pluripotenttien kantasolujen kykyyn erilaistua hermosoluja kohti immunosytokemialla mitattuna |
5 vuotta
|
Yhteistyökumppanit ja tutkijat
Sponsori
Opintojen ennätyspäivät
Opi tärkeimmät päivämäärät
Opiskelun aloitus (Arvioitu)
Ensisijainen valmistuminen (Arvioitu)
Opintojen valmistuminen (Arvioitu)
Opintoihin ilmoittautumispäivät
Ensimmäinen lähetetty
Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit
Ensimmäinen Lähetetty (Todellinen)
Tutkimustietojen päivitykset
Viimeisin päivitys julkaistu (Todellinen)
Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit
Viimeksi vahvistettu
Lisää tietoa
Tähän tutkimukseen liittyvät termit
Muita asiaankuuluvia MeSH-ehtoja
- Patologiset prosessit
- Hermoston sairaudet
- Endokriinisen järjestelmän sairaudet
- Sairaus
- Synnynnäiset poikkeavuudet
- Geneettiset sairaudet, synnynnäiset
- Tuki- ja liikuntaelinten sairaudet
- Luun sairaudet
- Kraniofacial poikkeavuudet
- Tuki- ja liikuntaelimistön poikkeavuudet
- Kortikaalisen kehityksen epämuodostumat, ryhmä I
- Kortikaalisen kehityksen epämuodostumat
- Hermoston epämuodostumat
- Luusairaudet, kehitys
- Oireyhtymä
- Mikrokefalia
- Osteokondrodysplasiat
- Dwarfismi
Muut tutkimustunnusnumerot
- 69HCL20_0599
Yksittäisten osallistujien tietojen suunnitelma (IPD)
Aiotko jakaa yksittäisten osallistujien tietoja (IPD)?
Lääke- ja laitetiedot, tutkimusasiakirjat
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää lääkevalmistetta
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää laitetuotetta
Nämä tiedot haettiin suoraan verkkosivustolta clinicaltrials.gov ilman muutoksia. Jos sinulla on pyyntöjä muuttaa, poistaa tai päivittää tutkimustietojasi, ota yhteyttä register@clinicaltrials.gov. Heti kun muutos on otettu käyttöön osoitteessa clinicaltrials.gov, se päivitetään automaattisesti myös verkkosivustollemme .
Kliiniset tutkimukset Lowry Woodin oireyhtymä
-
Nemours Children's ClinicPotentials Foundation; Walking with Giants FoundationRekrytointiMOPDII | RNU4atac-opatia (esim. MOPDI/III, Lowry-Woodin oireyhtymä, Roifmanin oireyhtymä) | Meier-Gorlinin oireyhtymä | Saul-Wilsonin oireyhtymä | Ligaasi 4 -syndrooma | Mikrokefaalinen primordiaalinen kääpiöYhdysvallat
Kliiniset tutkimukset Verinäytteitä
-
Thomas Jefferson UniversityRekrytointiRelapse Remitting multippeliskleroosiYhdysvallat
-
Natera, Inc.Eunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human Development... ja muut yhteistyökumppanitLopetettuAneuploidia | Trisomia 21 | Trisomia 18 | Trisomia 13Yhdysvallat, Irlanti, Kanada, Italia, Korean tasavalta, Espanja
-
University of PittsburghValmis
-
University of California, DavisValmis
-
Ohio State UniversityPeruutettuTerveet yksilötYhdysvallat
-
Children's Hospital Los AngelesRekrytointiLasten kiinteä kasvain, määrittelemätön, protokollakohtainenYhdysvallat
-
Anthony MaglioccoMontefiore Medical Center; University of Saskatchewan; DHR Health Institute... ja muut yhteistyökumppanitRekrytointi
-
Lawson Health Research InstituteUniversity of Toronto; University of Western Ontario, Canada; MOUNT SINAI... ja muut yhteistyökumppanitRekrytointi
-
Intermountain Health Care, Inc.Rekrytointi
-
Abramson Cancer Center of the University of PennsylvaniaPeruutettuVakava tai lievä toksisuus sädehoidosta ja/tai kemoterapiastaYhdysvallat