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Estudio de la fisiopatología de los síndromes asociados a RNU4ATAC y RTTN (ATAC)

8 de octubre de 2024 actualizado por: Hospices Civils de Lyon

Estudio de las consecuencias de las mutaciones de los genes RNU4ATAC y RTTN mediante enfoques transcriptómicos, bioquímicos y celulares para determinar la fisiopatología de sus síndromes asociados: enanismo primordial osteodisplásico microcefálico tipo I/III, síndrome de Roifman y síndrome de Lowry-Wood

En el genoma humano, alrededor de 750 genes contienen un intrón extirpado por el espliceosoma menor. Estos genes se denominan genes U12, y estos intrones, intrones menores o U12. El espliceosoma menor comprende su propio conjunto de snRNA, entre los que se encuentra U4atac. Su gen no codificante, RNU4ATAC, se ha encontrado mutado en los síndromes de Taybi-Linder (TALS), Roifman (RFMN) y Lowry-Wood (LWS). Estos raros trastornos del desarrollo asocian retraso del crecimiento ante y posnatal, microcefalia, displasia esquelética, discapacidad intelectual, distrofia retiniana e inmunodeficiencia. Sus mecanismos fisiopatológicos siguen sin resolverse: aún se desconocen el número de genes U12 implicados, su identidad y función, o los mecanismos celulares afectados por el defecto de empalme.

La hipótesis del estudio es que los genes U12 que codifican los componentes primarios de los cilios son particularmente sensibles a defectos menores de empalme causados ​​por mutaciones RNU4ATAC. De hecho, se descubrió que un niño que mostraba signos de TALS pero negativo para RNU4ATAC portaba una variante homocigótica en el gen RTTN, que codifica la proteína rotatina ubicada en el centrosoma y la base de los cilios primarios y que desempeña un papel en el mantenimiento de estas estructuras. Además, se identificaron mutaciones bialélicas de RNU4ATAC en cinco pacientes que presentaban rasgos sugestivos del síndrome de Joubert (JBTS), una ciliopatía bien caracterizada. Estos pacientes también presentan rasgos típicos de TALS/RFMN/LWS.

Para comprender mejor las causas de estas patologías, se reunirá una cohorte de pacientes con síndromes asociados a mutaciones bialélicas del gen RNU4ATAC o RTTN, con el fin de realizar estudios en las células de estos pacientes. Se tomarán muestras de sangre y, si es posible, biopsias de piel. Estas muestras se utilizarán para crear líneas de células madre pluripotentes inducidas. También se recolectarán muestras de sangre de los padres de los pacientes de RNU4ATAC, para eliminar en los análisis transcriptómicos variaciones de expresión debido a diferencias en los antecedentes genéticos. Se recolectarán biopsias de tejido de piel, músculos y cerebro de fetos que porten mutaciones de dos alelos RNU4ATAC o RTTN cuyos padres hayan tenido un aborto espontáneo o hayan elegido someterse a un aborto con medicamentos. Las muestras biológicas recogidas se utilizarán para estudiar el nivel de transcripción de los genes U12, el empalme de su ARN premensajero, sus principales funciones celulares y las características estructurales de tejidos y células.

Descripción general del estudio

Tipo de estudio

Intervencionista

Inscripción (Estimado)

45

Fase

  • No aplica

Contactos y Ubicaciones

Esta sección proporciona los datos de contacto de quienes realizan el estudio e información sobre dónde se lleva a cabo este estudio.

Estudio Contacto

Copia de seguridad de contactos de estudio

Ubicaciones de estudio

      • Bordeaux, Francia, 33000
        • Aún no reclutando
        • Centre de référence des anomalies du développement et syndromes malformatifs du Sud-Ouest Occitanie Réunion, CHU de Bordeaux-GH Pellegrin
        • Contacto:
      • Bron, Francia, 69500
        • Reclutamiento
        • Centre de référence anomalies du développement de Lyon, Hôpital Femme Mère Enfant
        • Contacto:
      • Dijon, Francia, 9000
        • Aún no reclutando
        • Centre de référence des anomalies du développement et syndromes malformatifs de l'Est, CHU de DIJON
        • Contacto:
      • Lille, Francia, 59000
        • Aún no reclutando
        • Centre de référence des anomalies du développement et syndromes malformatifs de l'inter région Nord-Ouest, Hôpital J de Flandre
        • Contacto:
      • Paris, Francia, 75743
        • Aún no reclutando
        • Unité Fonctionelle d'embryo-fœtopathologie, Hôpital Necker-Enfants Malades
        • Contacto:
          • Tania ATTIE-BITTACH, MD, PhD
          • Número de teléfono: +33 01 44 49 51 44
          • Correo electrónico: tania.attie@inserm.fr
      • Rennes, Francia, 35000
        • Aún no reclutando
        • Centre de référence des anomalies du développement et syndromes malformatifs de l'Ouest, Hôpital Sud
        • Contacto:

Criterios de participación

Los investigadores buscan personas que se ajusten a una determinada descripción, denominada criterio de elegibilidad. Algunos ejemplos de estos criterios son el estado de salud general de una persona o tratamientos previos.

Criterio de elegibilidad

Edades elegibles para estudiar

  • Niño
  • Adulto
  • Adulto Mayor

Acepta Voluntarios Saludables

Sí

Descripción

Criterios de inclusión:

Pacientes TALS, RFMN, LWS u otras patologías.

  • Mujer o hombre
  • Todas las edades
  • Presencia de mutaciones bialélicas de RNU4ATAC o RTTN
  • Consentimiento por escrito de los padres o tutor(es) legal(es)
  • Afiliación a un régimen de Seguridad Social

Participantes sanos (padre del paciente)

  • Mujer o hombre
  • Importante
  • Presencia de mutaciones monoalélicas de RNU4ATAC.
  • Consentimiento escrito del participante.
  • Afiliación a un régimen de Seguridad Social

Padres que hayan recurrido a una interrupción médica del embarazo o hayan tenido un aborto espontáneo (para muestras de fetos)

  • Mujer o hombre
  • Importante
  • Presencia de mutaciones bialélicas de RNU4ATAC o RTTN en el feto
  • Consentimiento escrito de los padres
  • Afiliación a un régimen de Seguridad Social

Criterio de exclusión:

Sujeto que participa en otra investigación que incluye un período de exclusión aún en curso.

Plan de estudios

Esta sección proporciona detalles del plan de estudio, incluido cómo está diseñado el estudio y qué mide el estudio.

¿Cómo está diseñado el estudio?

Detalles de diseño

  • Propósito principal: Otro
  • Asignación: No aleatorizado
  • Modelo Intervencionista: Asignación de un solo grupo
  • Enmascaramiento: Ninguno (etiqueta abierta)

Armas e Intervenciones

Grupo de participantes/brazo
Intervención / Tratamiento
Otro: Paciente RNU4ATAC
Paciente con mutación bialélica del gen RNU4ATAC
Muestras de sangre de 5 ml a 15 ml dependiendo de su peso.
Las biopsias de fragmento de piel de 2 a 3 mm de largo por 1 mm de ancho y 1 mm de profundidad se tomarán preferentemente en la cara interna del brazo, en el tercio superior, entre el pliegue del codo y el hueco de la axila, bajo estrictas condiciones de esterilidad. .
Otro: Feto RNU4ATAC
Feto con mutación bialélica del gen RNU4ATAC
Se tomarán biopsias de piel, músculos, cerebro y huesos de los fetos en la sala de autopsias después de la interrupción médica del embarazo o aborto espontáneo.
Otro: Padre RNU4ATAC
Padre de paciente o feto con mutación bialélica del gen RNU4ATAC y que presente mutación monoalélica del gen RNU4ATAC
Muestras de sangre de 5 ml a 15 ml dependiendo de su peso.
Otro: Paciente RTTN
Paciente con mutación bialélica del gen RTTN
Muestras de sangre de 5 ml a 15 ml dependiendo de su peso.
Las biopsias de fragmento de piel de 2 a 3 mm de largo por 1 mm de ancho y 1 mm de profundidad se tomarán preferentemente en la cara interna del brazo, en el tercio superior, entre el pliegue del codo y el hueco de la axila, bajo estrictas condiciones de esterilidad. .
Otro: Feto RTTN
Feto con mutación bialélica del gen RTTN
Se tomarán biopsias de piel, músculos, cerebro y huesos de los fetos en la sala de autopsias después de la interrupción médica del embarazo o aborto espontáneo.

¿Qué mide el estudio?

Medidas de resultado primarias

Medida de resultado
Medida Descripción
Periodo de tiempo
Identificación de las consecuencias de las mutaciones RNU4ATAC a nivel celular.
Periodo de tiempo: 5 años

Las disfunciones presentes en los diferentes tipos de células obtenidas de pacientes RNU4ATAC se identificarán en comparación con los controles y se compararán con las presentes en pacientes RTTN.

Consecuencias en las células de pacientes con mutaciones RNU4ATAC sobre la longitud y la estructura del cilio primario, medido mediante microscopía de fluorescencia, y sobre la formación de pequeñas partículas de ribonucleoproteína nuclear (snRNP), medida mediante análisis de sedimentación en gradiente de glicerol.

5 años

Medidas de resultado secundarias

Medida de resultado
Medida Descripción
Periodo de tiempo
Anomalías menores de empalme
Periodo de tiempo: 5 años

Se comparará el número y la lista de genes U12 para los cuales se identificará una alteración del empalme en las células del paciente con respecto a las células de control, teniendo en cuenta los diferentes fenotipos (TALS, RFMN, LWS y otras patologías posiblemente identificadas).

Consecuencias en células de pacientes de mutaciones RNU4ATAC en el empalme de intrones menores, medido mediante análisis de retención de intrones con los softwares bioinformáticos IRFinder y KisSplice después de experimentos de secuenciación de ARN

5 años
Comprensión de las anomalías de la diferenciación neuronal.
Periodo de tiempo: 5 años

Las anomalías en el comportamiento de las células diferenciadas en progenitores neuronales se identificarán mediante comparación con los controles, y se compararán teniendo en cuenta los diferentes fenotipos (TALS, RFMN, LWS y otra(s) patología(s) posiblemente identificada(s).

Consecuencias de las mutaciones RNU4ATAC sobre la capacidad de las células madre pluripotentes inducidas para diferenciarse hacia el linaje neuronal, medida por inmunocitoquímica

5 años

Colaboradores e Investigadores

Aquí es donde encontrará personas y organizaciones involucradas en este estudio.

Fechas de registro del estudio

Estas fechas rastrean el progreso del registro del estudio y los envíos de resultados resumidos a ClinicalTrials.gov. Los registros del estudio y los resultados informados son revisados ​​por la Biblioteca Nacional de Medicina (NLM) para asegurarse de que cumplan con los estándares de control de calidad específicos antes de publicarlos en el sitio web público.

Fechas importantes del estudio

Inicio del estudio (Actual)

27 de agosto de 2024

Finalización primaria (Estimado)

27 de agosto de 2029

Finalización del estudio (Estimado)

27 de agosto de 2029

Fechas de registro del estudio

Enviado por primera vez

31 de marzo de 2023

Primero enviado que cumplió con los criterios de control de calidad

26 de octubre de 2023

Publicado por primera vez (Actual)

1 de noviembre de 2023

Actualizaciones de registros de estudio

Última actualización publicada (Estimado)

9 de octubre de 2024

Última actualización enviada que cumplió con los criterios de control de calidad

8 de octubre de 2024

Última verificación

1 de octubre de 2024

Más información

Términos relacionados con este estudio

Plan de datos de participantes individuales (IPD)

¿Planea compartir datos de participantes individuales (IPD)?

NO

Información sobre medicamentos y dispositivos, documentos del estudio

Estudia un producto farmacéutico regulado por la FDA de EE. UU.

No

Estudia un producto de dispositivo regulado por la FDA de EE. UU.

No

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