이차성 부갑상선 기능항진증의 이질성을 밝히는 데 사용되는 단일 세포 서열 기술
본 프로젝트에서는 연구 요구사항에 맞는 사례를 선정하고, 이차성 부갑상선 기능항진증, 원발성 부갑상선 기능항진증 및 정상 인간 부갑상선 조직을 채취하여 단일 세포 전사 및 서열 분석 방법을 통해 각 그룹당 4가지 사례씩 총 3개 그룹으로 나누어 지도를 구축하고자 합니다. 인간 부갑상선 기능 유형에 대해 세포의 유전자 구조와 유전자 발현 상태를 밝히고, 2차 부갑상선 기능 항진증 세포의 발현 특성, 세포간 이질성, 세포 하위 집합의 이질성을 계층적으로 시각화하고, 단일 세포 지도를 그려 비교합니다. 그룹 간의 차이점. 이차성 부갑상선기능항진증의 발병기전을 탐색합니다.
이차성 부갑상선 기능항진증, 원발성 부갑상선 기능 항진증의 부갑상선 조직 및 사고로 얻은 정상 부갑상선 조직을 수집, 냉동 및 보존하고, 냉동 조직을 해동하여 단일 세포 현탁액을 제조하고 각 세포를 Mozhuo Genomics 시스템으로 특이적으로 표지한 후, 오일 분해, 중합효소 사슬 반응 증폭, 역전사를 통한 상보적 DNA 획득, 품질 검사를 통과한 상보적 DNA 라이브러리를 구축하여 고품질의 부갑상선 세포 데이터를 획득하였습니다. Cell Ranger, R Seurat 패키지 및 t-SNE 차원 축소 다이어그램을 사용하여 데이터의 차원을 줄이고 클러스터링하고 시각화했습니다.
부갑상선의 단일 세포 아틀라스를 구축하기 위해 연구자들은 유전자 발현 프로파일에 따라 유사한 세포의 클러스터 분석을 수행한 다음 t-SNE로 데이터를 시각화했습니다. 세포 클러스터링 결과에 따르면, 각 세포 클러스터에서 특이적이고 고도로 발현되는 유전자가 확인되었습니다. 랜드마크 유전자의 발현에 따라 세포 집단을 확인하고, 그룹 간 세포 유형 및 비율의 차이를 비교하였다.
연구 개요
연구 유형
등록 (추정된)
연락처 및 위치
연구 장소
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Beijing, 중국
- China and Japan Friendship Hospital
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참여기준
자격 기준
공부할 수 있는 나이
- 성인
- 고령자
건강한 자원 봉사자를 받아들입니다
샘플링 방법
연구 인구
설명
포함 기준:
- 수술적 치료를 받은 이차성 부갑상선 기능항진증 진단을 받은 연구 참가자
- 원발성 부갑상선 기능항진증 진단을 받고 수술적 치료를 받은 연구 참가자
- 사전 동의를 얻은 연구 참가자
제외 기준:
- 본태성 부갑상선 기능항진증이 있는 연구 참가자를 포함할 때 원발성 부갑상선 기능항진증과 같은 기타 비이차성 부갑상선 기능항진증 상태는 제외되었습니다.
- 본태성 부갑상선 기능항진증이 있는 연구 참가자를 포함할 때 이차성 부갑상선 기능항진증과 같은 기타 비원발성 부갑상선 기능항진증 상태는 제외되었습니다.
- 사전 동의 거부.
공부 계획
연구는 어떻게 설계됩니까?
디자인 세부사항
코호트 및 개입
그룹/코호트 |
개입 / 치료 |
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이차성 부갑상선 기능항진증
이차성 부갑상선기능항진증으로 진단된 환자
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단일 세포 시퀀싱 기술은 세포 간 이질성을 반영하여 개별 세포의 유전자 구조와 유전자 발현 상태를 밝힐 수 있습니다.
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원발성 부갑상선 기능항진증
원발성 부갑상선기능항진증으로 진단된 환자
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단일 세포 시퀀싱 기술은 세포 간 이질성을 반영하여 개별 세포의 유전자 구조와 유전자 발현 상태를 밝힐 수 있습니다.
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일반그룹
부갑상선 질환이 없는 사람에게서 채취한 다른 목 수술 중 우연히 얻은 부갑상선 조직입니다.
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단일 세포 시퀀싱 기술은 세포 간 이질성을 반영하여 개별 세포의 유전자 구조와 유전자 발현 상태를 밝힐 수 있습니다.
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연구는 무엇을 측정합니까?
주요 결과 측정
결과 측정 |
측정값 설명 |
기간 |
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단일 셀 아틀라스 구축
기간: 1년
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정상 부갑상선 기능항진증, 원발성 부갑상선 기능항진증, 이차성 부갑상선 기능항진증의 단일 세포 아틀라스가 구축되었습니다. 유전자 발현의 차이를 탐색하기 위해 차별 분석이 수행됩니다. 다음 단계는 케그를 수행하고 경로 정보를 분석하는 것입니다. 세포 집단은 집단 진행 중 세포 상태의 변화를 탐색하는 데 사용됩니다. 준시간적 분석은 세포 분화의 동적 궤적과 유전자 발현의 동적 과정을 묘사하도록 설계되었습니다. SCENIC은 유전자 공동 발현을 추론하기 위한 네트워크입니다. 조사관은 이를 구현하기 위해 R word의 CellRanger 및 Seurat 패키지와 같은 소프트웨어를 사용할 것입니다. |
1년
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공동 작업자 및 조사자
수사관
- 수석 연구원: Meng Yang, China-Japan Friendship Hospital
연구 기록 날짜
연구 주요 날짜
연구 시작 (실제)
기본 완료 (실제)
연구 완료 (추정된)
연구 등록 날짜
최초 제출
QC 기준을 충족하는 최초 제출
처음 게시됨 (실제)
연구 기록 업데이트
마지막 업데이트 게시됨 (실제)
QC 기준을 충족하는 마지막 업데이트 제출
마지막으로 확인됨
추가 정보
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