单细胞测序技术用于揭示继发性甲状旁腺功能亢进症的异质性
本项目拟选取符合研究要求的病例，取继发性甲状旁腺功能亢进症、原发性甲状旁腺功能亢进症和正常人甲状旁腺组织，共三组，每组4例，通过单细胞转录和测序的方法，构建图谱人类甲状旁腺功能类型分析，揭示细胞的基因结构和基因表达状态，对继发性甲状旁腺功能亢进细胞的表达特征、细胞间异质性、细胞亚群异质性进行分层可视化，绘制单细胞图谱，并进行比较群体之间的差异。 探讨继发性甲状旁腺功能亢进症的发病机制。
收集继发性甲状旁腺功能亢进症、原发性甲状旁腺功能亢进症的甲状旁腺组织和偶然获得的正常甲状旁腺组织，冷冻保存，冷冻组织解冻，制备单细胞悬液，每个细胞经墨卓基因组系统特异性标记，经破油、聚合酶链反应扩增、反转录获得互补DNA，构建通过质检的互补DNA文库，获得甲状旁腺细胞的高质量数据。 使用Cell Ranger、R Seurat包和t-SNE降维图对数据进行降维、聚类和可视化。
为了构建甲状旁腺的单细胞图谱，研究人员根据基因表达谱对相似细胞进行聚类分析，然后通过t-SNE将数据可视化。 根据细胞聚类的结果，鉴定出每个细胞簇中特异的、高表达的基因。 根据标志性基因的表达情况鉴定细胞群，并比较组间细胞类型和比例的差异。
研究概览
研究类型
注册 (估计的)
联系人和位置
学习地点
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Beijing、中国
- China and Japan Friendship Hospital
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参与标准
资格标准
适合学习的年龄
- 成人
- 年长者
接受健康志愿者
取样方法
研究人群
描述
纳入标准：
- 诊断为继发性甲状旁腺功能亢进症并接受手术治疗的研究参与者
- 诊断为原发性甲状旁腺功能亢进症并接受手术治疗的研究参与者
- 已获得知情同意的研究参与者
排除标准：
- 在纳入患有原发性甲状旁腺功能亢进症的研究参与者时，排除了其他非继发性甲状旁腺功能亢进症，例如原发性甲状旁腺功能亢进症。
- 在纳入患有原发性甲状旁腺功能亢进症的研究参与者时，排除了其他非原发性甲状旁腺功能亢进症，例如继发性甲状旁腺功能亢进症。
- 拒绝知情同意。
学习计划
研究是如何设计的？
设计细节
队列和干预
团体/队列 |
干预/治疗 |
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继发性甲状旁腺功能亢进症
被诊断为继发性甲状旁腺功能亢进症的患者
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单细胞测序技术可以揭示单个细胞的基因结构和基因表达状态，反映细胞之间的异质性。
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原发性甲状旁腺功能亢进症
被诊断为原发性甲状旁腺功能亢进症的患者
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单细胞测序技术可以揭示单个细胞的基因结构和基因表达状态，反映细胞之间的异质性。
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正常组
在其他颈部手术中偶然获得的甲状旁腺组织，来自没有甲状旁腺疾病的人。
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单细胞测序技术可以揭示单个细胞的基因结构和基因表达状态，反映细胞之间的异质性。
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研究衡量的是什么？
主要结果指标
结果测量 |
措施说明 |
大体时间 |
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构建单细胞图谱
大体时间：一年
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构建了正常甲状旁腺、原发性甲状旁腺功能亢进症和继发性甲状旁腺功能亢进症的单细胞图谱。 进行差异分析以探索基因表达的差异。 下一步是执行 kegg 并分析路径信息。 细胞群用于探索细胞群进展过程中细胞状态的变化。 准时间分析旨在描绘细胞分化的动态轨迹和基因表达的动态过程。 SCENIC 是一个用于推断基因共表达的网络。 研究人员将使用 CellRanger 和 R word 中的 Seurat 包等软件来实现这一点。 |
一年
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合作者和调查者
调查人员
- 首席研究员：Meng Yang、China-Japan Friendship Hospital
研究记录日期
研究主要日期
学习开始 (实际的)
初级完成 (实际的)
研究完成 (估计的)
研究注册日期
首次提交
首先提交符合 QC 标准的
首次发布 (实际的)
研究记录更新
最后更新发布 (实际的)
上次提交的符合 QC 标准的更新
最后验证
更多信息
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