Encellet sekvensteknologi brukt til å avsløre heterogenitet av sekundær hyperparatyreoidisme

Dette prosjektet har til hensikt å velge ut tilfeller som oppfyller forskningskravene, ta sekundær hyperparatyreoidisme, primær hyperparathyroidisme og normalt humant parathyroidvev, totalt tre grupper, 4 tilfeller i hver gruppe, gjennom metoden for enkeltcelle transkripsjon og sekvensering, konstruere et kart av humane biskjoldbruskkjertelfunksjonstyper, avsløre genstrukturen og genekspresjonsstatusen til celler, og visualisere ekspresjonskarakteristikkene, intercellulær heterogenitet og heterogenitet til celleundergrupper av sekundære hyperparatyreoideaceller på en hierarkisk måte, tegne et enkeltcellekart og sammenligne forskjeller mellom grupper. Å utforske patogenesen til sekundær hyperparatyreoidisme.

Sekundær hyperparathyroidisme, parathyroidvev av primær hyperparathyroidisme og normalt parathyroidvev oppnådd ved et uhell ble samlet, frosset og konservert, frosset vev tint, encellesuspensjon ble forberedt og hver celle ble spesifikt merket av Mozhuo Genomics-systemet, etter oljebrudd, polymerasekjede reaksjonsforsterkning, revers transkripsjon for å oppnå komplementært DNA, og et bibliotek med komplementært DNA som bestod kvalitetsinspeksjon ble konstruert for å oppnå høykvalitetsdata for parathyroidceller. Cell Ranger, R Seurat-pakken og t-SNE-dimensjonalitetsreduksjonsdiagram ble brukt for å redusere dimensjonaliteten, klynge og visualisere dataene.

For å konstruere et encellet atlas av biskjoldbruskkjertler, utførte etterforskere klyngeanalyse av lignende celler i henhold til genekspresjonsprofilen, og deretter visualiserte dataene ved t-SNE. I henhold til resultatene av celleklynge ble de spesifikke og høyt uttrykte genene i hver celleklynge identifisert. Cellepopulasjoner ble identifisert i henhold til uttrykket av landemerkegener, og forskjellene i celletyper og proporsjoner mellom grupper ble sammenlignet.