Yksisoluinen sekvenssitekniikka, jota käytetään paljastamaan sekundaarisen hyperparatyreoosin heterogeenisyys
Tässä hankkeessa on tarkoitus valita yksisoluisen transkription ja sekvensoinnin menetelmällä tapaukset, jotka täyttävät tutkimusvaatimukset, ottaa sekundäärinen lisäkilpirauhasen liikatoiminta, primaarinen lisäkilpirauhasen liikatoiminta ja normaali ihmisen lisäkilpirauhaskudos, yhteensä kolme ryhmää, 4 tapausta kussakin ryhmässä, yksisoluisen transkription ja sekvensoinnin avulla. ihmisen lisäkilpirauhasen toimintatyypeistä, paljastaa solujen geenirakenteen ja geeniekspression tilan ja visualisoida sekundaaristen lisäkilpirauhasen solujen ilmentymisominaisuudet, solujen välisen heterogeenisyyden ja solualaryhmien heterogeenisyyden hierarkkisella tavalla, piirtää yksisolukartan ja vertailla eroja ryhmien välillä. Sekundaarisen hyperparatyreoosin patogeneesin tutkiminen.
Sekundaarinen hyperparatyreoosi, primaarisen hyperparatyreoosin lisäkilpirauhaskudos ja vahingossa saatu normaali lisäkilpirauhaskudos kerättiin, pakastettiin ja säilöttiin, pakastettu kudos sulatettiin, valmistettiin yksisolususpensio ja jokainen solu merkittiin erityisesti Mozhuo Genomics -järjestelmällä öljyn rikkomisen jälkeen, polymeraasiketju reaktion monistus, käänteistranskriptio komplementaarisen DNA:n saamiseksi ja komplementaarisen DNA:n kirjasto, joka läpäisi laaduntarkastuksen, rakennettiin korkealaatuisten lisäkilpirauhassolujen tietojen saamiseksi. Cell Ranger -pakettia, R Seurat -pakettia ja t-SNE-ulottuvuuden vähennyskaaviota käytettiin mittasuhteiden vähentämiseen, klusteriin ja tietojen visualisointiin.
Rakentaakseen yksisoluisen lisäkilpirauhaskartan tutkijat suorittivat samankaltaisten solujen klusterianalyysin geeniekspressioprofiilin mukaan ja visualisoivat sitten tiedot t-SNE:llä. Soluklusteroinnin tulosten perusteella tunnistettiin kunkin soluklusterin spesifiset ja voimakkaasti ilmentyneet geenit. Solupopulaatiot tunnistettiin maamerkkigeenien ilmentymisen perusteella ja verrattiin solutyyppien ja ryhmien välisiä suhteita.
Tutkimuksen yleiskatsaus
Tila
Interventio / Hoito
Opintotyyppi
Ilmoittautuminen (Arvioitu)
Yhteystiedot ja paikat
Opiskelupaikat
-
-
-
Beijing, Kiina
- China and Japan Friendship Hospital
-
-
Osallistumiskriteerit
Kelpoisuusvaatimukset
Opintokelpoiset iät
- Aikuinen
- Vanhempi Aikuinen
Hyväksyy terveitä vapaaehtoisia
Näytteenottomenetelmä
Tutkimusväestö
Kuvaus
Sisällyttämiskriteerit:
- Tutkimukseen osallistuneet, joilla oli diagnosoitu sekundaarinen hyperparatyreoosi ja joille tehtiin kirurginen hoito
- Tutkimukseen osallistuneet, joilla oli diagnosoitu primaarinen hyperparatyreoosi ja joille tehtiin kirurginen hoito
- Tutkimukseen osallistuneet, jotka ovat saaneet tietoisen suostumuksen
Poissulkemiskriteerit:
- Muut ei-sekundaariset hyperparatyreoositilat, kuten primaarinen hyperparatyreoosi, suljettiin pois, kun tutkimukseen osallistujat, joilla oli essentiaalinen hyperparatyreoosi, otettiin mukaan.
- Muut ei-primaariset hyperparatyreoositilat, kuten sekundaarinen hyperparatyreoosi, suljettiin pois, kun tutkimukseen osallistujat, joilla oli essentiaalinen hyperparatyreoosi, otettiin mukaan.
- Tietoon perustuvan suostumuksen epääminen.
Opintosuunnitelma
Miten tutkimus on suunniteltu?
Suunnittelun yksityiskohdat
Kohortit ja interventiot
Ryhmä/Kohortti |
Interventio / Hoito |
|---|---|
|
Toissijainen hyperparatyreoosi
Potilaat, joilla on diagnosoitu sekundaarinen hyperparatyreoosi
|
Yksisoluinen sekvensointitekniikka voi paljastaa yksittäisten solujen geenirakenteen ja geeniekspression tilan, mikä heijastaa solujen välistä heterogeenisyyttä.
|
|
Primaarinen hyperparatyreoosi
Potilaat, joilla on diagnosoitu primaarinen hyperparatyreoosi
|
Yksisoluinen sekvensointitekniikka voi paljastaa yksittäisten solujen geenirakenteen ja geeniekspression tilan, mikä heijastaa solujen välistä heterogeenisyyttä.
|
|
Normaali ryhmä
Lisäkilpirauhaskudos, joka on saatu satunnaisesti muiden kaulaleikkausten aikana, peräisin ihmisiltä, joilla ei ole lisäkilpirauhasen sairautta.
|
Yksisoluinen sekvensointitekniikka voi paljastaa yksittäisten solujen geenirakenteen ja geeniekspression tilan, mikä heijastaa solujen välistä heterogeenisyyttä.
|
Mitä tutkimuksessa mitataan?
Ensisijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
Rakenna yksisoluinen atlas
Aikaikkuna: Yksi vuosi
|
Yksisoluinen kartasto normaalista lisäkilpirauhasesta, primaarisesta hyperparatyreoosista ja sekundaarisesta hyperparatyreoosista rakennettiin. Differentiaalianalyysi suoritetaan geeniekspression erojen tutkimiseksi. Seuraava vaihe on suorittaa kegg ja analysoida reittitiedot. Solupopulaatioita käytetään solujen tilan muutosten tutkimiseen populaation etenemisen aikana. Kvasi-ajallinen analyysi on suunniteltu rajaamaan solujen erilaistumisen dynaamista kehityskulkua ja geenien ilmentymisen dynaamista prosessia. SCENIC on verkosto geenien yhteisilmentymisen päättelemiseksi. Tutkijat käyttävät tämän toteuttamiseen ohjelmistoja, kuten CellRanger ja Seurat-paketti R-sanalla. |
Yksi vuosi
|
Yhteistyökumppanit ja tutkijat
Sponsori
Tutkijat
- Päätutkija: Meng Yang, China-Japan Friendship Hospital
Opintojen ennätyspäivät
Opi tärkeimmät päivämäärät
Opiskelun aloitus (Todellinen)
Ensisijainen valmistuminen (Todellinen)
Opintojen valmistuminen (Arvioitu)
Opintoihin ilmoittautumispäivät
Ensimmäinen lähetetty
Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit
Ensimmäinen Lähetetty (Todellinen)
Tutkimustietojen päivitykset
Viimeisin päivitys julkaistu (Todellinen)
Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit
Viimeksi vahvistettu
Lisää tietoa
Tähän tutkimukseen liittyvät termit
Muita asiaankuuluvia MeSH-ehtoja
Muut tutkimustunnusnumerot
- 2023-NHLHCRF-YYPPLC-ZR-08
Yksittäisten osallistujien tietojen suunnitelma (IPD)
Aiotko jakaa yksittäisten osallistujien tietoja (IPD)?
Lääke- ja laitetiedot, tutkimusasiakirjat
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää lääkevalmistetta
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää laitetuotetta
Yhdysvalloissa valmistettu ja sieltä viety tuote
Nämä tiedot haettiin suoraan verkkosivustolta clinicaltrials.gov ilman muutoksia. Jos sinulla on pyyntöjä muuttaa, poistaa tai päivittää tutkimustietojasi, ota yhteyttä register@clinicaltrials.gov. Heti kun muutos on otettu käyttöön osoitteessa clinicaltrials.gov, se päivitetään automaattisesti myös verkkosivustollemme .