매우 긴 읽기 시퀀싱을 통해 까다로운 진단 해결 (SCHeDULeRS)

ONT(Oxford Nanopore Technology)를 적용한 LRS의 진단 성능은 실시간 표적 접근 방식과 매우 긴 판독 생성을 통해 현재 진단이 어려운 유전 질환의 병원성 변이체 식별에 평가됩니다. 유사유전자의 존재(1) 및 임상적 중요성의 정의를 위해 aCGH에 의해 식별된 SV 중단점의 정확한 매핑(2).

1. 분자 진단이 확립된 환자는 다음 각 질환에 대해 수집됩니다: 상염색체 우성 다낭성 신장 질환(ADPKD)이 있는 환자 10명, CYP21 결핍이 있는 환자 10명. 결과 도달 시간 및 정확한 분자 특성 분석 측면에서 가능한 ONT 개선을 테스트하기 위한 모호한 결과가 있는 사례가 포함됩니다. 가능한 모든 유형의 변경(미스센스, 넌센스, 삽입 삭제, 엑소닉 및 유전자 삭제)을 전 세계적으로 포괄하는 각 원인 유전자(각각 PKD1 및 CYP21A2)에 영향을 미치는 돌연변이의 전체 범위가 포함됩니다.
2. 관찰된 임상 사진의 원인이 될 수 있는 질병 유전자에 가까운 aCGH 정의 중단점 매핑을 갖춘 카피 수 변이체(CNV)를 보유한 다른 10명의 환자 모음입니다.

이 제안의 주요 목적은 정확한 분자 진단이 종종 불가능하거나 어렵고 현재 유전자 검사로 극도로 시간이 많이 걸리는 상황에서 임상 유전체학 루틴에서 직면한 진단 문제를 해결하는 데 있어 ONT 효능을 평가하는 것입니다. Sanger 시퀀싱, NGS 패널 및 MLPA는 많은 단일 유전자 장애를 담당하는 병원성 변이체 및 CNV를 식별하고 특정 임상 용의자가 없는 고립성 또는 증후군성 지적 장애가 있는 aCGH 환자를 통한 분석에 일상적으로 사용됩니다. 이러한 분석은 시간이 많이 걸리고, 기술적으로 힘들며, 기술적 한계로 인해 모호한 결과가 발생하고 확실한 진단이 불가능할 수 있으므로 개별적으로 결론을 내리지 못하는 경우가 많습니다. 그 의도는 시퀀싱 중에 임상적으로 관련된 영역의 적용 범위를 늘리기 위한 실시간 표적 접근 방식을 통해 ONT가 신속성과 민감도 측면에서 현재 진단 도구를 능가하여 진단 프로세스의 효율성을 상당히 향상시킨다는 것을 입증하는 것입니다. 제안된 표적 ONT 접근법의 성공은 우리 연구실에서 이미 연구된 광범위한 장애의 진단을 위해 이 전략을 구현하기 위한 원칙의 증거를 제공할 것입니다.