- ICH GCP
- 미국 임상 시험 레지스트리
- 임상시험 NCT07366554
한국인의 대장 선종에 대한 후성유전적 요인
한국인 대장 선종의 후성유전적 요인 탐구
이 연구는 한국 인구에서 대장선종(CRA)과 관련된 후성유전학적 요인을 탐구하는 것을 목표로 합니다. CRA는 선종-암종 순서에서 중요한 전암성 병변이며, 메틸화된 유전자 마커를 식별하는 것은 대장암(CRC)의 조기 발견 및 위험 분류를 개선할 수 있습니다.
대장경 용종절제술을 받는 총 32명의 환자가 등록될 예정입니다. 선종성 조직과 인접한 정상 조직을 채취하여 디옥시리보핵산(DNA) 추출 및 바이설파이트 전환을 수행할 것입니다. 정량적 메틸화 특이적 중합효소 연쇄 반응(qMSP)과 생어 시퀀싱을 사용하여 후보 유전자(SFRP2, TFPI2, SEPT9, SDC2)의 메틸화 상태를 평가할 것입니다. 대변 샘플은 또한 전체 유전체 시퀀싱(WGS)을 통해 분석되어 미생물군 및 유전자 프로파일을 평가할 것입니다.
이 연구는 이러한 유전자의 메틸화 수준이 정상 점막에 비해 선종 조직에서 유의미하게 상승하는지 확인함으로써, 대장 신생물 감시 및 맞춤형 대장경 추적 관찰 간격을 위한 잠재적 생체 표지자를 식별하고자 합니다.
연구 개요
상태
정황
상세 설명
대장암(CRC)은 한국에서 가장 흔한 악성 종양 중 하나로, 국가 암 발생 통계에서 두 번째로 높은 순위를 차지합니다. 대부분의 대장암은 선종-암종 순서를 통해 발생하며, 이 과정에서 후성유전학적 및 유전학적 변화가 중요한 역할을 합니다. 대장 선종에서 메틸화된 유전자 표지자를 식별하는 것은 초기 발암 기전에 대한 통찰력을 제공하고, 폴립 절제 후 보다 개인화된 감시 전략을 가능하게 할 수 있습니다.
이 연구는 한국 환자의 대장 선종과 관련된 후성유전학적 요인, 특히 DNA 메틸화 패턴을 탐구하는 데 중점을 둡니다. 대장경 폴립 절제술을 받는 총 32명의 참가자를 모집할 예정입니다. 각 참가자로부터 선종 조직과 인접한 정상 점막(약 5mm 크기)을 수집할 것입니다. 대변 샘플도 미생물 군집 및 유전체 분석을 위해 얻을 것입니다.
조직 및 대변 샘플에서 추출한 DNA는 EZ DNA 메틸화-골드 키트(Zymo Research)를 사용하여 중아황산염 전환을 거칩니다. 양적 메틸화 특이적 중합효소 연쇄 반응(qMSP)을 수행하여, 이전에 대장 신생물 바이오마커로서 잠재력을 보여준 네 가지 후보 유전자-SFRP2(분비 프리즐드 관련 단백질 2), TFPI2(조직 인자 경로 억제제 2), SEPT9(세프틴 9), SDC2(신데칸 2)-의 프로모터 메틸화 수준을 평가할 것입니다. 선택된 샘플은 또한 CpG 수준의 메틸화 프로파일링을 위해 생어 염기서열 분석을 거칠 것입니다. 대변 DNA는 일루미나 NovaSeq 6000 플랫폼에서 전체 유전체 시퀀싱(WGS)을 통해 분석되어 미생물 구성 및 유전적 배경을 평가할 것입니다.
메틸화 지수(MtI) 및 메틸화 기준 백분율(PMR) 값을 계산하고 선종과 인접 정상 조직 사이에서 비교할 것입니다. 수신자 조작 특성(ROC) 곡선 분석을 통해 각 유전자가 잠재적 바이오마커로서의 민감도와 특이도를 결정할 것입니다.
선종 조직에서 유의미하게 상향 조절되는 메틸화 유전자를 식별함으로써, 이 연구는 대장 선종의 재발 또는 악성 변형을 예측하기 위한 후보 후성유전학적 표지자를 제안하는 것을 목표로 합니다. 연구 결과는 폴립 절제 후 감시 간격을 정교화하고 대장암의 정밀 예방 전략을 지원하는 데 기여할 수 있습니다.
연구 유형
등록 (추정된)
연락처 및 위치
연구 연락처
- 이름: OneJoong KIM, M.D.
- 전화번호: 82+010+2111+0415
- 이메일: biblian@chamc.co.kr
연구 장소
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Gyeonggi-do
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Seongnam-si, Gyeonggi-do, 대한민국, 13496
- Bundang CHA Hospital
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연락하다:
- KIM OneJoong
- 전화번호: 01021115353
- 이메일: biblian@chamc.co.kr
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참여기준
자격 기준
공부할 수 있는 나이
- 성인
- 고령자
건강한 자원 봉사자를 받아들입니다
샘플링 방법
연구 인구
설명
포함 기준:
19-85세 성인.
대장 선종에 대한 대장경적 용종 절제술을 시행받는 환자.
연구 목적을 이해하고 서면 동의서를 작성할 수 있는 자.
선종 및 인접 정상 점막 샘플링에 충분한 조직이 확보된 경우.
제외 기준:
대장암, 염증성 장질환 또는 유전성 대장암 증후군(예: 가족성 선종성 용종증, 린치 증후군)의 병력.
해부학적 구조나 병리를 변경할 수 있는 과거 대장 수술 이력.
불충분한 샘플 품질 또는 DNA 추출 실패.
동의서 거부 또는 철회.
연구자의 판단에 따라 참여가 부적절한 중증 동반 질환.
공부 계획
연구는 어떻게 설계됩니까?
디자인 세부사항
코호트 및 개입
그룹/코호트 |
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대장 선종 그룹
대장선종을 위한 대장경 폴립 절제술을 받는 참가자.
메틸화 및 시퀀싱 분석을 위해 선종 조직과 인접한 정상 점막을 수집합니다.
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연구는 무엇을 측정합니까?
주요 결과 측정
결과 측정 |
측정값 설명 |
기간 |
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대장 조직에서의 SFRP2 메틸화 지수
기간: 기준선 (단일 시점)]
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선종성 대장 조직과 인접한 정상 대장 조직에서의 DNA 메틸화 수준의 정량적 평가.
메틸화 수준은 정량적 메틸화 특이적 PCR(qMSP)을 사용하여 측정되며, 메틸화 지수(MtI, %)로 표시됩니다.
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기준선 (단일 시점)]
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대장 조직에서 TFPI2의 메틸화 지수
기간: 기준선 (단일 시점)]
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선종성 대장직장 조직과 인접한 정상 대장직장 조직에서의 DNA 메틸화 수준 정량적 평가.
메틸화 수준은 정량적 메틸화 특이적 PCR(qMSP)을 사용하여 결정되며 메틸화 지수(MtI, %)로 표시됩니다.
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기준선 (단일 시점)]
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대장 조직에서 SEPT9의 메틸화 지수
기간: Baseline (Single Time Point)]
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선종성 대장직장 조직과 인접한 정상 대장직장 조직에서의 DNA 메틸화 수준의 정량적 평가.
메틸화 수준은 정량적 메틸화 특이적 PCR(qMSP)을 사용하여 측정되며, 메틸화 지수(MtI, %)로 표시됩니다.
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Baseline (Single Time Point)]
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대장 조직에서 SDC2의 메틸화 지수
기간: 기준선 (단일 시점)]
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선종성 대장 조직과 인접한 정상 대장 조직에서 DNA 메틸화 수준의 정량적 평가.
메틸화 수준은 정량적 메틸화 특이적 PCR(qMSP)을 사용하여 측정하고 메틸화 지수(MtI, %)로 표현됩니다.
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기준선 (단일 시점)]
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2차 결과 측정
결과 측정 |
측정값 설명 |
기간 |
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선종 검출을 위한 메틸화된 SFRP2의 민감도 및 특이도
기간: 기준선 (단일 시점)
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수신자 조작 특성(ROC) 곡선 분석을 통해 메틸화된 SFRP2가 선종 조직과 정상 조직을 구분하는 진단 성능을 평가하는 데 사용됩니다.
qMSP에서 도출된 메틸화 참조 백분율(PMR) 값은 그룹 간에 비교됩니다. |
기준선 (단일 시점)
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선종 검출을 위한 메틸화된 TFPI2의 민감도 및 특이도
기간: 기준선 (단일 시점)
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수신자 조작 특성(ROC) 곡선 분석은 선종 조직과 정상 조직을 구별하기 위한 메틸화된 TFPI2의 진단 성능을 평가하는 데 사용됩니다.
qMSP에서 도출된 메틸화된 기준 백분율(PMR) 값은 그룹 간에 비교됩니다.
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기준선 (단일 시점)
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선종 검출을 위한 메틸화된 SEPT9의 민감도와 특이도
기간: 기준선 (단일 시점)
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수신자 조작 특성(ROC) 곡선 분석은 선종 조직과 정상 조직을 구별하는 데 있어 메틸화된 SEPT9의 진단 성능을 평가하는 데 사용됩니다.
qMSP에서 도출된 메틸화된 참조(PMR) 값의 백분율을 그룹 간에 비교합니다.
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기준선 (단일 시점)
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선종 검출을 위한 메틸화된 SDC2의 민감도와 특이도
기간: 기준선 (단일 시점)
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수신자 조작 특성(ROC) 곡선 분석은 정상 조직과 선종 조직을 구분하는 데 있어 메틸화된 SDC2의 진단 성능을 평가하는 데 사용됩니다.
qMSP에서 도출된 메틸화된 기준 백분율(PMR) 값이 그룹 간에 비교됩니다.
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기준선 (단일 시점)
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공동 작업자 및 조사자
연구 기록 날짜
연구 주요 날짜
연구 시작 (추정된)
기본 완료 (추정된)
연구 완료 (추정된)
연구 등록 날짜
최초 제출
QC 기준을 충족하는 최초 제출
처음 게시됨 (실제)
연구 기록 업데이트
마지막 업데이트 게시됨 (실제)
QC 기준을 충족하는 마지막 업데이트 제출
마지막으로 확인됨
추가 정보
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