Epigenetyczne czynniki gruczolaka jelita grubego u Koreańczyków
Badanie czynników epigenetycznych gruczolaka jelita grubego u Koreańczyków
To badanie ma na celu zbadanie czynników epigenetycznych związanych z gruczolakiem jelita grubego (CRA) w populacji koreańskiej. CRA jest kluczową zmianą przednowotworową w sekwencji gruczolak–rak, a identyfikacja metylowanych markerów genetycznych może poprawić wczesne wykrywanie i stratyfikację ryzyka raka jelita grubego (CRC).
W badaniu weźmie udział łącznie 32 pacjentów poddawanych kolonoskopowej polipektomii. Zostaną pobrane tkanki gruczolakowe i przyległe tkanki prawidłowe w celu ekstrakcji kwasu deoksyrybonukleinowego (DNA) i konwersji bisulfitowej. Do oceny stanu metylacji genów kandydackich (SFRP2, TFPI2, SEPT9 i SDC2) zostaną wykorzystane ilościowa reakcja łańcuchowa polimerazy specyficzna dla metylacji (qMSP) oraz sekwencjonowanie Sangera. Próbki kału zostaną również przeanalizowane za pomocą sekwencjonowania całego genomu (WGS) w celu oceny profilu mikrobiomu i profilu genetycznego.
Badanie ma na celu ustalenie, czy poziomy metylacji tych genów są istotnie podwyższone w tkance gruczolaka w porównaniu z prawidłową błoną śluzową, identyfikując w ten sposób potencjalne biomarkery do nadzoru nad nowotworami jelita grubego i personalizowania odstępów między kolonoskopiami kontrolnymi.
Przegląd badań
Status
Szczegółowy opis
Rak jelita grubego (CRC) jest jednym z najczęstszych nowotworów złośliwych w Korei, zajmując drugie miejsce w krajowych statystykach zachorowalności na raka. Większość przypadków CRC rozwija się w wyniku sekwencji gruczolak-rak, w której kluczową rolę odgrywają zmiany epigenetyczne i genetyczne. Identyfikacja zmetylowanych markerów genetycznych w gruczolaku jelita grubego może dostarczyć informacji na temat wczesnych mechanizmów kancerogenezy i umożliwić bardziej spersonalizowane strategie nadzoru po polipektomii.
Niniejsze badanie koncentruje się na zbadaniu czynników epigenetycznych – w szczególności wzorców metylacji DNA – związanych z gruczolakiem jelita grubego u koreańskich pacjentów. Zostanie zrekrutowanych łącznie 32 uczestników poddawanych kolonoskopowej polipektomii. Od każdego uczestnika zostanie pobrana zarówno tkanka gruczolakowata, jak i sąsiadująca prawidłowa błona śluzowa (o wielkości około 5 milimetrów (mm)). Próbki stolca również zostaną pobrane do analizy mikrobiomu i genomowej.
DNA wyizolowane z tkanek i próbek stolca zostanie poddane konwersji bisulfitowej przy użyciu zestawu EZ DNA Methylation-Gold Kit (Zymo Research). Ilościowa metylospecyficzna reakcja łańcuchowa polimerazy (qMSP) zostanie przeprowadzona w celu oceny poziomów metylacji promotorów czterech genów kandydackich – SFRP2 (Secreted Frizzled Related Protein 2), TFPI2 (Tissue Factor Pathway Inhibitor 2), SEPT9 (Septin 9) i SDC2 (Syndecan 2) – które wcześniej wykazały potencjał jako biomarkery nowotworów jelita grubego. Wybrane próbki zostaną również poddane sekwencjonowaniu metodą Sangera w celu profilowania metylacji na poziomie CpG. DNA ze stolca zostanie przeanalizowane za pomocą sekwencjonowania całego genomu (WGS) na platformie Illumina NovaSeq 6000 w celu oceny składu mikrobiomu i kontekstu genetycznego.
Indeksy metylacji (MtI) i wartości procentowego udziału metylowanego odniesienia (PMR) zostaną obliczone i porównane między tkanką gruczolakowatą a sąsiadującą prawidłową tkanką. Analiza krzywej ROC (Receiver Operating Characteristic) określi czułość i specyficzność każdego genu jako potencjalnego biomarkera.
Poprzez identyfikację zmetylowanych genów, które są istotnie nadeksprymowane w tkankach gruczolakowatych, niniejsze badanie ma na celu zaproponowanie kandydackich markerów epigenetycznych do przewidywania nawrotu lub złośliwej transformacji gruczolaka jelita grubego. Odkrycia te mogą przyczynić się do udoskonalenia odstępów nadzoru po polipektomii oraz wsparcia precyzyjnych strategii prewencji w CRC.
Typ studiów
Zapisy (Szacowany)
Kontakty i lokalizacje
Kontakt w sprawie studiów
- Nazwa: OneJoong KIM, M.D.
- Numer telefonu: 82+010+2111+0415
- E-mail: biblian@chamc.co.kr
Lokalizacje studiów
-
-
Gyeonggi-do
-
Seongnam-si, Gyeonggi-do, Korea Południowa, 13496
- Bundang CHA Hospital
-
Kontakt:
- KIM OneJoong
- Numer telefonu: 01021115353
- E-mail: biblian@chamc.co.kr
-
-
Kryteria uczestnictwa
Kryteria kwalifikacji
Wiek uprawniający do nauki
- Dorosły
- Starszy dorosły
Akceptuje zdrowych ochotników
Metoda próbkowania
Badana populacja
Uczestnicy będą rekrutowani kolejno spośród osób, które wyrażą pisemną świadomą zgodę na pobranie tkanek gruczolakowatych i przyległych tkanek prawidłowych.
Populacja badana obejmuje osoby dorosłe w wieku 19-85 lat, które są klinicznie kwalifikowane do kolonoskopii i pobierania próbek tkanek.
Opis
Kryteria włączenia:
Dorośli w wieku 19-85 lat.
Przeprowadzenie polipektomii kolonoskopowej z powodu gruczolaka jelita grubego.
Zdolność do zrozumienia celu badania i udzielenia pisemnej świadomej zgody.
Dostępność odpowiedniej tkanki do pobrania próbek zarówno z gruczolaka, jak i przyległej zdrowej błony śluzowej.
Kryteria wykluczenia:
Wywiad raka jelita grubego, choroby zapalnej jelit lub dziedzicznego zespołu raka jelita grubego (np. FAP, zespół Lyncha).
Wcześniejsza operacja jelita grubego, która może zmienić anatomię lub patologię.
Niewystarczająca jakość próbki lub niepowodzenie ekstrakcji DNA.
Odmowa lub wycofanie świadomej zgody.
Poważne choroby współistniejące, które według uznania badacza czynią udział nieodpowiednim.
Plan studiów
Jak projektuje się badanie?
Szczegóły projektu
Kohorty i interwencje
Grupa / Kohorta |
|---|
|
Grupa Gruczolaków Jelita Grubego
Uczestnicy poddawani polipektomii kolonoskopowej z powodu gruczolaka jelita grubego.
Tkanka gruczolakowata i przyległa prawidłowa błona śluzowa zostaną pobrane do analizy metylacji i sekwencjonowania. |
Co mierzy badanie?
Podstawowe miary wyniku
Miara wyniku |
Opis środka |
Ramy czasowe |
|---|---|---|
|
Indeks metylacji SFRP2 w tkance jelita grubego
Ramy czasowe: Baseline (Pojedynczy Punkt Czasowy)]
|
Ilościowa ocena poziomów metylacji DNA w tkankach gruczolakowatych w porównaniu z sąsiadującymi prawidłowymi tkankami jelita grubego.
Poziomy metylacji będą określane za pomocą ilościowej reakcji łańcuchowej polimerazy specyficznej dla metylacji (qMSP) i wyrażane jako wskaźnik metylacji (MtI, %).
|
Baseline (Pojedynczy Punkt Czasowy)]
|
|
Wskaźnik metylacji TFPI2 w tkance jelita grubego
Ramy czasowe: Punkt wyjściowy (Pojedynczy punkt czasowy)]
|
Ilościowa ocena poziomów metylacji DNA w tkankach gruczolakowatych w porównaniu z sąsiadującymi prawidłowymi tkankami jelita grubego.
Poziomy metylacji będą określane za pomocą ilościowej reakcji PCR specyficznej dla metylacji (qMSP) i wyrażane jako indeks metylacji (MtI, %).
|
Punkt wyjściowy (Pojedynczy punkt czasowy)]
|
|
Indeks metylacji SEPT9 w tkance jelita grubego
Ramy czasowe: Punkt wyjściowy (pojedynczy punkt czasowy)]
|
Ilościowa ocena poziomów metylacji DNA w tkankach gruczolakowatych w porównaniu z sąsiadującymi prawidłowymi tkankami jelita grubego.
Poziomy metylacji zostaną określone przy użyciu ilościowej reakcji łańcuchowej polimerazy specyficznej dla metylacji (qMSP) i wyrażone jako wskaźnik metylacji (MtI, %).
|
Punkt wyjściowy (pojedynczy punkt czasowy)]
|
|
Indeks metylacji SDC2 w tkance jelita grubego
Ramy czasowe: Baseline (Single Time Point)]
|
Ilościowa ocena poziomów metylacji DNA w tkankach gruczolakowatych w porównaniu z sąsiadującymi prawidłowymi tkankami jelita grubego.
Poziomy metylacji zostaną określone przy użyciu ilościowej reakcji łańcuchowej polimerazy specyficznej dla metylacji (qMSP) i wyrażone jako wskaźnik metylacji (MtI, %).
|
Baseline (Single Time Point)]
|
Miary wyników drugorzędnych
Miara wyniku |
Opis środka |
Ramy czasowe |
|---|---|---|
|
Czułość i swoistość metylowanego SFRP2 w wykrywaniu gruczolaka
Ramy czasowe: Wartość wyjściowa (Pojedynczy punkt czasowy)
|
Analiza krzywej charakterystyki operacyjnej odbiornika (ROC) zostanie wykorzystana do oceny skuteczności diagnostycznej metylowanego SFRP2 w różnicowaniu tkanki gruczolakowatej od prawidłowej. Wartości procentu metylowanego odniesienia (PMR) uzyskane z qMSP zostaną porównane między grupami.
|
Wartość wyjściowa (Pojedynczy punkt czasowy)
|
|
Czułość i swoistość metylowanego TFPI2 w wykrywaniu gruczolaka
Ramy czasowe: Punkt wyjściowy (Pojedynczy punkt czasowy)
|
Analiza krzywej charakterystyki pracy odbiornika (ROC) zostanie zastosowana w celu oceny skuteczności diagnostycznej metylowanego TFPI2 w rozróżnianiu tkanki gruczolakowatej od prawidłowej.
Wartości procentowej metylacji referencyjnej (PMR) uzyskane metodą qMSP zostaną porównane między grupami.
|
Punkt wyjściowy (Pojedynczy punkt czasowy)
|
|
Czułość i swoistość metylowanego SEPT9 w wykrywaniu gruczolaka
Ramy czasowe: Linia bazowa (Pojedynczy punkt czasowy)
|
Analiza krzywej charakterystyki operacyjnej odbiornika (ROC) zostanie wykorzystana do oceny wydajności diagnostycznej metylowanego SEPT9 w różnicowaniu tkanki gruczolakowatej od prawidłowej.
Wartości procentu metylowanego odniesienia (PMR) uzyskane z qMSP zostaną porównane między grupami.
|
Linia bazowa (Pojedynczy punkt czasowy)
|
|
Czułość i swoistość metylowanego SDC2 w wykrywaniu gruczolaka
Ramy czasowe: Punkt wyjściowy (pojedynczy punkt czasowy)
|
Analiza krzywej charakterystyki operacyjnej odbiornika (ROC) zostanie wykorzystana do oceny wydajności diagnostycznej metylowanego SDC2 w odróżnianiu tkanki gruczolakowatej od normalnej.
Wartości procentowe metylowanego odniesienia (PMR) uzyskane z qMSP będą porównywane między grupami.
|
Punkt wyjściowy (pojedynczy punkt czasowy)
|
Współpracownicy i badacze
Sponsor
Daty zapisu na studia
Główne daty studiów
Rozpoczęcie studiów (Szacowany)
Zakończenie podstawowe (Szacowany)
Ukończenie studiów (Szacowany)
Daty rejestracji na studia
Pierwszy przesłany
Pierwszy przesłany, który spełnia kryteria kontroli jakości
Pierwszy wysłany (Rzeczywisty)
Aktualizacje rekordów badań
Ostatnia wysłana aktualizacja (Rzeczywisty)
Ostatnia przesłana aktualizacja, która spełniała kryteria kontroli jakości
Ostatnia weryfikacja
Więcej informacji
Terminy związane z tym badaniem
Słowa kluczowe
Inne numery identyfikacyjne badania
- CHAMC IRB 2025-05-034-004
Plan dla danych uczestnika indywidualnego (IPD)
Planujesz udostępniać dane poszczególnych uczestników (IPD)?
Informacje o lekach i urządzeniach, dokumenty badawcze
Bada produkt leczniczy regulowany przez amerykańską FDA
Bada produkt urządzenia regulowany przez amerykańską FDA
Te informacje zostały pobrane bezpośrednio ze strony internetowej clinicaltrials.gov bez żadnych zmian. Jeśli chcesz zmienić, usunąć lub zaktualizować dane swojego badania, skontaktuj się z register@clinicaltrials.gov. Gdy tylko zmiana zostanie wprowadzona na stronie clinicaltrials.gov, zostanie ona automatycznie zaktualizowana również na naszej stronie internetowej .
Badania kliniczne na Gruczolak jelita grubego
-
WAYCEN IncAktywny, nie rekrutującyRak | Gruczolak | Gruczolak jelita grubego | Hiperplastyczny polip | Siedząca ząbkowana zmiana | Nie-AdenomaKorea Południowa
-
Assistance Publique - Hôpitaux de ParisRekrutacyjnyNowotwór | Syndrom Lyncha | Mutacja MMR | Adenoma jelita cienkiego | Gruczolakorak jelita cienkiegoFrancja