Эпигенетические факторы колоректальной аденомы у корейцев
Исследование эпигенетических факторов колоректальной аденомы у корейцев
Данное исследование направлено на изучение эпигенетических факторов, связанных с колоректальной аденомой (КРА) в корейской популяции. КРА является ключевым предраковым поражением в последовательности аденома-карцинома, и выявление метилированных генетических маркеров может улучшить раннее выявление и стратификацию риска колоректального рака (КРР).
Всего будет включено 32 пациента, проходящих колоноскопическую полипэктомию. Аденоматозные и прилегающие нормальные ткани будут собраны для экстракции дезоксирибонуклеиновой кислоты (ДНК) и бисульфитной конверсии. Количественная метилирование-специфичная полимеразная цепная реакция (кМСПЦР) и секвенирование по Сэнгеру будут использованы для оценки статуса метилирования кандидатных генов (SFRP2, TFPI2, SEPT9 и SDC2). Образцы стула также будут проанализированы с помощью полногеномного секвенирования (ПГС) для оценки микробиома и генетических профилей.
Исследование стремится определить, значительно ли повышены уровни метилирования этих генов в ткани аденомы по сравнению с нормальной слизистой оболочкой, тем самым выявляя потенциальные биомаркеры для наблюдения за колоректальными неоплазиями и персонализированных интервалов последующего колоноскопического наблюдения.
Обзор исследования
Статус
Подробное описание
Колоректальный рак (КРР) является одним из наиболее распространенных злокачественных новообразований в Корее, занимая второе место в национальной статистике заболеваемости раком. Большинство случаев КРР развивается по аденома-карцинома последовательности, в которой эпигенетические и генетические изменения играют критическую роль. Выявление метилированных генетических маркеров в колоректальной аденоме может дать представление о ранних механизмах канцерогенеза и позволить разработать более индивидуализированные стратегии наблюдения после полипэктомии.
Данное исследование сосредоточено на изучении эпигенетических факторов, особенно паттернов метилирования ДНК, связанных с колоректальной аденомой у корейских пациентов. Всего будет набрано 32 участника, проходящих колоноскопическую полипэктомию. От каждого участника будут собраны как аденоматозная ткань, так и прилегающая нормальная слизистая оболочка (примерно 5 миллиметров (мм) в размере). Также будут получены образцы стула для анализа микробиома и генома.
ДНК, экстрагированная из тканей и образцов стула, пройдет бисульфитную конверсию с использованием набора EZ DNA Methylation-Gold Kit (Zymo Research). Будет проведена количественная метил-специфичная полимеразная цепная реакция (qMSP) для оценки уровня промоторного метилирования четырех генов-кандидатов — SFRP2 (секретируемый связанный с Frizzled белок 2), TFPI2 (ингибитор пути тканевого фактора 2), SEPT9 (септин 9) и SDC2 (синдecан 2), — которые ранее показали потенциал в качестве биомаркеров колоректальных неоплазий. Выбранные образцы также пройдут секвенирование по Сэнгеру для профилирования метилирования на уровне CpG. ДНК из стула будет проанализирована с помощью полногеномного секвенирования (WGS) на платформе Illumina NovaSeq 6000 для оценки микробного состава и генетического контекста.
Индексы метилирования (MtI) и процент метилированного референса (PMR) будут рассчитаны и сравнены между аденомой и прилегающими нормальными тканями. Анализ ROC-кривой определит чувствительность и специфичность каждого гена как потенциального биомаркера.
Путем выявления метилированных генов, значительно повышенных в аденоматозных тканях, данное исследование направлено на предложение кандидатных эпигенетических маркеров для прогнозирования рецидива или злокачественной трансформации колоректальной аденомы. Результаты могут способствовать уточнению интервалов наблюдения после полипэктомии и поддержке стратегий точной профилактики КРР.
Тип исследования
Регистрация (Оцененный)
Контакты и местонахождение
Контакты исследования
- Имя: OneJoong KIM, M.D.
- Номер телефона: 82+010+2111+0415
- Электронная почта: biblian@chamc.co.kr
Места учебы
-
-
Gyeonggi-do
-
Seongnam-si, Gyeonggi-do, Южная Корея, 13496
- Bundang CHA Hospital
-
Контакт:
- KIM OneJoong
- Номер телефона: 01021115353
- Электронная почта: biblian@chamc.co.kr
-
-
Критерии участия
Критерии приемлемости
Возраст, подходящий для обучения
- Взрослый
- Пожилой взрослый
Принимает здоровых добровольцев
Метод выборки
Исследуемая популяция
Описание
Критерии включения:
Взрослые в возрасте 19–85 лет.
Пациенты, проходящие колоноскопическую полипэктомию по поводу колоректальной аденомы.
Способность понять цель исследования и предоставить письменное информированное согласие.
Наличие достаточного количества ткани для забора образцов как аденомы, так и прилегающей нормальной слизистой оболочки.
Критерии исключения:
Наличие в анамнезе колоректального рака, воспалительных заболеваний кишечника или наследственных синдромов колоректального рака (например, САП, синдром Линча).
Предшествующие операции на толстой кишке, которые могут изменить анатомию или патологию.
Неудовлетворительное качество образца или неудача при экстракции ДНК.
Отказ или отзыв информированного согласия.
Тяжелые сопутствующие заболевания, делающие участие неприемлемым по усмотрению исследователя.
Учебный план
Как устроено исследование?
Детали дизайна
Когорты и вмешательства
Группа / когорта |
|---|
|
Группа колоректальной аденомы
Участники, проходящие колоноскопическую полипэктомию по поводу колоректальной аденомы.
Аденоматозная ткань и прилегающая нормальная слизистая оболочка будут собраны для метилирования и секвенирования.
|
Что измеряет исследование?
Первичные показатели результатов
Мера результата |
Мера Описание |
Временное ограничение |
|---|---|---|
|
Индекс метилирования SFRP2 в ткани толстой кишки
Временное ограничение: Базовый уровень (один момент времени)]
|
Количественная оценка уровней метилирования ДНК в аденоматозных тканях толстой кишки по сравнению с прилегающими нормальными тканями.
Уровни метилирования будут определяться с помощью количественной метилирование-специфичной ПЦР (qMSP) и выражаться в виде индекса метилирования (MtI, %).
|
Базовый уровень (один момент времени)]
|
|
Индекс метилирования TFPI2 в колоректальной ткани
Временное ограничение: Базовый уровень (однократная точка времени)]
|
Количественная оценка уровня метилирования ДНК в аденоматозных тканях толстой кишки по сравнению с прилегающими нормальными тканями.
Уровни метилирования будут определяться с помощью количественной метилирование-специфичной ПЦР (qMSP) и выражаться в виде индекса метилирования (MtI, %).
|
Базовый уровень (однократная точка времени)]
|
|
Индекс метилирования SEPT9 в колоректальной ткани
Временное ограничение: Базовый уровень (Единичный момент времени)]
|
Количественная оценка уровней метилирования ДНК в аденоматозных тканях толстой кишки по сравнению с прилегающими нормальными тканями.
Уровни метилирования будут определяться с помощью количественной метилирование-специфичной ПЦР (qMSP) и выражаться в виде индекса метилирования (MtI, %).
|
Базовый уровень (Единичный момент времени)]
|
|
Индекс метилирования SDC2 в ткани толстой кишки
Временное ограничение: Базовый уровень (единичная временная точка)]
|
Количественная оценка уровней метилирования ДНК в аденоматозных тканях толстой кишки по сравнению с прилежащими нормальными тканями.
Уровни метилирования будут определяться с помощью количественной метилирование-специфичной ПЦР (qMSP) и выражаться в виде индекса метилирования (MtI, %).
|
Базовый уровень (единичная временная точка)]
|
Вторичные показатели результатов
Мера результата |
Мера Описание |
Временное ограничение |
|---|---|---|
|
Чувствительность и специфичность метилированного SFRP2 для обнаружения аденомы
Временное ограничение: Базовый уровень (Единичный момент времени)
|
Анализ кривой рабочих характеристик приемника (ROC-кривой) будет использоваться для оценки диагностической эффективности метилированного SFRP2 в различении аденоматозной и нормальной ткани.
Процент метилированной референсной последовательности (PMR), полученный из qMSP, будет сравниваться между группами.
|
Базовый уровень (Единичный момент времени)
|
|
Чувствительность и специфичность метилированного TFPI2 для выявления аденомы
Временное ограничение: Базовый уровень (одна временная точка)
|
Для оценки диагностической эффективности метилированного TFPI2 в дифференциации аденоматозной ткани от нормальной будет использован анализ кривой рабочих характеристик приемника (ROC-кривой).
Процент метилированных референсных значений (PMR), полученных методом qMSP, будет сравниваться между группами.
|
Базовый уровень (одна временная точка)
|
|
Чувствительность и специфичность метилированного SEPT9 для выявления аденомы
Временное ограничение: Исходный уровень (единичная временная точка)
|
Анализ ROC-кривой (кривой рабочих характеристик приемника) будет использоваться для оценки диагностической эффективности метилированного гена SEPT9 в дифференциации аденоматозной ткани от нормальной.
Проценты метилирования референсных значений (PMR), полученные с помощью количественной MSP, будут сравниваться между группами.
|
Исходный уровень (единичная временная точка)
|
|
Чувствительность и специфичность метилированного SDC2 для обнаружения аденомы
Временное ограничение: Базовый уровень (Единичный момент времени)
|
Анализ кривой рабочих характеристик приемника (ROC-кривая) будет использоваться для оценки диагностической эффективности метилированного SDC2 в различении аденоматозной ткани от нормальной.
Процент метилирования референсного гена (PMR), полученный из qMSP, будет сравниваться между группами.
|
Базовый уровень (Единичный момент времени)
|
Соавторы и исследователи
Спонсор
Даты записи исследования
Изучение основных дат
Начало исследования (Оцененный)
Первичное завершение (Оцененный)
Завершение исследования (Оцененный)
Даты регистрации исследования
Первый отправленный
Впервые представлено, что соответствует критериям контроля качества
Первый опубликованный (Действительный)
Обновления учебных записей
Последнее опубликованное обновление (Действительный)
Последнее отправленное обновление, отвечающее критериям контроля качества
Последняя проверка
Дополнительная информация
Термины, связанные с этим исследованием
Ключевые слова
Другие идентификационные номера исследования
- CHAMC IRB 2025-05-034-004
Планирование данных отдельных участников (IPD)
Планируете делиться данными об отдельных участниках (IPD)?
Информация о лекарствах и устройствах, исследовательские документы
Изучает лекарственный продукт, регулируемый FDA США.
Изучает продукт устройства, регулируемый Управлением по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов США.
Эта информация была получена непосредственно с веб-сайта clinicaltrials.gov без каких-либо изменений. Если у вас есть запросы на изменение, удаление или обновление сведений об исследовании, обращайтесь по адресу register@clinicaltrials.gov. Как только изменение будет реализовано на clinicaltrials.gov, оно будет автоматически обновлено и на нашем веб-сайте. .