Korealaisen paksusuolen adenoman epigeneettiset tekijät
Korealaisen paksusuolen adenoman epigeneettisten tekijöiden tutkimus
Tämä tutkimus pyrkii tutkimaan epigeneettisiä tekijöitä, jotka liittyvät kolonadenoomiin (CRA) korealaisessa väestössä. CRA on keskeinen esikliininen muutos adenoomi-karsinoomasarjassa, ja metyloitujen geneettisten merkkiaineiden tunnistaminen voi parantaa paksusuolen syövän (CRC) varhaista havaitsemista ja riskiluokittelua.
Mukaan otetaan yhteensä 32 potilasta, jotka käyvät läpi kolonoskopisen polypektomian. Adenoomisesta ja viereisistä normaaleista kudoksista kerätään näytteet deoksiribonukleiinihapon (DNA) eristämistä ja bisulfiittimuuntamista varten. Kvantitatiivista metylointispesifistä polymeraasiketjureaktiota (qMSP) ja Sanger-sekvensointia käytetään arvioimaan ehdokkaan geenien (SFRP2, TFPI2, SEPT9 ja SDC2) metylointitilaa. Ulostenäytteitä analysoidaan myös kokogenomisekvensoinnilla (WGS) mikrobiston ja geneettisten profiilien arvioimiseksi.
Tutkimus pyrkii selvittämään, ovatko näiden geenien metylointitasot merkitsevästi kohonneet adenoomikudoksessa verrattuna normaaliin limakalvoon, mikä mahdollistaa mahdollisten biomarkkereiden tunnistamisen kolorektaalisen neoplasian seurantaan ja personoituihin kolonoskopiaseurantaväleihin.
Tutkimuksen yleiskatsaus
Tila
Yksityiskohtainen kuvaus
Suolistosyöpä (CRC) on yksi yleisimmistä pahanlaatuisista kasvaimista Koreassa, ja se sijoittuu toiseksi kansallisissa syöpäilmaantuvuus tilastoissa. Useimmat CRC:t kehittyvät adenoomi-karsinooma-sekvenssin kautta, jossa epigeneettisillä ja geneettisillä muutoksilla on ratkaiseva rooli. Metyloituneiden geneettisten merkkiaineiden tunnistaminen suoliston adenoomissa voi tarjota näkemyksiä varhaisista syöpäkehityksen mekanismeista ja mahdollistaa yksilöllisemmät seurantastrategiat polypektomian jälkeen.
Tämä tutkimus keskittyy epigeneettisten tekijöiden – erityisesti DNA-metylaatiokuvioiden – tutkimiseen korealaisilla potilailla esiintyvän suoliston adenoomiin liittyen. Yhteensä 32 kolonoskopiseen polypektomiaan osallistuvaa osallistujaa rekrytoidaan. Jokaiselta osallistujalta kerätään sekä adenoomakudos että viereinen normaali limakalvo (noin 5 millimetrin (mm) kokoinen). Myös ulostenäytteet kerätään mikrobiomi- ja genomi-analyysiä varten.
Kudoksesta ja ulostenäytteistä eristetty DNA käsitellään bisulfiittimuunnoksella käyttäen EZ DNA Methylation-Gold Kit -sarjaa (Zymo Research). Kvantitatiivista metylaatiospesifistä polymeraasiketjureaktiota (qMSP) suoritetaan neljän kandidaattigeenin – SFRP2 (Secreted Frizzled Related Protein 2), TFPI2 (Tissue Factor Pathway Inhibitor 2), SEPT9 (Septin 9) ja SDC2 (Syndecan 2) – promotorimetylaatiotasojen arvioimiseksi, joilla on aiemmin osoitettu potentiaalia suoliston neoplasian biomarkkereina. Valituista näytteistä suoritetaan myös Sanger-sekvensointi CpG-tason metylaatio-profilointia varten. Ulosten DNA analysoidaan kokogenomisekvensoinnilla (WGS) Illumina NovaSeq 6000 -alustalla mikrobiomikoostumuksen ja geneettisen kontekstin arvioimiseksi.
Metylaatioindeksit (MtI) ja prosentuaaliset metyloitujen viitearvojen (PMR) arvot lasketaan ja verrataan adenoomien ja viereisten normaalikudosten välillä. Vastaanottajan toimintaluokituskäyrä (ROC) -analyysi määrittää kunkin geenin herkkyyden ja spesifisyyden mahdollisena biomarkkerina.
Tunnistamalla adenoomakudoksissa merkitsevästi ylireguloituneita metyloituja geenejä tämä tutkimus pyrkii esittämään kandidaatteja epigeneettisiksi merkkiaineiksi suoliston adenoomien uusiutumisen tai pahanlaatuisen muuntumisen ennustamiseksi. Löydökset voivat edistää polypektomian jälkeisten seurantaväliaikojen hienosäätöä ja tukea tarkkoja ehkäisystrategioita CRC:ssä.
Opintotyyppi
Ilmoittautuminen (Arvioitu)
Yhteystiedot ja paikat
Opiskeluyhteys
- Nimi: OneJoong KIM, M.D.
- Puhelinnumero: 82+010+2111+0415
- Sähköposti: biblian@chamc.co.kr
Opiskelupaikat
-
-
Gyeonggi-do
-
Seongnam-si, Gyeonggi-do, Etelä -Korea, 13496
- Bundang CHA Hospital
-
Ottaa yhteyttä:
- KIM OneJoong
- Puhelinnumero: 01021115353
- Sähköposti: biblian@chamc.co.kr
-
-
Osallistumiskriteerit
Kelpoisuusvaatimukset
Opintokelpoiset iät
- Aikuinen
- Vanhempi Aikuinen
Hyväksyy terveitä vapaaehtoisia
Näytteenottomenetelmä
Tutkimusväestö
Kuvaus
Osallistumiskriteerit:
Aikuiset 19–85-vuotiaat.
Käyvät läpi kolonoskopisen polypektomian kolorektaaliselle adenoomalle.
Kykenevät ymmärtämään tutkimuksen tarkoituksen ja antamaan kirjallisen tietoon perustuvan suostumuksen.
Riittävästi kudosta saatavilla sekä adenoomalle että viereiselle normaaliselle limakalvonäytteelle.
Poissulkemiskriteerit:
Kolorektaalisen syövän, tulehduksellisen suolistosairauden tai perinnöllisen kolorektaalisen syövän oireyhtymän (esim. FAP, Lynchin oireyhtymä) historia.
Aiempi kolorektaalinen leikkaus, joka voi muuttaa anatomiaa tai patologiaa.
Riittämätön näytteen laatu tai DNA:n eristyksen epäonnistuminen.
Tietoon perustuvan suostumuksen kieltäytyminen tai peruuttaminen.
Vaikeat sairaudet, jotka tekevät osallistumisen sopimattomaksi tutkijan harkinnan mukaan.
Opintosuunnitelma
Miten tutkimus on suunniteltu?
Suunnittelun yksityiskohdat
Kohortit ja interventiot
Ryhmä/Kohortti |
|---|
|
Suoliston adenoomaryhmä
Osallistujat, joille tehdään paksusuolen adenoman poistoleikkaus kolonoskopialla.
Adenomaattista kudosta ja viereistä normaalia limakalvoa kerätään metylaatio- ja sekvensointianalyysejä varten.
|
Mitä tutkimuksessa mitataan?
Ensisijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
SFRP2:n metylaatioindeksi suolistosoluissa
Aikaikkuna: Perustaso (Yksittäinen ajanhetki)]
|
Adenomaattisten ja viereisten normaalien paksusuolen kudosten DNA-metylaatiotasoihin liittyvä määrällinen arviointi.
Metylaatiotasot määritetään käyttämällä määrällistä metylaatiospesifistä PCR:ää (qMSP) ja ilmaistaan metylaatioindeksinä (MtI, %).
|
Perustaso (Yksittäinen ajanhetki)]
|
|
TFPI2:n metylaatioindeksi paksu- ja peräsuolen kudoksessa
Aikaikkuna: Alkutila (Yksittäinen aikapiste)]
|
Adenomatoosisten ja vierekkäisten normaalien paksusuolen kudosten DNA-metylaatiotasojen kvantitatiivinen arviointi.
Metylaatiotasot määritetään käyttämällä kvantitatiivista metylaatiospesifistä PCR:ää (qMSP) ja ilmaistaan metylaatioindeksinä (MtI, %).
|
Alkutila (Yksittäinen aikapiste)]
|
|
SEPT9:n metylaatioindeksi paksusuolen kudoksessa
Aikaikkuna: Perustaso (Yksittäinen ajanhetki)
|
Adenomisten ja viereisten normaalien paksusuolen kudosten DNA-metylaatiotasoja määritetään kvantitatiivisesti.
Metylaatiotasoja määritetään kvantitatiivisella metylaatiospesifisellä PCR-menetelmällä (qMSP) ja ilmaistaan metylaatioindeksinä (MtI, %).
|
Perustaso (Yksittäinen ajanhetki)
|
|
SDC2:n metylaatioindeksi paksusuolen kudoksessa
Aikaikkuna: Perustaso (Yksittäinen aikapiste)]
|
Kvantitatiivinen arvio DNA-metylaatiotasojen adenomaattisissa versus viereisissä normaaleissa kolorektaalisissa kudoksissa.
Metylaatiotasot määritetään kvantitatiivisella metylaatiospesifisellä PCR:llä (qMSP) ja ilmaistaan metylaatioindeksinä (MtI, %).
|
Perustaso (Yksittäinen aikapiste)]
|
Toissijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
Metyloituneen SFRP2:n herkkyys ja spesifisyys adenoman havaitsemisessa
Aikaikkuna: Perustaso (Yksittäinen ajanhetki)
|
Receiver operating characteristic (ROC) -käyräanalyysia käytetään arvioimaan metyloidun SFRP2:n diagnostista suorituskykyä adenomisen kudoksen erottamisessa normaalista kudoksesta.
Metyloituneen referenssin prosenttiosuudet (PMR), jotka saadaan qMSP:stä, verrataan ryhmien välillä.
|
Perustaso (Yksittäinen ajanhetki)
|
|
Metyloituneen TFPI2:n herkkyys ja spesifisyys adenoman havaitsemisessa
Aikaikkuna: Perustaso (Yksittäinen aikapiste)
|
Receiver operating characteristic (ROC) -käyräanalyysiä käytetään metyloidun TFPI2:n diagnostisen suorituskyvyn arvioimiseen adenomaisen ja normaalin kudoksen erottamisessa.
Kvantitatiivisesta MSP:stä (qMSP) saatuja metyloidun viitteen prosenttiosuuksia (PMR) verrataan ryhmien välillä.
|
Perustaso (Yksittäinen aikapiste)
|
|
Metyloituneen SEPT9:n herkkyys ja spesifisyys adenoman havaitsemisessa
Aikaikkuna: Perustaso (Yksittäinen aikapiste)
|
Receiver operating characteristic (ROC) -käyräanalyysiä käytetään metyloidun SEPT9:n diagnostisen suorituskyvyn arvioimiseen adenomisen ja normaalin kudoksen erottamisessa.
Kvantitatiivisesta MSP:stä (qMSP) saatuja metyloidun referenssin prosenttiosuuksia (PMR) verrataan ryhmien välillä.
|
Perustaso (Yksittäinen aikapiste)
|
|
Metyloituneen SDC2:n herkkyys ja spesifisyys adenoman havaitsemisessa
Aikaikkuna: Perustaso (yksi ajanhetki)
|
Receiver operating characteristic (ROC) -käyräanalyysia käytetään arvioimaan metyloidun SDC2:n diagnostista suorituskykyä adenomisen ja normaalin kudoksen erottamisessa.
Quantitative MSP:stä saatuja metyloidun referenssin prosenttiosuuksia (PMR) verrataan ryhmien välillä.
|
Perustaso (yksi ajanhetki)
|
Yhteistyökumppanit ja tutkijat
Sponsori
Opintojen ennätyspäivät
Opi tärkeimmät päivämäärät
Opiskelun aloitus (Arvioitu)
Ensisijainen valmistuminen (Arvioitu)
Opintojen valmistuminen (Arvioitu)
Opintoihin ilmoittautumispäivät
Ensimmäinen lähetetty
Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit
Ensimmäinen Lähetetty (Todellinen)
Tutkimustietojen päivitykset
Viimeisin päivitys julkaistu (Todellinen)
Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit
Viimeksi vahvistettu
Lisää tietoa
Tähän tutkimukseen liittyvät termit
Avainsanat
Muut tutkimustunnusnumerot
- CHAMC IRB 2025-05-034-004
Yksittäisten osallistujien tietojen suunnitelma (IPD)
Aiotko jakaa yksittäisten osallistujien tietoja (IPD)?
Lääke- ja laitetiedot, tutkimusasiakirjat
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää lääkevalmistetta
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää laitetuotetta
Nämä tiedot haettiin suoraan verkkosivustolta clinicaltrials.gov ilman muutoksia. Jos sinulla on pyyntöjä muuttaa, poistaa tai päivittää tutkimustietojasi, ota yhteyttä register@clinicaltrials.gov. Heti kun muutos on otettu käyttöön osoitteessa clinicaltrials.gov, se päivitetään automaattisesti myös verkkosivustollemme .
Kliiniset tutkimukset Kolorektaalinen adenooma
-
Massachusetts General HospitalValmisColoRectal syövän seulonta