Factores Epigenéticos del Adenoma Colorrectal en Coreanos
Exploración de Factores Epigenéticos del Adenoma Colorrectal en Coreanos
Este estudio tiene como objetivo explorar los factores epigenéticos asociados con el adenoma colorrectal (ACR) en la población coreana. El ACR es una lesión precancerosa clave en la secuencia adenoma-carcinoma, y la identificación de marcadores genéticos metilados puede mejorar la detección temprana y la estratificación de riesgo para el cáncer colorrectal (CCR).
Se incluirá un total de 32 pacientes sometidos a polipectomía colonoscópica. Se recolectarán tejidos adenomatosos y normales adyacentes para la extracción de ácido desoxirribonucleico (ADN) y conversión con bisulfito. Se utilizarán la reacción en cadena de la polimerasa específica de metilación cuantitativa (qMSP) y la secuenciación de Sanger para evaluar el estado de metilación de genes candidatos (SFRP2, TFPI2, SEPT9 y SDC2). También se analizarán muestras de heces mediante secuenciación del genoma completo (WGS) para evaluar los perfiles del microbioma y genéticos.
El estudio busca determinar si los niveles de metilación de estos genes están significativamente elevados en el tejido adenomatoso en comparación con la mucosa normal, identificando así posibles biomarcadores para la vigilancia de neoplasias colorrectales y la personalización de los intervalos de seguimiento por colonoscopia.
Descripción general del estudio
Estado
Descripción detallada
El cáncer colorrectal (CCR) es una de las neoplasias malignas más comunes en Corea, ocupando el segundo lugar en las estadísticas nacionales de incidencia de cáncer. La mayoría de los CCR surgen a través de la secuencia adenoma-carcinoma, en la que las alteraciones epigenéticas y genéticas desempeñan un papel fundamental. Identificar marcadores genéticos metilados en el adenoma colorrectal puede proporcionar información sobre los mecanismos carcinogénicos tempranos y permitir estrategias de vigilancia más individualizadas después de la polipectomía.
Este estudio se centra en explorar factores epigenéticos, particularmente los patrones de metilación del ADN, asociados con el adenoma colorrectal en pacientes coreanos. Se reclutarán un total de 32 participantes que se sometan a polipectomía colonoscópica. De cada participante, se recolectarán tanto tejido adenomatoso como mucosa normal adyacente (aproximadamente 5 milímetros (mm) de tamaño). También se obtendrán muestras de heces para análisis del microbioma y genómico.
El ADN extraído de tejidos y muestras de heces se someterá a conversión con bisulfito utilizando el kit EZ DNA Methylation-Gold (Zymo Research). Se realizará una reacción en cadena de la polimerasa específica de metilación cuantitativa (qMSP) para evaluar los niveles de metilación del promotor de cuatro genes candidatos: SFRP2 (Proteína 2 Relacionada con Frizzled Secretada), TFPI2 (Inhibidor 2 de la Vía del Factor Tisular), SEPT9 (Septina 9) y SDC2 (Sindecán 2), que previamente han mostrado potencial como biomarcadores de neoplasia colorrectal. Las muestras seleccionadas también se someterán a secuenciación Sanger para el perfil de metilación a nivel de CpG. El ADN de las heces se analizará mediante secuenciación del genoma completo (WGS) en la plataforma Illumina NovaSeq 6000 para evaluar la composición microbiana y el contexto genético.
Se calcularán y compararán entre tejidos adenomatosos y normales adyacentes los índices de metilación (MtI) y los valores de porcentaje de referencia metilada (PMR). El análisis de la curva de características operativas del receptor (ROC) determinará la sensibilidad y especificidad de cada gen como biomarcador potencial.
Al identificar genes metilados que están significativamente regulados al alza en tejidos adenomatosos, este estudio tiene como objetivo proponer marcadores epigenéticos candidatos para predecir la recurrencia o transformación maligna del adenoma colorrectal. Los hallazgos pueden contribuir a refinar los intervalos de vigilancia post-polipectomía y apoyar estrategias de prevención de precisión en el CCR.
Tipo de estudio
Inscripción (Estimado)
Contactos y Ubicaciones
Estudio Contacto
- Nombre: OneJoong KIM, M.D.
- Número de teléfono: 82+010+2111+0415
- Correo electrónico: biblian@chamc.co.kr
Ubicaciones de estudio
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Gyeonggi-do
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Seongnam-si, Gyeonggi-do, Corea del Sur, 13496
- Bundang CHA Hospital
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Contacto:
- KIM OneJoong
- Número de teléfono: 01021115353
- Correo electrónico: biblian@chamc.co.kr
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Criterios de participación
Criterio de elegibilidad
Edades elegibles para estudiar
- Adulto
- Adulto Mayor
Acepta Voluntarios Saludables
Método de muestreo
Población de estudio
Descripción
Criterios de inclusión:
Adultos de 19 a 85 años.
Sometidos a polipectomía colonoscópica por adenoma colorrectal.
Capaces de comprender el propósito del estudio y proporcionar consentimiento informado por escrito.
Tejido adecuado disponible para muestreo tanto del adenoma como de la mucosa normal adyacente.
Criterios de exclusión:
Antecedentes de cáncer colorrectal, enfermedad inflamatoria intestinal o síndrome de cáncer colorrectal hereditario (por ejemplo, PAF, síndrome de Lynch).
Cirugía colorrectal previa que pueda alterar la anatomía o la patología.
Calidad de muestra inadecuada o fallo en la extracción de ADN.
Rechazo o retirada del consentimiento informado.
Comorbilidades graves que, a criterio del investigador, hagan inadecuada la participación.
Plan de estudios
¿Cómo está diseñado el estudio?
Detalles de diseño
Cohortes e Intervenciones
Grupo / Cohorte |
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Grupo de Adenoma Colorrectal
Participantes sometidos a polipectomía colonoscópica por adenoma colorrectal.
Se recolectará tejido adenomatoso y mucosa normal adyacente para análisis de metilación y secuenciación.
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¿Qué mide el estudio?
Medidas de resultado primarias
Medida de resultado |
Medida Descripción |
Periodo de tiempo |
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Índice de metilación de SFRP2 en tejido colorrectal
Periodo de tiempo: Línea de base (punto temporal único)
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Evaluación cuantitativa de los niveles de metilación del ADN en tejidos colorrectales adenomatosos frente a tejidos normales adyacentes.
Los niveles de metilación se determinarán mediante PCR cuantitativa específica de metilación (qMSP) y se expresarán como índice de metilación (MtI, %).
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Línea de base (punto temporal único)
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Índice de metilación de TFPI2 en tejido colorrectal
Periodo de tiempo: Línea de base (Punto único en el tiempo)]
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Evaluación cuantitativa de los niveles de metilación del ADN en tejidos colorrectales adenomatosos frente a tejidos normales adyacentes.
Los niveles de metilación se determinarán mediante PCR cuantitativa específica de metilación (qMSP) y se expresarán como índice de metilación (MtI, %).
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Línea de base (Punto único en el tiempo)]
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Índice de metilación de SEPT9 en tejido colorrectal
Periodo de tiempo: Línea de base (punto temporal único)
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Evaluación cuantitativa de los niveles de metilación del ADN en tejidos colorrectales adenomatosos frente a tejidos normales adyacentes.
Los niveles de metilación se determinarán mediante PCR específica de metilación cuantitativa (qMSP) y se expresarán como índice de metilación (MtI, %).
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Línea de base (punto temporal único)
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Índice de metilación de SDC2 en tejido colorrectal
Periodo de tiempo: Línea de base (punto temporal único)
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Evaluación cuantitativa de los niveles de metilación del ADN en tejidos colorrectales adenomatosos frente a tejidos normales adyacentes.
Los niveles de metilación se determinarán mediante PCR cuantitativa específica de metilación (qMSP) y se expresarán como índice de metilación (MtI, %).
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Línea de base (punto temporal único)
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Medidas de resultado secundarias
Medida de resultado |
Medida Descripción |
Periodo de tiempo |
|---|---|---|
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Sensibilidad y especificidad del SFRP2 metilado para la detección de adenoma
Periodo de tiempo: Baseline (Punto de Tiempo Único)
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Se utilizará el análisis de la curva ROC (característica operativa del receptor) para evaluar el rendimiento diagnóstico de SFRP2 metilado en la distinción entre tejido adenomatoso y tejido normal.
Los valores de porcentaje de referencia metilada (PMR) derivados de qMSP se compararán entre grupos. |
Baseline (Punto de Tiempo Único)
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Sensibilidad y especificidad de TFPI2 metilado para la detección de adenoma
Periodo de tiempo: Baseline (Punto Único en el Tiempo)
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El análisis de la curva de características operativas del receptor (ROC) se utilizará para evaluar el rendimiento diagnóstico de TFPI2 metilado en la distinción entre tejido adenomatoso y tejido normal.
Los valores del porcentaje de referencia metilada (PMR) derivados de qMSP se compararán entre los grupos.
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Baseline (Punto Único en el Tiempo)
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Sensibilidad y especificidad de SEPT9 metilado para la detección de adenoma
Periodo de tiempo: Baseline (Punto de tiempo único)
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Se utilizará el análisis de la curva de características operativas del receptor (ROC) para evaluar el rendimiento diagnóstico de la metilación de SEPT9 en la distinción entre tejido adenomatoso y tejido normal.
Los valores del porcentaje de referencia metilada (PMR) derivados de qMSP se compararán entre los grupos.
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Baseline (Punto de tiempo único)
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Sensibilidad y especificidad del SDC2 metilado para la detección de adenoma
Periodo de tiempo: Baseline (Single Time Point)
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Se utilizará el análisis de la curva de características operativas del receptor (ROC) para evaluar el rendimiento diagnóstico de la SDC2 metilada en la distinción entre tejido adenomatoso y tejido normal.
Los valores del porcentaje de referencia metilada (PMR) obtenidos mediante qMSP se compararán entre los grupos.
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Baseline (Single Time Point)
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Colaboradores e Investigadores
Patrocinador
Fechas de registro del estudio
Fechas importantes del estudio
Inicio del estudio (Estimado)
Finalización primaria (Estimado)
Finalización del estudio (Estimado)
Fechas de registro del estudio
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Primero enviado que cumplió con los criterios de control de calidad
Publicado por primera vez (Actual)
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Última actualización enviada que cumplió con los criterios de control de calidad
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- CHAMC IRB 2025-05-034-004
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Estudia un producto farmacéutico regulado por la FDA de EE. UU.
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