De klinische epidemiologie van scrubtyfus bij mensen, vlooien en knaagdieren
Studie Overzicht
Toestand
Toestand
Conditie
Conditie
Gedetailleerde beschrijving
Studie ontwerp:
Het project zal een gedetailleerd onderzoek uitvoeren van één menselijke gemeenschap en haar omgeving die het risico loopt op scrubtyfus:
Chiggers, knaagdieren en habitatstudie:
Doorsnijdt verschillende habitats en bepaalt de ruimtelijke verspreiding van soorten vlooien en knaagdieren. Dit wordt 3x/jaar uitgevoerd.
Habitatkartering met hoge resolutie. Vergelijking van genomen van O. tsutsugamushi gedetecteerd in verschillende omgevingen, met behulp van geprobeerde WGS.
Dorpscohortstudie:
Volg een cohort van dorpelingen gedurende 2 jaar waarbij alle koortspatiënten worden gescreend op scrubtyfus en de seroconversiepercentages worden bepaald en O. tsutsugamushi-genotypes worden geïnfecteerd.
Procedures:
- Mijten:
In samenwerking met ecologie/GIS-medewerkers zal de omgeving van de gemeenschap in kaart worden gebracht en dwarsdoorsneden worden aangelegd over de diverse habitats die door de gemeenschap worden gebruikt. Vrijlevende mijten zullen worden verzameld met zwarte plastic platen en zwarte doek21, uit grond met behulp van Berlese trechters en bij knaagdieren. Trombiculide mijten zullen geïdentificeerd worden naar geslacht en een subgroep naar soort.
DNA zal worden geëxtraheerd uit individuele chiggers, en qPCR-screening voor O. tsutsugamushi-positiviteit zal worden uitgevoerd (real-time PCR gericht op 47kDa-gen). Een deel van de bevestigde positieven zal genotypering ondergaan door middel van poging tot sequentiebepaling van het gehele genoom (WGS).
- knaagdieren:
Knaagdieren zullen langs transecten levend worden gevangen en geïdentificeerd in samenwerking met de Universiteit van Montpellier24. Alle mijten zullen bij knaagdieren worden verwijderd, de knaagdieren worden gedood en de milt en lever van knaagdieren worden verzameld voor O. tsutsugamushi qPCR-screening. Een deel van de O. tsutsugamushi-positieve monsters zal genotypering ondergaan door middel van een poging tot WGS of uitgebreide MLST-analyse.
- Menselijke cohort:
Iedereen in de gemeenschap (> 10 jaar oud) zal worden benaderd en om toestemming worden gevraagd om deel te nemen. Bij alle ingeschrevenen wordt gedurende 2 jaar om de 4 maanden elke 4 maanden een ELISA/IFA-scrubtyfusbehandeling (van bloedvlekken met een vingerprik) uitgevoerd om de snelheid en dynamiek van seroconversie te schatten. Bij elk bezoek wordt een korte vragenlijst afgenomen om te bepalen of de deelnemer in de voorgaande 4 maanden koorts heeft gehad.
Patiënten die zich met een koortsachtige ziekte presenteren aan lokale zorginstellingen, zullen klinisch worden beoordeeld en ter plaatse zal een scrubtyfus IgM snelle diagnostische test (RDT) worden uitgevoerd. RDT-positieve patiënten zullen worden gerekruteerd voor het onderzoek en gepaarde acute/revaliderende monsters zullen naar LOMWRU worden gestuurd voor ELISA-, qPCR- en BSL3-kweek, gevolgd door genotypering door een poging tot WGS. Een vragenlijst zal worden toegediend aan gerekruteerde patiënten om de geregistreerde symptomen en vitale functies te bepalen.
Epidemiologie & Ecologie:
De exacte monsterverzamellocaties en habitatdetails zullen worden vastgelegd.
Genomische analyses:
Om de relaties tussen zeer diverse O. tsutsugamushi genotypen in hosts met meerdere stammen/genotype-infecties te karakteriseren, is een deel van de qPCR-positieven (ong. 480 monsters) zullen worden geanalyseerd door middel van sequentiebepaling van het hele genoom bij WTCHG in Oxford.
Studietype
Studietype
Inschrijving (Verwacht)
Inschrijving
Deelname Criteria
Geschiktheidscriteria
Geschiktheidscriteria
Leeftijden die in aanmerking komen voor studie
Accepteert gezonde vrijwilligers
Geslachten die in aanmerking komen voor studie
Bemonsteringsmethode
Studie Bevolking
Groep 1 Man of vrouw, 10 jaar of ouder, met koorts
Groep 2 Man of vrouw, 10 jaar of ouder, levend in een geïdentificeerde scrubtyfusomgeving
Beschrijving
Inclusiecriteria:
Acute scrubtyfus (groep 1)
- Presenteren met koorts> 38 C en positief testen door scrubtyfus RDT.
- Man of vrouw, 10 jaar of ouder.
- Deelnemer is bereid en in staat geïnformeerde toestemming te geven voor deelname aan het onderzoek.
Scrub tyfus serosurvey (Groep 2)
- Dorpelingen die in een omgeving leven waarvan bekend is dat struiktyfus aanwezig is, die asymptomatisch zijn.
- Man of vrouw, 10 jaar of ouder.
- Deelnemer is bereid en in staat geïnformeerde toestemming te geven voor deelname aan het onderzoek.
Uitsluitingscriteria:
Acute scrubtyfus (groep 1)
- Dorpelingen/patiënten jonger dan 10 jaar.
- Degenen die geen schriftelijke geïnformeerde toestemming willen geven.
Scrub tyfus serosurvey (Groep 2)
- Dorpelingen/patiënten jonger dan 10 jaar.
- Degenen die geen schriftelijke geïnformeerde toestemming willen geven.
Studie plan
Hoe is de studie opgezet?
Ontwerpdetails
- Observatiemodellen: Cohort
- Tijdsperspectieven: Prospectief
Aantal groepen / cohorten
Cohorten en interventies
Groep / CohortGroep / Cohort |
|---|
|
Acute scrubtyfus (groep 1)
Deelnemers met koorts krijgen mondeling toestemming voor een scrubtyfus RDT, met behulp van
|
|
Scrub tyfus serosurvey (Groep 2)
Dorpelingen die in een geïdentificeerde omgeving met scrubtyfus leven, zullen over het onderzoek worden geïnformeerd en gevraagd om schriftelijke geïnformeerde toestemming te geven.
Als ze ermee instemmen om aan het onderzoek deel te nemen, wordt hen gevraagd een vingerprik-gedroogde-bloedvlektest (DBS) uit te voeren waarop scrubtyfus-ELISA en IFA worden uitgevoerd.
|
Wat meet het onderzoek?
Primaire uitkomstmaten
Primaire uitkomstmaten
Uitkomstmaat |
Tijdsspanne |
|---|---|
|
de diversiteit bepalen van O. tsutsugamushi-genotypes die knaagdieren en mijten infecteren en deze koppelen aan hun geografische verspreiding en bijbehorende habitatkenmerken.
Tijdsspanne: tot 24 maanden
|
tot 24 maanden
|
|
Correleer de frequentie van O. tsutsugamushi in mijten en knaagdieren met habitatkenmerken, om interacties tussen distributie en transmissiedynamiek te definiëren.
Tijdsspanne: tot 24 maanden
|
tot 24 maanden
|
|
Identificeer de belangrijkste mijtvectoren en knaagdiergastheren die betrokken zijn bij de natuurlijke historie van scrubtyfus, menselijke infectie en ziektevirulentie
Tijdsspanne: tot 24 maanden
|
tot 24 maanden
|
Secundaire uitkomstmaten
Secundaire uitkomstmaten
Uitkomstmaat |
Tijdsspanne |
|---|---|
|
Bepaal veranderingen in scrubtyfus-antilichaamtiters in de loop van de tijd en identificeer acuut geïnfecteerde scrubtyfusgevallen
Tijdsspanne: tot 24 maanden
|
tot 24 maanden
|
|
Identificeer van mensen afgeleide O. tsutsugamushi-genotypes om genotype-relaties tussen menselijke, knaagdier- en mijt-afgeleide genotypen te definiëren.
Tijdsspanne: tot 24 maanden
|
tot 24 maanden
|
|
Identificeer vermeende determinanten van menselijke infectie/virulentie
Tijdsspanne: tot 24 maanden
|
tot 24 maanden
|
|
De verspreiding van O. tsutsugamushi-positieve mijten, knaagdieren en mensen met habitatkenmerken met elkaar verbinden om interventies voor te stellen om het risico op ziekten bij de mens te verminderen.
Tijdsspanne: tot 24 maanden
|
tot 24 maanden
|
Medewerkers en onderzoekers
Sponsor
Sponsor
Medewerkers
Medewerkers
Studie record data
Bestudeer belangrijke data
Studie start (Werkelijk)
Studie start
Primaire voltooiing (Werkelijk)
Primaire voltooiing
Studie voltooiing (Werkelijk)
Studie voltooiing
Studieregistratiedata
Eerst ingediend
Eerst ingediend
Eerst ingediend dat voldeed aan de QC-criteria
Eerst ingediend dat voldeed aan de QC-criteria
Eerst geplaatst (Schatting)
Eerst geplaatst
Updates van studierecords
Laatste update geplaatst (Werkelijk)
Laatste update geplaatst
Laatste update ingediend die voldeed aan QC-criteria
Laatste update ingediend die voldeed aan QC-criteria
Laatst geverifieerd
Laatst geverifieerd
Meer informatie
Termen gerelateerd aan deze studie
Trefwoorden
Aanvullende relevante MeSH-voorwaarden
Andere studie-ID-nummers
Andere studie-ID-nummers
- OxTREC no. 48-15
Plan Individuele Deelnemersgegevens (IPD)
Bent u van plan om gegevens van individuele deelnemers (IPD) te delen?
Deze informatie is zonder wijzigingen rechtstreeks van de website clinicaltrials.gov gehaald. Als u verzoeken heeft om uw onderzoeksgegevens te wijzigen, te verwijderen of bij te werken, neem dan contact op met register@clinicaltrials.gov. Zodra er een wijziging wordt doorgevoerd op clinicaltrials.gov, wordt deze ook automatisch bijgewerkt op onze website .