Omic-benaderingen van neurologische ontwikkelingsstoornissen
Omic-benaderingen om de functionele en fenotypische gevolgen van zeldzame structurele genomische varianten bij neurologische ontwikkelingsstoornissen en aangeboren afwijkingen te karakteriseren
Studie Overzicht
Toestand
Toestand
Conditie
Conditie
Interventie / Behandeling
Interventie / Behandeling
Studietype
Studietype
Inschrijving (Werkelijk)
Inschrijving
Fase
Fase
- Niet toepasbaar
Contacten en locaties
Studie Locaties
-
-
LC
-
Bosisio Parini, LC, Italië, 23842
- Scientific Institute IRCCS Eugenio Medea
-
-
Deelname Criteria
Geschiktheidscriteria
Geschiktheidscriteria
Leeftijden die in aanmerking komen voor studie
- Kind
- Volwassen
Accepteert gezonde vrijwilligers
Beschrijving
Inclusiecriteria:
Patiënten met neurologische ontwikkelingsstoornissen die een genomische herschikking vertonen, geïdentificeerd door middel van chromosomale microarray-analyse (CMA)
Uitsluitingscriteria:
NA
Studie plan
Hoe is de studie opgezet?
Ontwerpdetails
- Primair doel: Diagnostisch
- Toewijzing: NVT
- Interventioneel model: Opdracht voor een enkele groep
- Masker: Geen (open label)
Aantal wapens
Wapens en interventies
Deelnemersgroep / ArmDeelnemersgroep / Arm |
Interventie / BehandelingInterventie / Behandeling |
|---|---|
|
Experimenteel: Whole Genome Sequencing (WGS) en transcriptoomanalyse
om door middel van WGS-analyse het genoom van geselecteerde patiënten te onderzoeken met een gedetailleerde klinische karakterisering. WGS zal ook worden uitgevoerd op het DNA van de ouder waaruit de CNV voortkomt, om te zoeken naar mogelijke genomische kenmerken die predisponeren voor de herschikking die bij zijn/haar zoon/dochter wordt gedetecteerd. om de expressieprofielen van structurele varianten te onderzoeken door middel van transcriptoomanalyse |
In het licht van de inconsistenties tussen de CNV en de fenotypische uitkomst verwachten we dat WGS-analyse zal onthullen dat een deel van deze CNV's een complexere structuur heeft dan degene die door CMA en FISH wordt ontward.
We veronderstellen dat CNV een verstoorde genoomvouwingsconfiguratie op verschillende hiërarchische niveaus van chromatineorganisatie zou moeten weerspiegelen, zoals verstoring van de TAD-grenzen.
Om dit aspect te onderzoeken, zijn we van plan expressieprofielen te onderzoeken van onsterfelijk gemaakte lymfoblastoïde B-cellijnen (LBL's) afgeleid van normale controles en patiënten.
We verwachten een subset van naar beneden of naar boven gereguleerde genen te vinden die zich in het herschikte gebied bevinden en die op hun beurt de expressie van andere genen kunnen veranderen, wat mogelijk kan leiden tot verstoring van ziektegerelateerde routes.
|
Wat meet het onderzoek?
Primaire uitkomstmaten
Primaire uitkomstmaten
Uitkomstmaat |
Maatregel Beschrijving |
Tijdsspanne |
|---|---|---|
|
Aantal waarschijnlijke pathogene structurele varianten
Tijdsspanne: een keer bij de aanwerving
|
Aantal waarschijnlijke pathogene structurele varianten gevonden door volledige genoomsequencing en transcriptoomanalyse.
|
een keer bij de aanwerving
|
|
Aantal patiënten bij wie een genotype-fenotypecorrelatie is gevonden
Tijdsspanne: een keer bij de aanwerving
|
Aantal patiënten voor wie een correlatie tussen genotype en fenotype is gevonden op basis van resultaten van volledige genoomsequencing en transcriptoomanalyse.
|
een keer bij de aanwerving
|
Medewerkers en onderzoekers
Sponsor
Sponsor
Studie record data
Bestudeer belangrijke data
Studie start (Werkelijk)
Studie start
Primaire voltooiing (Werkelijk)
Primaire voltooiing
Studie voltooiing (Werkelijk)
Studie voltooiing
Studieregistratiedata
Eerst ingediend
Eerst ingediend
Eerst ingediend dat voldeed aan de QC-criteria
Eerst ingediend dat voldeed aan de QC-criteria
Eerst geplaatst (Werkelijk)
Eerst geplaatst
Updates van studierecords
Laatste update geplaatst (Werkelijk)
Laatste update geplaatst
Laatste update ingediend die voldeed aan QC-criteria
Laatste update ingediend die voldeed aan QC-criteria
Laatst geverifieerd
Laatst geverifieerd
Meer informatie
Termen gerelateerd aan deze studie
Trefwoorden
Aanvullende relevante MeSH-voorwaarden
Andere studie-ID-nummers
Andere studie-ID-nummers
- 1001 (Registro Nacional Estudios Clinicos (RNEC))
Plan Individuele Deelnemersgegevens (IPD)
Bent u van plan om gegevens van individuele deelnemers (IPD) te delen?
Informatie over medicijnen en apparaten, studiedocumenten
Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd geneesmiddel
Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd apparaatproduct
product vervaardigd in en geëxporteerd uit de V.S.
Deze informatie is zonder wijzigingen rechtstreeks van de website clinicaltrials.gov gehaald. Als u verzoeken heeft om uw onderzoeksgegevens te wijzigen, te verwijderen of bij te werken, neem dan contact op met register@clinicaltrials.gov. Zodra er een wijziging wordt doorgevoerd op clinicaltrials.gov, wordt deze ook automatisch bijgewerkt op onze website .