Омические подходы к нарушениям нервно-психического развития
Омические подходы к характеристике функциональных и фенотипических последствий редких структурных вариантов генома при нарушениях развития нервной системы и врожденных аномалиях
Обзор исследования
Статус
Статус
Условия
Условия
Вмешательство/лечение
Вмешательство/лечение
Тип исследования
Тип исследования
Регистрация (Действительный)
Регистрация
Фаза
Фаза
- Непригодный
Контакты и местонахождение
Места учебы
-
-
LC
-
Bosisio Parini, LC, Италия, 23842
- Scientific Institute IRCCS Eugenio Medea
-
-
Критерии участия
Критерии приемлемости
Критерии приемлемости
Возраст, подходящий для обучения
- Ребенок
- Взрослый
Принимает здоровых добровольцев
Описание
Критерии включения:
Пациенты с нарушениями развития нервной системы, несущими геномную перестройку, выявленную с помощью хромосомного микроматричного анализа (CMA)
Критерий исключения:
NA
Учебный план
Как устроено исследование?
Детали дизайна
- Основная цель: Диагностика
- Распределение: Н/Д
- Интервенционная модель: Одногрупповое задание
- Маскировка: Нет (открытая этикетка)
Количество рук
Оружие и интервенции
Группа участников / АрмияГруппа участников / Армия |
Вмешательство/лечениеВмешательство/лечение |
|---|---|
|
Экспериментальный: Полногеномное секвенирование (WGS) и анализ транскриптома
исследовать с помощью WGS-анализа геном отдельных пациентов с подробной клинической характеристикой. WGS также будет выполнен на ДНК родителя, от которого произошел CNV, для поиска любых потенциальных геномных сигнатур, предрасполагающих к перегруппировке, обнаруженной у его/ее сына/дочери. исследовать профили экспрессии структурных вариантов с помощью анализа транскриптома |
В свете несоответствий между CNV и фенотипическим результатом мы ожидаем, что анализ WGS покажет, что часть этих CNV имеет более сложную структуру, чем та, которую распутывают CMA и FISH.
Мы предполагаем, что CNV должен отражать нарушенную конфигурацию сворачивания генома на нескольких иерархических уровнях организации хроматина, например, нарушение границ TADs.
Чтобы изучить этот аспект, мы планируем изучить профили экспрессии иммортализованных лимфобластоидных B-клеточных линий (LBL), полученных от нормальных людей и пациентов.
Мы ожидаем обнаружить подмножество генов с пониженной или повышенной регуляцией, расположенных внутри реаранжированной области, что, в свою очередь, может изменить экспрессию других генов, что, возможно, приведет к нарушению путей, связанных с заболеванием.
|
Что измеряет исследование?
Первичные показатели результатов
Первичные показатели результатов
Мера результата |
Мера Описание |
Временное ограничение |
|---|---|---|
|
Число вероятных патогенных структурных вариантов
Временное ограничение: один раз при приеме на работу
|
Количество вероятных патогенных структурных вариантов, обнаруженных с помощью полногеномного секвенирования и анализа транскриптома.
|
один раз при приеме на работу
|
|
Количество пациентов, у которых обнаружена корреляция генотип-фенотип
Временное ограничение: один раз при приеме на работу
|
Количество пациентов, у которых выявлена корреляция генотип-фенотип по результатам полногеномного секвенирования и анализа транскриптома.
|
один раз при приеме на работу
|
Соавторы и исследователи
Спонсор
Спонсор
Даты записи исследования
Изучение основных дат
Начало исследования (Действительный)
Начало исследования
Первичное завершение (Действительный)
Первичное завершение
Завершение исследования (Действительный)
Завершение исследования
Даты регистрации исследования
Первый отправленный
Первый отправленный
Впервые представлено, что соответствует критериям контроля качества
Впервые представлено, что соответствует критериям контроля качества
Первый опубликованный (Действительный)
Первый опубликованный
Обновления учебных записей
Последнее опубликованное обновление (Действительный)
Последнее опубликованное обновление
Последнее отправленное обновление, отвечающее критериям контроля качества
Последнее отправленное обновление, отвечающее критериям контроля качества
Последняя проверка
Последняя проверка
Дополнительная информация
Термины, связанные с этим исследованием
Ключевые слова
Дополнительные соответствующие термины MeSH
Другие идентификационные номера исследования
Другие идентификационные номера исследования
- 1001 (Registro Nacional Estudios Clinicos (RNEC))
Планирование данных отдельных участников (IPD)
Планируете делиться данными об отдельных участниках (IPD)?
Информация о лекарствах и устройствах, исследовательские документы
Изучает лекарственный продукт, регулируемый FDA США.
Изучает продукт устройства, регулируемый Управлением по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов США.
продукт, произведенный в США и экспортированный из США.
Эта информация была получена непосредственно с веб-сайта clinicaltrials.gov без каких-либо изменений. Если у вас есть запросы на изменение, удаление или обновление сведений об исследовании, обращайтесь по адресу register@clinicaltrials.gov. Как только изменение будет реализовано на clinicaltrials.gov, оно будет автоматически обновлено и на нашем веб-сайте. .