NIPD van CFTC door WGA gekoppeld aan mini-exome-sequencing (DIAFEXOME)

Context:

Niet-invasieve prenatale diagnostiek (NIPD), gebaseerd op de analyse van circulerend celvrij foetaal DNA (cff-DNA), is veelbelovend voor een vroege diagnose van monogene ziekten. Een dergelijke aanpak is een veiliger alternatief voor invasieve methoden van prenataal onderzoek (vruchtwaterpunctie of choriocentese) die een aanzienlijk risico op een miskraam met zich meebrengen (0,5%-1%). Technische problemen met betrekking tot de kenmerken van cff-DNA blijven echter bestaan, en NIPD-technieken vereisen een lange procesontwikkeling die specifiek is voor een gen en/of een bepaalde mutatie.

Doelstellingen:

Het doel van deze studie is om ons aanbod van NIPD aan te vullen door een aanpak te ontwikkelen voor geïsoleerde circulerende trofoblastische foetale cellen (CFTC) aangepast aan de analyse van de genen en mutaties die betrokken zijn bij de huidige prenatale testverzoeken.

Methodologie :

Van zwangere vrouwen vanaf 9 weken zwangerschap waarvoor een prenataal onderzoek wordt aangevraagd, wordt bloed afgenomen.

CFTC-isolatie met verrijkingssystemen voor circulerende tumorcellen (CTC's) zal worden gevolgd door volledige genoomamplificatie gekoppeld aan mini-exome-sequencing en bioinformatische filtering die specifiek zal zijn voor de prenatale testindicatie.

Het onderzoek zal in 2 fasen worden uitgevoerd:

• analytische validatie van de methode door bestudering van de datakwaliteit van de sequencing van beoogde genen die frequent worden onderworpen aan prenatale testen (zie prenatale testen ziektelijst uit "ABM DPN 2014" in Bijlage 2).
• klinische evaluatie van de methode door de overeenstemming te controleren tussen de resultaten verkregen door onze nieuwe aanpak versus die verkregen door standaardprocedure (vruchtwaterpunctie of choriocentese) voor 15 zwangere vrouwen.

Verwachte resultaten en perspectieven:

Het doel van deze studie is om het proof of concept vast te stellen van een semi-universele NIPD-methode op basis van een eenvoudige maternale bloedtest die zou kunnen worden toegepast op de meeste zeldzame ziekten die prenatale tests vereisen.

Deze NIPD-benadering zou het aantal invasieve procedures verminderen en daarmee het risico op een miskraam als gevolg van vruchtwaterpunctie of choriocentese elimineren. Het zou ook nationale toegang mogelijk maken tot deze NIPD-test voor een breed scala aan zeldzame ziekten.