HBV Virions bundne proteiner

Fremveksten av hepatocellulært karsinom (HCC) har ført til et søk etter en grundig forståelse av biologien til en av de viktigste årsakene, hepatitt B-viruset (HBV). HBV-partikler tilegner seg via spirende og innkapsling cellulære proteiner. Det er økende bevis på flere virale arter på at virionbundne proteiner er tilbøyelige til å være involvert enten ved replikasjons-, spirende/utgående eller inngangs-/frigjøringstrinn i virussyklusen.

Identifisering av slike mål kan gi ideelle kandidater for å få innsikt i avhengigheten av HBV av en begrenset undergruppe av vertsproteiner, og gir derfor raffinerte sett med genetisk stabile mål for terapi. Dette prosjektets mål er å sette opp tilstrekkelige forhold for robust og reproduserbar rensing av HBV-virioner i kliniske prøver, etterfulgt av identifisering av deres HBV-bundne vertsproteiner og karakterisering av deres funksjoner. Proteomikkprofilering av HBV-partikler renset fra kliniske prøver vil bli overlagt med proteiner identifisert og karakterisert i cellekulturdyrkede HBV-partikler, ved bruk av kriterier for klinisk biomarkøroppdagelse. Mål identifisert i begge prøvesettene vil bli utsatt for in vitro-undersøkelser ved bruk av HBV-replikerende celler. Konvensjonelle biokjemiske og avbildningsmetoder vil bli brukt for å: (i) fastslå deres fysiske assosiasjon med HBV-virioner; (ii) definere modalitetene for deres interaksjon med HBV-proteiner; (iii) dechiffrere topologien og subcellulær lokalisering av deres assosiasjon med HBV-proteiner og virioner; (iv) kvantitativt vurdere deres funksjonelle involvering i partikkelspirer, utgang eller sekresjon og smitteevne. En kandidat som ga tilfredsstillende resultater i disse eksperimentene vil bli avslørt og undersøkt videre på strukturbiologinivå, i forskningssamarbeidsprogrammer.