- ICH GCP
- US Clinical Trials Registry
- Klinisk utprøving NCT00339508
Undersøkende dataanalyse for sykdommers stamtavler og kreftgenetikk
Forskerne har utviklet og distribuert flere programvarepakker for stamtavleanalyse (FAST, CASPAR, PedHunter, IIC) og kreftgenetikk (oncotree, METREX). Brukere som trenger hjelp med programvaren eller som ønsker å se nye funksjoner lagt til, sender ofte forskerne datafiler som inkluderer menneskelige data. Informasjonen er normalt kodet, og forskerne har ikke tilgang til identifikasjon av personene som har informasjon i filene. Noen ganger gir innholdet i filene opphav til samarbeid mellom programvareutviklerne og leverandørene av filene. Fordi bekymringer for konfidensialitet av medisinsk informasjon har økt betydelig de siste årene, må forskerne søke om unntak fra detaljert tilsyn med etisk komité for hvert datasett de mottar. Denne prosessen er tungvint og gjør det vanskelig å hjelpe programvarebrukere. Mengden informasjon som kreves for å søke om dispensasjon, utgjør også en barriere for samarbeid.
En fullstendig protokoll vil utsette alle datasett for tilsyn med etisk komité uten behov for individuelle dispensasjonsforespørsler, noe som gjør det mulig for forskerne å hjelpe brukere med programvareproblemer og samarbeide med andre forskere.
Fra 1. januar 2000 til 15. desember 2001 mottok forskerne 71 forespørsler om bistand, hvorav 19 inkluderte datafiler. Ingen av datafilene hadde noen navn eller pasientidentifikatorer. Av disse 19 sendte forskerne i 8 tilfeller tilbake modifiserte utdatafiler. I to av disse åtte tilfellene kunne forskerne se resultater av forskningsinteresse; en av dem gjaldt menneskelige data. I 2 av de 19 tilfellene sendte forskerne tilbake modifiserte inndatafiler; i et slikt tilfelle etablerte de et samarbeid med opphavsmannen til filene. I sum kommer de fleste forespørsler under overskriften kundeservice, uten forskningsinnhold. Noen få fører imidlertid til forskningsresultater eller samarbeid, som det kreves tilsyn med etisk komité for.
I løpet av den treårige tidsrammen for denne protokollen forventer forskerne å motta data om maksimalt 10 000 individer. De har endret programvaredokumentasjonen for å eksplisitt instruere brukere om å sørge for at datafilene de sender ikke har navn. Skulle de motta filer med navn, vil de slette filene og be opphavsmannen sende dem inn på nytt med navn kodet. Brukere sender inn data via ukryptert e-post. Dataene lagres i passordbeskyttede datamaskiner ved National Institutes of Health.
Studieoversikt
Status
Forhold
Detaljert beskrivelse
Vi har utviklet programvarepakker for stamtavleanalyse (FAST, CASPAR, PedHunter, IIC) og kreftgenetikk (oncotrees, METREX). Hensikten med denne protokollen er å tillate oss å jobbe med programvareproblemrapporter som kan inneholde data fra mennesker. Dataene skal være kodet, som vi mener at hvis det er noen koblinger mellom identifikatorer og navn, har vi ikke lenkene for å dekode navnene. Av og til fører vår bistand til et mer formelt forskningssamarbeid. Denne protokollen søker å klargjøre retningslinjene som vi kan gi hjelp til brukere av vår menneskelige genetikkprogramvare under, og å etablere en formell prosedyre der vi kan søke IRB-godkjenning for de serendipiterte samarbeidene som oppstår ved å gi den hjelpen. Vi kan ikke forutsi størrelsen på prøver eller sykdommene som er studert i datasettene som er sendt til oss, så de fleste medisinske aspektene ved denne protokollen er nødvendigvis generelle. Vi er avhengige av at dataene blir kodet og at innsamlere av data har sine egne institusjonelle godkjenninger for å beskytte mot de fleste risikoer. De vitenskapelige aspektene ved å undersøke problemrapporter kan ikke være hypotesedrevet fordi vi ikke kan gjette hvilke problemer som vil oppstå. På ingeniørsiden er de grunnleggende hypotesene at: 1) programvaren vår sannsynligvis inneholder noen feil eller andre svakheter, som ikke lett kan finnes unntatt ved å la andre bruke programvaren og 2) en god måte å forbedre funksjonaliteten til programvaren på er å oppmuntre brukere til å sende inn problemrapporter og andre forslag.
Denne protokollen har vært i kraft siden tidlig i 2002. De eneste endringene i løpet av den tiden var å opprette tre samarbeid, som beskrevet i avsnitt 4.6 og 4.7 og 4.8. Protokollen har vært ganske nyttig og ingen endringer er foreslått i prosedyrer.
Studietype
Registrering (Faktiske)
Kontakter og plasseringer
Studiesteder
-
-
Maryland
-
Bethesda, Maryland, Forente stater, 20892
- National Human Genome Research Institute (NHGRI), 9000 Rockville Pike
-
-
Deltakelseskriterier
Kvalifikasjonskriterier
Alder som er kvalifisert for studier
- Barn
- Voksen
- Eldre voksen
Tar imot friske frivillige
Kjønn som er kvalifisert for studier
Beskrivelse
- INKLUSJONS-/EXKLUSJONSKRITERIER:
Brukerforespørsler:
Når du mottar datasett for problemrapporter og/eller nye funksjonsforespørsler, vil alle datasett bli akseptert. Vi ville ikke vurdere hvordan dataene ble samlet inn. Årsakene til dette er: de medisinske aspektene ved datasettet er irrelevante for årsaken til at vi mottar dataene; vi kan ikke svare raskt på problemrapporter hvis vi må få detaljer om hvordan dataene ble samlet inn; dataene brukes aldri av oss til forskning på egenskapene som er studier av forskerne som samlet inn data.
Samarbeid:
For samarbeidsstudier vil vi be om detaljer om hvordan dataene ble samlet inn, inkludert bevis på godkjenning fra et lokalt etisk styre. Vi vil sende til NHGRI IRB en endring som beskriver det nye samarbeidet. Denne endringen vil nødvendigvis inkludere en formell indikasjon på at den samarbeidende forskningsgruppen har tillatelse til å samle inn og analysere menneskelige data som de presenterer for oss (i kodet og oppsummert format). For samarbeidspartnere i USA vil tillatelsen bestå av en IRB-godkjent protokoll eller unntak fra samarbeidspartnerens institusjon. For samarbeidspartnere utenfor USA vil tillatelsen være en av typene avtaler som for tiden støttes av NIH Office of Human Subjects Research.
Hvis vi ikke ser bevis på passende tillatelse til å samle inn dataene eller IRB avslår vårt foreslåtte endringsforslag, vil vi ekskludere oss selv fra å delta i det foreslåtte samarbeidet.
Det er to andre omstendigheter der vi også har utelukket samarbeid om analyse av datasett i fortiden og kan gjøre det i fremtiden. En omstendighet var at vi ikke følte at det foreslåtte datasettet muligens kunne gi tilstrekkelig statistisk kraft til å oppdage noe interessant. Den andre omstendigheten var at vi hadde et eksisterende samarbeid med en forskningsgruppe, og en konkurrerende gruppe ba oss om å samarbeide også.
Studieplan
Hvordan er studiet utformet?
Samarbeidspartnere og etterforskere
Etterforskere
- Hovedetterforsker: Alejandro A Schaffer, Ph.D., National Human Genome Research Institute (NHGRI)
Publikasjoner og nyttige lenker
Generelle publikasjoner
- Buhler J, Owerbach D, Schaffer AA, Kimmel M, Gabbay KH. Linkage analyses in type I diabetes mellitus using CASPAR, a software and statistical program for conditional analysis of polygenic diseases. Hum Hered. 1997 Jul-Aug;47(4):211-22. doi: 10.1159/000154415.
- Desper R, Jiang F, Kallioniemi OP, Moch H, Papadimitriou CH, Schaffer AA. Inferring tree models for oncogenesis from comparative genome hybridization data. J Comput Biol. 1999 Spring;6(1):37-51. doi: 10.1089/cmb.1999.6.37.
- Atkinson TP, Schaffer AA, Grimbacher B, Schroeder HW Jr, Woellner C, Zerbe CS, Puck JM. An immune defect causing dominant chronic mucocutaneous candidiasis and thyroid disease maps to chromosome 2p in a single family. Am J Hum Genet. 2001 Oct;69(4):791-803. doi: 10.1086/323611. Epub 2001 Aug 21.
Studierekorddatoer
Studer hoveddatoer
Studiestart
Studiet fullført
Datoer for studieregistrering
Først innsendt
Først innsendt som oppfylte QC-kriteriene
Først lagt ut (Anslag)
Oppdateringer av studieposter
Sist oppdatering lagt ut (Faktiske)
Siste oppdatering sendt inn som oppfylte QC-kriteriene
Sist bekreftet
Mer informasjon
Begreper knyttet til denne studien
Andre studie-ID-numre
- 999902152
- 02-HG-N152
Denne informasjonen ble hentet direkte fra nettstedet clinicaltrials.gov uten noen endringer. Hvis du har noen forespørsler om å endre, fjerne eller oppdatere studiedetaljene dine, vennligst kontakt register@clinicaltrials.gov. Så snart en endring er implementert på clinicaltrials.gov, vil denne også bli oppdatert automatisk på nettstedet vårt. .