Denne siden ble automatisk oversatt og nøyaktigheten av oversettelsen er ikke garantert. Vennligst referer til engelsk versjon for en kildetekst.

Kombinert genom- og RNA-sekvensering for genetisk diagnose av parkinsonisme (ParkOmic)

20. august 2026 oppdatert av: University Hospital, Strasbourg, France

Identifikasjon av de manglende genetiske årsakene til Parkinsons syndrom: en kombinert tilnærming ved genom- og RNA-sekvensering

Til tross for den økende tilgjengeligheten og fremskrittene i analysen av DNA-sekvensering med høy gjennomstrømning, forblir flertallet av pasienter med tidlig debut eller familiær parkinsonisme uten en molekylær diagnose.

Å studere de genetiske formene for parkinsoniske syndromer presenterer en rekke kliniske, vitenskapelige og terapeutiske interesser. I klinisk praksis tillater identifisering av den genetiske årsaken hos en pasient å gi genetisk rådgivning og estimere risikoen for tilbakefall hos deres slektninger. Etablering av korrelasjoner mellom genotypen og fenotypen til pasienter med genetisk betinget parkinsonisme, gjør det mulig å bedre forutse utviklingen av sykdommen, eller til og med å fremheve biomarkører i de presymptomatiske fasene. Til slutt representerer proteinene kodet av genene involvert i familiær parkinsonisme potensielle terapeutiske mål som sannsynligvis vil bli modulert av nevrobeskyttende farmakologiske midler, selv ved sporadisk Parkinsons sykdom.

I dette arbeidet tok etterforskerne sikte på å belyse de manglende genetiske årsakene til parkinsonisme gjennom bruk av kombinert RNA og helgenomsekvensering.

Studieoversikt

Status

Rekruttering

Forhold

Intervensjon / Behandling

Detaljert beskrivelse

Etterforskerne valgte 14 pasienter med tidlig debut av parkinsonisme som ingen variant av viss patogenisitet hadde blitt identifisert for etter eksomsekvensering.

Pasienter og deres pårørende vil ta blodprøve etter inklusjonsbesøket for DNA-ekstraksjon, pasienter vil få en hudbiopsi for fibroblastkultur og RNA-ekstraksjon for RNA-sekvensering. Genomsekvenseringen vil bli utført på en Illumina® HiSeq4000-sekvenser.

Etterforskere vil også utføre hudbiopsier på pasienter for fibroblastkulturer for å trekke ut RNA for RNA-sekvensering. Valget av fibroblastanalyse for studiet av transkriptomet er begrunnet med det faktum at gener uttrykt i hjernen som sannsynligvis er assosiert med nevrodegenerative sykdommer, kommer oftere til uttrykk i huden enn i andre klinisk tilgjengelige vev som blod. Hudbiopsier vil bli utført av henvisende klinikere, og RNA-ekstraksjon vil bli utført ved bruk av Quiagen® RNeasy-settet.

Transkriptomanalyse ved RNA-sekvensering inkludert sekvensering og bioinformatikkbehandling av data, inkludert påvisning av aberrant spleising (LeafCutter), avvikende uttrykk (DESeq) og identifikasjon av varianter (GATK + Varank) vil også bli utført Genomdata vil bli integrert med data fra RNA sekvensering. Etterforskerne planlegger å analysere alle 14 pasientene i henhold til denne strategien.

Studietype

Intervensjonell

Registrering (Antatt)

14

Fase

  • Ikke aktuelt

Kontakter og plasseringer

Denne delen inneholder kontaktinformasjon for de som utfører studien, og informasjon om hvor denne studien blir utført.

Studiekontakt

Studiesteder

  • Frankrike
    • Grand Est
      • Strasbourg, Grand Est, Frankrike, 67000

Deltakelseskriterier

Forskere ser etter personer som passer til en bestemt beskrivelse, kalt kvalifikasjonskriterier. Noen eksempler på disse kriteriene er en persons generelle helsetilstand eller tidligere behandlinger.

Kvalifikasjonskriterier

Alder som er kvalifisert for studier

  • Voksen
  • Eldre voksen

Tar imot friske frivillige

Nei

Beskrivelse

Inkluderingskriterier:

  • Ekstrapyramidalt syndrom som begynner før eller i en alder av 40 eller assosiert med en familiehistorie:
  • Dopaminerg denervering bevist ved ioflupan hjernescintigrafi (DaTscan®)
  • DNA fra begge asymptomatiske foreldre tilgjengelig i biobank
  • Subjekt som er tilknyttet en helseforsikringsordning for sosial beskyttelse eller begunstiget eller begunstiget
  • Subjektet er i stand til å forstå målene og risikoene knyttet til forskningen og gi datert og signert informert samtykke

Ekskluderingskriterier:

  • - Kontraindikasjon for å utføre en overfladisk hudbiopsi gitt av protokollen
  • Molekylær årsak til parkinsonisme tidligere identifisert
  • Fravær av tidligere genetisk utforskning ved høykapasitets DNA-sekvensering
  • Pasient med sent oppstått sporadisk parkinsonsyndrom (> 40 år) uten familiehistorie
  • Pasient med Parkinsons syndrom assosiert med en spesifikk diagnose (genetisk eller ikke-genetisk patologi: eksponering for nevroleptika, toksisk opprinnelse)
  • Umulig å gi forsøkspersonen informert informasjon
  • Subjekt under rettslig beskyttelse
  • Emne under vergemål eller kuratorskap

Studieplan

Denne delen gir detaljer om studieplanen, inkludert hvordan studien er utformet og hva studien måler.

Hvordan er studiet utformet?

Designdetaljer

  • Primært formål: Diagnostisk
  • Tildeling: N/A
  • Intervensjonsmodell: Enkeltgruppeoppdrag
  • Masking: Ingen (Open Label)

Våpen og intervensjoner

Deltakergruppe / Arm
Intervensjon / Behandling
Eksperimentell: Genom- og RNA-sekvensering
Diagnostisk test: Kombiner hele genom og RNA-sekvensering
High-throughput DNA- og RNA-sekvensering

Hva måler studien?

Primære resultatmål

Resultatmål
Tiltaksbeskrivelse
Tidsramme
Frekvens for genetisk diagnose
Tidsramme: 18 måneder
Å estimere frekvensen av genetiske diagnoser oppnådd ved genomsekvensering kombinert med RNA-sekvensering i en kohort av pasienter med tidlig debut eller familiært parkinsonsyndrom uten molekylær diagnose.
18 måneder

Sekundære resultatmål

Resultatmål
Tiltaksbeskrivelse
Tidsramme
Gener implisert
Tidsramme: 18 måneder
Estimer andelen pasienter som bærer patogene eller sannsynligvis patogene varianter i hvert av genene identifisert i dette arbeidet
18 måneder
Bidrag av RNA-sekvensering
Tidsramme: 18 måneder
Estimer andelen av patogene eller sannsynligvis patogene varianter som oppdages sekundært takket være bidraget fra RNA-sekvensering og ikke identifisert ved analyse av genomet tatt isolert.
18 måneder
Genotype og fenotype korrelasjon
Tidsramme: 18 måneder
Estimer andelen pasienter som har spesifikke kliniske, biologiske og avbildningsegenskaper for hver identifisert genetisk årsak (genotype/fenotype-korrelasjon).
18 måneder
Nye genetiske årsaker
Tidsramme: 18 måneder
Beskriv nye molekylære mekanismer ved parkinsonsyndrom.
18 måneder
Toleranse
Tidsramme: 18 måneder
Estimer andelen pasienter som opplever en uønsket hendelse knyttet til prosedyren.
18 måneder
Nye assosierte gener
Tidsramme: 18 måneder
Beskriv nye gener assosiert med parkinsonsyndrom.
18 måneder

Samarbeidspartnere og etterforskere

Det er her du vil finne personer og organisasjoner som er involvert i denne studien.

Sponsor

University Hospital, Strasbourg, France

Studierekorddatoer

Disse datoene sporer fremdriften for innsending av studieposter og sammendragsresultater til ClinicalTrials.gov. Studieposter og rapporterte resultater gjennomgås av National Library of Medicine (NLM) for å sikre at de oppfyller spesifikke kvalitetskontrollstandarder før de legges ut på det offentlige nettstedet.

Studer hoveddatoer

Studiestart (Faktiske)

14. januar 2025

Primær fullføring (Antatt)

1. januar 2027

Studiet fullført (Antatt)

1. januar 2027

Datoer for studieregistrering

Først innsendt

26. august 2024

Først innsendt som oppfylte QC-kriteriene

28. august 2024

Først lagt ut (Faktiske)

29. august 2024

Oppdateringer av studieposter

Sist oppdatering lagt ut (Faktiske)

21. august 2026

Siste oppdatering sendt inn som oppfylte QC-kriteriene

20. august 2026

Sist bekreftet

1. august 2026

Mer informasjon

Begreper knyttet til denne studien

Ytterligere relevante MeSH-vilkår

Andre studie-ID-numre

  • 9320

Legemiddel- og utstyrsinformasjon, studiedokumenter

Studerer et amerikansk FDA-regulert medikamentprodukt

Nei

Studerer et amerikansk FDA-regulert enhetsprodukt

Nei

Denne informasjonen ble hentet direkte fra nettstedet clinicaltrials.gov uten noen endringer. Hvis du har noen forespørsler om å endre, fjerne eller oppdatere studiedetaljene dine, vennligst kontakt register@clinicaltrials.gov. Så snart en endring er implementert på clinicaltrials.gov, vil denne også bli oppdatert automatisk på nettstedet vårt. .

Abonnere