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Kombinierte Genom- und RNA-Sequenzierung zur genetischen Diagnose von Parkinsonismus (ParkOmic)

20. August 2026 aktualisiert von: University Hospital, Strasbourg, France

Identifizierung der fehlenden genetischen Ursachen des Parkinson-Syndroms: ein kombinierter Ansatz durch Genom- und RNA-Sequenzierung

Trotz der zunehmenden Verfügbarkeit und Fortschritte in der Analyse der Hochdurchsatz-DNA-Sequenzierung bleibt die Mehrheit der Patienten mit früh einsetzendem oder familiärem Parkinsonismus ohne molekulare Diagnose.

Die Untersuchung der genetischen Formen des Parkinson-Syndroms bietet zahlreiche klinische, wissenschaftliche und therapeutische Interessen. In der klinischen Praxis ermöglicht die Identifizierung der genetischen Ursache bei einem Patienten eine genetische Beratung und die Abschätzung des Risikos eines erneuten Auftretens bei seinen Angehörigen. Durch die Ermittlung von Korrelationen zwischen dem Genotyp und dem Phänotyp von Patienten mit genetisch bedingtem Parkinsonismus lässt sich die Entwicklung der Krankheit besser vorhersagen oder sogar Biomarker während der präsymptomatischen Phasen hervorheben. Schließlich stellen die Proteine, die von den Genen kodiert werden, die an familiärem Parkinsonismus beteiligt sind, potenzielle therapeutische Ziele dar, die wahrscheinlich durch neuroprotektive pharmakologische Wirkstoffe moduliert werden, selbst bei sporadischer Parkinson-Krankheit.

In dieser Arbeit zielten die Forscher darauf ab, die fehlenden genetischen Ursachen von Parkinsonismus durch die Anwendung kombinierter RNA- und Gesamtgenomsequenzierung aufzuklären.

Studienübersicht

Status

Rekrutierung

Bedingungen

Intervention / Behandlung

Detaillierte Beschreibung

Die Forscher wählten 14 Patienten mit früh einsetzendem Parkinsonismus aus, bei denen nach der Exomsequenzierung keine Variante einer bestimmten Pathogenität identifiziert werden konnte.

Bei Patienten und ihren Angehörigen wird nach dem Einschlussbesuch eine Blutprobe zur DNA-Extraktion entnommen, die Patienten erhalten eine Hautbiopsie zur Fibroblastenkultur und eine RNA-Extraktion zur RNA-Sequenzierung. Die Genomsequenzierung wird auf einem Illumina® HiSeq4000-Sequenzer durchgeführt.

Die Forscher werden bei Patienten auch Hautbiopsien für Fibroblastenkulturen durchführen, um RNA für die RNA-Sequenzierung zu extrahieren. Die Wahl der Fibroblastenanalyse zur Untersuchung des Transkriptoms wird durch die Tatsache gerechtfertigt, dass im Gehirn exprimierte Gene, die wahrscheinlich mit neurodegenerativen Erkrankungen in Zusammenhang stehen, häufiger in der Haut exprimiert werden als in anderen klinisch zugänglichen Geweben wie Blut. Hautbiopsien werden von den überweisenden Ärzten durchgeführt und die RNA-Extraktion wird mit dem Quiagen® RNeasy-Kit durchgeführt.

Eine Transkriptomanalyse durch RNA-Sequenzierung einschließlich Sequenzierung und bioinformatischer Verarbeitung von Daten, einschließlich der Erkennung von aberrantem Spleißen (LeafCutter), aberranter Ausdrücke (DESeq) und der Identifizierung von Varianten (GATK + Varank) wird ebenfalls durchgeführt. Genomdaten werden mit Daten aus RNA integriert Sequenzierung. Die Forscher planen, alle 14 Patienten gemäß dieser Strategie zu analysieren.

Studientyp

Interventionell

Einschreibung (Geschätzt)

14

Phase

  • Unzutreffend

Kontakte und Standorte

Dieser Abschnitt enthält die Kontaktdaten derjenigen, die die Studie durchführen, und Informationen darüber, wo diese Studie durchgeführt wird.

Studienkontakt

Studienorte

  • Frankreich
    • Grand Est
      • Strasbourg, Grand Est, Frankreich, 67000

Teilnahmekriterien

Forscher suchen nach Personen, die einer bestimmten Beschreibung entsprechen, die als Auswahlkriterien bezeichnet werden. Einige Beispiele für diese Kriterien sind der allgemeine Gesundheitszustand einer Person oder frühere Behandlungen.

Zulassungskriterien

Studienberechtigtes Alter

  • Erwachsene
  • Älterer Erwachsener

Akzeptiert gesunde Freiwillige

Nein

Beschreibung

Einschlusskriterien:

  • Extrapyramidales Syndrom, das vor oder im Alter von 40 Jahren beginnt oder mit einer Familienanamnese verbunden ist:
  • Dopaminerge Denervierung nachgewiesen durch Ioflupan-Hirnszintigraphie (DaTscan®)
  • DNAs von beiden asymptomatischen Eltern sind in der Biobank verfügbar
  • Person, die einer Sozialversicherungs-Krankenversicherung angeschlossen ist oder Anspruchsberechtigte bzw. Anspruchsberechtigter ist
  • Der Proband ist in der Lage, die Ziele und Risiken im Zusammenhang mit der Forschung zu verstehen und eine datierte und unterzeichnete Einverständniserklärung abzugeben

Ausschlusskriterien:

  • - Kontraindikation für die Durchführung einer im Protokoll vorgesehenen oberflächlichen Hautbiopsie
  • Molekulare Ursache für Parkinsonismus bereits identifiziert
  • Keine vorherige genetische Untersuchung mittels Hochdurchsatz-DNA-Sequenzierung
  • Patient mit spät einsetzendem sporadischem Parkinson-Syndrom (> 40 Jahre) ohne Familienanamnese
  • Patient mit Parkinson-Syndrom im Zusammenhang mit einer spezifischen Diagnose (genetische oder nicht genetische Pathologie: Exposition gegenüber Neuroleptika, toxischer Ursprung)
  • Unmöglichkeit, dem Subjekt fundierte Informationen zur Verfügung zu stellen
  • Gegenstand unter gerichtlichem Schutz
  • Subjekt unter Vormundschaft oder Kuratorium

Studienplan

Dieser Abschnitt enthält Einzelheiten zum Studienplan, einschließlich des Studiendesigns und der Messung der Studieninhalte.

Wie ist die Studie aufgebaut?

Designdetails

  • Hauptzweck: Diagnose
  • Zuteilung: N / A
  • Interventionsmodell: Einzelgruppenzuweisung
  • Maskierung: Keine (Offenes Etikett)

Waffen und Interventionen

Teilnehmergruppe / Arm
Intervention / Behandlung
Experimental: Genom- und RNA-Sequenzierung
Diagnosetest: Kombinierte Gesamtgenom- und RNA-Sequenzierung
Hochdurchsatz-DNA- und RNA-Sequenzierung

Was misst die Studie?

Primäre Ergebnismessungen

Ergebnis Maßnahme
Maßnahmenbeschreibung
Zeitfenster
Genetische Diagnoserate
Zeitfenster: 18 Monate
Abschätzung der Rate genetischer Diagnosen, die durch Genomsequenzierung in Verbindung mit RNA-Sequenzierung in einer Kohorte von Patienten mit früh einsetzendem oder familiärem Parkinson-Syndrom ohne molekulare Diagnose erhalten wurden.
18 Monate

Sekundäre Ergebnismessungen

Ergebnis Maßnahme
Maßnahmenbeschreibung
Zeitfenster
Gene beteiligt
Zeitfenster: 18 Monate
Schätzen Sie den Anteil der Patienten, die pathogene oder wahrscheinlich pathogene Varianten in jedem der in dieser Arbeit identifizierten Gene tragen
18 Monate
Beitrag der RNA-Sequenzierung
Zeitfenster: 18 Monate
Schätzen Sie den Anteil pathogener oder wahrscheinlich pathogener Varianten, die dank des Beitrags der RNA-Sequenzierung sekundär entdeckt und nicht durch die Analyse des isolierten Genoms identifiziert wurden.
18 Monate
Genotyp- und Phänotyp-Korrelation
Zeitfenster: 18 Monate
Schätzen Sie den Anteil der Patienten, die für jede identifizierte genetische Ursache spezifische klinische, biologische und bildgebende Merkmale aufweisen (Genotyp/Phänotyp-Korrelation).
18 Monate
Neue genetische Ursachen
Zeitfenster: 18 Monate
Beschreiben Sie neue molekulare Mechanismen von Parkinson-Syndromen.
18 Monate
Toleranz
Zeitfenster: 18 Monate
Schätzen Sie den Anteil der Patienten, bei denen im Zusammenhang mit dem Eingriff ein unerwünschtes Ereignis auftritt.
18 Monate
Neue assoziierte Gene
Zeitfenster: 18 Monate
Beschreiben Sie neue Gene, die mit Parkinson-Syndromen assoziiert sind.
18 Monate

Mitarbeiter und Ermittler

Hier finden Sie Personen und Organisationen, die an dieser Studie beteiligt sind.

Sponsor

University Hospital, Strasbourg, France

Studienaufzeichnungsdaten

Diese Daten verfolgen den Fortschritt der Übermittlung von Studienaufzeichnungen und zusammenfassenden Ergebnissen an ClinicalTrials.gov. Studienaufzeichnungen und gemeldete Ergebnisse werden von der National Library of Medicine (NLM) überprüft, um sicherzustellen, dass sie bestimmten Qualitätskontrollstandards entsprechen, bevor sie auf der öffentlichen Website veröffentlicht werden.

Haupttermine studieren

Studienbeginn (Tatsächlich)

14. Januar 2025

Primärer Abschluss (Geschätzt)

1. Januar 2027

Studienabschluss (Geschätzt)

1. Januar 2027

Studienanmeldedaten

Zuerst eingereicht

26. August 2024

Zuerst eingereicht, das die QC-Kriterien erfüllt hat

28. August 2024

Zuerst gepostet (Tatsächlich)

29. August 2024

Studienaufzeichnungsaktualisierungen

Letztes Update gepostet (Tatsächlich)

21. August 2026

Letztes eingereichtes Update, das die QC-Kriterien erfüllt

20. August 2026

Zuletzt verifiziert

1. August 2026

Mehr Informationen

Begriffe im Zusammenhang mit dieser Studie

Zusätzliche relevante MeSH-Bedingungen

Andere Studien-ID-Nummern

  • 9320

Arzneimittel- und Geräteinformationen, Studienunterlagen

Studiert ein von der US-amerikanischen FDA reguliertes Arzneimittelprodukt

Nein

Studiert ein von der US-amerikanischen FDA reguliertes Geräteprodukt

Nein

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