Deze pagina is automatisch vertaald en de nauwkeurigheid van de vertaling kan niet worden gegarandeerd. Raadpleeg de Engelse versie voor een brontekst.

Gecombineerde genoom- en RNA-sequencing voor genetische diagnose van parkinsonisme (ParkOmic)

20 augustus 2026 bijgewerkt door: University Hospital, Strasbourg, France

Identificatie van de ontbrekende genetische oorzaken van Parkinson-syndromen: een gecombineerde aanpak door genoom- en RNA-sequencing

Ondanks de toenemende beschikbaarheid en vooruitgang in de analyse van high-throughput DNA-sequencing, blijft de meerderheid van de patiënten met early-onset of familiale parkinsonisme zonder een moleculaire diagnose.

Het bestuderen van de genetische vormen van Parkinson-syndromen brengt talrijke klinische, wetenschappelijke en therapeutische interesses met zich mee. In de klinische praktijk maakt het identificeren van de genetische oorzaak bij een patiënt het mogelijk genetische counseling te bieden en het risico op herhaling bij hun familieleden in te schatten. Door correlaties vast te stellen tussen het genotype en het fenotype van patiënten met genetisch bepaald parkinsonisme, kunnen we beter anticiperen op de evolutie van de ziekte, of zelfs biomarkers tijdens de presymptomatische fasen onder de aandacht brengen. Ten slotte vertegenwoordigen de eiwitten die worden gecodeerd door de genen die betrokken zijn bij familiaal parkinsonisme potentiële therapeutische doelen die waarschijnlijk worden gemoduleerd door neuroprotectieve farmacologische middelen, zelfs bij de sporadische ziekte van Parkinson.

In dit werk probeerden onderzoekers de ontbrekende genetische oorzaken van parkinsonisme op te helderen door de toepassing van gecombineerd RNA en volledige genoomsequencing.

Studie Overzicht

Toestand

Werving

Conditie

Interventie / Behandeling

Gedetailleerde beschrijving

Onderzoekers selecteerden 14 patiënten met parkinsonisme met vroege aanvang, bij wie geen variant van een bepaalde pathogeniciteit was geïdentificeerd na exoomsequencing.

Patiënten en hun familieleden zullen na het inclusiebezoek een bloedmonster afnemen voor DNA-extractie, patiënten zullen een huidbiopsie ontvangen voor fibroblastcultuur en RNA-extractie voor RNA-sequencing. De genoomsequencing zal worden uitgevoerd op een Illumina® HiSeq4000-sequencer.

Onderzoekers zullen ook huidbiopten uitvoeren bij patiënten voor fibroblastculturen om RNA te extraheren voor RNA-sequencing. De keuze voor fibroblastanalyse voor de studie van het transcriptoom wordt gerechtvaardigd door het feit dat genen die in de hersenen tot expressie worden gebracht en die waarschijnlijk geassocieerd zijn met neurodegeneratieve ziekten, vaker in de huid tot expressie komen dan in de andere klinisch toegankelijke weefsels zoals bloed. Huidbiopten zullen worden uitgevoerd door de verwijzende artsen, en RNA-extractie zal worden uitgevoerd met behulp van de Quiagen® RNeasy-kit.

Transcriptoomanalyse door middel van RNA-sequencing inclusief sequencing en bioinformatica-verwerking van gegevens, inclusief detectie van afwijkende splicing (LeafCutter), afwijkende expressies (DESeq) en identificatie van varianten (GATK + Varank) zullen ook worden uitgevoerd. Genoomgegevens zullen worden geïntegreerd met gegevens van RNA sequentiebepaling. Onderzoekers zijn van plan alle 14 patiënten volgens deze strategie te analyseren.

Studietype

Ingrijpend

Inschrijving (Geschat)

14

Fase

  • Niet toepasbaar

Contacten en locaties

In dit gedeelte vindt u de contactgegevens van degenen die het onderzoek uitvoeren en informatie over waar dit onderzoek wordt uitgevoerd.

Studiecontact

Studie Locaties

Deelname Criteria

Onderzoekers zoeken naar mensen die aan een bepaalde beschrijving voldoen, de zogenaamde geschiktheidscriteria. Enkele voorbeelden van deze criteria zijn iemands algemene gezondheidstoestand of eerdere behandelingen.

Geschiktheidscriteria

Leeftijden die in aanmerking komen voor studie

  • Volwassen
  • Oudere volwassene

Accepteert gezonde vrijwilligers

Nee

Beschrijving

Inclusiecriteria:

  • Extrapiramidaal syndroom dat vóór of op de leeftijd van 40 jaar begint of geassocieerd is met een familiegeschiedenis:
  • Dopaminerge denervatie bewezen door joflupaan-hersenscintigrafie (DaTscan®)
  • DNA's van beide asymptomatische ouders beschikbaar in biobank
  • Betrokkene aangesloten bij een sociale ziektekostenverzekering of begunstigde of begunstigde
  • De proefpersoon is in staat de doelstellingen en risico's van het onderzoek te begrijpen en een gedateerde en ondertekende geïnformeerde toestemming te geven

Uitsluitingscriteria:

  • - Contra-indicatie voor het uitvoeren van een oppervlakkige huidbiopsie zoals voorzien in het protocol
  • Moleculaire oorzaak van parkinsonisme eerder geïdentificeerd
  • Ontbreken van eerdere genetische verkenning door middel van high-throughput DNA-sequencing
  • Patiënt met het sporadisch Parkinson-syndroom met late aanvang (> 40 jaar) zonder familiegeschiedenis
  • Patiënt met het syndroom van Parkinson geassocieerd met een specifieke diagnose (genetische of niet-genetische pathologie: blootstelling aan neuroleptica, toxische oorsprong)
  • Onmogelijkheid om de proefpersoon van geïnformeerde informatie te voorzien
  • Onderwerp onder rechterlijke bescherming
  • Onderwerp onder curatele of curatele

Studie plan

Dit gedeelte bevat details van het studieplan, inclusief hoe de studie is opgezet en wat de studie meet.

Hoe is de studie opgezet?

Ontwerpdetails

  • Primair doel: Diagnostisch
  • Toewijzing: NVT
  • Interventioneel model: Opdracht voor een enkele groep
  • Masker: Geen (open label)

Wapens en interventies

Deelnemersgroep / Arm
Interventie / Behandeling
Experimenteel: Genoom- en RNA-sequencing
Diagnostische toets: Combineer het hele genoom en RNA-sequencing
High-throughput DNA- en RNA-sequencing

Wat meet het onderzoek?

Primaire uitkomstmaten

Uitkomstmaat
Maatregel Beschrijving
Tijdsspanne
Genetisch diagnosepercentage
Tijdsspanne: 18 maanden
Het schatten van het aantal genetische diagnoses dat wordt verkregen door genoomsequencing gekoppeld aan RNA-sequencing binnen een cohort van patiënten met vroege of familiale Parkinson-syndromen zonder moleculaire diagnose.
18 maanden

Secundaire uitkomstmaten

Uitkomstmaat
Maatregel Beschrijving
Tijdsspanne
Genen betrokken
Tijdsspanne: 18 maanden
Schat het aandeel patiënten dat drager is van pathogene of waarschijnlijk pathogene varianten in elk van de genen die in dit werk zijn geïdentificeerd
18 maanden
Bijdrage van RNA-sequencing
Tijdsspanne: 18 maanden
Schat het aandeel pathogene of waarschijnlijk pathogene varianten die secundair zijn gedetecteerd dankzij de bijdrage van RNA-sequencing en die niet zijn geïdentificeerd door analyse van het geïsoleerde genoom.
18 maanden
Correlatie tussen genotype en fenotype
Tijdsspanne: 18 maanden
Schat het aandeel patiënten met specifieke klinische, biologische en beeldvormende kenmerken voor elke geïdentificeerde genetische oorzaak (correlatie genotype/fenotype).
18 maanden
Nieuwe genetische oorzaken
Tijdsspanne: 18 maanden
Beschrijf nieuwe moleculaire mechanismen van Parkinson-syndromen.
18 maanden
Tolerantie
Tijdsspanne: 18 maanden
Schat het percentage patiënten dat een bijwerking ervaart die verband houdt met de procedure.
18 maanden
Nieuwe geassocieerde genen
Tijdsspanne: 18 maanden
Beschrijf nieuwe genen geassocieerd met Parkinson-syndromen.
18 maanden

Medewerkers en onderzoekers

Hier vindt u mensen en organisaties die betrokken zijn bij dit onderzoek.

Sponsor

University Hospital, Strasbourg, France

Studie record data

Deze datums volgen de voortgang van het onderzoeksdossier en de samenvatting van de ingediende resultaten bij ClinicalTrials.gov. Studieverslagen en gerapporteerde resultaten worden beoordeeld door de National Library of Medicine (NLM) om er zeker van te zijn dat ze voldoen aan specifieke kwaliteitscontrolenormen voordat ze op de openbare website worden geplaatst.

Bestudeer belangrijke data

Studie start (Werkelijk)

14 januari 2025

Primaire voltooiing (Geschat)

1 januari 2027

Studie voltooiing (Geschat)

1 januari 2027

Studieregistratiedata

Eerst ingediend

26 augustus 2024

Eerst ingediend dat voldeed aan de QC-criteria

28 augustus 2024

Eerst geplaatst (Werkelijk)

29 augustus 2024

Updates van studierecords

Laatste update geplaatst (Werkelijk)

21 augustus 2026

Laatste update ingediend die voldeed aan QC-criteria

20 augustus 2026

Laatst geverifieerd

1 augustus 2026

Meer informatie

Termen gerelateerd aan deze studie

Aanvullende relevante MeSH-voorwaarden

Andere studie-ID-nummers

  • 9320

Informatie over medicijnen en apparaten, studiedocumenten

Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd geneesmiddel

Nee

Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd apparaatproduct

Nee

Deze informatie is zonder wijzigingen rechtstreeks van de website clinicaltrials.gov gehaald. Als u verzoeken heeft om uw onderzoeksgegevens te wijzigen, te verwijderen of bij te werken, neem dan contact op met register@clinicaltrials.gov. Zodra er een wijziging wordt doorgevoerd op clinicaltrials.gov, wordt deze ook automatisch bijgewerkt op onze website .

Abonneren