CtDNA flytende biopsi for tidlig vurdering av gjenværende sykdom ved HPV-assosiert hode- og nakkekreft (Clear-HPVca) (Clear-HPVca)

Humant papillomavirus assosiert hode- og nakke plateepitelkarsinom (HPV+HNC) er den vanligste HPV-assosierte kreften i USA. Kirurgi er en vanlig tilnærming for primærbehandling av HPV+HNC i tidlig stadium. Mange pasienter som gjennomgår kirurgi mottar adjuvant strålebehandling eller kjemoradiasjonsbehandling for å behandle potensiell gjenværende sykdom, som for tiden er spådd basert på klinikopatologiske risikofaktorer inkludert positive marginer, ekstranodal forlengelse, flere positive lymfeknuter, vaskulær invasjon og lymfatisk invasjon. Imidlertid er det begrensninger i å forutsi gjenværende sykdom basert på bruken av disse funksjonene alene - bruken av klinikopatologiske risikofaktorer for prediksjon er ikke-standardisert og har dårlig individualisert prediktiv og prognostisk kapasitet. Foreløpig er det ingen etablerte biomarkører for å forutsi gjenværende sykdom.

Sirkulerende tumor-DNA (ctDNA) er en fremvoksende minimalt invasiv prognostisk biomarkør, for å oppdage molekylær restsykdom (MRD) og forutsi tilbakefall i flere solide kreftformer. Prospektive studier i kreftformer som tykktarmskreft har vist ikke bare sterk sykdomsfri overlevelse (DFS) prognostisk kapasitet, men også total overlevelse (OS). Tidligere studier har vist at HPV+HNCs frigjør sirkulerende tumor HPV-DNA (ctHPVDNA) i blodet der det fungerer som en nøyaktig sanntidsbiomarkør for sykdomsstatus etter operasjon. Hos pasienter uten patologiske risikofaktorer fjernes ctHPVDNA raskt etter operasjonen. Hos pasienter med gjenværende sykdom forblir ctHPVDNA forhøyet etter operasjonen. Imidlertid har innledende studier vist at pasienter med mikroskopiske nivåer av gjenværende sykdom ofte ikke oppdages av nåværende tilnærminger ved bruk av droplet digital PCR (ddPCR), noe som tyder på at betydelig mer sensitive analyser er nødvendige.

HPV-DeepSeek er en HPV-helgenom neste generasjons sekvenseringsanalyse som er betydelig mer sensitiv enn ddPCR-baserte tilnærminger. Vi tar sikte på å gjennomføre en prospektiv observasjonskohortstudie av HPV+HNC-pasienter behandlet med kurativ intensjonskirurgi for å teste den primære hypotesen om at pasienter med MRD-deteksjon etter operasjon vil ha dårligere 2-års DFS og OS og den sekundære hypotesen om at pasienter med MRD-deteksjon etter operasjon. behandlingsavslutning (overvåking) vil ha dårligere 2-års DFS og OS.