Biopsja płynna CtDNA do wczesnej oceny choroby resztkowej w raku głowy i szyi związanym z HPV (Clear-HPVca) (Clear-HPVca)

Rak płaskonabłonkowy głowy i szyi związany z wirusem brodawczaka ludzkiego (HPV+HNC) jest najczęstszym nowotworem związanym z wirusem HPV w Stanach Zjednoczonych. Operacja jest powszechnym podejściem do pierwotnego leczenia HPV+HNC we wczesnym stadium. Wielu pacjentów poddawanych zabiegom chirurgicznym otrzymuje uzupełniającą radioterapię lub chemioradioterapię w celu leczenia potencjalnej choroby resztkowej, którą obecnie przewiduje się na podstawie kliniczno-patologicznych czynników ryzyka, w tym dodatnich marginesów, rozrostu pozawęzłowego, licznych dodatnich węzłów chłonnych, naciekania naczyń i nacieków limfatycznych. Istnieją jednak ograniczenia w przewidywaniu choroby resztkowej na podstawie samych tych cech – wykorzystanie kliniczno-patologicznych czynników ryzyka do przewidywania jest niestandaryzowane i ma słabą zindywidualizowaną zdolność predykcyjną i prognostyczną. Obecnie nie ma ustalonych biomarkerów pozwalających przewidzieć chorobę resztkową.

Krążące DNA nowotworu (ctDNA) to nowy, minimalnie inwazyjny biomarker prognostyczny, służący do wykrywania molekularnej choroby resztkowej (MRD) i przewidywania nawrotu wielu nowotworów litych. Prospektywne badania nad nowotworami, takimi jak rak jelita grubego, wykazały nie tylko silną zdolność prognostyczną w zakresie przeżycia wolnego od choroby (DFS), ale także przeżycia całkowitego (OS). Poprzednie badania wykazały, że HPV+HNC uwalniają krążące DNA HPV nowotworu (ctHPVDNA) do krwi, gdzie służy ono jako dokładny biomarker stanu chorobowego w czasie rzeczywistym po operacji. U pacjentów bez patologicznych czynników ryzyka ctHPVDNA jest szybko usuwany po operacji. U pacjentów z chorobą resztkową stężenie ctHPVDNA pozostaje podwyższone po operacji. Jednakże wstępne badania wykazały, że pacjenci z mikroskopijnymi poziomami choroby resztkowej często nie są wykrywani obecnymi metodami wykorzystującymi cyfrową PCR typu droplet (ddPCR), co sugeruje, że konieczne są znacznie bardziej czułe testy.

HPV-DeepSeek to test sekwencjonowania nowej generacji całego genomu HPV, który jest znacznie bardziej czuły niż metody oparte na ddPCR. Naszym celem jest przeprowadzenie prospektywnego, obserwacyjnego badania kohortowego pacjentów z HPV+HNC leczonych chirurgicznie w celu wyleczenia, aby przetestować główną hipotezę, że pacjenci z wykryciem MRD po operacji będą mieli gorszy 2-letni DFS i OS oraz wtórną hipotezę, że pacjenci z wykryciem MRD po operacji zakończenie leczenia (nadzór) będzie skutkować gorszym 2-letnim DFS i OS.