Rhinovirus Hospitalisering og Undersøkelse av Nasal-luftvei Omikk (RHINO) Studiet

Mål 1: Involverer prospektiv etablering av en kohort av generelt friske barn i alderen 12 til 36 måneder som skal følges longitudinelt i 36 måneder i en observasjonsstudie. For å fastslå hyppigheten av virusinfeksjon med RV og andre luftveisvirus, vil barn få utført to prøvetak av nesens slimhinne når de utvikler en akutt luftveisinfeksjon (øvre luftveissymptomer som varer mer enn 24 timer) og fire ganger i året for overvåkning. Ett prøvetak vil være fra fremre del av nesen og vil bli brukt til identifikasjon av virus, og et andre midt-turbinat prøvetak vil bli brukt for vertstranskriptomikk. Dette vil gjøre det mulig for forskerne å skape mange prøver fra både symptomatiske og asymptomatiske infeksjoner. Prøvene vil bli brukt til å utvikle en vertssignatur for å skille symptomatiske og asymptomatiske infeksjoner.

Mål 2a: Involverer evaluering av generelt friske barn innlagt på AFCH med akutte nedre luftveisinfeksjoner inkludert bronkiolitt, astma og samfunnservervet lungebetennelse. Det vil også være evaluering av spedbarn under 6 måneder som kan bli syke med et RV-syndrom. Disse barna vil bli evaluert med to neseprøvetak som ovenfor. Dette muliggjør identifikasjon av barn infisert med RV og andre luftveisvirus. Anvendelse av vertssignaturen utviklet i Mål 1 vil fastslå den faktiske andelen av disse barna som er infisert med RV hvor sykdommen (kliniske symptomer) er forårsaket av RV.

Mål 2b: Involverer prospektiv etablering av en kohort av generelt friske barn i alderen 5 til 17 år som skal prøvetas etter behov for å tjene som alders- og sesongmatchede kontroller for Innleggelsesgruppen. For å fastslå hyppigheten av virusinfeksjon med RV og andre luftveisvirus, vil 2 friske barn gi et enkelt prøvetak av nesens slimhinne innen 2 uker etter hver innlagt deltaker som er 5-17 år gammel. Det ene prøvetaket vil være fra fremre del av nesen og vil bli brukt til identifikasjon av virus. Aldersmatching vil skje innen 3 grupper:

• Alder 5-8 år: n=50
• Alder 9-13 år: n=30
• Alder 14-17 år: n=20

Mål 3: Bruk parallell bulk og enkeltcelle RNA-sekvensering (scRNA-seq) for å identifisere målrettbare prosesser av akutt, alvorlig nedre luftveisinfeksjon forårsaket av RV. Forskerne antar at integrert bulk RNA-sekvensering og scRNA-seq vil identifisere immun-/betennelsesdefekter og mål for intervensjon. Bulk og scRNA-seq på respirasjonsprøver fra godt karakteriserte pasienter med alvorlig RV-sykdom vil bli utført for å teste denne hypotesen og for å sammenligne prøver hentet fra de med ikke-alvorlig sykdom.