Nowe biomarkery w progresji nowotworowej przełyku Barretta (BE)

Pacjenci z przełykiem Barretta (BE) mają zwiększone ryzyko gruczolakoraka przełyku, które jest 40-125 razy większe niż w populacji ogólnej. Jednak obecne techniki wykrywania dysplazji i obserwowania nieprawidłowego barwienia immunohistochemicznego p53 nie są dokładnymi ani wiarygodnymi metodami określania, którzy pacjenci z BE ulegną progresji do raka. Hipermetylacja DNA to proces epigenetyczny, który zachodzi w regionie promotorowym niektórych genów, powodując supresję ekspresji genów. Inaktywacja określonych genów poprzez hipermetylację jest silnie związana z rakiem.

Głównym celem tych badań jest ustalenie, czy hipermetylacja DNA jest biomarkerem, który pozwoli przewidzieć, którzy pacjenci z BE prawdopodobnie rozwiną się w gruczolakoraka. Pacjenci z BE i/lub gruczolakorakiem przełyku, którzy przechodzą endoskopię w Johns Hopkins Hospital, będą stanowić kohortę pacjentów. Hipermetylacja genów zostanie oceniona poprzez przeprowadzenie specyficznej dla metylacji reakcji łańcuchowej polimerazy (PCR) na panelu 8 genów związanych z rakiem.

Cel szczegółowy 1: Porównanie częstości występowania hipermetylacji genów u pacjentów z BE z różnymi stopniami dysplazji i/lub gruczolakoraka, przy użyciu archiwalnych próbek.

Cel szczegółowy 2: Określenie, czy obecność hipermetylacji genu w początkowych biopsjach pacjentów z BE jest związana z progresją do gruczolakoraka, przy użyciu zarchiwizowanych próbek. Porównanie hipermetylacji genów z obecnie dostępnymi markerami progresji nowotworu.

Cel szczegółowy 3: Określenie, czy metylowany DNA z BE i/lub gruczolakoraka można wykryć we krwi obwodowej pacjentów, porównując profile metylacji próbek biopsji przełyku z próbkami krwi obwodowej pobranymi w tym samym czasie od pacjentów włączonych do badania prospektywnego.

Jeśli hipermetylacja jednego lub więcej genów zostanie wykryta na wczesnym etapie u pacjentów z BE, którzy później przekształcą się w gruczolakoraka, hipermetylację można wykorzystać jako wczesny predyktor gruczolakoraka, nawet zanim zmiany patologiczne będą widoczne. Ponadto badania te pomogą określić specyficzne zdarzenia genetyczne, które występują w transformacji nowotworowej z BE do gruczolakoraka.

Długoterminowym celem tego projektu jest ustalenie, czy hipermetylacja może identyfikować pacjentów z BE, którzy są narażeni na wysokie ryzyko progresji nowotworu, umożliwiając w ten sposób wczesną interwencję w postaci częstszego nadzoru endoskopowego, chemoprewencji, terapii ablacyjnej lub operacji.